MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 12673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351364
2	NC_022108	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351364
3	NC_022108	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351364
4	NC_022108	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351364
5	NC_022108	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351364
6	NC_022108	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351364
7	NC_022108	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351364
8	NC_022108	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351364
9	NC_022108	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351364
10	NC_022108	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351365
11	NC_022108	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351365
12	NC_022108	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351365
13	NC_022108	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351365
14	NC_022108	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351365
15	NC_022108	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351365
16	NC_022108	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351365
17	NC_022108	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351366
18	NC_022108	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351366
19	NC_022108	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351366
20	NC_022108	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351366
21	NC_022108	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351366
22	NC_022108	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351366
23	NC_022108	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351366
24	NC_022108	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351366
25	NC_022108	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351366
26	NC_022108	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351366
27	NC_022108	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351366
28	NC_022108	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351366
29	NC_022108	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351366
30	NC_022108	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351366
31	NC_022108	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351366
32	NC_022108	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351366
33	NC_022108	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351366
34	NC_022108	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351366
35	NC_022108	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351366
36	NC_022108	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351366
37	NC_022108	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351366
38	NC_022108	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351366
39	NC_022108	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351367
40	NC_022108	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351367
41	NC_022108	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351367
42	NC_022108	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351367
43	NC_022108	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351367
44	NC_022108	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351367
45	NC_022108	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351367
46	NC_022108	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351367
47	NC_022108	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351367
48	NC_022108	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351367
49	NC_022108	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351367
50	NC_022108	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351367
51	NC_022108	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351367
52	NC_022108	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351367
53	NC_022108	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351367
54	NC_022108	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351367
55	NC_022108	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351368
56	NC_022108	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351368
57	NC_022108	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351368
58	NC_022108	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351368
59	NC_022108	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351368
60	NC_022108	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351368
61	NC_022108	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351368
62	NC_022108	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351368
63	NC_022108	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351368
64	NC_022108	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351368
65	NC_022108	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351368
66	NC_022108	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351368
67	NC_022108	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351368
68	NC_022108	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351368
69	NC_022108	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351368
70	NC_022108	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351368
71	NC_022108	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351368
72	NC_022108	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351368
73	NC_022108	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351369
74	NC_022108	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351369
75	NC_022108	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351369
76	NC_022108	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351369
77	NC_022108	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351369
78	NC_022108	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352196
79	NC_022108	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352196
80	NC_022108	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351370
81	NC_022108	TCC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351370
82	NC_022108	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351370
83	NC_022108	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351370
84	NC_022108	TTC	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351370
85	NC_022108	GAA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351371
86	NC_022108	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351371
87	NC_022108	CTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351371
88	NC_022108	GAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351371
89	NC_022108	ATA	2	6	8580	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351371
90	NC_022108	AGG	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351371
91	NC_022108	GAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351371
92	NC_022108	CAG	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351371
93	NC_022108	TGT	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351371
94	NC_022108	GAG	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351371
95	NC_022108	TAC	2	6	8954	8959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351371
96	NC_022108	GTT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351371
97	NC_022108	AAG	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351371
98	NC_022108	GAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351371
99	NC_022108	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351372
100	NC_022108	AGA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351372
101	NC_022108	TGC	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351372
102	NC_022108	GAA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351372
103	NC_022108	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351372
104	NC_022108	TGG	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351372
105	NC_022108	GTA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351373
106	NC_022108	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351373
107	NC_022108	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351373
108	NC_022108	ATG	2	6	10157	10162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351373
109	NC_022108	CGT	2	6	10184	10189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351373
110	NC_022108	GAC	2	6	10354	10359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351373
111	NC_022108	GGT	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351373
112	NC_022108	GAA	2	6	10487	10492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351373
113	NC_022108	CAA	2	6	10509	10514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351373
114	NC_022108	GGA	2	6	10571	10576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351373
115	NC_022108	CGA	2	6	10628	10633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351373
116	NC_022108	CTT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351373
117	NC_022108	TTG	2	6	10774	10779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351373
118	NC_022108	CTT	2	6	10788	10793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351373
119	NC_022108	ATC	2	6	10898	10903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351373
120	NC_022108	TGT	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351373
121	NC_022108	AGA	2	6	11010	11015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351373
122	NC_022108	AGG	2	6	11049	11054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351373
123	NC_022108	GAT	2	6	11109	11114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351373
124	NC_022108	CGA	2	6	11115	11120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351373
125	NC_022108	AAT	2	6	11328	11333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351374
126	NC_022108	AGG	2	6	11571	11576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351374
127	NC_022108	ATA	3	9	11581	11589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351374
128	NC_022108	TAT	2	6	11600	11605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351374
129	NC_022108	ACA	2	6	11611	11616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351374
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258	NC_022108	TAA	2	6	24311	24316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351382
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262	NC_022108	TAA	2	6	24876	24881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351383
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500	NC_022108	TGT	2	6	46058	46063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351405

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