MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 20343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022109	T	6	6	59526	59531	0 %	100 %	0 %	0 %	532352335
1002	NC_022109	TAG	2	6	59573	59578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352335
1003	NC_022109	GCT	2	6	59586	59591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352335
1004	NC_022109	GTC	2	6	59612	59617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352335
1005	NC_022109	ATGG	2	8	59625	59632	25 %	25 %	50 %	0 %	532352335
1006	NC_022109	AGG	2	6	59659	59664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352335
1007	NC_022109	GA	3	6	59711	59716	50 %	0 %	50 %	0 %	532352335
1008	NC_022109	CAA	2	6	59734	59739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352335
1009	NC_022109	ATAA	2	8	59771	59778	75 %	25 %	0 %	0 %	532352335
1010	NC_022109	GAGCA	2	10	59811	59820	40 %	0 %	40 %	20 %	532352335
1011	NC_022109	GT	3	6	59849	59854	0 %	50 %	50 %	0 %	532352335
1012	NC_022109	TAG	2	6	59861	59866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352335
1013	NC_022109	AAG	2	6	60046	60051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352335
1014	NC_022109	CTC	2	6	60058	60063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352335
1015	NC_022109	AAC	2	6	60091	60096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352335
1016	NC_022109	T	7	7	60110	60116	0 %	100 %	0 %	0 %	532352335
1017	NC_022109	CTT	2	6	60160	60165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352335
1018	NC_022109	AAT	2	6	60190	60195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352335
1019	NC_022109	TTC	2	6	60201	60206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352335
1020	NC_022109	ATGT	2	8	60221	60228	25 %	50 %	25 %	0 %	532352335
1021	NC_022109	CATT	2	8	60250	60257	25 %	50 %	0 %	25 %	532352335
1022	NC_022109	ATG	2	6	60271	60276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352336
1023	NC_022109	CCT	2	6	60277	60282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352336
1024	NC_022109	AGT	2	6	60332	60337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352336
1025	NC_022109	TCT	2	6	60355	60360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352336
1026	NC_022109	TCA	2	6	60367	60372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352336
1027	NC_022109	TTC	2	6	60488	60493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352336
1028	NC_022109	CTTT	2	8	60523	60530	0 %	75 %	0 %	25 %	532352336
1029	NC_022109	TTCT	2	8	60546	60553	0 %	75 %	0 %	25 %	532352336
1030	NC_022109	TTC	2	6	60584	60589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352336
1031	NC_022109	TC	3	6	60596	60601	0 %	50 %	0 %	50 %	532352336
1032	NC_022109	T	6	6	60608	60613	0 %	100 %	0 %	0 %	532352336
1033	NC_022109	T	7	7	60668	60674	0 %	100 %	0 %	0 %	532352336
1034	NC_022109	CAGA	2	8	60782	60789	50 %	0 %	25 %	25 %	532353121
1035	NC_022109	GA	3	6	60824	60829	50 %	0 %	50 %	0 %	532353121
1036	NC_022109	TAA	2	6	60837	60842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353121
1037	NC_022109	TCA	2	6	61053	61058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352337
1038	NC_022109	TTC	2	6	61115	61120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1039	NC_022109	TCT	2	6	61179	61184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1040	NC_022109	A	6	6	61215	61220	100 %	0 %	0 %	0 %	532352337
1041	NC_022109	CA	3	6	61222	61227	50 %	0 %	0 %	50 %	532352337
1042	NC_022109	TGA	2	6	61234	61239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352337
1043	NC_022109	TTA	2	6	61247	61252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352337
1044	NC_022109	TCA	2	6	61287	61292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352337
1045	NC_022109	GAA	2	6	61293	61298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352337
1046	NC_022109	TCT	2	6	61299	61304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1047	NC_022109	AAG	2	6	61339	61344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352337
1048	NC_022109	CTT	2	6	61351	61356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1049	NC_022109	ATT	2	6	61361	61366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352337
1050	NC_022109	AT	3	6	61472	61477	50 %	50 %	0 %	0 %	532352337
1051	NC_022109	GA	3	6	61495	61500	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
1052	NC_022109	TTC	2	6	61522	61527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1053	NC_022109	GAA	2	6	61566	61571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352337
1054	NC_022109	GA	3	6	61621	61626	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
1055	NC_022109	ATG	2	6	61863	61868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352337
1056	NC_022109	TGT	2	6	61910	61915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352337
1057	NC_022109	AGC	2	6	61928	61933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352337
1058	NC_022109	AAT	2	6	62091	62096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352337
1059	NC_022109	ATG	2	6	62163	62168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352337
1060	NC_022109	TGTGA	2	10	62259	62268	20 %	40 %	40 %	0 %	532352337
1061	NC_022109	TGT	2	6	62280	62285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352337
1062	NC_022109	A	6	6	62361	62366	100 %	0 %	0 %	0 %	532352337
