MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022107	CTTC	2	8	54601	54608	0 %	50 %	0 %	50 %	532350483
1002	NC_022107	GAAT	2	8	54636	54643	50 %	25 %	25 %	0 %	532350483
1003	NC_022107	TGT	2	6	54672	54677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350483
1004	NC_022107	GAT	2	6	54700	54705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350483
1005	NC_022107	TTGA	2	8	54706	54713	25 %	50 %	25 %	0 %	532350483
1006	NC_022107	GTA	2	6	54746	54751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350483
1007	NC_022107	CTT	2	6	54760	54765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350483
1008	NC_022107	A	6	6	54895	54900	100 %	0 %	0 %	0 %	532350483
1009	NC_022107	G	6	6	54951	54956	0 %	0 %	100 %	0 %	532350483
1010	NC_022107	AAT	2	6	55048	55053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350483
1011	NC_022107	GGAA	2	8	55062	55069	50 %	0 %	50 %	0 %	532350483
1012	NC_022107	GATCTG	2	12	55097	55108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532350483
1013	NC_022107	GGTTCA	2	12	55234	55245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532350483
1014	NC_022107	TTATC	2	10	55335	55344	20 %	60 %	0 %	20 %	532350483
1015	NC_022107	TGAGT	2	10	55356	55365	20 %	40 %	40 %	0 %	532350483
1016	NC_022107	TCA	3	9	55369	55377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350483
1017	NC_022107	GTT	2	6	55384	55389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350483
1018	NC_022107	TCT	2	6	55429	55434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350483
1019	NC_022107	GGA	2	6	55435	55440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350483
1020	NC_022107	TGC	2	6	55470	55475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350483
1021	NC_022107	AT	3	6	55680	55685	50 %	50 %	0 %	0 %	532350483
1022	NC_022107	TTA	2	6	55695	55700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350483
1023	NC_022107	GTT	2	6	55863	55868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1024	NC_022107	TGT	2	6	55913	55918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1025	NC_022107	CTGG	3	12	55973	55984	0 %	25 %	50 %	25 %	532351274
1026	NC_022107	ATT	2	6	55988	55993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351274
1027	NC_022107	GAT	2	6	56001	56006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351274
1028	NC_022107	TCT	2	6	56019	56024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351274
1029	NC_022107	TCC	2	6	56054	56059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351274
1030	NC_022107	TTA	2	6	56067	56072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351274
1031	NC_022107	TTGC	2	8	56110	56117	0 %	50 %	25 %	25 %	532351274
1032	NC_022107	T	6	6	56162	56167	0 %	100 %	0 %	0 %	532351274
1033	NC_022107	GTA	2	6	56193	56198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351274
1034	NC_022107	GTT	2	6	56304	56309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1035	NC_022107	AG	3	6	56316	56321	50 %	0 %	50 %	0 %	532351274
1036	NC_022107	TGG	2	6	56324	56329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351274
1037	NC_022107	GTTGT	2	10	56403	56412	0 %	60 %	40 %	0 %	532351274
1038	NC_022107	T	6	6	56458	56463	0 %	100 %	0 %	0 %	532351274
1039	NC_022107	A	7	7	56500	56506	100 %	0 %	0 %	0 %	532351274
1040	NC_022107	TCC	2	6	56508	56513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351274
1041	NC_022107	AGT	3	9	56597	56605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351274
1042	NC_022107	AGCT	2	8	56609	56616	25 %	25 %	25 %	25 %	532351274
1043	NC_022107	CT	3	6	56615	56620	0 %	50 %	0 %	50 %	532351274
1044	NC_022107	TGG	2	6	56651	56656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351274
1045	NC_022107	GT	3	6	56665	56670	0 %	50 %	50 %	0 %	532351274
1046	NC_022107	TGT	2	6	56674	56679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1047	NC_022107	AGT	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351274
1048	NC_022107	GTT	2	6	56777	56782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1049	NC_022107	T	6	6	56781	56786	0 %	100 %	0 %	0 %	532351274
1050	NC_022107	AGA	2	6	56937	56942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351274
1051	NC_022107	CAG	2	6	57100	57105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351274
1052	NC_022107	TTG	2	6	57122	57127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1053	NC_022107	TGT	2	6	57200	57205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351274
1054	NC_022107	TG	3	6	57303	57308	0 %	50 %	50 %	0 %	532351274
1055	NC_022107	GGTT	2	8	57312	57319	0 %	50 %	50 %	0 %	532351274
1056	NC_022107	TAA	2	6	57368	57373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351274
1057	NC_022107	ACT	2	6	57384	57389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351274
1058	NC_022107	TTA	2	6	57390	57395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351274
1059	NC_022107	GAA	3	9	57408	57416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351274
1060	NC_022107	ATT	2	6	57419	57424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351274
1061	NC_022107	T	6	6	57423	57428	0 %	100 %	0 %	0 %	532351274
1062	NC_022107	ATT	2	6	57438	57443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351274
1063	NC_022107	TGA	2	6	57579	57584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351275
1064	NC_022107	TGT	2	6	57609	57614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351275
1065	NC_022107	GGA	2	6	57616	57621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351275
1066	NC_022107	GTT	2	6	57622	57627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351275
