MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_022107	GCT	2	6	79206	79211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350498
1503	NC_022107	TCT	2	6	79217	79222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350498
1504	NC_022107	T	7	7	79913	79919	0 %	100 %	0 %	0 %	532350499
1505	NC_022107	TGA	2	6	80018	80023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350499
1506	NC_022107	TGTCT	2	10	80033	80042	0 %	60 %	20 %	20 %	532350499
1507	NC_022107	TGAT	2	8	80107	80114	25 %	50 %	25 %	0 %	532350499
1508	NC_022107	TCAT	2	8	80129	80136	25 %	50 %	0 %	25 %	532350499
1509	NC_022107	T	6	6	80185	80190	0 %	100 %	0 %	0 %	532350499
1510	NC_022107	TCT	2	6	80297	80302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350499
1511	NC_022107	GAA	2	6	80307	80312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350499
1512	NC_022107	TGC	2	6	80357	80362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350499
1513	NC_022107	CAA	2	6	80391	80396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350499
1514	NC_022107	GAA	2	6	80409	80414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350499
1515	NC_022107	GGA	2	6	80453	80458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350499
1516	NC_022107	TC	4	8	80481	80488	0 %	50 %	0 %	50 %	532350499
1517	NC_022107	A	7	7	80500	80506	100 %	0 %	0 %	0 %	532350499
1518	NC_022107	TTACT	2	10	80540	80549	20 %	60 %	0 %	20 %	532350499
1519	NC_022107	TATC	2	8	80556	80563	25 %	50 %	0 %	25 %	532350499
1520	NC_022107	GA	3	6	80574	80579	50 %	0 %	50 %	0 %	532350499
1521	NC_022107	TAT	2	6	80654	80659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350499
1522	NC_022107	TA	3	6	80794	80799	50 %	50 %	0 %	0 %	532350499
1523	NC_022107	AGA	2	6	80858	80863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350499
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1525	NC_022107	CTGC	2	8	80971	80978	0 %	25 %	25 %	50 %	532350500
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1529	NC_022107	CTT	2	6	81059	81064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350500
1530	NC_022107	CAT	2	6	81106	81111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350500
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1533	NC_022107	GGTT	2	8	81264	81271	0 %	50 %	50 %	0 %	532350500
1534	NC_022107	CT	3	6	81304	81309	0 %	50 %	0 %	50 %	532350500
1535	NC_022107	GGA	2	6	81310	81315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350500
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1538	NC_022107	T	6	6	81330	81335	0 %	100 %	0 %	0 %	532350500
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1540	NC_022107	TCAT	2	8	81467	81474	25 %	50 %	0 %	25 %	532350500
1541	NC_022107	TTA	2	6	81517	81522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350500
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1543	NC_022107	AGA	2	6	81552	81557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350500
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1546	NC_022107	T	6	6	81702	81707	0 %	100 %	0 %	0 %	532350501
1547	NC_022107	GAC	2	6	81729	81734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350501
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1549	NC_022107	TTA	2	6	81775	81780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350501
1550	NC_022107	CTT	2	6	81829	81834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350501
1551	NC_022107	TTA	2	6	81872	81877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350501
1552	NC_022107	T	6	6	81880	81885	0 %	100 %	0 %	0 %	532350501
1553	NC_022107	AGAAA	2	10	81930	81939	80 %	0 %	20 %	0 %	532350501
1554	NC_022107	T	6	6	81985	81990	0 %	100 %	0 %	0 %	532350501
1555	NC_022107	GTTA	2	8	82009	82016	25 %	50 %	25 %	0 %	532350501
1556	NC_022107	ACA	2	6	82043	82048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350501
1557	NC_022107	GCG	2	6	82075	82080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350501
1558	NC_022107	T	6	6	82118	82123	0 %	100 %	0 %	0 %	532350501
1559	NC_022107	TGG	3	9	82144	82152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350501
1560	NC_022107	CAG	2	6	82220	82225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350501
1561	NC_022107	GTT	2	6	82231	82236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350501
1562	NC_022107	TATT	2	8	82241	82248	25 %	75 %	0 %	0 %	532350501
1563	NC_022107	GTG	2	6	82265	82270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350501
1564	NC_022107	CCT	2	6	82315	82320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350501
1565	NC_022107	GGAAG	2	10	82443	82452	40 %	0 %	60 %	0 %	532350501
1566	NC_022107	ATT	2	6	82462	82467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350501
1567	NC_022107	TTG	2	6	82484	82489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350501
