MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022110	ATA	2	6	313175	313180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353463
6002	NC_022110	A	8	8	313211	313218	100 %	0 %	0 %	0 %	532353463
6003	NC_022110	CTT	2	6	313219	313224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353463
6004	NC_022110	ATA	2	6	313270	313275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353463
6005	NC_022110	CTT	2	6	313375	313380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6006	NC_022110	A	6	6	313462	313467	100 %	0 %	0 %	0 %	532353464
6007	NC_022110	CTAA	2	8	313512	313519	50 %	25 %	0 %	25 %	532353464
6008	NC_022110	CTT	2	6	313561	313566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6009	NC_022110	TCT	2	6	313596	313601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6010	NC_022110	T	7	7	313625	313631	0 %	100 %	0 %	0 %	532353464
6011	NC_022110	CTT	2	6	313648	313653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6012	NC_022110	TGC	2	6	313746	313751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353464
6013	NC_022110	TTC	2	6	313826	313831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6014	NC_022110	GAA	2	6	313885	313890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
6015	NC_022110	AGA	2	6	313958	313963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
6016	NC_022110	TTC	2	6	313997	314002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6017	NC_022110	GGAA	2	8	314180	314187	50 %	0 %	50 %	0 %	532353464
6018	NC_022110	AGGT	2	8	314202	314209	25 %	25 %	50 %	0 %	532353464
6019	NC_022110	TCT	2	6	314226	314231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6020	NC_022110	AAACT	2	10	314242	314251	60 %	20 %	0 %	20 %	532353464
6021	NC_022110	TA	3	6	314365	314370	50 %	50 %	0 %	0 %	532353464
6022	NC_022110	ATAC	2	8	314384	314391	50 %	25 %	0 %	25 %	532353464
6023	NC_022110	GCT	2	6	314443	314448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353464
6024	NC_022110	CTT	2	6	314527	314532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6025	NC_022110	AAG	2	6	314536	314541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
6026	NC_022110	CTT	2	6	314552	314557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6027	NC_022110	T	7	7	314556	314562	0 %	100 %	0 %	0 %	532353464
6028	NC_022110	AACAT	2	10	314575	314584	60 %	20 %	0 %	20 %	532353464
6029	NC_022110	AGA	2	6	314597	314602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
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6031	NC_022110	T	8	8	314747	314754	0 %	100 %	0 %	0 %	532353464
6032	NC_022110	AGC	2	6	314777	314782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353464
6033	NC_022110	GA	3	6	314794	314799	50 %	0 %	50 %	0 %	532353464
6034	NC_022110	AT	3	6	314821	314826	50 %	50 %	0 %	0 %	532353464
6035	NC_022110	CTT	2	6	314866	314871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6036	NC_022110	GAA	2	6	314874	314879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
6037	NC_022110	CTC	2	6	314916	314921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353464
6038	NC_022110	TA	3	6	314952	314957	50 %	50 %	0 %	0 %	532353464
6039	NC_022110	A	6	6	315072	315077	100 %	0 %	0 %	0 %	532353464
6040	NC_022110	AAG	2	6	315086	315091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353464
6041	NC_022110	TTTG	2	8	315155	315162	0 %	75 %	25 %	0 %	532353464
6042	NC_022110	AAAC	2	8	315204	315211	75 %	0 %	0 %	25 %	532353464
6043	NC_022110	CTT	2	6	315236	315241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6044	NC_022110	A	6	6	315254	315259	100 %	0 %	0 %	0 %	532353464
6045	NC_022110	CTT	2	6	315275	315280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353464
6046	NC_022110	T	6	6	315279	315284	0 %	100 %	0 %	0 %	532353464
6047	NC_022110	AAT	2	6	315288	315293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353464
6048	NC_022110	A	9	9	315303	315311	100 %	0 %	0 %	0 %	532353464
6049	NC_022110	ACT	2	6	315317	315322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353464
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6051	NC_022110	TTG	2	6	315380	315385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353464
6052	NC_022110	TAC	2	6	315580	315585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353465
6053	NC_022110	CTT	2	6	315603	315608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
6054	NC_022110	AATC	2	8	315612	315619	50 %	25 %	0 %	25 %	532353465
6055	NC_022110	CTT	2	6	315652	315657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
6056	NC_022110	ATC	2	6	315691	315696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353465
6057	NC_022110	TAAT	2	8	315833	315840	50 %	50 %	0 %	0 %	532353465
6058	NC_022110	AGCA	2	8	315930	315937	50 %	0 %	25 %	25 %	532353465
6059	NC_022110	AT	3	6	315952	315957	50 %	50 %	0 %	0 %	532353465
6060	NC_022110	A	6	6	315973	315978	100 %	0 %	0 %	0 %	532353465
6061	NC_022110	TTC	2	6	316030	316035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
6062	NC_022110	GTT	2	6	316045	316050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353465
6063	NC_022110	TCCGG	2	10	316058	316067	0 %	20 %	40 %	40 %	532353465
6064	NC_022110	GATT	2	8	316164	316171	25 %	50 %	25 %	0 %	532353465
6065	NC_022110	ATC	2	6	316189	316194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353465
