MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022108	CTC	2	6	128489	128494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351467
2502	NC_022108	TTC	2	6	128671	128676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2503	NC_022108	TGA	2	6	128719	128724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351468
2504	NC_022108	ATCCA	2	10	128731	128740	40 %	20 %	0 %	40 %	532351468
2505	NC_022108	T	6	6	128743	128748	0 %	100 %	0 %	0 %	532351468
2506	NC_022108	CCG	2	6	128774	128779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351468
2507	NC_022108	CTT	2	6	128802	128807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2508	NC_022108	CTT	2	6	128814	128819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2509	NC_022108	AGAA	2	8	128824	128831	75 %	0 %	25 %	0 %	532351468
2510	NC_022108	GTA	2	6	128893	128898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351468
2511	NC_022108	TCA	2	6	128936	128941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351468
2512	NC_022108	TTC	2	6	129001	129006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2513	NC_022108	AGC	2	6	129055	129060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351468
2514	NC_022108	AG	3	6	129101	129106	50 %	0 %	50 %	0 %	532351468
2515	NC_022108	TCT	2	6	129123	129128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2516	NC_022108	CTT	2	6	129129	129134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2517	NC_022108	ACC	2	6	129271	129276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351468
2518	NC_022108	CGT	2	6	129297	129302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351468
2519	NC_022108	GAA	2	6	129324	129329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351468
2520	NC_022108	CATC	2	8	129404	129411	25 %	25 %	0 %	50 %	532351468
2521	NC_022108	CTT	2	6	129489	129494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2522	NC_022108	AAT	2	6	129501	129506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351468
2523	NC_022108	CAT	2	6	129543	129548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351468
2524	NC_022108	GA	3	6	129563	129568	50 %	0 %	50 %	0 %	532351468
2525	NC_022108	GT	5	10	129610	129619	0 %	50 %	50 %	0 %	532351468
2526	NC_022108	TGC	2	6	129679	129684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351468
2527	NC_022108	GA	3	6	129760	129765	50 %	0 %	50 %	0 %	532351468
2528	NC_022108	AGA	2	6	129967	129972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351468
2529	NC_022108	T	6	6	129981	129986	0 %	100 %	0 %	0 %	532351468
2530	NC_022108	TG	4	8	130003	130010	0 %	50 %	50 %	0 %	532351468
2531	NC_022108	T	6	6	130027	130032	0 %	100 %	0 %	0 %	532351468
2532	NC_022108	GAGG	2	8	130092	130099	25 %	0 %	75 %	0 %	532351468
2533	NC_022108	ATG	2	6	130140	130145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351468
2534	NC_022108	AAG	2	6	130151	130156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351468
2535	NC_022108	CTT	2	6	130182	130187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351468
2536	NC_022108	TCA	2	6	130202	130207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351468
2537	NC_022108	AGC	2	6	130270	130275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351468
2538	NC_022108	GAAGA	2	10	130280	130289	60 %	0 %	40 %	0 %	532351468
2539	NC_022108	GTT	2	6	130292	130297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351468
2540	NC_022108	T	7	7	130356	130362	0 %	100 %	0 %	0 %	532351468
2541	NC_022108	CAG	2	6	130411	130416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351468
2542	NC_022108	AGT	2	6	130461	130466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351468
2543	NC_022108	TC	3	6	130482	130487	0 %	50 %	0 %	50 %	532351468
2544	NC_022108	ATC	2	6	130522	130527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352208
2545	NC_022108	AG	3	6	130559	130564	50 %	0 %	50 %	0 %	532352208
2546	NC_022108	AG	3	6	130584	130589	50 %	0 %	50 %	0 %	532352208
2547	NC_022108	T	6	6	130621	130626	0 %	100 %	0 %	0 %	532352208
2548	NC_022108	TTTG	2	8	130911	130918	0 %	75 %	25 %	0 %	532351469
2549	NC_022108	CTG	2	6	130959	130964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351469
2550	NC_022108	GAC	2	6	130967	130972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351469
2551	NC_022108	CAG	2	6	131036	131041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351469
2552	NC_022108	TTG	2	6	131042	131047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351469
2553	NC_022108	AAG	2	6	131061	131066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2554	NC_022108	CTT	2	6	131145	131150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351469
2555	NC_022108	AATT	2	8	131190	131197	50 %	50 %	0 %	0 %	532351469
2556	NC_022108	GAA	2	6	131240	131245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2557	NC_022108	TTCT	2	8	131355	131362	0 %	75 %	0 %	25 %	532351469
2558	NC_022108	AAT	2	6	131375	131380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351469
2559	NC_022108	AG	3	6	131464	131469	50 %	0 %	50 %	0 %	532351469
2560	NC_022108	TGTA	2	8	131487	131494	25 %	50 %	25 %	0 %	532351469
2561	NC_022108	GAG	2	6	131532	131537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351469
2562	NC_022108	TGA	2	6	131608	131613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2563	NC_022108	TAG	2	6	131625	131630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2564	NC_022108	TGAA	2	8	131724	131731	50 %	25 %	25 %	0 %	532351469
2565	NC_022108	AT	3	6	131740	131745	50 %	50 %	0 %	0 %	532351469
2566	NC_022108	CTT	2	6	131799	131804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351469
2567	NC_022108	ATTC	2	8	131818	131825	25 %	50 %	0 %	25 %	532351469
2568	NC_022108	TTCT	2	8	131901	131908	0 %	75 %	0 %	25 %	532351469
2569	NC_022108	TTC	2	6	131931	131936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351469
2570	NC_022108	TGA	2	6	131959	131964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2571	NC_022108	TGA	2	6	132013	132018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2572	NC_022108	AAG	2	6	132054	132059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2573	NC_022108	AGCA	2	8	132072	132079	50 %	0 %	25 %	25 %	532351469
