MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022108	AAT	2	6	255495	255500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351573
5002	NC_022108	GCA	2	6	255505	255510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351573
5003	NC_022108	ACA	2	6	255571	255576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351573
5004	NC_022108	TTG	2	6	255635	255640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351573
5005	NC_022108	AGA	2	6	255690	255695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351573
5006	NC_022108	TAG	2	6	255710	255715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351573
5007	NC_022108	ATTTTT	2	12	255731	255742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532351573
5008	NC_022108	CTG	2	6	255949	255954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5009	NC_022108	TTG	2	6	255980	255985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351574
5010	NC_022108	TCTG	2	8	256005	256012	0 %	50 %	25 %	25 %	532351574
5011	NC_022108	TCC	2	6	256035	256040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351574
5012	NC_022108	TTC	2	6	256091	256096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351574
5013	NC_022108	CGA	2	6	256125	256130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5014	NC_022108	TTC	2	6	256172	256177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351574
5015	NC_022108	ACG	2	6	256232	256237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5016	NC_022108	AACC	2	8	256276	256283	50 %	0 %	0 %	50 %	532351574
5017	NC_022108	AAG	2	6	256309	256314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351574
5018	NC_022108	CTG	2	6	256333	256338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5019	NC_022108	GCT	2	6	256461	256466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351574
5020	NC_022108	ATTT	2	8	256518	256525	25 %	75 %	0 %	0 %	532351574
5021	NC_022108	TAT	2	6	256563	256568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351574
5022	NC_022108	ATG	2	6	256790	256795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351575
5023	NC_022108	ATCT	2	8	256839	256846	25 %	50 %	0 %	25 %	532351575
5024	NC_022108	T	7	7	256881	256887	0 %	100 %	0 %	0 %	532351575
5025	NC_022108	GCT	2	6	256891	256896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351575
5026	NC_022108	CTT	2	6	256901	256906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5027	NC_022108	T	6	6	256922	256927	0 %	100 %	0 %	0 %	532351575
5028	NC_022108	CT	4	8	256990	256997	0 %	50 %	0 %	50 %	532351575
5029	NC_022108	TTA	2	6	257055	257060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351575
5030	NC_022108	GCC	2	6	257189	257194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351575
5031	NC_022108	TTCG	2	8	257252	257259	0 %	50 %	25 %	25 %	532351575
5032	NC_022108	CTT	2	6	257288	257293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5033	NC_022108	CTA	2	6	257324	257329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351575
5034	NC_022108	TC	3	6	257343	257348	0 %	50 %	0 %	50 %	532351575
5035	NC_022108	TTC	2	6	257451	257456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5036	NC_022108	CTT	2	6	257459	257464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5037	NC_022108	TC	3	6	257481	257486	0 %	50 %	0 %	50 %	532351575
5038	NC_022108	TCT	2	6	257543	257548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5039	NC_022108	CAA	2	6	257604	257609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351575
5040	NC_022108	GTTTT	2	10	257616	257625	0 %	80 %	20 %	0 %	532351575
5041	NC_022108	TTA	2	6	257640	257645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351575
5042	NC_022108	CATT	2	8	257664	257671	25 %	50 %	0 %	25 %	532351575
5043	NC_022108	CAC	2	6	257674	257679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351575
5044	NC_022108	GCT	2	6	257759	257764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351575
5045	NC_022108	TCA	2	6	257807	257812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351575
5046	NC_022108	TCT	2	6	257842	257847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5047	NC_022108	TTC	2	6	257856	257861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351575
5048	NC_022108	TGC	2	6	257915	257920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351575
5049	NC_022108	GTT	2	6	257921	257926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351575
5050	NC_022108	TAAT	2	8	257931	257938	50 %	50 %	0 %	0 %	532351575
5051	NC_022108	A	6	6	257939	257944	100 %	0 %	0 %	0 %	532351575
5052	NC_022108	AGA	2	6	257956	257961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351575
5053	NC_022108	GAT	2	6	258226	258231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351576
5054	NC_022108	GGC	2	6	258290	258295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351576
