MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022107	CT	3	6	207376	207381	0 %	50 %	0 %	50 %	532350599
4002	NC_022107	TTC	2	6	207465	207470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350599
4003	NC_022107	GCT	2	6	207518	207523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350599
4004	NC_022107	CCT	2	6	207543	207548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350599
4005	NC_022107	GAA	2	6	207564	207569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
4006	NC_022107	A	7	7	207572	207578	100 %	0 %	0 %	0 %	532350599
4007	NC_022107	A	6	6	207580	207585	100 %	0 %	0 %	0 %	532350599
4008	NC_022107	TTC	2	6	207604	207609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350599
4009	NC_022107	GAA	2	6	207618	207623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
4010	NC_022107	GAA	2	6	207690	207695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
4011	NC_022107	TTC	2	6	207710	207715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350599
4012	NC_022107	ATT	2	6	207740	207745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350599
4013	NC_022107	TTAC	2	8	207779	207786	25 %	50 %	0 %	25 %	532350599
4014	NC_022107	AAC	2	6	207812	207817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350599
4015	NC_022107	A	6	6	207837	207842	100 %	0 %	0 %	0 %	532350599
4016	NC_022107	TTA	2	6	207904	207909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350599
4017	NC_022107	GAA	2	6	208098	208103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
4018	NC_022107	AAG	2	6	208201	208206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350599
4019	NC_022107	TGA	2	6	208208	208213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350599
4020	NC_022107	TAT	2	6	208216	208221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350599
4021	NC_022107	GGC	2	6	208240	208245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350599
4022	NC_022107	TTA	2	6	208288	208293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350600
4023	NC_022107	ATG	2	6	208300	208305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350600
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4025	NC_022107	GGA	2	6	208425	208430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350600
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4028	NC_022107	GC	3	6	208520	208525	0 %	0 %	50 %	50 %	532350600
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4030	NC_022107	TC	3	6	208731	208736	0 %	50 %	0 %	50 %	532350600
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4033	NC_022107	TAGG	2	8	208915	208922	25 %	25 %	50 %	0 %	532350600
4034	NC_022107	CTC	2	6	208951	208956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350600
4035	NC_022107	TCT	2	6	208980	208985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350600
4036	NC_022107	CTT	3	9	209049	209057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350601
4037	NC_022107	TGT	2	6	209076	209081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350601
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4039	NC_022107	TGA	2	6	209170	209175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350601
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4041	NC_022107	T	6	6	209262	209267	0 %	100 %	0 %	0 %	532350601
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4045	NC_022107	TCC	2	6	209454	209459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350601
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4050	NC_022107	ATAA	2	8	209612	209619	75 %	25 %	0 %	0 %	532350601
4051	NC_022107	GAG	2	6	209713	209718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350601
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4054	NC_022107	GAAG	2	8	209859	209866	50 %	0 %	50 %	0 %	532350601
4055	NC_022107	CT	3	6	209881	209886	0 %	50 %	0 %	50 %	532350601
4056	NC_022107	AGC	2	6	209903	209908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350601
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4058	NC_022107	TGG	2	6	210058	210063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350602
4059	NC_022107	GTA	2	6	210116	210121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350602
4060	NC_022107	TAG	2	6	210251	210256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350602
4061	NC_022107	TGT	2	6	210325	210330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350602
4062	NC_022107	GCT	2	6	210337	210342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350602
4063	NC_022107	ACA	3	9	210347	210355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350602
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4065	NC_022107	AGA	2	6	210391	210396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350602
4066	NC_022107	AG	3	6	210418	210423	50 %	0 %	50 %	0 %	532350602
4067	NC_022107	CT	3	6	210435	210440	0 %	50 %	0 %	50 %	532350602
4068	NC_022107	CTT	2	6	210461	210466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350602
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4070	NC_022107	CTA	2	6	210527	210532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350602
