MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022108	AGG	2	6	103630	103635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351449
2002	NC_022108	TCC	2	6	103639	103644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351449
2003	NC_022108	AGG	2	6	103645	103650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351449
2004	NC_022108	GTTT	2	8	103733	103740	0 %	75 %	25 %	0 %	532351449
2005	NC_022108	ATC	2	6	103754	103759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351449
2006	NC_022108	GA	3	6	103809	103814	50 %	0 %	50 %	0 %	532351449
2007	NC_022108	AGTA	2	8	103858	103865	50 %	25 %	25 %	0 %	532351449
2008	NC_022108	GGAA	2	8	104019	104026	50 %	0 %	50 %	0 %	532351449
2009	NC_022108	GAA	2	6	104092	104097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351449
2010	NC_022108	GAA	2	6	104109	104114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351449
2011	NC_022108	GCA	2	6	104204	104209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351449
2012	NC_022108	GTAA	2	8	104215	104222	50 %	25 %	25 %	0 %	532351449
2013	NC_022108	TCT	2	6	104252	104257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351449
2014	NC_022108	TGG	2	6	104281	104286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351449
2015	NC_022108	CAG	2	6	104317	104322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351449
2016	NC_022108	AAGG	2	8	104345	104352	50 %	0 %	50 %	0 %	532351449
2017	NC_022108	GTAC	2	8	104360	104367	25 %	25 %	25 %	25 %	532351449
2018	NC_022108	AG	3	6	104403	104408	50 %	0 %	50 %	0 %	532351449
2019	NC_022108	ATCAT	2	10	104426	104435	40 %	40 %	0 %	20 %	532351449
2020	NC_022108	GTT	2	6	104463	104468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351449
2021	NC_022108	ATC	2	6	104527	104532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351449
2022	NC_022108	GTA	3	9	104576	104584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351449
2023	NC_022108	T	6	6	104599	104604	0 %	100 %	0 %	0 %	532351449
2024	NC_022108	GAA	2	6	104695	104700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351449
2025	NC_022108	AG	3	6	104843	104848	50 %	0 %	50 %	0 %	532351449
2026	NC_022108	TCC	2	6	104947	104952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351449
2027	NC_022108	CTTT	2	8	105041	105048	0 %	75 %	0 %	25 %	532351449
2028	NC_022108	ATCA	2	8	105085	105092	50 %	25 %	0 %	25 %	532351449
2029	NC_022108	GGCAT	2	10	105134	105143	20 %	20 %	40 %	20 %	532351449
2030	NC_022108	AGC	2	6	105157	105162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351449
2031	NC_022108	ATG	2	6	105209	105214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351449
2032	NC_022108	TGA	2	6	105216	105221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351449
2033	NC_022108	ATA	2	6	105230	105235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351449
2034	NC_022108	TCC	2	6	105253	105258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351449
2035	NC_022108	ACG	2	6	105260	105265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351449
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2037	NC_022108	AGG	2	6	105372	105377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351449
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2040	NC_022108	ATC	2	6	105497	105502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351449
2041	NC_022108	AGC	2	6	105748	105753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351450
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2043	NC_022108	CGT	2	6	105982	105987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351450
2044	NC_022108	TA	3	6	106142	106147	50 %	50 %	0 %	0 %	532351450
2045	NC_022108	AGG	2	6	106179	106184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351450
2046	NC_022108	T	6	6	106219	106224	0 %	100 %	0 %	0 %	532351450
2047	NC_022108	AGC	2	6	106245	106250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351450
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2049	NC_022108	CAA	2	6	106398	106403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351450
2050	NC_022108	AG	3	6	106435	106440	50 %	0 %	50 %	0 %	532351450
2051	NC_022108	TCAGAA	2	12	106445	106456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351450
2052	NC_022108	T	6	6	106465	106470	0 %	100 %	0 %	0 %	532351450
2053	NC_022108	ATA	2	6	106473	106478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351450
2054	NC_022108	A	6	6	106554	106559	100 %	0 %	0 %	0 %	532351450
2055	NC_022108	T	6	6	106642	106647	0 %	100 %	0 %	0 %	532351450
2056	NC_022108	T	6	6	106685	106690	0 %	100 %	0 %	0 %	532351450
2057	NC_022108	AAGA	2	8	106764	106771	75 %	0 %	25 %	0 %	532352204
2058	NC_022108	T	8	8	106834	106841	0 %	100 %	0 %	0 %	532352204
2059	NC_022108	TAG	2	6	106982	106987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351451
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2062	NC_022108	TCAG	2	8	107132	107139	25 %	25 %	25 %	25 %	532351451
2063	NC_022108	AGC	2	6	107199	107204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351451
2064	NC_022108	T	6	6	107229	107234	0 %	100 %	0 %	0 %	532351451
2065	NC_022108	GA	3	6	107246	107251	50 %	0 %	50 %	0 %	532351451