2574	NC_022108	GAA	2	6	132167	132172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2575	NC_022108	AAAAG	2	10	132193	132202	80 %	0 %	20 %	0 %	532351469
2576	NC_022108	CTT	2	6	132297	132302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351469
2577	NC_022108	GGA	2	6	132304	132309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351469
2578	NC_022108	TGA	2	6	132373	132378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2579	NC_022108	GTT	2	6	132395	132400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351469
2580	NC_022108	A	6	6	132426	132431	100 %	0 %	0 %	0 %	532351469
2581	NC_022108	GGAG	2	8	132436	132443	25 %	0 %	75 %	0 %	532351469
2582	NC_022108	GGA	2	6	132466	132471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351469
2583	NC_022108	AGA	2	6	132478	132483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2584	NC_022108	CAGT	2	8	132516	132523	25 %	25 %	25 %	25 %	532351469
2585	NC_022108	GATTC	2	10	132524	132533	20 %	40 %	20 %	20 %	532351469
2586	NC_022108	GCT	2	6	132536	132541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351469
2587	NC_022108	TAA	2	6	132649	132654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351469
2588	NC_022108	GAA	2	6	132656	132661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2589	NC_022108	GAT	2	6	132664	132669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2590	NC_022108	AT	3	6	132688	132693	50 %	50 %	0 %	0 %	532351469
2591	NC_022108	TCC	2	6	132727	132732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351469
2592	NC_022108	GAA	2	6	132749	132754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2593	NC_022108	GGAG	2	8	132755	132762	25 %	0 %	75 %	0 %	532351469
2594	NC_022108	TC	3	6	132763	132768	0 %	50 %	0 %	50 %	532351469
2595	NC_022108	AAG	2	6	132778	132783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2596	NC_022108	TGT	2	6	132796	132801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351469
2597	NC_022108	TGA	2	6	132808	132813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2598	NC_022108	AAG	2	6	132831	132836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2599	NC_022108	TGA	2	6	132862	132867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2600	NC_022108	AAG	2	6	132887	132892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2601	NC_022108	ATT	2	6	132960	132965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351469
2602	NC_022108	AAG	2	6	132993	132998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351469
2603	NC_022108	TGT	2	6	133009	133014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351469
2604	NC_022108	ATT	2	6	133032	133037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351469
2605	NC_022108	GAAA	2	8	133154	133161	75 %	0 %	25 %	0 %	532351469
2606	NC_022108	GAT	2	6	133178	133183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2607	NC_022108	AGT	2	6	133264	133269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351469
2608	NC_022108	TGT	2	6	133275	133280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351469
2609	NC_022108	TTAAAA	2	12	133356	133367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351469
2610	NC_022108	TG	3	6	133391	133396	0 %	50 %	50 %	0 %	532351469
2611	NC_022108	TCT	2	6	133433	133438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351470
2612	NC_022108	ACCG	2	8	133442	133449	25 %	0 %	25 %	50 %	532351470
2613	NC_022108	GCGA	2	8	133454	133461	25 %	0 %	50 %	25 %	532351470
2614	NC_022108	CAA	2	6	133503	133508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351470
2615	NC_022108	AGA	2	6	133619	133624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351470
2616	NC_022108	GGA	2	6	133691	133696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351470
2617	NC_022108	GAT	2	6	133752	133757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351470
2618	NC_022108	AG	3	6	133860	133865	50 %	0 %	50 %	0 %	532351470
2619	NC_022108	TGC	2	6	133877	133882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351470
2620	NC_022108	GAA	2	6	133947	133952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351470
2621	NC_022108	GCT	2	6	134007	134012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351470
2622	NC_022108	CCT	2	6	134106	134111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351470
2623	NC_022108	TTAC	2	8	134120	134127	25 %	50 %	0 %	25 %	532351470
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2626	NC_022108	TTC	2	6	134296	134301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351470
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2640	NC_022108	CT	3	6	134821	134826	0 %	50 %	0 %	50 %	532351470
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2748	NC_022108	ATT	2	6	140107	140112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351479
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2751	NC_022108	GCA	2	6	140224	140229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351479
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2753	NC_022108	GCT	2	6	140260	140265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351479
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2763	NC_022108	CTG	2	6	141149	141154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351479
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2858	NC_022108	ATG	2	6	145873	145878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351486
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2995	NC_022108	AACG	2	8	152546	152553	50 %	0 %	25 %	25 %	532351490
2996	NC_022108	TGA	3	9	152667	152675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351490
2997	NC_022108	TGTT	2	8	152715	152722	0 %	75 %	25 %	0 %	532351490
2998	NC_022108	CTGTG	2	10	152734	152743	0 %	40 %	40 %	20 %	532351490
2999	NC_022108	AGC	2	6	152812	152817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351490
3000	NC_022108	TAT	2	6	152860	152865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351490

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