4071	NC_022107	TGC	2	6	210580	210585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350603
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4075	NC_022107	GAAC	2	8	210824	210831	50 %	0 %	25 %	25 %	532350603
4076	NC_022107	CA	4	8	210897	210904	50 %	0 %	0 %	50 %	532350603
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4083	NC_022107	ACA	2	6	211184	211189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350603
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4087	NC_022107	TAA	2	6	211290	211295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
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4089	NC_022107	TTC	2	6	211433	211438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4090	NC_022107	ATC	2	6	211513	211518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350603
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4092	NC_022107	ATA	2	6	211553	211558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
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4094	NC_022107	ACG	2	6	211603	211608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350603
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4097	NC_022107	TCT	2	6	211670	211675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
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4102	NC_022107	TTTA	2	8	211939	211946	25 %	75 %	0 %	0 %	532350603
4103	NC_022107	TTC	3	9	211959	211967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350603
4104	NC_022107	AAC	2	6	212107	212112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350603
4105	NC_022107	T	6	6	212128	212133	0 %	100 %	0 %	0 %	532350603
4106	NC_022107	ATTT	2	8	212244	212251	25 %	75 %	0 %	0 %	532350603
4107	NC_022107	AAT	2	6	212275	212280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4108	NC_022107	GC	3	6	212324	212329	0 %	0 %	50 %	50 %	532350603
4109	NC_022107	AAT	2	6	212386	212391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350603
4110	NC_022107	CCT	2	6	212393	212398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350603
4111	NC_022107	AATT	2	8	212482	212489	50 %	50 %	0 %	0 %	532350603
4112	NC_022107	TTG	2	6	212514	212519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350603
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4119	NC_022107	TTTA	2	8	213043	213050	25 %	75 %	0 %	0 %	532350603
4120	NC_022107	ATT	2	6	213081	213086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350604
4121	NC_022107	TTG	2	6	213227	213232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350604
4122	NC_022107	TC	3	6	213257	213262	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4123	NC_022107	TTC	2	6	213296	213301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4124	NC_022107	AGT	2	6	213314	213319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350604
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4126	NC_022107	TCT	2	6	213367	213372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4127	NC_022107	TGGA	2	8	213399	213406	25 %	25 %	50 %	0 %	532350604
4128	NC_022107	TTC	2	6	213453	213458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4129	NC_022107	TA	3	6	213473	213478	50 %	50 %	0 %	0 %	532350604
4130	NC_022107	TTC	2	6	213501	213506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350604
4131	NC_022107	GCA	2	6	213511	213516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350604
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4135	NC_022107	AACG	2	8	213693	213700	50 %	0 %	25 %	25 %	532350604
4136	NC_022107	TCA	2	6	213736	213741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350604
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4138	NC_022107	CCAT	2	8	213784	213791	25 %	25 %	0 %	50 %	532350604
4139	NC_022107	GA	3	6	213802	213807	50 %	0 %	50 %	0 %	532350604
4140	NC_022107	T	6	6	213822	213827	0 %	100 %	0 %	0 %	532350604
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4150	NC_022107	CT	3	6	214275	214280	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4151	NC_022107	CT	3	6	214283	214288	0 %	50 %	0 %	50 %	532350604
4152	NC_022107	AGC	2	6	214290	214295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350604
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4154	NC_022107	CAC	2	6	214382	214387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350604
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4159	NC_022107	CTTGT	2	10	214613	214622	0 %	60 %	20 %	20 %	532350604
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4164	NC_022107	CTGGAT	2	12	214940	214951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532350604
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4188	NC_022107	CCA	2	6	216505	216510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350606
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4224	NC_022107	TTC	2	6	218323	218328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
4225	NC_022107	TAC	2	6	218356	218361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350608