1067	NC_022107	GCT	2	6	57661	57666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351275
1068	NC_022107	GAT	2	6	57679	57684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351275
1069	NC_022107	TGA	2	6	57696	57701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351275
1070	NC_022107	TCC	2	6	57711	57716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351275
1071	NC_022107	AGTTGT	2	12	57775	57786	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532351275
1072	NC_022107	AGA	2	6	57846	57851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351275
1073	NC_022107	CTA	2	6	57862	57867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351275
1074	NC_022107	TGA	2	6	58032	58037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351275
1075	NC_022107	TGT	2	6	58104	58109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351275
1076	NC_022107	AGAA	2	8	58173	58180	75 %	0 %	25 %	0 %	532351275
1077	NC_022107	CT	3	6	58184	58189	0 %	50 %	0 %	50 %	532351275
1078	NC_022107	GTT	2	6	58193	58198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351275
1079	NC_022107	AGGT	2	8	58213	58220	25 %	25 %	50 %	0 %	532351275
1080	NC_022107	CAC	2	6	58326	58331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351275
1081	NC_022107	AGG	2	6	58377	58382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351275
1082	NC_022107	TCT	2	6	58393	58398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351275
1083	NC_022107	TCT	2	6	58513	58518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351275
1084	NC_022107	T	6	6	58521	58526	0 %	100 %	0 %	0 %	532351275
1085	NC_022107	GCT	2	6	58603	58608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351275
1086	NC_022107	ATC	2	6	58641	58646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351275
1087	NC_022107	TCT	2	6	58652	58657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351275
1088	NC_022107	TGT	2	6	58676	58681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351275
1089	NC_022107	TTGTTC	2	12	58695	58706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532351275
1090	NC_022107	T	6	6	58715	58720	0 %	100 %	0 %	0 %	532351275
1091	NC_022107	CTT	2	6	58733	58738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351275
1092	NC_022107	TTC	2	6	58764	58769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351275
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1094	NC_022107	TCC	2	6	58851	58856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351275
1095	NC_022107	TAGA	2	8	58892	58899	50 %	25 %	25 %	0 %	532351275
1096	NC_022107	TTA	2	6	58978	58983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351275
1097	NC_022107	TGAA	2	8	58997	59004	50 %	25 %	25 %	0 %	532351275
1098	NC_022107	T	8	8	59074	59081	0 %	100 %	0 %	0 %	532351275
1099	NC_022107	T	6	6	59094	59099	0 %	100 %	0 %	0 %	532351275
1100	NC_022107	T	6	6	59105	59110	0 %	100 %	0 %	0 %	532351275
1101	NC_022107	AGA	2	6	59178	59183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350484
1102	NC_022107	TCT	2	6	59194	59199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350484
1103	NC_022107	T	6	6	59226	59231	0 %	100 %	0 %	0 %	532350484
1104	NC_022107	CGTT	2	8	59377	59384	0 %	50 %	25 %	25 %	532350484
1105	NC_022107	GGAG	2	8	59386	59393	25 %	0 %	75 %	0 %	532350484
1106	NC_022107	GTAA	2	8	59438	59445	50 %	25 %	25 %	0 %	532350484
1107	NC_022107	TCCTAA	2	12	59505	59516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350484
1108	NC_022107	AGT	2	6	59534	59539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350484
1109	NC_022107	T	6	6	59566	59571	0 %	100 %	0 %	0 %	532350484
1110	NC_022107	TAG	2	6	59613	59618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350484
1111	NC_022107	GCT	2	6	59626	59631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350484
1112	NC_022107	GTC	2	6	59652	59657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350484
1113	NC_022107	ATGG	2	8	59665	59672	25 %	25 %	50 %	0 %	532350484
1114	NC_022107	AGG	2	6	59699	59704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350484
1115	NC_022107	GA	3	6	59751	59756	50 %	0 %	50 %	0 %	532350484
1116	NC_022107	CAA	2	6	59774	59779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350484
1117	NC_022107	ATAA	2	8	59811	59818	75 %	25 %	0 %	0 %	532350484
1118	NC_022107	GAGCA	2	10	59851	59860	40 %	0 %	40 %	20 %	532350484
1119	NC_022107	GT	3	6	59889	59894	0 %	50 %	50 %	0 %	532350484
1120	NC_022107	TAG	2	6	59901	59906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350484
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1123	NC_022107	T	7	7	60150	60156	0 %	100 %	0 %	0 %	532350484
1124	NC_022107	CTT	2	6	60200	60205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350484
1125	NC_022107	AAT	2	6	60230	60235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350484
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1127	NC_022107	ATGT	2	8	60261	60268	25 %	50 %	25 %	0 %	532350484
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1374	NC_022107	GATT	2	8	72674	72681	25 %	50 %	25 %	0 %	532350494
1375	NC_022107	GAA	2	6	72749	72754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350494
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1377	NC_022107	CTC	2	6	72802	72807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350494
1378	NC_022107	ACTCTT	2	12	72870	72881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532350494
1379	NC_022107	GAA	2	6	72891	72896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350494
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