5055	NC_022108	TTC	2	6	258306	258311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5056	NC_022108	ATT	2	6	258329	258334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351576
5057	NC_022108	CT	3	6	258362	258367	0 %	50 %	0 %	50 %	532351576
5058	NC_022108	AGG	2	6	258439	258444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351576
5059	NC_022108	TAC	2	6	258479	258484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351576
5060	NC_022108	CTT	2	6	258514	258519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5061	NC_022108	TAA	2	6	258676	258681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351576
5062	NC_022108	CTT	3	9	258863	258871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5063	NC_022108	AAAC	2	8	258893	258900	75 %	0 %	0 %	25 %	532351576
5064	NC_022108	AAT	2	6	258938	258943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351576
5065	NC_022108	TTTCT	2	10	258948	258957	0 %	80 %	0 %	20 %	532351576
5066	NC_022108	TTTA	2	8	259055	259062	25 %	75 %	0 %	0 %	532351576
5067	NC_022108	TC	3	6	259102	259107	0 %	50 %	0 %	50 %	532351576
5068	NC_022108	T	6	6	259112	259117	0 %	100 %	0 %	0 %	532351576
5069	NC_022108	TCT	3	9	259125	259133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5070	NC_022108	GGC	2	6	259147	259152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351576
5071	NC_022108	GAT	2	6	259162	259167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351576
5072	NC_022108	TCT	2	6	259180	259185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5073	NC_022108	A	6	6	259214	259219	100 %	0 %	0 %	0 %	532351576
5074	NC_022108	TCT	2	6	259232	259237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351576
5075	NC_022108	TGC	2	6	259246	259251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351576
5076	NC_022108	T	6	6	259289	259294	0 %	100 %	0 %	0 %	532351576
5077	NC_022108	TATT	2	8	259348	259355	25 %	75 %	0 %	0 %	532351576
5078	NC_022108	ACTT	2	8	259430	259437	25 %	50 %	0 %	25 %	532351576
5079	NC_022108	TGG	2	6	259529	259534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351576
5080	NC_022108	TCTT	2	8	259599	259606	0 %	75 %	0 %	25 %	532351576
5081	NC_022108	AAC	2	6	259640	259645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351576
5082	NC_022108	A	6	6	259834	259839	100 %	0 %	0 %	0 %	532351577
5083	NC_022108	GCA	2	6	259882	259887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351577
5084	NC_022108	TCT	2	6	259929	259934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351577
5085	NC_022108	TGC	2	6	259935	259940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351577
5086	NC_022108	TTA	2	6	260005	260010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351577
5087	NC_022108	CTT	2	6	260011	260016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351577
5088	NC_022108	CAA	2	6	260081	260086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351577
5089	NC_022108	GTC	2	6	260101	260106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351577
5090	NC_022108	CAG	2	6	260110	260115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351577
5091	NC_022108	CTT	2	6	260332	260337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351578
5092	NC_022108	CAA	2	6	260357	260362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351578
5093	NC_022108	TGCAA	2	10	260368	260377	40 %	20 %	20 %	20 %	532351578
5094	NC_022108	AAC	2	6	260378	260383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351578
5095	NC_022108	A	6	6	260420	260425	100 %	0 %	0 %	0 %	532351578
5096	NC_022108	TGC	2	6	260494	260499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351578
5097	NC_022108	TTC	2	6	260553	260558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351578
5098	NC_022108	TTGT	2	8	260568	260575	0 %	75 %	25 %	0 %	532351578
5099	NC_022108	CTGG	2	8	260576	260583	0 %	25 %	50 %	25 %	532351578
5100	NC_022108	TTG	2	6	260635	260640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351578
5101	NC_022108	TCT	2	6	260658	260663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351578
5102	NC_022108	TAT	2	6	260856	260861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351579
5103	NC_022108	TTC	2	6	260862	260867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351579
5104	NC_022108	AGA	2	6	260932	260937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351579
5105	NC_022108	CTT	2	6	260980	260985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351579
5106	NC_022108	CT	3	6	261020	261025	0 %	50 %	0 %	50 %	532351579
5107	NC_022108	TC	3	6	261036	261041	0 %	50 %	0 %	50 %	532351579
5108	NC_022108	CT	3	6	261048	261053	0 %	50 %	0 %	50 %	532351579
5109	NC_022108	ACCTTT	2	12	261087	261098	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532351579
5110	NC_022108	T	6	6	261096	261101	0 %	100 %	0 %	0 %	532351579
