MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 20343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022109	AG	3	6	235231	235236	50 %	0 %	50 %	0 %	532352474
4502	NC_022109	GTT	2	6	235307	235312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352474
4503	NC_022109	GTA	2	6	235328	235333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352474
4504	NC_022109	TTCC	2	8	235360	235367	0 %	50 %	0 %	50 %	532352474
4505	NC_022109	A	6	6	235378	235383	100 %	0 %	0 %	0 %	532352474
4506	NC_022109	A	6	6	235462	235467	100 %	0 %	0 %	0 %	532352474
4507	NC_022109	TAA	2	6	235532	235537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352474
4508	NC_022109	ACG	2	6	235593	235598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352474
4509	NC_022109	AAC	2	6	235632	235637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352474
4510	NC_022109	TC	3	6	235660	235665	0 %	50 %	0 %	50 %	532352474
4511	NC_022109	AAG	2	6	235674	235679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352474
4512	NC_022109	GACT	2	8	235691	235698	25 %	25 %	25 %	25 %	532352474
4513	NC_022109	AT	3	6	235789	235794	50 %	50 %	0 %	0 %	532352474
4514	NC_022109	A	6	6	235817	235822	100 %	0 %	0 %	0 %	532352474
4515	NC_022109	A	7	7	235839	235845	100 %	0 %	0 %	0 %	532352474
4516	NC_022109	CAT	2	6	235862	235867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352474
4517	NC_022109	ACA	2	6	235899	235904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352474
4518	NC_022109	TTCAC	2	10	235941	235950	20 %	40 %	0 %	40 %	532352475
4519	NC_022109	CTT	3	9	235996	236004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4520	NC_022109	ATA	2	6	236019	236024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352475
4521	NC_022109	CTGT	2	8	236071	236078	0 %	50 %	25 %	25 %	532352475
4522	NC_022109	AAC	2	6	236142	236147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352475
4523	NC_022109	AGA	2	6	236375	236380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352475
4524	NC_022109	TCT	2	6	236610	236615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4525	NC_022109	AT	5	10	236630	236639	50 %	50 %	0 %	0 %	532352475
4526	NC_022109	TTGA	2	8	236681	236688	25 %	50 %	25 %	0 %	532352475
4527	NC_022109	CTT	2	6	236693	236698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4528	NC_022109	AAGT	2	8	236762	236769	50 %	25 %	25 %	0 %	532352475
4529	NC_022109	TTCCTT	2	12	236825	236836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4530	NC_022109	GAC	2	6	237064	237069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352475
4531	NC_022109	C	6	6	237106	237111	0 %	0 %	0 %	100 %	532352475
4532	NC_022109	TGC	2	6	237161	237166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352475
4533	NC_022109	GAT	2	6	237172	237177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352475
4534	NC_022109	TCT	2	6	237180	237185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4535	NC_022109	CTT	2	6	237211	237216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4536	NC_022109	ATCC	2	8	237226	237233	25 %	25 %	0 %	50 %	532352475
4537	NC_022109	CTT	2	6	237271	237276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4538	NC_022109	TCA	2	6	237543	237548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352475
4539	NC_022109	GAG	2	6	237554	237559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352475
4540	NC_022109	A	6	6	237591	237596	100 %	0 %	0 %	0 %	532352475
4541	NC_022109	TTG	2	6	237622	237627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352475
4542	NC_022109	TTC	2	6	237696	237701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4543	NC_022109	GCA	2	6	237778	237783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352475
4544	NC_022109	C	6	6	237818	237823	0 %	0 %	0 %	100 %	532352475
4545	NC_022109	A	7	7	237936	237942	100 %	0 %	0 %	0 %	532352475
4546	NC_022109	TCG	2	6	237996	238001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352475
4547	NC_022109	TC	3	6	238060	238065	0 %	50 %	0 %	50 %	532352475
4548	NC_022109	GT	3	6	238070	238075	0 %	50 %	50 %	0 %	532352475
4549	NC_022109	TCC	2	6	238275	238280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352475
4550	NC_022109	TCT	2	6	238326	238331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
4551	NC_022109	TGT	2	6	238366	238371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352475
4552	NC_022109	CAT	2	6	238481	238486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352476
4553	NC_022109	T	8	8	238488	238495	0 %	100 %	0 %	0 %	532352476
4554	NC_022109	AGG	2	6	238589	238594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352476
4555	NC_022109	CTC	2	6	238636	238641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352476
4556	NC_022109	TAG	2	6	238645	238650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352476
4557	NC_022109	GAA	2	6	238830	238835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352476
4558	NC_022109	T	6	6	238837	238842	0 %	100 %	0 %	0 %	532352476
4559	NC_022109	CTG	2	6	238909	238914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352476
4560	NC_022109	GAC	2	6	238939	238944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352476
4561	NC_022109	TAT	2	6	238946	238951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352476
4562	NC_022109	TTC	2	6	238993	238998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352476
4563	NC_022109	CT	4	8	239058	239065	0 %	50 %	0 %	50 %	532352476
4564	NC_022109	CAG	2	6	239211	239216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352476
4565	NC_022109	CAG	2	6	239350	239355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352476
4566	NC_022109	AC	3	6	239491	239496	50 %	0 %	0 %	50 %	532352476
4567	NC_022109	TCTCCT	2	12	239706	239717	0 %	50 %	0 %	50 %	532352476
4568	NC_022109	TCTTT	2	10	239803	239812	0 %	80 %	0 %	20 %	532352476
4569	NC_022109	TAG	3	9	239817	239825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352476
4570	NC_022109	TTCT	2	8	239891	239898	0 %	75 %	0 %	25 %	532352477
