MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022108	TTC	2	6	79074	79079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351427
1502	NC_022108	T	8	8	79081	79088	0 %	100 %	0 %	0 %	532351427
1503	NC_022108	ATG	2	6	79097	79102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351427
1504	NC_022108	GCC	2	6	79109	79114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351427
1505	NC_022108	TCC	2	6	79157	79162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351427
1506	NC_022108	GCT	2	6	79189	79194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351427
1507	NC_022108	TCT	2	6	79200	79205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351427
1508	NC_022108	T	7	7	79896	79902	0 %	100 %	0 %	0 %	532351428
1509	NC_022108	TGA	2	6	80001	80006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351428
1510	NC_022108	TGTCT	2	10	80016	80025	0 %	60 %	20 %	20 %	532351428
1511	NC_022108	TGAT	2	8	80090	80097	25 %	50 %	25 %	0 %	532351428
1512	NC_022108	TCAT	2	8	80112	80119	25 %	50 %	0 %	25 %	532351428
1513	NC_022108	T	6	6	80168	80173	0 %	100 %	0 %	0 %	532351428
1514	NC_022108	GGTTTA	2	12	80179	80190	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532351428
1515	NC_022108	TCT	2	6	80280	80285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351428
1516	NC_022108	GAA	2	6	80290	80295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351428
1517	NC_022108	TGC	2	6	80340	80345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351428
1518	NC_022108	CAA	2	6	80374	80379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351428
1519	NC_022108	GAA	2	6	80392	80397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351428
1520	NC_022108	GGA	2	6	80436	80441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351428
1521	NC_022108	TC	4	8	80464	80471	0 %	50 %	0 %	50 %	532351428
1522	NC_022108	A	7	7	80483	80489	100 %	0 %	0 %	0 %	532351428
1523	NC_022108	TTACT	2	10	80523	80532	20 %	60 %	0 %	20 %	532351428
1524	NC_022108	TATC	2	8	80539	80546	25 %	50 %	0 %	25 %	532351428
1525	NC_022108	GA	3	6	80557	80562	50 %	0 %	50 %	0 %	532351428
1526	NC_022108	TAT	2	6	80637	80642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351428
1527	NC_022108	AGA	2	6	80841	80846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351428
1528	NC_022108	GGGA	2	8	80850	80857	25 %	0 %	75 %	0 %	532351428
1529	NC_022108	CTGC	2	8	80954	80961	0 %	25 %	25 %	50 %	532351429
1530	NC_022108	GCT	2	6	80972	80977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351429
1531	NC_022108	ATT	2	6	80978	80983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351429
1532	NC_022108	CTT	2	6	81021	81026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351429
1533	NC_022108	CTT	2	6	81042	81047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351429
1534	NC_022108	CAT	2	6	81089	81094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351429
1535	NC_022108	TGA	2	6	81211	81216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351429
1536	NC_022108	AGG	2	6	81222	81227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351429
1537	NC_022108	GGTT	2	8	81247	81254	0 %	50 %	50 %	0 %	532351429
1538	NC_022108	GTC	2	6	81270	81275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351429
1539	NC_022108	CT	3	6	81287	81292	0 %	50 %	0 %	50 %	532351429
1540	NC_022108	GGA	2	6	81293	81298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351429
1541	NC_022108	CAA	2	6	81299	81304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351429
1542	NC_022108	AG	3	6	81306	81311	50 %	0 %	50 %	0 %	532351429
1543	NC_022108	T	6	6	81313	81318	0 %	100 %	0 %	0 %	532351429
1544	NC_022108	CGAT	2	8	81375	81382	25 %	25 %	25 %	25 %	532351429
1545	NC_022108	TCAT	2	8	81450	81457	25 %	50 %	0 %	25 %	532351429
1546	NC_022108	TTA	2	6	81500	81505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351429
1547	NC_022108	TG	3	6	81517	81522	0 %	50 %	50 %	0 %	532351429
1548	NC_022108	AGA	2	6	81535	81540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351429
1549	NC_022108	AAG	2	6	81552	81557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351429
1550	NC_022108	AC	3	6	81600	81605	50 %	0 %	0 %	50 %	532351429
1551	NC_022108	T	6	6	81685	81690	0 %	100 %	0 %	0 %	532351430
1552	NC_022108	GAC	2	6	81712	81717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351430
1553	NC_022108	GA	3	6	81746	81751	50 %	0 %	50 %	0 %	532351430
1554	NC_022108	TTA	2	6	81758	81763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351430
1555	NC_022108	CTT	2	6	81812	81817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351430
1556	NC_022108	TTA	2	6	81855	81860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351430
1557	NC_022108	T	6	6	81863	81868	0 %	100 %	0 %	0 %	532351430
1558	NC_022108	AGAAA	2	10	81913	81922	80 %	0 %	20 %	0 %	532351430
1559	NC_022108	T	6	6	81968	81973	0 %	100 %	0 %	0 %	532351430
1560	NC_022108	GTTA	2	8	81992	81999	25 %	50 %	25 %	0 %	532351430
1561	NC_022108	ACA	2	6	82026	82031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351430
1562	NC_022108	GCG	2	6	82058	82063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351430
1563	NC_022108	T	6	6	82101	82106	0 %	100 %	0 %	0 %	532351430
1564	NC_022108	TGG	3	9	82127	82135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351430
1565	NC_022108	CAG	2	6	82203	82208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351430
1566	NC_022108	GTT	2	6	82214	82219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351430
1567	NC_022108	TATT	2	8	82224	82231	25 %	75 %	0 %	0 %	532351430
1568	NC_022108	GTG	2	6	82248	82253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351430
1569	NC_022108	CCT	2	6	82298	82303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351430