5111	NC_022108	T	6	6	261215	261220	0 %	100 %	0 %	0 %	532351579
5112	NC_022108	T	6	6	261280	261285	0 %	100 %	0 %	0 %	532351579
5113	NC_022108	TTC	2	6	261333	261338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351579
5114	NC_022108	AGA	2	6	261412	261417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351579
5115	NC_022108	CAAA	2	8	261457	261464	75 %	0 %	0 %	25 %	532351579
5116	NC_022108	CTT	2	6	261530	261535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351579
5117	NC_022108	ATT	2	6	261555	261560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351579
5118	NC_022108	CTC	2	6	261628	261633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351579
5119	NC_022108	CAT	2	6	261709	261714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351579
5120	NC_022108	CTT	2	6	261733	261738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351579
5121	NC_022108	TGT	2	6	261749	261754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351579
5122	NC_022108	CAA	2	6	261783	261788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351579
5123	NC_022108	GCTT	2	8	261811	261818	0 %	50 %	25 %	25 %	532351579
5124	NC_022108	GAT	2	6	261827	261832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351579
5125	NC_022108	AAT	2	6	261833	261838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351579
5126	NC_022108	TTA	2	6	261845	261850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351579
5127	NC_022108	TAA	2	6	261865	261870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351579
5128	NC_022108	TTG	2	6	261906	261911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351579
5129	NC_022108	ACT	2	6	261937	261942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351579
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5131	NC_022108	TAT	2	6	261976	261981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351579
5132	NC_022108	CCG	2	6	261987	261992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351579
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5134	NC_022108	TC	4	8	262051	262058	0 %	50 %	0 %	50 %	532351579
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5136	NC_022108	A	6	6	262156	262161	100 %	0 %	0 %	0 %	532351579
5137	NC_022108	TTG	2	6	262199	262204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351579
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5139	NC_022108	A	6	6	262294	262299	100 %	0 %	0 %	0 %	532351579
5140	NC_022108	AGC	2	6	262349	262354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351579
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5144	NC_022108	TAA	2	6	262572	262577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351579
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5148	NC_022108	AC	3	6	262761	262766	50 %	0 %	0 %	50 %	532351579
5149	NC_022108	GTTC	2	8	262828	262835	0 %	50 %	25 %	25 %	532351579
5150	NC_022108	CT	3	6	262891	262896	0 %	50 %	0 %	50 %	532351579
5151	NC_022108	GCA	2	6	262970	262975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351579
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5153	NC_022108	GCT	2	6	263042	263047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351579
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5162	NC_022108	A	6	6	263514	263519	100 %	0 %	0 %	0 %	532351579
5163	NC_022108	TAT	2	6	263526	263531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351579
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5212	NC_022108	TGA	2	6	266568	266573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351584
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5220	NC_022108	CA	3	6	266927	266932	50 %	0 %	0 %	50 %	532351584
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5226	NC_022108	T	6	6	267332	267337	0 %	100 %	0 %	0 %	532351584
5227	NC_022108	CAAA	2	8	267350	267357	75 %	0 %	0 %	25 %	532351584
5228	NC_022108	A	6	6	267361	267366	100 %	0 %	0 %	0 %	532351584
5229	NC_022108	CAG	2	6	267539	267544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351585
5230	NC_022108	A	6	6	267545	267550	100 %	0 %	0 %	0 %	532351585
5231	NC_022108	ATT	2	6	267561	267566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351585
5232	NC_022108	TC	3	6	267662	267667	0 %	50 %	0 %	50 %	532351585
5233	NC_022108	TTC	3	9	267705	267713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351585
5234	NC_022108	TTG	2	6	267722	267727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351585
5235	NC_022108	ACTT	2	8	267797	267804	25 %	50 %	0 %	25 %	532351585
5236	NC_022108	AGC	2	6	267854	267859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351585
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5238	NC_022108	TTG	2	6	268016	268021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351585