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4232	NC_022107	TCT	2	6	218619	218624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
4233	NC_022107	TTC	2	6	218672	218677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
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4237	NC_022107	CTT	2	6	218917	218922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
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4239	NC_022107	A	6	6	218948	218953	100 %	0 %	0 %	0 %	532350608
4240	NC_022107	TTCC	2	8	218982	218989	0 %	50 %	0 %	50 %	532350608
4241	NC_022107	TTC	2	6	219046	219051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
4242	NC_022107	ATC	2	6	219071	219076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350608
4243	NC_022107	TAA	3	9	219181	219189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350608
4244	NC_022107	TA	3	6	219286	219291	50 %	50 %	0 %	0 %	532350608
4245	NC_022107	CTG	2	6	219328	219333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350608
4246	NC_022107	CTT	2	6	219349	219354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
4247	NC_022107	TCA	2	6	219372	219377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350608
4248	NC_022107	TTC	2	6	219437	219442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350608
4249	NC_022107	ATG	2	6	219884	219889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350609
4250	NC_022107	GAT	2	6	219942	219947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350609
4251	NC_022107	AGA	2	6	219961	219966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350609
4252	NC_022107	AAC	2	6	219986	219991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350609
4253	NC_022107	CTC	2	6	220034	220039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350609
4254	NC_022107	T	7	7	220054	220060	0 %	100 %	0 %	0 %	532350609
4255	NC_022107	A	6	6	220064	220069	100 %	0 %	0 %	0 %	532350609
4256	NC_022107	CTC	2	6	220079	220084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350609
4257	NC_022107	CGAA	2	8	220086	220093	50 %	0 %	25 %	25 %	532350609
4258	NC_022107	ATT	2	6	220101	220106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350609
4259	NC_022107	GCT	2	6	220186	220191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350609
4260	NC_022107	CAA	2	6	220218	220223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350609
4261	NC_022107	AACA	2	8	220253	220260	75 %	0 %	0 %	25 %	532350609
4262	NC_022107	TGTC	2	8	220280	220287	0 %	50 %	25 %	25 %	532350609
4263	NC_022107	ACG	2	6	220399	220404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350609
4264	NC_022107	GGA	2	6	220429	220434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350609
4265	NC_022107	TCTA	2	8	220467	220474	25 %	50 %	0 %	25 %	532350609
4266	NC_022107	CTT	2	6	220529	220534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350609
4267	NC_022107	CA	3	6	220538	220543	50 %	0 %	0 %	50 %	532350609
4268	NC_022107	GA	3	6	220565	220570	50 %	0 %	50 %	0 %	532350609
4269	NC_022107	TCT	2	6	220583	220588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350609
4270	NC_022107	TAGC	2	8	220631	220638	25 %	25 %	25 %	25 %	532350609
4271	NC_022107	C	6	6	220638	220643	0 %	0 %	0 %	100 %	532350609
4272	NC_022107	AAATA	2	10	220647	220656	80 %	20 %	0 %	0 %	532350609
4273	NC_022107	GAA	2	6	220661	220666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350609
4274	NC_022107	ACA	2	6	220747	220752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350609
4275	NC_022107	ACA	2	6	220762	220767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350609
4276	NC_022107	TAA	2	6	220772	220777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350609
4277	NC_022107	AAG	3	9	220799	220807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350609
4278	NC_022107	AGG	2	6	220905	220910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350609
4279	NC_022107	CAA	2	6	221162	221167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350610
4280	NC_022107	CT	3	6	221184	221189	0 %	50 %	0 %	50 %	532350610
4281	NC_022107	GCT	2	6	221227	221232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350610
4282	NC_022107	T	7	7	221238	221244	0 %	100 %	0 %	0 %	532350610
4283	NC_022107	CTT	2	6	221269	221274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350610
4284	NC_022107	ATT	2	6	221292	221297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350610
4285	NC_022107	GCA	2	6	221344	221349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350610
4286	NC_022107	CTTT	2	8	221355	221362	0 %	75 %	0 %	25 %	532350610
4287	NC_022107	TCG	2	6	221384	221389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350610
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4289	NC_022107	CTT	2	6	221657	221662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350611
4290	NC_022107	GGA	2	6	221665	221670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350611
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4293	NC_022107	CTAT	2	8	221809	221816	25 %	50 %	0 %	25 %	532350611