6066	NC_022110	T	6	6	316198	316203	0 %	100 %	0 %	0 %	532353465
6067	NC_022110	TTC	2	6	316282	316287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
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6070	NC_022110	TTC	2	6	316565	316570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
6071	NC_022110	ATC	2	6	316579	316584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353465
6072	NC_022110	CTT	2	6	316629	316634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353465
6073	NC_022110	GCT	2	6	316641	316646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353465
6074	NC_022110	GAA	2	6	316656	316661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353465
6075	NC_022110	TC	3	6	316674	316679	0 %	50 %	0 %	50 %	532353465
6076	NC_022110	ACT	2	6	316720	316725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353465
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6078	NC_022110	ACA	2	6	316838	316843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353465
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6089	NC_022110	TCCAA	2	10	317245	317254	40 %	20 %	0 %	40 %	532353466
6090	NC_022110	ATTG	2	8	317262	317269	25 %	50 %	25 %	0 %	532353466
6091	NC_022110	TAT	2	6	317369	317374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353466
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6095	NC_022110	TAA	2	6	317459	317464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353466
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6099	NC_022110	AATA	2	8	317618	317625	75 %	25 %	0 %	0 %	532353466
6100	NC_022110	TAAA	2	8	317639	317646	75 %	25 %	0 %	0 %	532353466
6101	NC_022110	CAGA	2	8	317647	317654	50 %	0 %	25 %	25 %	532353466
6102	NC_022110	AAC	2	6	317656	317661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353466
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6104	NC_022110	AATA	2	8	317714	317721	75 %	25 %	0 %	0 %	532353466
6105	NC_022110	GAA	2	6	318131	318136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
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6107	NC_022110	GCT	2	6	318162	318167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6108	NC_022110	TCAA	2	8	318217	318224	50 %	25 %	0 %	25 %	532353467
6109	NC_022110	ATTTA	2	10	318311	318320	40 %	60 %	0 %	0 %	532353467
6110	NC_022110	C	7	7	318326	318332	0 %	0 %	0 %	100 %	532353467
6111	NC_022110	TCC	2	6	318336	318341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353467
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6113	NC_022110	TCT	3	9	318381	318389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353467
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6119	NC_022110	A	6	6	318660	318665	100 %	0 %	0 %	0 %	532353467
6120	NC_022110	GAA	2	6	318726	318731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
6121	NC_022110	GATG	2	8	318746	318753	25 %	25 %	50 %	0 %	532353467
6122	NC_022110	TTAT	2	8	318780	318787	25 %	75 %	0 %	0 %	532353467
6123	NC_022110	TGA	2	6	318788	318793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6124	NC_022110	TTG	2	6	318805	318810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353467
6125	NC_022110	GCT	2	6	318819	318824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6126	NC_022110	GAG	2	6	318871	318876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353467
6127	NC_022110	A	6	6	318958	318963	100 %	0 %	0 %	0 %	532353467
6128	NC_022110	GTT	2	6	318966	318971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353467
6129	NC_022110	CCT	2	6	318975	318980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353467
6130	NC_022110	A	6	6	319020	319025	100 %	0 %	0 %	0 %	532353467
6131	NC_022110	TCA	2	6	319048	319053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353467
6132	NC_022110	TGA	2	6	319055	319060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6133	NC_022110	TGC	2	6	319070	319075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6134	NC_022110	CT	3	6	319083	319088	0 %	50 %	0 %	50 %	532353467
6135	NC_022110	TTC	2	6	319111	319116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353467
6136	NC_022110	A	6	6	319216	319221	100 %	0 %	0 %	0 %	532353467
6137	NC_022110	GCT	2	6	319269	319274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6138	NC_022110	TGA	2	6	319283	319288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
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6141	NC_022110	GAA	2	6	319347	319352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
6142	NC_022110	TGA	2	6	319367	319372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6143	NC_022110	AGT	2	6	319388	319393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6144	NC_022110	AAAG	2	8	319475	319482	75 %	0 %	25 %	0 %	532353467
6145	NC_022110	CGT	2	6	319527	319532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6146	NC_022110	TCCT	2	8	319572	319579	0 %	50 %	0 %	50 %	532353467
6147	NC_022110	GCA	2	6	319619	319624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353467
6148	NC_022110	GGA	2	6	319644	319649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353467
6149	NC_022110	GAT	2	6	319709	319714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6150	NC_022110	TCC	2	6	319721	319726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353467