1568	NC_022107	TTC	2	6	82492	82497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350501
1569	NC_022107	T	6	6	82526	82531	0 %	100 %	0 %	0 %	532350501
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1572	NC_022107	GA	3	6	82656	82661	50 %	0 %	50 %	0 %	532350501
1573	NC_022107	GTTC	2	8	82666	82673	0 %	50 %	25 %	25 %	532350501
1574	NC_022107	GCT	2	6	82801	82806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350501
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1577	NC_022107	CAT	2	6	82879	82884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350501
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1579	NC_022107	GA	3	6	82976	82981	50 %	0 %	50 %	0 %	532350501
1580	NC_022107	TAC	2	6	83027	83032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350502
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1582	NC_022107	T	7	7	83063	83069	0 %	100 %	0 %	0 %	532350502
1583	NC_022107	T	6	6	83076	83081	0 %	100 %	0 %	0 %	532350502
1584	NC_022107	GTA	2	6	83162	83167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350502
1585	NC_022107	T	6	6	83173	83178	0 %	100 %	0 %	0 %	532350502
1586	NC_022107	TATG	2	8	83197	83204	25 %	50 %	25 %	0 %	532350502
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1591	NC_022107	CAA	2	6	83310	83315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350502
1592	NC_022107	ACTG	2	8	83320	83327	25 %	25 %	25 %	25 %	532350502
1593	NC_022107	CATT	2	8	83335	83342	25 %	50 %	0 %	25 %	532350502
1594	NC_022107	AGA	2	6	83368	83373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350502
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1597	NC_022107	ATTA	2	8	83527	83534	50 %	50 %	0 %	0 %	532350502
1598	NC_022107	TTTG	2	8	83567	83574	0 %	75 %	25 %	0 %	532350502
1599	NC_022107	TTG	2	6	83664	83669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350502
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1601	NC_022107	TCTA	2	8	83851	83858	25 %	50 %	0 %	25 %	532350502
1602	NC_022107	CTA	2	6	83879	83884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350502
1603	NC_022107	TAT	2	6	83932	83937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350502
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1605	NC_022107	AGT	2	6	84045	84050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350503
1606	NC_022107	TAT	2	6	84072	84077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350503
1607	NC_022107	TGC	2	6	84087	84092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350503
1608	NC_022107	AAG	2	6	84107	84112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350503
1609	NC_022107	TC	3	6	84119	84124	0 %	50 %	0 %	50 %	532350503
1610	NC_022107	AG	3	6	84130	84135	50 %	0 %	50 %	0 %	532350503
1611	NC_022107	GAA	2	6	84163	84168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350503
1612	NC_022107	CAG	2	6	84302	84307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350503
1613	NC_022107	TAA	2	6	84348	84353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350503
1614	NC_022107	AG	3	6	84397	84402	50 %	0 %	50 %	0 %	532350503
1615	NC_022107	TTC	2	6	84416	84421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350503
1616	NC_022107	GAAG	2	8	84460	84467	50 %	0 %	50 %	0 %	532350503
1617	NC_022107	A	6	6	84484	84489	100 %	0 %	0 %	0 %	532350503
1618	NC_022107	AGA	2	6	84534	84539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350503
1619	NC_022107	TTC	2	6	84612	84617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350503
1620	NC_022107	TAAA	2	8	84626	84633	75 %	25 %	0 %	0 %	532350503
1621	NC_022107	ATCC	2	8	84697	84704	25 %	25 %	0 %	50 %	532350503
1622	NC_022107	TGG	2	6	84725	84730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350503
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1625	NC_022107	ACA	2	6	84789	84794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350503
1626	NC_022107	TTTC	2	8	84844	84851	0 %	75 %	0 %	25 %	532350503
1627	NC_022107	AGAT	2	8	84885	84892	50 %	25 %	25 %	0 %	532350503
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1993	NC_022107	TTTCT	2	10	103244	103253	0 %	80 %	0 %	20 %	532350519
1994	NC_022107	CGA	2	6	103275	103280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350519
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1996	NC_022107	T	9	9	103307	103315	0 %	100 %	0 %	0 %	532350519
1997	NC_022107	GCA	2	6	103422	103427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350519
1998	NC_022107	TGC	2	6	103459	103464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350519
1999	NC_022107	CTC	2	6	103477	103482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350519
2000	NC_022107	TTC	2	6	103527	103532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350520

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