2066	NC_022108	TGT	2	6	107268	107273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351451
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2070	NC_022108	GA	3	6	107393	107398	50 %	0 %	50 %	0 %	532351451
2071	NC_022108	A	6	6	107422	107427	100 %	0 %	0 %	0 %	532351451
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2073	NC_022108	TGA	2	6	107583	107588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351451
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2086	NC_022108	GATT	2	8	108353	108360	25 %	50 %	25 %	0 %	532351452
2087	NC_022108	TCTT	2	8	108457	108464	0 %	75 %	0 %	25 %	532351452
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2091	NC_022108	CAGC	2	8	108730	108737	25 %	0 %	25 %	50 %	532351452
2092	NC_022108	CTC	2	6	108753	108758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351452
2093	NC_022108	AG	3	6	108760	108765	50 %	0 %	50 %	0 %	532351452
2094	NC_022108	GGA	2	6	108778	108783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351452
2095	NC_022108	GCTG	2	8	108809	108816	0 %	25 %	50 %	25 %	532351452
2096	NC_022108	A	6	6	108853	108858	100 %	0 %	0 %	0 %	532351452
2097	NC_022108	AAAGC	2	10	108860	108869	60 %	0 %	20 %	20 %	532351452
2098	NC_022108	A	6	6	108895	108900	100 %	0 %	0 %	0 %	532351452
2099	NC_022108	TTC	2	6	109063	109068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352205
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2101	NC_022108	TGC	2	6	109134	109139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352205
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2104	NC_022108	CTTT	2	8	109266	109273	0 %	75 %	0 %	25 %	532352205
2105	NC_022108	AGG	2	6	109285	109290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352205
2106	NC_022108	TTG	2	6	109294	109299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352205
2107	NC_022108	T	6	6	109354	109359	0 %	100 %	0 %	0 %	532352205
2108	NC_022108	CAA	2	6	109368	109373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352205
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2111	NC_022108	CATAAC	2	12	109489	109500	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352205
2112	NC_022108	T	7	7	109539	109545	0 %	100 %	0 %	0 %	532352205
2113	NC_022108	AAG	2	6	109584	109589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352205
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2115	NC_022108	T	7	7	109699	109705	0 %	100 %	0 %	0 %	532351453
2116	NC_022108	AGA	2	6	109728	109733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351453
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2118	NC_022108	TCT	2	6	109866	109871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351453
2119	NC_022108	TC	3	6	109923	109928	0 %	50 %	0 %	50 %	532351453
2120	NC_022108	GCATT	2	10	110020	110029	20 %	40 %	20 %	20 %	532351453
2121	NC_022108	TTC	2	6	110041	110046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351453
2122	NC_022108	AT	3	6	110107	110112	50 %	50 %	0 %	0 %	532351454
2123	NC_022108	TGCT	2	8	110123	110130	0 %	50 %	25 %	25 %	532351454
2124	NC_022108	T	6	6	110165	110170	0 %	100 %	0 %	0 %	532351454
2125	NC_022108	CCT	2	6	110173	110178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351454
2126	NC_022108	ATA	2	6	110244	110249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351454
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2128	NC_022108	TCT	2	6	110361	110366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351454
2129	NC_022108	GAT	2	6	110423	110428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351454
2130	NC_022108	TG	3	6	110492	110497	0 %	50 %	50 %	0 %	532351454
2131	NC_022108	T	6	6	110711	110716	0 %	100 %	0 %	0 %	532351454
2132	NC_022108	TTG	2	6	110735	110740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351454
2133	NC_022108	TAA	2	6	110758	110763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351454
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2135	NC_022108	TCA	2	6	110886	110891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351454
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2137	NC_022108	TAG	2	6	111130	111135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351454
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2144	NC_022108	CAT	2	6	111703	111708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351454
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2212	NC_022108	T	6	6	114556	114561	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2213	NC_022108	CTG	2	6	114651	114656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351455
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2216	NC_022108	GA	4	8	114727	114734	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2217	NC_022108	AGAA	2	8	114757	114764	75 %	0 %	25 %	0 %	532351455
2218	NC_022108	ACT	2	6	114767	114772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
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2223	NC_022108	GGA	2	6	114932	114937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351455
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2226	NC_022108	GAT	2	6	115024	115029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351455
2227	NC_022108	CATGT	2	10	115085	115094	20 %	40 %	20 %	20 %	532351455