1063	NC_022109	ATT	2	6	62378	62383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352337
1064	NC_022109	CGA	2	6	62426	62431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352337
1065	NC_022109	GA	3	6	62436	62441	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
1066	NC_022109	A	6	6	62517	62522	100 %	0 %	0 %	0 %	532352337
1067	NC_022109	CTT	2	6	62559	62564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
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1069	NC_022109	TTA	2	6	62670	62675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352337
1070	NC_022109	CTT	2	6	62746	62751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1071	NC_022109	AAG	2	6	62758	62763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352337
1072	NC_022109	TC	3	6	62857	62862	0 %	50 %	0 %	50 %	532352337
1073	NC_022109	CAA	2	6	62958	62963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352337
1074	NC_022109	AT	3	6	63038	63043	50 %	50 %	0 %	0 %	532352337
1075	NC_022109	TTC	2	6	63044	63049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352337
1076	NC_022109	GTT	2	6	63183	63188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352337
1077	NC_022109	CTTC	2	8	63189	63196	0 %	50 %	0 %	50 %	532352337
1078	NC_022109	AG	3	6	63238	63243	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
1079	NC_022109	CT	4	8	63246	63253	0 %	50 %	0 %	50 %	532352337
1080	NC_022109	T	6	6	63265	63270	0 %	100 %	0 %	0 %	532352337
1081	NC_022109	GTTCTT	2	12	63384	63395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352337
1082	NC_022109	TTA	2	6	63410	63415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352337
1083	NC_022109	AG	3	6	63473	63478	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
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1085	NC_022109	TATG	2	8	63543	63550	25 %	50 %	25 %	0 %	532352337
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1089	NC_022109	AGTGA	2	10	63786	63795	40 %	20 %	40 %	0 %	532352338
1090	NC_022109	AG	3	6	63860	63865	50 %	0 %	50 %	0 %	532352338
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1092	NC_022109	ATT	2	6	64053	64058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352338
1093	NC_022109	CCTTC	2	10	64060	64069	0 %	40 %	0 %	60 %	532352338
1094	NC_022109	TCC	2	6	64085	64090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352338
1095	NC_022109	CTT	2	6	64135	64140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352338
1096	NC_022109	AAG	2	6	64288	64293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352338
1097	NC_022109	TCTT	2	8	64332	64339	0 %	75 %	0 %	25 %	532352338
1098	NC_022109	A	6	6	64365	64370	100 %	0 %	0 %	0 %	532352338
1099	NC_022109	TAC	2	6	64422	64427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352338
1100	NC_022109	TAG	2	6	64462	64467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352338
1101	NC_022109	TCT	2	6	64619	64624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352338
1102	NC_022109	AGGT	2	8	64651	64658	25 %	25 %	50 %	0 %	532352338
1103	NC_022109	AGA	2	6	64700	64705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352338
1104	NC_022109	ATG	2	6	64725	64730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352338
1105	NC_022109	ATC	2	6	64750	64755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352338
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1107	NC_022109	GAA	4	12	64878	64889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352339
1108	NC_022109	ATT	2	6	64900	64905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352339
1109	NC_022109	T	6	6	64904	64909	0 %	100 %	0 %	0 %	532352339
1110	NC_022109	CTG	2	6	64933	64938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352339
1111	NC_022109	GTT	2	6	65043	65048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352339
1112	NC_022109	A	6	6	65099	65104	100 %	0 %	0 %	0 %	532352339
1113	NC_022109	AG	3	6	65156	65161	50 %	0 %	50 %	0 %	532352339
1114	NC_022109	CAG	2	6	65212	65217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352339
1115	NC_022109	GCT	2	6	65309	65314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352339
1116	NC_022109	GA	3	6	65342	65347	50 %	0 %	50 %	0 %	532352339
1117	NC_022109	AGA	3	9	65345	65353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352339
1118	NC_022109	CT	3	6	65382	65387	0 %	50 %	0 %	50 %	532352339
1119	NC_022109	CCT	2	6	65454	65459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352339
1120	NC_022109	TCA	2	6	65478	65483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352339
1121	NC_022109	CTT	2	6	65497	65502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352339
1122	NC_022109	ATC	2	6	65507	65512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352339
1123	NC_022109	TCA	2	6	65596	65601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352339
1124	NC_022109	TTC	3	9	65656	65664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352340
1125	NC_022109	CCT	2	6	65813	65818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352340
1126	NC_022109	A	6	6	65945	65950	100 %	0 %	0 %	0 %	532352340
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1128	NC_022109	TAG	2	6	65986	65991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352340
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