MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022107	GAG	2	6	28363	28368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350457
502	NC_022107	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	532350457
503	NC_022107	GCA	2	6	28419	28424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350457
504	NC_022107	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	532350457
505	NC_022107	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532350457
506	NC_022107	TTC	2	6	28618	28623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350457
507	NC_022107	CAG	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350457
508	NC_022107	GAA	2	6	28644	28649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350457
509	NC_022107	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350457
510	NC_022107	TTC	2	6	28691	28696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350457
511	NC_022107	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	532350457
512	NC_022107	AAG	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350457
513	NC_022107	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	532350457
514	NC_022107	GAA	2	6	29073	29078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350457
515	NC_022107	TGT	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350458
516	NC_022107	TCT	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350458
517	NC_022107	ACA	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350458
518	NC_022107	ATG	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350458
519	NC_022107	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532350458
520	NC_022107	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532350458
521	NC_022107	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532350458
522	NC_022107	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532350458
523	NC_022107	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	532350458
524	NC_022107	ATC	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350458
525	NC_022107	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	532350458
526	NC_022107	T	8	8	29872	29879	0 %	100 %	0 %	0 %	532350458
527	NC_022107	ATG	2	6	29897	29902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350458
528	NC_022107	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	532350458
529	NC_022107	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	532350459
530	NC_022107	GTT	2	6	30114	30119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350459
531	NC_022107	GAA	2	6	30123	30128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350459
532	NC_022107	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	532350459
533	NC_022107	TCT	2	6	30189	30194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350459
534	NC_022107	ACT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350459
535	NC_022107	TTC	2	6	30307	30312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350459
536	NC_022107	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	532350459
537	NC_022107	CCT	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350459
538	NC_022107	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532350459
539	NC_022107	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	532350459
540	NC_022107	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532350459
541	NC_022107	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350459
542	NC_022107	GAT	2	6	30528	30533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350459
543	NC_022107	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532350459
544	NC_022107	TAG	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350459
545	NC_022107	GTT	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350459
546	NC_022107	TAA	2	6	30734	30739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350459
547	NC_022107	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	532350459
548	NC_022107	AGA	2	6	30893	30898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350459
549	NC_022107	TCG	2	6	30956	30961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350459
550	NC_022107	ATG	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350459
551	NC_022107	TGG	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350459
552	NC_022107	GAA	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350459
553	NC_022107	ATT	2	6	31071	31076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350459
554	NC_022107	ATG	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350459
555	NC_022107	AAG	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350459
556	NC_022107	T	6	6	31212	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	532350459
557	NC_022107	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	532350459
558	NC_022107	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	532350459
559	NC_022107	ACA	2	6	31300	31305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350460
560	NC_022107	TGT	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350460
561	NC_022107	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	532350460
562	NC_022107	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532350460
563	NC_022107	A	6	6	31535	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	532350460
564	NC_022107	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	532350460
565	NC_022107	TGC	2	6	31594	31599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350460
566	NC_022107	AGC	2	6	31612	31617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350460
567	NC_022107	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	532350461
568	NC_022107	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	532350461
569	NC_022107	AAG	2	6	31861	31866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350461
570	NC_022107	AAG	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350461
571	NC_022107	CTT	2	6	31907	31912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350461
572	NC_022107	CGT	2	6	31938	31943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350461
573	NC_022107	TGA	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350461
574	NC_022107	GAG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350461
575	NC_022107	GCG	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350461
576	NC_022107	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	532350461
577	NC_022107	AGA	2	6	32235	32240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350461
578	NC_022107	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	532350461
579	NC_022107	AAG	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350461
580	NC_022107	ATT	2	6	32473	32478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350461
581	NC_022107	T	6	6	32578	32583	0 %	100 %	0 %	0 %	532350461
582	NC_022107	GGA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350461
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590	NC_022107	TGA	2	6	33335	33340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350463
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593	NC_022107	CTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350463
594	NC_022107	T	6	6	33518	33523	0 %	100 %	0 %	0 %	532350463
595	NC_022107	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350463
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598	NC_022107	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	532350463
599	NC_022107	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	532350463
600	NC_022107	CTG	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350464
601	NC_022107	ACA	2	6	33893	33898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350464
602	NC_022107	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	532350464
603	NC_022107	GTC	2	6	33949	33954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350464
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607	NC_022107	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532350464
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611	NC_022107	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532350464
612	NC_022107	TGC	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350464
613	NC_022107	TGT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350464
614	NC_022107	ATG	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350464
615	NC_022107	AAG	2	6	34372	34377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350464
616	NC_022107	GAA	2	6	34391	34396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350464
617	NC_022107	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532350465
618	NC_022107	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532350465
619	NC_022107	GAT	2	6	34602	34607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350465
620	NC_022107	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	532350465
621	NC_022107	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532350465
622	NC_022107	AGA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350465
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