4294	NC_022107	GAT	2	6	222022	222027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350611
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4310	NC_022107	TCC	2	6	222597	222602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350612
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4312	NC_022107	GAT	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
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4317	NC_022107	A	6	6	222828	222833	100 %	0 %	0 %	0 %	532350612
4318	NC_022107	TTA	2	6	222856	222861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350612
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4320	NC_022107	ATG	2	6	222889	222894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
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4322	NC_022107	T	6	6	222966	222971	0 %	100 %	0 %	0 %	532350612
4323	NC_022107	GAT	2	6	222978	222983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350612
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4329	NC_022107	AGA	2	6	223132	223137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350612
4330	NC_022107	AGA	2	6	223162	223167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350612
4331	NC_022107	TAC	2	6	223173	223178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350612
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4333	NC_022107	CAT	2	6	223220	223225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350612
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4335	NC_022107	CTGCTT	2	12	223240	223251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532350612
4336	NC_022107	CAA	2	6	223324	223329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350612
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4339	NC_022107	AAG	2	6	223450	223455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350612
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4342	NC_022107	AGC	2	6	223525	223530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350612
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4350	NC_022107	CTTT	2	8	223771	223778	0 %	75 %	0 %	25 %	532350612
4351	NC_022107	TTTC	2	8	223824	223831	0 %	75 %	0 %	25 %	532350612
4352	NC_022107	TC	3	6	223895	223900	0 %	50 %	0 %	50 %	532350612
4353	NC_022107	A	7	7	223912	223918	100 %	0 %	0 %	0 %	532350612
4354	NC_022107	ACG	2	6	223996	224001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350612
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4361	NC_022107	CTTT	2	8	224288	224295	0 %	75 %	0 %	25 %	532350613
4362	NC_022107	GTA	2	6	224300	224305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350613
4363	NC_022107	T	6	6	224318	224323	0 %	100 %	0 %	0 %	532350613
4364	NC_022107	ATT	2	6	224324	224329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350613
4365	NC_022107	ATG	2	6	224355	224360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350613
4366	NC_022107	TATCT	2	10	224441	224450	20 %	60 %	0 %	20 %	532350613
4367	NC_022107	TAT	2	6	224518	224523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350613
4368	NC_022107	TGC	2	6	224524	224529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350613
4369	NC_022107	A	7	7	224621	224627	100 %	0 %	0 %	0 %	532350613
4370	NC_022107	TTTTC	2	10	224643	224652	0 %	80 %	0 %	20 %	532350613
4371	NC_022107	TC	3	6	224757	224762	0 %	50 %	0 %	50 %	532350613
4372	NC_022107	CATT	2	8	224805	224812	25 %	50 %	0 %	25 %	532350613
4373	NC_022107	A	7	7	224848	224854	100 %	0 %	0 %	0 %	532350613
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4482	NC_022107	ATTT	2	8	230354	230361	25 %	75 %	0 %	0 %	532350619
4483	NC_022107	TGG	2	6	230432	230437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350619
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4486	NC_022107	GC	3	6	230643	230648	0 %	0 %	50 %	50 %	532350619
4487	NC_022107	ATT	2	6	230691	230696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350619
4488	NC_022107	GCA	2	6	230804	230809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350619
4489	NC_022107	CTA	2	6	230845	230850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350619
4490	NC_022107	CATC	2	8	230860	230867	25 %	25 %	0 %	50 %	532350619
4491	NC_022107	TTA	2	6	230917	230922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350619
4492	NC_022107	TCT	3	9	230937	230945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350619
4493	NC_022107	A	6	6	231013	231018	100 %	0 %	0 %	0 %	532350619
4494	NC_022107	GCT	2	6	231072	231077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350619
4495	NC_022107	TCT	2	6	231207	231212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350619
4496	NC_022107	T	6	6	231386	231391	0 %	100 %	0 %	0 %	532350619
4497	NC_022107	GC	3	6	231545	231550	0 %	0 %	50 %	50 %	532350619
4498	NC_022107	GAC	2	6	231572	231577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350619
4499	NC_022107	A	8	8	231614	231621	100 %	0 %	0 %	0 %	532350619
4500	NC_022107	TAA	2	6	231650	231655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350619

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