MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20012	NC_022108	AGG	2	6	1025517	1025522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
20013	NC_022108	GGA	2	6	1025527	1025532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352189
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20118	NC_022108	GAA	2	6	1029981	1029986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352191
20119	NC_022108	TTA	3	9	1029987	1029995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352191
20120	NC_022108	GTT	3	9	1030011	1030019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352191
20121	NC_022108	GGA	2	6	1030059	1030064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352191
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20123	NC_022108	CAT	2	6	1030114	1030119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352191
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20134	NC_022108	GA	3	6	1030745	1030750	50 %	0 %	50 %	0 %	532352191
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20149	NC_022108	TCT	2	6	1031255	1031260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352191
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20155	NC_022108	TTA	2	6	1031535	1031540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352191
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20225	NC_022108	CAAG	2	8	1034316	1034323	50 %	0 %	25 %	25 %	532352192
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20231	NC_022108	GCTA	2	8	1034619	1034626	25 %	25 %	25 %	25 %	532352192
20232	NC_022108	ATA	2	6	1034692	1034697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352192
20233	NC_022108	GA	3	6	1034710	1034715	50 %	0 %	50 %	0 %	532352192
20234	NC_022108	AC	3	6	1034913	1034918	50 %	0 %	0 %	50 %	532352192
20235	NC_022108	TAA	2	6	1034921	1034926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352192
20236	NC_022108	ACA	2	6	1034985	1034990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352192
20237	NC_022108	ACA	2	6	1035015	1035020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352192
20238	NC_022108	TATG	2	8	1035065	1035072	25 %	50 %	25 %	0 %	532352192
20239	NC_022108	CAT	2	6	1035229	1035234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352192
20240	NC_022108	T	6	6	1035239	1035244	0 %	100 %	0 %	0 %	532352192
20241	NC_022108	TTGT	2	8	1035248	1035255	0 %	75 %	25 %	0 %	532352192
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20247	NC_022108	CTC	2	6	1035679	1035684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352193
20248	NC_022108	CAGCAC	2	12	1035685	1035696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532352193
20249	NC_022108	CTG	2	6	1035703	1035708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352193
20250	NC_022108	T	6	6	1035757	1035762	0 %	100 %	0 %	0 %	532352193
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20266	NC_022108	GAT	2	6	1036232	1036237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352193
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20340	NC_022108	AG	3	6	1040485	1040490	50 %	0 %	50 %	0 %	532352194
20341	NC_022108	T	6	6	1040535	1040540	0 %	100 %	0 %	0 %	532352194
20342	NC_022108	AAG	2	6	1040604	1040609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352194
20343	NC_022108	GAG	2	6	1040626	1040631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352194
20344	NC_022108	GA	5	10	1040646	1040655	50 %	0 %	50 %	0 %	532352194
20345	NC_022108	GCT	2	6	1040715	1040720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352194
20346	NC_022108	T	6	6	1040748	1040753	0 %	100 %	0 %	0 %	532352194
20347	NC_022108	CTT	2	6	1040754	1040759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352194
20348	NC_022108	AGG	2	6	1040865	1040870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352194
20349	NC_022108	TGC	2	6	1040886	1040891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352194
20350	NC_022108	AAAGA	2	10	1040914	1040923	80 %	0 %	20 %	0 %	532352194
20351	NC_022108	GAA	2	6	1040948	1040953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352194
20352	NC_022108	GAACA	2	10	1041028	1041037	60 %	0 %	20 %	20 %	532352194
20353	NC_022108	AG	3	6	1041058	1041063	50 %	0 %	50 %	0 %	532352194
20354	NC_022108	CTCC	2	8	1041065	1041072	0 %	25 %	0 %	75 %	532352194
20355	NC_022108	TGT	2	6	1041108	1041113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352194
20356	NC_022108	TTGC	2	8	1041191	1041198	0 %	50 %	25 %	25 %	532352194
20357	NC_022108	CAAG	2	8	1041218	1041225	50 %	0 %	25 %	25 %	532352194
20358	NC_022108	AG	6	12	1041224	1041235	50 %	0 %	50 %	0 %	532352194
20359	NC_022108	ACA	2	6	1041265	1041270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352194
20360	NC_022108	AG	3	6	1041309	1041314	50 %	0 %	50 %	0 %	532352194
20361	NC_022108	TAC	2	6	1041342	1041347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352194
20362	NC_022108	GCC	2	6	1041358	1041363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352194
20363	NC_022108	GAAA	2	8	1041388	1041395	75 %	0 %	25 %	0 %	532352194
20364	NC_022108	AGA	2	6	1041457	1041462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352194
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20377	NC_022108	AGA	2	6	1041993	1041998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352194
20378	NC_022108	A	8	8	1042008	1042015	100 %	0 %	0 %	0 %	532352194
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