6151	NC_022110	AT	3	6	319730	319735	50 %	50 %	0 %	0 %	532353467
6152	NC_022110	CGC	2	6	319776	319781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353467
6153	NC_022110	TGTGT	2	10	319788	319797	0 %	60 %	40 %	0 %	532353467
6154	NC_022110	TGA	2	6	319802	319807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
6155	NC_022110	CAT	3	9	319910	319918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353467
6156	NC_022110	GTG	2	6	319957	319962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353467
6157	NC_022110	TGC	2	6	320021	320026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353467
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6159	NC_022110	AAG	2	6	320098	320103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
6160	NC_022110	TAA	2	6	320132	320137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353467
6161	NC_022110	GGA	2	6	320270	320275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353467
6162	NC_022110	AAG	2	6	320314	320319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
6163	NC_022110	CG	4	8	320331	320338	0 %	0 %	50 %	50 %	532353467
6164	NC_022110	AGA	2	6	320345	320350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353467
6165	NC_022110	GTT	2	6	320355	320360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353467
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6167	NC_022110	TGA	2	6	320429	320434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353467
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6173	NC_022110	TGT	2	6	320831	320836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353468
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6178	NC_022110	AAT	2	6	321120	321125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353468
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6180	NC_022110	CTT	2	6	321163	321168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353468
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6182	NC_022110	ATGGA	2	10	321300	321309	40 %	20 %	40 %	0 %	532353468
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6185	NC_022110	CAA	2	6	321444	321449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353468
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6188	NC_022110	CAT	2	6	321551	321556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353468
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6190	NC_022110	A	7	7	321577	321583	100 %	0 %	0 %	0 %	532353468
6191	NC_022110	GCC	2	6	321596	321601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353468
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6193	NC_022110	ATA	2	6	321697	321702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354055
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6200	NC_022110	AAAACA	2	12	322013	322024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532353469
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6203	NC_022110	AAG	2	6	322183	322188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353469
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6205	NC_022110	GAG	2	6	322291	322296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353469
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6209	NC_022110	TA	3	6	322447	322452	50 %	50 %	0 %	0 %	532353469
6210	NC_022110	GCT	2	6	322497	322502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353469
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6214	NC_022110	A	6	6	322657	322662	100 %	0 %	0 %	0 %	532353469
6215	NC_022110	GAGC	2	8	322763	322770	25 %	0 %	50 %	25 %	532353469
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6221	NC_022110	TAA	2	6	322922	322927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353469
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6224	NC_022110	ACG	2	6	323033	323038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353469
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6228	NC_022110	AGA	2	6	323183	323188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353469
6229	NC_022110	GGC	2	6	323252	323257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353469
6230	NC_022110	ATG	2	6	323322	323327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353469
6231	NC_022110	AC	3	6	323352	323357	50 %	0 %	0 %	50 %	532353469
6232	NC_022110	CT	3	6	323373	323378	0 %	50 %	0 %	50 %	532353469
6233	NC_022110	ACA	2	6	323384	323389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353469
6234	NC_022110	TTC	2	6	323424	323429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353469
6235	NC_022110	AAAAAG	2	12	323439	323450	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532353469
6236	NC_022110	CCT	4	12	323523	323534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353469
6237	NC_022110	TACA	2	8	323623	323630	50 %	25 %	0 %	25 %	532353470
6238	NC_022110	AAG	2	6	323665	323670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353470
6239	NC_022110	GAA	2	6	323691	323696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353470
6240	NC_022110	TGA	2	6	323709	323714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353470
6241	NC_022110	TAT	2	6	323740	323745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353470
6242	NC_022110	TTGG	2	8	323796	323803	0 %	50 %	50 %	0 %	532353470