2228	NC_022108	TCT	2	6	115246	115251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2229	NC_022108	ACA	2	6	115256	115261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2230	NC_022108	CGA	2	6	115268	115273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351455
2231	NC_022108	ATC	2	6	115321	115326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351455
2232	NC_022108	TCT	2	6	115338	115343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2233	NC_022108	GGAA	2	8	115364	115371	50 %	0 %	50 %	0 %	532351455
2234	NC_022108	ACC	2	6	115399	115404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351455
2235	NC_022108	TTG	2	6	115485	115490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351455
2236	NC_022108	AAC	2	6	115507	115512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2237	NC_022108	ACTTCG	2	12	115547	115558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532351455
2238	NC_022108	ACA	3	9	115637	115645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2239	NC_022108	CAA	2	6	115662	115667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351455
2240	NC_022108	TTC	3	9	115711	115719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2241	NC_022108	TCT	2	6	115772	115777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351455
2242	NC_022108	AAGC	2	8	115781	115788	50 %	0 %	25 %	25 %	532351455
2243	NC_022108	TATCG	2	10	115789	115798	20 %	40 %	20 %	20 %	532351455
2244	NC_022108	T	6	6	115805	115810	0 %	100 %	0 %	0 %	532351455
2245	NC_022108	ATG	2	6	115846	115851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351455
2246	NC_022108	GGTT	2	8	116113	116120	0 %	50 %	50 %	0 %	532351456
2247	NC_022108	T	7	7	116129	116135	0 %	100 %	0 %	0 %	532351456
2248	NC_022108	GCT	2	6	116255	116260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2249	NC_022108	TTTCT	2	10	116305	116314	0 %	80 %	0 %	20 %	532351456
2250	NC_022108	ACA	2	6	116342	116347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351456
2251	NC_022108	TAT	2	6	116530	116535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351456
2252	NC_022108	TATC	2	8	116562	116569	25 %	50 %	0 %	25 %	532351456
2253	NC_022108	TTTG	2	8	116659	116666	0 %	75 %	25 %	0 %	532351456
2254	NC_022108	AGG	3	9	116671	116679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351456
2255	NC_022108	AGA	2	6	116692	116697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351456
2256	NC_022108	GA	3	6	116746	116751	50 %	0 %	50 %	0 %	532351456
2257	NC_022108	A	6	6	116799	116804	100 %	0 %	0 %	0 %	532351456
2258	NC_022108	GTTC	2	8	116855	116862	0 %	50 %	25 %	25 %	532351456
2259	NC_022108	TAA	2	6	116875	116880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351456
2260	NC_022108	ACC	2	6	116891	116896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351456
2261	NC_022108	GCT	2	6	116909	116914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2262	NC_022108	AGG	2	6	116959	116964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351456
2263	NC_022108	ATT	2	6	116993	116998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351456
2264	NC_022108	TTC	2	6	117010	117015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351456
2265	NC_022108	TGC	2	6	117040	117045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
2266	NC_022108	CTG	2	6	117087	117092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351456
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2268	NC_022108	TGC	2	6	117303	117308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351457
2269	NC_022108	AAG	2	6	117311	117316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351457
2270	NC_022108	GAAA	2	8	117363	117370	75 %	0 %	25 %	0 %	532351457
2271	NC_022108	GTT	2	6	117406	117411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351457
2272	NC_022108	TAT	2	6	117422	117427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351457
2273	NC_022108	TCC	2	6	117449	117454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351457
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2280	NC_022108	AAG	2	6	117695	117700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352207
2281	NC_022108	TAA	2	6	117708	117713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352207
2282	NC_022108	CA	3	6	117915	117920	50 %	0 %	0 %	50 %	532352207
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2285	NC_022108	AT	3	6	118121	118126	50 %	50 %	0 %	0 %	532351458
2286	NC_022108	T	6	6	118131	118136	0 %	100 %	0 %	0 %	532351458
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2290	NC_022108	G	6	6	118267	118272	0 %	0 %	100 %	0 %	532351458
2291	NC_022108	T	6	6	118290	118295	0 %	100 %	0 %	0 %	532351458
2292	NC_022108	GTT	2	6	118408	118413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351458
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2302	NC_022108	TTC	2	6	118803	118808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351459
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2304	NC_022108	TTTA	2	8	118834	118841	25 %	75 %	0 %	0 %	532351459
2305	NC_022108	CTG	2	6	119032	119037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351459