1570	NC_022108	GGAAG	2	10	82426	82435	40 %	0 %	60 %	0 %	532351430
1571	NC_022108	ATT	2	6	82445	82450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351430
1572	NC_022108	TTG	2	6	82467	82472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351430
1573	NC_022108	TTC	2	6	82475	82480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351430
1574	NC_022108	T	6	6	82509	82514	0 %	100 %	0 %	0 %	532351430
1575	NC_022108	GAA	2	6	82548	82553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351430
1576	NC_022108	GAA	2	6	82577	82582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351430
1577	NC_022108	GA	3	6	82639	82644	50 %	0 %	50 %	0 %	532351430
1578	NC_022108	GTTC	2	8	82649	82656	0 %	50 %	25 %	25 %	532351430
1579	NC_022108	GCT	2	6	82784	82789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351430
1580	NC_022108	GTGC	2	8	82796	82803	0 %	25 %	50 %	25 %	532351430
1581	NC_022108	TAA	2	6	82846	82851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351430
1582	NC_022108	CAT	2	6	82862	82867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351430
1583	NC_022108	GAA	2	6	82874	82879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351430
1584	NC_022108	GA	3	6	82959	82964	50 %	0 %	50 %	0 %	532351430
1585	NC_022108	TAC	2	6	83010	83015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351430
1586	NC_022108	T	6	6	83034	83039	0 %	100 %	0 %	0 %	532351431
1587	NC_022108	T	7	7	83046	83052	0 %	100 %	0 %	0 %	532351431
1588	NC_022108	T	6	6	83059	83064	0 %	100 %	0 %	0 %	532351431
1589	NC_022108	GTA	2	6	83145	83150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351431
1590	NC_022108	T	6	6	83156	83161	0 %	100 %	0 %	0 %	532351431
1591	NC_022108	TATG	2	8	83180	83187	25 %	50 %	25 %	0 %	532351431
1592	NC_022108	TAT	2	6	83209	83214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351431
1593	NC_022108	GTCTGT	2	12	83223	83234	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532351431
1594	NC_022108	TCA	2	6	83243	83248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351431
1595	NC_022108	TCAT	2	8	83251	83258	25 %	50 %	0 %	25 %	532351431
1596	NC_022108	CAA	2	6	83293	83298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351431
1597	NC_022108	ACTG	2	8	83303	83310	25 %	25 %	25 %	25 %	532351431
1598	NC_022108	CATT	2	8	83318	83325	25 %	50 %	0 %	25 %	532351431
1599	NC_022108	AGA	2	6	83351	83356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351431
1600	NC_022108	AGCA	2	8	83357	83364	50 %	0 %	25 %	25 %	532351431
1601	NC_022108	TC	3	6	83379	83384	0 %	50 %	0 %	50 %	532351431
1602	NC_022108	ATTA	2	8	83510	83517	50 %	50 %	0 %	0 %	532351431
1603	NC_022108	TTTG	2	8	83550	83557	0 %	75 %	25 %	0 %	532351431
1604	NC_022108	TTG	2	6	83647	83652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351431
1605	NC_022108	GAT	2	6	83744	83749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351431
1606	NC_022108	TCTA	2	8	83834	83841	25 %	50 %	0 %	25 %	532351431
1607	NC_022108	CTA	2	6	83862	83867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351431
1608	NC_022108	TAT	2	6	83915	83920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351431
1609	NC_022108	TAAG	2	8	83939	83946	50 %	25 %	25 %	0 %	532351431
1610	NC_022108	AGT	2	6	84028	84033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351432
1611	NC_022108	TAT	2	6	84055	84060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351432
1612	NC_022108	TGC	2	6	84070	84075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351432
1613	NC_022108	AAG	2	6	84090	84095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351432
1614	NC_022108	TC	3	6	84102	84107	0 %	50 %	0 %	50 %	532351432
1615	NC_022108	AG	3	6	84113	84118	50 %	0 %	50 %	0 %	532351432
1616	NC_022108	GAA	2	6	84146	84151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351432
1617	NC_022108	CAG	2	6	84285	84290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351432
1618	NC_022108	TAA	2	6	84331	84336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351432
1619	NC_022108	AG	3	6	84380	84385	50 %	0 %	50 %	0 %	532351432
1620	NC_022108	TTC	2	6	84399	84404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351432
1621	NC_022108	GAAG	2	8	84443	84450	50 %	0 %	50 %	0 %	532351432
1622	NC_022108	A	6	6	84467	84472	100 %	0 %	0 %	0 %	532351432
1623	NC_022108	AGA	2	6	84517	84522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351432
1624	NC_022108	TTC	2	6	84595	84600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351432
1625	NC_022108	TAAA	2	8	84609	84616	75 %	25 %	0 %	0 %	532351432
1626	NC_022108	ATCC	2	8	84680	84687	25 %	25 %	0 %	50 %	532351432
1627	NC_022108	TGG	2	6	84708	84713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351432
1628	NC_022108	TGA	2	6	84741	84746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351432
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1989	NC_022108	TCT	2	6	103140	103145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351448
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1991	NC_022108	TTTCT	2	10	103220	103229	0 %	80 %	0 %	20 %	532351448
1992	NC_022108	CGA	2	6	103251	103256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351448
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1994	NC_022108	T	9	9	103283	103291	0 %	100 %	0 %	0 %	532351448
1995	NC_022108	GCA	2	6	103398	103403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351448
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1998	NC_022108	TCT	2	6	103473	103478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351448
1999	NC_022108	TTC	2	6	103503	103508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351449
2000	NC_022108	CTT	2	6	103539	103544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351449

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