6243	NC_022110	TCA	2	6	323832	323837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353470
6244	NC_022110	CAT	2	6	323971	323976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353470
6245	NC_022110	TCT	2	6	324063	324068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353470
6246	NC_022110	TCT	2	6	324099	324104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353470
6247	NC_022110	AGC	3	9	324122	324130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353470
6248	NC_022110	TGC	2	6	324134	324139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353470
6249	NC_022110	TTC	2	6	324155	324160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353470
6250	NC_022110	CTTT	2	8	324203	324210	0 %	75 %	0 %	25 %	532353470
6251	NC_022110	ATC	2	6	324212	324217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353470
6252	NC_022110	TTCT	2	8	324248	324255	0 %	75 %	0 %	25 %	532353470
6253	NC_022110	T	6	6	324275	324280	0 %	100 %	0 %	0 %	532353470
6254	NC_022110	ACT	2	6	324294	324299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353470
6255	NC_022110	T	6	6	324329	324334	0 %	100 %	0 %	0 %	532353470
6256	NC_022110	GCT	2	6	324346	324351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353470
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6259	NC_022110	T	7	7	324445	324451	0 %	100 %	0 %	0 %	532353470
6260	NC_022110	T	6	6	324458	324463	0 %	100 %	0 %	0 %	532353470
6261	NC_022110	TAG	2	6	324526	324531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353470
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6264	NC_022110	T	7	7	324712	324718	0 %	100 %	0 %	0 %	532353470
6265	NC_022110	AAG	2	6	324879	324884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353471
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6269	NC_022110	TA	3	6	325094	325099	50 %	50 %	0 %	0 %	532353471
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6272	NC_022110	T	6	6	325146	325151	0 %	100 %	0 %	0 %	532353471
6273	NC_022110	CCCCT	2	10	325156	325165	0 %	20 %	0 %	80 %	532353471
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6275	NC_022110	TCC	2	6	325325	325330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353471
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6279	NC_022110	CTT	2	6	325434	325439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353471
6280	NC_022110	TCT	2	6	325468	325473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353471
6281	NC_022110	A	7	7	325627	325633	100 %	0 %	0 %	0 %	532353472
6282	NC_022110	ATA	2	6	325694	325699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353472
6283	NC_022110	TC	3	6	325701	325706	0 %	50 %	0 %	50 %	532353472
6284	NC_022110	GAAA	2	8	325722	325729	75 %	0 %	25 %	0 %	532353472
6285	NC_022110	AGCT	2	8	325762	325769	25 %	25 %	25 %	25 %	532353472
6286	NC_022110	TCT	2	6	325790	325795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353472
6287	NC_022110	TGA	2	6	325828	325833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353472
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6289	NC_022110	ACA	2	6	325983	325988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353472
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6291	NC_022110	GAA	2	6	326098	326103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353473
6292	NC_022110	GCTA	2	8	326120	326127	25 %	25 %	25 %	25 %	532353473
6293	NC_022110	GAAC	2	8	326139	326146	50 %	0 %	25 %	25 %	532353473
6294	NC_022110	CT	3	6	326200	326205	0 %	50 %	0 %	50 %	532353473
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6322	NC_022110	CCAG	2	8	327589	327596	25 %	0 %	25 %	50 %	532353475
6323	NC_022110	GCA	2	6	327608	327613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353475
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6345	NC_022110	T	6	6	328718	328723	0 %	100 %	0 %	0 %	532353476
6346	NC_022110	TA	3	6	328728	328733	50 %	50 %	0 %	0 %	532353476
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6357	NC_022110	AT	3	6	329281	329286	50 %	50 %	0 %	0 %	532353476
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6364	NC_022110	AAT	2	6	329570	329575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353476
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6366	NC_022110	CT	3	6	329751	329756	0 %	50 %	0 %	50 %	532353476
6367	NC_022110	ACA	2	6	329809	329814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353476
6368	NC_022110	A	6	6	329993	329998	100 %	0 %	0 %	0 %	532353476
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6493	NC_022110	CAA	2	6	336337	336342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353481
6494	NC_022110	TC	3	6	336414	336419	0 %	50 %	0 %	50 %	532353481
6495	NC_022110	CAG	2	6	336431	336436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353481
6496	NC_022110	TCA	2	6	336439	336444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353481
6497	NC_022110	GCT	2	6	336484	336489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353481
6498	NC_022110	AAC	2	6	336503	336508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353481
6499	NC_022110	CAAA	2	8	336514	336521	75 %	0 %	0 %	25 %	532353481
6500	NC_022110	GAAT	2	8	336570	336577	50 %	25 %	25 %	0 %	532353481

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