MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022108	CTAT	2	8	625518	625525	25 %	50 %	0 %	25 %	532351893
12502	NC_022108	TA	3	6	625591	625596	50 %	50 %	0 %	0 %	532351893
12503	NC_022108	TCT	2	6	625610	625615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12504	NC_022108	A	7	7	625742	625748	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12505	NC_022108	CTCC	2	8	625772	625779	0 %	25 %	0 %	75 %	532351893
12506	NC_022108	CATA	2	8	625781	625788	50 %	25 %	0 %	25 %	532351893
12507	NC_022108	GAA	2	6	625851	625856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351893
12508	NC_022108	CTT	2	6	625880	625885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12509	NC_022108	CT	4	8	625895	625902	0 %	50 %	0 %	50 %	532351893
12510	NC_022108	TATC	2	8	625952	625959	25 %	50 %	0 %	25 %	532351893
12511	NC_022108	TAA	2	6	625979	625984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351893
12512	NC_022108	ATT	2	6	626006	626011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12513	NC_022108	CT	3	6	626129	626134	0 %	50 %	0 %	50 %	532351893
12514	NC_022108	TTC	2	6	626161	626166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12515	NC_022108	TAT	2	6	626226	626231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12516	NC_022108	CTT	2	6	626357	626362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12517	NC_022108	TGC	2	6	626363	626368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351893
12518	NC_022108	ACC	2	6	626372	626377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351893
12519	NC_022108	A	6	6	626412	626417	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12520	NC_022108	TTA	2	6	626589	626594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12521	NC_022108	GAT	2	6	626607	626612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351893
12522	NC_022108	A	6	6	626778	626783	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12523	NC_022108	CTT	2	6	626786	626791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12524	NC_022108	TCA	2	6	626890	626895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351893
12525	NC_022108	GACA	2	8	626903	626910	50 %	0 %	25 %	25 %	532351893
12526	NC_022108	GAA	2	6	626967	626972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351893
12527	NC_022108	CCT	2	6	627012	627017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351893
12528	NC_022108	TTA	2	6	627075	627080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12529	NC_022108	CTG	2	6	627117	627122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351893
12530	NC_022108	AC	3	6	627147	627152	50 %	0 %	0 %	50 %	532351893
12531	NC_022108	A	6	6	627191	627196	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12532	NC_022108	GTT	2	6	627210	627215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351893
12533	NC_022108	CAA	2	6	627220	627225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351893
12534	NC_022108	GT	3	6	627226	627231	0 %	50 %	50 %	0 %	532351893
12535	NC_022108	T	6	6	627280	627285	0 %	100 %	0 %	0 %	532351893
12536	NC_022108	TCA	2	6	627334	627339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351893
12537	NC_022108	TTTAT	2	10	627371	627380	20 %	80 %	0 %	0 %	532351893
12538	NC_022108	TGA	2	6	627407	627412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351893
12539	NC_022108	AAAT	2	8	627428	627435	75 %	25 %	0 %	0 %	532351893
12540	NC_022108	ATT	2	6	627543	627548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12541	NC_022108	CA	3	6	627593	627598	50 %	0 %	0 %	50 %	532351893
12542	NC_022108	ATT	2	6	627627	627632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12543	NC_022108	TCT	2	6	627633	627638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12544	NC_022108	TAC	2	6	627646	627651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351893
12545	NC_022108	AAG	2	6	627677	627682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351893
12546	NC_022108	A	7	7	627686	627692	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12547	NC_022108	TTC	2	6	627770	627775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12548	NC_022108	A	6	6	627783	627788	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12549	NC_022108	CAA	2	6	627804	627809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351893
12550	NC_022108	AGG	2	6	627820	627825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351893
12551	NC_022108	ACT	2	6	627841	627846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351893
12552	NC_022108	GCT	2	6	627951	627956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351893
12553	NC_022108	CT	3	6	627977	627982	0 %	50 %	0 %	50 %	532351893
12554	NC_022108	GTT	2	6	627999	628004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351893
12555	NC_022108	TCT	2	6	628006	628011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12556	NC_022108	ATT	2	6	628035	628040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12557	NC_022108	AGA	2	6	628106	628111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351893
12558	NC_022108	TGC	2	6	628166	628171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351893
12559	NC_022108	TGG	2	6	628224	628229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351893
12560	NC_022108	A	7	7	628279	628285	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12561	NC_022108	ACT	2	6	628339	628344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351893
12562	NC_022108	A	7	7	628353	628359	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12563	NC_022108	CT	3	6	628440	628445	0 %	50 %	0 %	50 %	532351893
12564	NC_022108	AAG	2	6	628480	628485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351893
12565	NC_022108	A	7	7	628501	628507	100 %	0 %	0 %	0 %	532351893
12566	NC_022108	TTC	2	6	628526	628531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12567	NC_022108	T	6	6	628551	628556	0 %	100 %	0 %	0 %	532351893
12568	NC_022108	CCT	2	6	628557	628562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351893
12569	NC_022108	TCC	2	6	628787	628792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351894
12570	NC_022108	TCT	2	6	628812	628817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351894
12571	NC_022108	A	8	8	628848	628855	100 %	0 %	0 %	0 %	532351894
