MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 12911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350435
2	NC_022107	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350435
3	NC_022107	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350435
4	NC_022107	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350435
5	NC_022107	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350435
6	NC_022107	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350435
7	NC_022107	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350435
8	NC_022107	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350435
9	NC_022107	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350435
10	NC_022107	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350435
11	NC_022107	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
12	NC_022107	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350436
13	NC_022107	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350436
14	NC_022107	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350436
15	NC_022107	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
16	NC_022107	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350436
17	NC_022107	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350436
18	NC_022107	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350437
19	NC_022107	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
20	NC_022107	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350437
21	NC_022107	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350437
22	NC_022107	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
23	NC_022107	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350437
24	NC_022107	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
25	NC_022107	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350437
26	NC_022107	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
27	NC_022107	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350437
28	NC_022107	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350437
29	NC_022107	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
30	NC_022107	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350437
31	NC_022107	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350437
32	NC_022107	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
33	NC_022107	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
34	NC_022107	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
35	NC_022107	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350437
36	NC_022107	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350437
37	NC_022107	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350437
38	NC_022107	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350437
39	NC_022107	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350437
40	NC_022107	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350438
41	NC_022107	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
42	NC_022107	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
43	NC_022107	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
44	NC_022107	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
45	NC_022107	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350438
46	NC_022107	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
47	NC_022107	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350438
48	NC_022107	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
49	NC_022107	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350438
50	NC_022107	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350438
51	NC_022107	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350438
52	NC_022107	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350438
53	NC_022107	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350438
54	NC_022107	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350438
55	NC_022107	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350438
56	NC_022107	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350439
57	NC_022107	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350439
58	NC_022107	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
59	NC_022107	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350439
60	NC_022107	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
61	NC_022107	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
62	NC_022107	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
63	NC_022107	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
64	NC_022107	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
65	NC_022107	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350439
66	NC_022107	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350439
67	NC_022107	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350439
68	NC_022107	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350439
69	NC_022107	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350439
70	NC_022107	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350439
71	NC_022107	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350439
72	NC_022107	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
73	NC_022107	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350439
74	NC_022107	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350440
75	NC_022107	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350440
76	NC_022107	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350440
77	NC_022107	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350440
78	NC_022107	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350440
79	NC_022107	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351272
80	NC_022107	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351272
81	NC_022107	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350441
82	NC_022107	TCC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350441
83	NC_022107	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350441
84	NC_022107	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350441
85	NC_022107	TTC	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350441
86	NC_022107	GAA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350442
87	NC_022107	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350442
88	NC_022107	CTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350442
89	NC_022107	GAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350442
90	NC_022107	ATA	2	6	8580	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350442
91	NC_022107	AGG	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350442
92	NC_022107	GAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350442
93	NC_022107	CAG	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350442
94	NC_022107	TGT	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350442
95	NC_022107	GAG	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350442
96	NC_022107	TAC	2	6	8954	8959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350442
97	NC_022107	GTT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350442
98	NC_022107	AAG	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350442
99	NC_022107	GAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350442
100	NC_022107	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350443
101	NC_022107	AGA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350443
102	NC_022107	TGC	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350443
103	NC_022107	GAA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350443
104	NC_022107	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350443
105	NC_022107	TGG	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350443
106	NC_022107	GTA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350444
107	NC_022107	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350444
108	NC_022107	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350444
109	NC_022107	ATG	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350444
110	NC_022107	CGT	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350444
111	NC_022107	GAC	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350444
112	NC_022107	GGT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350444
113	NC_022107	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350444
114	NC_022107	CAA	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350444
115	NC_022107	GGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350444
116	NC_022107	CGA	2	6	10630	10635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350444
117	NC_022107	CTT	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350444
118	NC_022107	TTG	2	6	10776	10781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350444
119	NC_022107	CTT	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350444
120	NC_022107	ATC	2	6	10900	10905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350444
121	NC_022107	TGT	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350444
122	NC_022107	AGA	2	6	11012	11017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350444
123	NC_022107	AGG	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350444
124	NC_022107	GAT	2	6	11111	11116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350444
125	NC_022107	CGA	2	6	11117	11122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350444
126	NC_022107	AAT	2	6	11330	11335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350445
127	NC_022107	AGG	2	6	11573	11578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350445
128	NC_022107	ATA	3	9	11583	11591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350445
129	NC_022107	TAT	2	6	11602	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350445
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261	NC_022107	AGA	2	6	24749	24754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350454
262	NC_022107	TAA	2	6	24881	24886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350454
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