4571	NC_022109	AAT	2	6	239913	239918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352477
4572	NC_022109	CT	3	6	239950	239955	0 %	50 %	0 %	50 %	532352477
4573	NC_022109	GTC	2	6	240018	240023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352477
4574	NC_022109	TCC	2	6	240063	240068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352477
4575	NC_022109	ACGG	2	8	240076	240083	25 %	0 %	50 %	25 %	532352477
4576	NC_022109	AGA	2	6	240096	240101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352477
4577	NC_022109	CAA	2	6	240126	240131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352477
4578	NC_022109	TCA	2	6	240184	240189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352477
4579	NC_022109	TCT	2	6	240211	240216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352477
4580	NC_022109	AAACCA	2	12	240281	240292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352477
4581	NC_022109	A	6	6	240302	240307	100 %	0 %	0 %	0 %	532352477
4582	NC_022109	AATCT	2	10	240397	240406	40 %	40 %	0 %	20 %	532352477
4583	NC_022109	TCA	2	6	240422	240427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352478
4584	NC_022109	CA	3	6	240439	240444	50 %	0 %	0 %	50 %	532352478
4585	NC_022109	ACT	2	6	240587	240592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352478
4586	NC_022109	AGAT	2	8	240601	240608	50 %	25 %	25 %	0 %	532352478
4587	NC_022109	CTT	2	6	240663	240668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352478
4588	NC_022109	CTG	2	6	240669	240674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352478
4589	NC_022109	T	6	6	240688	240693	0 %	100 %	0 %	0 %	532352478
4590	NC_022109	AAT	2	6	240754	240759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352478
4591	NC_022109	ATTA	2	8	240796	240803	50 %	50 %	0 %	0 %	532352478
4592	NC_022109	T	7	7	240854	240860	0 %	100 %	0 %	0 %	532352478
4593	NC_022109	AAT	2	6	240926	240931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352479
4594	NC_022109	TC	3	6	241050	241055	0 %	50 %	0 %	50 %	532352479
4595	NC_022109	AGA	2	6	241097	241102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352479
4596	NC_022109	CTA	2	6	241171	241176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352479
4597	NC_022109	GAA	3	9	241201	241209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352479
4598	NC_022109	T	6	6	241210	241215	0 %	100 %	0 %	0 %	532352479
4599	NC_022109	CTC	2	6	241234	241239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352479
4600	NC_022109	TCCA	2	8	241277	241284	25 %	25 %	0 %	50 %	532352479
4601	NC_022109	CT	3	6	241430	241435	0 %	50 %	0 %	50 %	532352479
4602	NC_022109	CA	4	8	241460	241467	50 %	0 %	0 %	50 %	532352479
4603	NC_022109	CCA	2	6	241477	241482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352479
4604	NC_022109	GAA	2	6	241533	241538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352479
4605	NC_022109	GTT	2	6	241552	241557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352479
4606	NC_022109	TTAA	2	8	241687	241694	50 %	50 %	0 %	0 %	532352480
4607	NC_022109	CT	3	6	241709	241714	0 %	50 %	0 %	50 %	532352480
4608	NC_022109	TAG	2	6	241748	241753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352480
4609	NC_022109	CTC	2	6	241784	241789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352480
4610	NC_022109	TAA	2	6	241803	241808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352480
4611	NC_022109	AG	3	6	241815	241820	50 %	0 %	50 %	0 %	532352480
4612	NC_022109	T	8	8	241836	241843	0 %	100 %	0 %	0 %	532352480
4613	NC_022109	TGA	2	6	241845	241850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352480
4614	NC_022109	TCT	2	6	241871	241876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352480
4615	NC_022109	AAG	2	6	241895	241900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352480
4616	NC_022109	TAA	2	6	241970	241975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352480
4617	NC_022109	AGA	2	6	242013	242018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352480
4618	NC_022109	CAAT	2	8	242027	242034	50 %	25 %	0 %	25 %	532352480
4619	NC_022109	CAA	2	6	242073	242078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352480
4620	NC_022109	ACA	2	6	242154	242159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352480
4621	NC_022109	ACAA	2	8	242180	242187	75 %	0 %	0 %	25 %	532352480
4622	NC_022109	CTT	2	6	242192	242197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352480
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4624	NC_022109	ACT	2	6	242280	242285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352480
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4871	NC_022109	TCC	2	6	253837	253842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352493
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4874	NC_022109	A	6	6	253914	253919	100 %	0 %	0 %	0 %	532352493
4875	NC_022109	AGA	2	6	253925	253930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352493
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4887	NC_022109	A	6	6	254617	254622	100 %	0 %	0 %	0 %	532352494
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4992	NC_022109	CAA	2	6	260128	260133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352500
4993	NC_022109	TGCAA	2	10	260139	260148	40 %	20 %	20 %	20 %	532352500
4994	NC_022109	AAC	2	6	260149	260154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352500
4995	NC_022109	A	6	6	260191	260196	100 %	0 %	0 %	0 %	532352500
4996	NC_022109	TGC	2	6	260265	260270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352500
4997	NC_022109	TTC	2	6	260324	260329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352500
4998	NC_022109	TTGT	2	8	260339	260346	0 %	75 %	25 %	0 %	532352500
4999	NC_022109	CTGG	2	8	260347	260354	0 %	25 %	50 %	25 %	532352500
5000	NC_022109	TTG	2	6	260406	260411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352500

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