12572	NC_022108	GAG	2	6	628926	628931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351894
12573	NC_022108	CT	3	6	628990	628995	0 %	50 %	0 %	50 %	532351894
12574	NC_022108	TC	3	6	629063	629068	0 %	50 %	0 %	50 %	532351894
12575	NC_022108	TGCT	2	8	629113	629120	0 %	50 %	25 %	25 %	532351894
12576	NC_022108	CT	3	6	629135	629140	0 %	50 %	0 %	50 %	532351894
12577	NC_022108	T	6	6	629176	629181	0 %	100 %	0 %	0 %	532351894
12578	NC_022108	AGGA	2	8	629623	629630	50 %	0 %	50 %	0 %	532351895
12579	NC_022108	GCA	2	6	629675	629680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351895
12580	NC_022108	TCT	2	6	629693	629698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351895
12581	NC_022108	A	6	6	629888	629893	100 %	0 %	0 %	0 %	532351895
12582	NC_022108	ATT	2	6	629899	629904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351895
12583	NC_022108	GGT	2	6	629908	629913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351895
12584	NC_022108	AAGC	2	8	629975	629982	50 %	0 %	25 %	25 %	532351895
12585	NC_022108	AAT	2	6	630001	630006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351895
12586	NC_022108	GAA	2	6	630133	630138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351895
12587	NC_022108	TGA	2	6	630216	630221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351895
12588	NC_022108	TCA	2	6	630324	630329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351895
12589	NC_022108	GCA	2	6	630340	630345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351895
12590	NC_022108	CAG	2	6	630443	630448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351895
12591	NC_022108	CAA	3	9	630451	630459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351895
12592	NC_022108	A	6	6	630458	630463	100 %	0 %	0 %	0 %	532351895
12593	NC_022108	ACT	2	6	630559	630564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351895
12594	NC_022108	CAG	2	6	630565	630570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351895
12595	NC_022108	TCA	2	6	630604	630609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351895
12596	NC_022108	GTT	2	6	630717	630722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351895
12597	NC_022108	GCT	2	6	630724	630729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351895
12598	NC_022108	A	6	6	630757	630762	100 %	0 %	0 %	0 %	532351895
12599	NC_022108	A	6	6	630789	630794	100 %	0 %	0 %	0 %	532351895
12600	NC_022108	ATA	2	6	630865	630870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351896
12601	NC_022108	TTG	2	6	630932	630937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351896
12602	NC_022108	GAA	2	6	631041	631046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351896
12603	NC_022108	TCA	2	6	631096	631101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351896
12604	NC_022108	TGA	2	6	631115	631120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351896
12605	NC_022108	GGA	2	6	631131	631136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351896
12606	NC_022108	ATT	2	6	631155	631160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351896
12607	NC_022108	CA	3	6	631170	631175	50 %	0 %	0 %	50 %	532351896
12608	NC_022108	TGC	2	6	631229	631234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351896
12609	NC_022108	CTAT	2	8	631264	631271	25 %	50 %	0 %	25 %	532351896
12610	NC_022108	ACTC	2	8	631298	631305	25 %	25 %	0 %	50 %	532351896
12611	NC_022108	CTAC	2	8	631324	631331	25 %	25 %	0 %	50 %	532351896
12612	NC_022108	ATG	2	6	631344	631349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351896
12613	NC_022108	TGA	2	6	631381	631386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351896
12614	NC_022108	ATT	2	6	631552	631557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351896
12615	NC_022108	TTTA	2	8	631587	631594	25 %	75 %	0 %	0 %	532351896
12616	NC_022108	TTCG	2	8	631605	631612	0 %	50 %	25 %	25 %	532351896
12617	NC_022108	AACCTC	2	12	631661	631672	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532351896
12618	NC_022108	A	6	6	631734	631739	100 %	0 %	0 %	0 %	532351896
12619	NC_022108	GTGA	2	8	631776	631783	25 %	25 %	50 %	0 %	532351896
12620	NC_022108	AGC	2	6	631968	631973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351897
12621	NC_022108	AGG	2	6	631983	631988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351897
12622	NC_022108	AAC	2	6	631997	632002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351897
12623	NC_022108	GCA	2	6	632023	632028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351897
12624	NC_022108	CTT	2	6	632092	632097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351897
12625	NC_022108	A	6	6	632141	632146	100 %	0 %	0 %	0 %	532351897
12626	NC_022108	AAG	2	6	632156	632161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351897
12627	NC_022108	TCG	2	6	632207	632212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351897
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12630	NC_022108	TAT	2	6	632316	632321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351897
12631	NC_022108	CTT	2	6	632402	632407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351897
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12633	NC_022108	CT	3	6	632647	632652	0 %	50 %	0 %	50 %	532351897
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12642	NC_022108	TCCC	2	8	632978	632985	0 %	25 %	0 %	75 %	532351898
12643	NC_022108	ATT	2	6	633000	633005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351898
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12651	NC_022108	ATT	2	6	633335	633340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351898
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12658	NC_022108	A	11	11	633661	633671	100 %	0 %	0 %	0 %	532351898
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12735	NC_022108	GGAG	2	8	636697	636704	25 %	0 %	75 %	0 %	532351902
12736	NC_022108	TTC	2	6	636705	636710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351902
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12741	NC_022108	TG	3	6	637098	637103	0 %	50 %	50 %	0 %	532351903
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12987	NC_022108	CTG	2	6	648312	648317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351913
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