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5240	NC_022108	A	7	7	268098	268104	100 %	0 %	0 %	0 %	532351585
5241	NC_022108	T	7	7	268207	268213	0 %	100 %	0 %	0 %	532352222
5242	NC_022108	GTT	2	6	268215	268220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352222
5243	NC_022108	TC	3	6	268229	268234	0 %	50 %	0 %	50 %	532352222
5244	NC_022108	TTC	2	6	268244	268249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352222
5245	NC_022108	AGT	2	6	268310	268315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352222
5246	NC_022108	TTCT	2	8	268511	268518	0 %	75 %	0 %	25 %	532351586
5247	NC_022108	GA	3	6	268573	268578	50 %	0 %	50 %	0 %	532351586
5248	NC_022108	TAAAA	2	10	268604	268613	80 %	20 %	0 %	0 %	532351586
5249	NC_022108	GTT	2	6	268628	268633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351586
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5254	NC_022108	TAC	2	6	268905	268910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351586
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5361	NC_022108	TCTA	2	8	273716	273723	25 %	50 %	0 %	25 %	532351589
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5367	NC_022108	T	7	7	274163	274169	0 %	100 %	0 %	0 %	532351590
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5369	NC_022108	GCA	2	6	274226	274231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351590
5370	NC_022108	GAAA	2	8	274243	274250	75 %	0 %	25 %	0 %	532351590
5371	NC_022108	TG	3	6	274287	274292	0 %	50 %	50 %	0 %	532351590
5372	NC_022108	TGG	2	6	274324	274329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351590
5373	NC_022108	GCA	2	6	274352	274357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351590
5374	NC_022108	TCT	2	6	274382	274387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351590
5375	NC_022108	TCCCT	2	10	274466	274475	0 %	40 %	0 %	60 %	532351590
5376	NC_022108	ATT	2	6	274484	274489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351590
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5378	NC_022108	TCTT	2	8	274576	274583	0 %	75 %	0 %	25 %	532351590
5379	NC_022108	ATTT	2	8	274605	274612	25 %	75 %	0 %	0 %	532351590
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5382	NC_022108	TAT	2	6	274669	274674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351590
5383	NC_022108	TCT	2	6	274756	274761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351590
5384	NC_022108	ATCCT	2	10	274770	274779	20 %	40 %	0 %	40 %	532351590
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5444	NC_022108	TCC	2	6	277014	277019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351592
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5477	NC_022108	GAA	2	6	278546	278551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
5478	NC_022108	AAAT	2	8	278559	278566	75 %	25 %	0 %	0 %	532351593
5479	NC_022108	TC	3	6	278577	278582	0 %	50 %	0 %	50 %	532351593
5480	NC_022108	GAA	2	6	278594	278599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
5481	NC_022108	TAA	2	6	278676	278681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351593
5482	NC_022108	CAT	2	6	278685	278690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351593
5483	NC_022108	ACG	2	6	278781	278786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351593
5484	NC_022108	ATT	2	6	279006	279011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351593
5485	NC_022108	GGAACA	2	12	279019	279030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532351593
5486	NC_022108	ATGCT	2	10	279097	279106	20 %	40 %	20 %	20 %	532351593
5487	NC_022108	TCT	2	6	279218	279223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
5488	NC_022108	CAT	2	6	279341	279346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351593
5489	NC_022108	CTT	2	6	279395	279400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351593
5490	NC_022108	AGA	2	6	279412	279417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351593
5491	NC_022108	GTA	2	6	279474	279479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351593
5492	NC_022108	ATA	2	6	279501	279506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351593
5493	NC_022108	ACC	2	6	279524	279529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351593
5494	NC_022108	CCAT	2	8	279536	279543	25 %	25 %	0 %	50 %	532351593
5495	NC_022108	GAG	2	6	279596	279601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351593
5496	NC_022108	GCTT	2	8	279637	279644	0 %	50 %	25 %	25 %	532351593
5497	NC_022108	GTTT	2	8	279704	279711	0 %	75 %	25 %	0 %	532351593
5498	NC_022108	ATATTA	2	12	279727	279738	50 %	50 %	0 %	0 %	532351593
5499	NC_022108	GCA	2	6	279913	279918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351594
5500	NC_022108	GCT	2	6	279935	279940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351594

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