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2320	NC_022108	AAG	2	6	119583	119588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351460
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2325	NC_022108	GCTA	2	8	119696	119703	25 %	25 %	25 %	25 %	532351460
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2347	NC_022108	GTA	2	6	120979	120984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351461
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2352	NC_022108	CT	3	6	121287	121292	0 %	50 %	0 %	50 %	532351461
2353	NC_022108	GAA	2	6	121341	121346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2354	NC_022108	TCC	2	6	121432	121437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351461
2355	NC_022108	ATG	2	6	121541	121546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351461
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2357	NC_022108	CTT	2	6	121583	121588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351461
2358	NC_022108	AGA	2	6	121680	121685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2359	NC_022108	GAA	2	6	121696	121701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2360	NC_022108	TTTC	2	8	121778	121785	0 %	75 %	0 %	25 %	532351461
2361	NC_022108	AAC	2	6	121829	121834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351461
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2363	NC_022108	TGA	2	6	121877	121882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351461
2364	NC_022108	AT	3	6	121989	121994	50 %	50 %	0 %	0 %	532351461
2365	NC_022108	GTT	2	6	122029	122034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351461
2366	NC_022108	CAA	2	6	122046	122051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351461
2367	NC_022108	AAG	2	6	122054	122059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2368	NC_022108	AGA	2	6	122121	122126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351461
2369	NC_022108	TGA	2	6	122133	122138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351461
2370	NC_022108	CTT	2	6	122176	122181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351461
2371	NC_022108	TC	3	6	122199	122204	0 %	50 %	0 %	50 %	532351461
2372	NC_022108	ATC	2	6	122382	122387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351461
2373	NC_022108	AAAG	2	8	122509	122516	75 %	0 %	25 %	0 %	532351461
2374	NC_022108	GA	3	6	122529	122534	50 %	0 %	50 %	0 %	532351461
2375	NC_022108	GCTTC	2	10	122537	122546	0 %	40 %	20 %	40 %	532351461
2376	NC_022108	TCTA	2	8	122578	122585	25 %	50 %	0 %	25 %	532351461
2377	NC_022108	ACT	2	6	122739	122744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351462
2378	NC_022108	AAGGGT	2	12	122809	122820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532351462
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2380	NC_022108	T	6	6	122851	122856	0 %	100 %	0 %	0 %	532351462
2381	NC_022108	AGCT	2	8	122884	122891	25 %	25 %	25 %	25 %	532351462
2382	NC_022108	CAA	2	6	122953	122958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351462
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2385	NC_022108	ATA	2	6	123109	123114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351462
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2393	NC_022108	T	6	6	123671	123676	0 %	100 %	0 %	0 %	532351463
2394	NC_022108	GA	3	6	123749	123754	50 %	0 %	50 %	0 %	532351463
2395	NC_022108	GGGTTT	2	12	123772	123783	0 %	50 %	50 %	0 %	532351463
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2399	NC_022108	TGGA	2	8	123840	123847	25 %	25 %	50 %	0 %	532351463
2400	NC_022108	GCAA	2	8	123875	123882	50 %	0 %	25 %	25 %	532351463
2401	NC_022108	TTA	2	6	123920	123925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351463
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2441	NC_022108	GA	3	6	125841	125846	50 %	0 %	50 %	0 %	532351465
2442	NC_022108	GTA	2	6	125857	125862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351465
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2451	NC_022108	TACAA	2	10	126324	126333	60 %	20 %	0 %	20 %	532351465
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2490	NC_022108	CAG	2	6	127888	127893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351466
2491	NC_022108	CTT	2	6	127906	127911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351466
2492	NC_022108	CTT	2	6	127957	127962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351466
2493	NC_022108	ACA	2	6	128019	128024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351466
2494	NC_022108	GTC	2	6	128026	128031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351466
2495	NC_022108	CTT	2	6	128101	128106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351466
2496	NC_022108	TGC	2	6	128300	128305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351467
2497	NC_022108	ATC	2	6	128311	128316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351467
2498	NC_022108	T	6	6	128317	128322	0 %	100 %	0 %	0 %	532351467
2499	NC_022108	GAA	2	6	128379	128384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351467
2500	NC_022108	CTT	3	9	128409	128417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351467

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