MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 2535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532349508
2	NC_022106	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532349509
3	NC_022106	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532349509
4	NC_022106	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532349510
5	NC_022106	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532349510
6	NC_022106	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532349510
7	NC_022106	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532349511
8	NC_022106	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532349511
9	NC_022106	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532349511
10	NC_022106	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532349511
11	NC_022106	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532349512
12	NC_022106	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532349512
13	NC_022106	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532349512
14	NC_022106	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532349513
15	NC_022106	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532349513
16	NC_022106	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532350346
17	NC_022106	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532350346
18	NC_022106	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532349514
19	NC_022106	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532349515
20	NC_022106	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532349515
21	NC_022106	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532349515
22	NC_022106	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532349515
23	NC_022106	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532349516
24	NC_022106	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532349516
25	NC_022106	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532349516
26	NC_022106	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	532349517
27	NC_022106	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	532349517
28	NC_022106	AGCC	2	8	10656	10663	25 %	0 %	25 %	50 %	532349517
29	NC_022106	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	532349517
30	NC_022106	AATG	2	8	11542	11549	50 %	25 %	25 %	0 %	532349518
31	NC_022106	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	532349519
32	NC_022106	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	532349519
33	NC_022106	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	532349520
34	NC_022106	TTCT	2	8	14211	14218	0 %	75 %	0 %	25 %	532349520
35	NC_022106	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	532349520
36	NC_022106	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	532349521
37	NC_022106	AAAT	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	532349521
38	NC_022106	GTAA	2	8	16403	16410	50 %	25 %	25 %	0 %	532349522
39	NC_022106	CTAA	2	8	16596	16603	50 %	25 %	0 %	25 %	532349522
40	NC_022106	AGAA	2	8	16859	16866	75 %	0 %	25 %	0 %	532349522
41	NC_022106	ATTT	2	8	17005	17012	25 %	75 %	0 %	0 %	532349522
42	NC_022106	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	532349524
43	NC_022106	GAAG	2	8	19511	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
44	NC_022106	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	532349524
45	NC_022106	TGTA	2	8	20229	20236	25 %	50 %	25 %	0 %	532349525
46	NC_022106	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	532349526
47	NC_022106	CATT	2	8	22704	22711	25 %	50 %	0 %	25 %	532349526
48	NC_022106	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532349526
49	NC_022106	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532349526
50	NC_022106	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532349526
51	NC_022106	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532349526
52	NC_022106	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532349526
53	NC_022106	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532349526
54	NC_022106	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	532349527
55	NC_022106	TTCG	2	8	25201	25208	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
56	NC_022106	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
57	NC_022106	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	532349527
58	NC_022106	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
59	NC_022106	TTTC	2	8	25953	25960	0 %	75 %	0 %	25 %	532349527
60	NC_022106	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
61	NC_022106	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	532349528
62	NC_022106	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	532349528
63	NC_022106	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	532349528
64	NC_022106	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	532349528
65	NC_022106	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	532349529
66	NC_022106	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	532349529
67	NC_022106	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532349531
68	NC_022106	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
69	NC_022106	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
70	NC_022106	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	532349531
71	NC_022106	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	532349532
72	NC_022106	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532349532
73	NC_022106	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532349532
74	NC_022106	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	532349534
75	NC_022106	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532349537
76	NC_022106	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532349537
77	NC_022106	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532349538
78	NC_022106	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532349538
79	NC_022106	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	532349539
80	NC_022106	TCGA	2	8	35160	35167	25 %	25 %	25 %	25 %	532349539
81	NC_022106	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	532349539
82	NC_022106	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532349539
83	NC_022106	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	532349539
84	NC_022106	CTTT	2	8	36638	36645	0 %	75 %	0 %	25 %	532349540
85	NC_022106	ATGA	2	8	37128	37135	50 %	25 %	25 %	0 %	532349540
86	NC_022106	TAGG	2	8	37287	37294	25 %	25 %	50 %	0 %	532349540
87	NC_022106	CAAT	2	8	37471	37478	50 %	25 %	0 %	25 %	532349540
88	NC_022106	AATG	2	8	38258	38265	50 %	25 %	25 %	0 %	532349540
89	NC_022106	AGAA	2	8	39095	39102	75 %	0 %	25 %	0 %	532349541
90	NC_022106	AAGA	2	8	39147	39154	75 %	0 %	25 %	0 %	532349541
91	NC_022106	ATCC	2	8	39155	39162	25 %	25 %	0 %	50 %	532349541
92	NC_022106	TAAT	2	8	39366	39373	50 %	50 %	0 %	0 %	532349541
93	NC_022106	GTGC	2	8	41455	41462	0 %	25 %	50 %	25 %	532349543
94	NC_022106	AGAA	2	8	41874	41881	75 %	0 %	25 %	0 %	532349543
95	NC_022106	GGAT	2	8	42026	42033	25 %	25 %	50 %	0 %	532349543
96	NC_022106	AAAC	2	8	43234	43241	75 %	0 %	0 %	25 %	532349545
97	NC_022106	CAAT	2	8	43438	43445	50 %	25 %	0 %	25 %	532349545
98	NC_022106	ATTT	2	8	44195	44202	25 %	75 %	0 %	0 %	532349547
99	NC_022106	GCTC	2	8	44503	44510	0 %	25 %	25 %	50 %	532349547
100	NC_022106	TTCT	2	8	44645	44652	0 %	75 %	0 %	25 %	532349547
101	NC_022106	TTGA	2	8	45245	45252	25 %	50 %	25 %	0 %	532349548
102	NC_022106	TGTT	2	8	45417	45424	0 %	75 %	25 %	0 %	532349548
103	NC_022106	CTAT	2	8	45447	45454	25 %	50 %	0 %	25 %	532349548
104	NC_022106	TGTT	2	8	45476	45483	0 %	75 %	25 %	0 %	532349548
105	NC_022106	CTAT	2	8	45772	45779	25 %	50 %	0 %	25 %	532349548
106	NC_022106	AAGA	2	8	46268	46275	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
107	NC_022106	AAGA	2	8	46325	46332	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
108	NC_022106	AAAG	2	8	46365	46372	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
109	NC_022106	AAGA	2	8	46480	46487	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
110	NC_022106	ACTT	2	8	46741	46748	25 %	50 %	0 %	25 %	532349549
111	NC_022106	ATGG	2	8	47367	47374	25 %	25 %	50 %	0 %	532349549
112	NC_022106	AGGA	2	8	47398	47405	50 %	0 %	50 %	0 %	532349549
113	NC_022106	GAAC	2	8	47945	47952	50 %	0 %	25 %	25 %	532349549
114	NC_022106	AAGT	2	8	47980	47987	50 %	25 %	25 %	0 %	532349549
115	NC_022106	AACA	2	8	48189	48196	75 %	0 %	0 %	25 %	532349550
116	NC_022106	CTTT	2	8	48385	48392	0 %	75 %	0 %	25 %	532349550
117	NC_022106	CTTT	2	8	49270	49277	0 %	75 %	0 %	25 %	532349551
118	NC_022106	GTAG	2	8	49288	49295	25 %	25 %	50 %	0 %	532349551
119	NC_022106	GAAG	2	8	50716	50723	50 %	0 %	50 %	0 %	532349552
120	NC_022106	TTCA	2	8	51138	51145	25 %	50 %	0 %	25 %	532349552
121	NC_022106	TCTA	2	8	51355	51362	25 %	50 %	0 %	25 %	532349552
122	NC_022106	GGAA	2	8	52521	52528	50 %	0 %	50 %	0 %	532349554
123	NC_022106	TTAA	2	8	53262	53269	50 %	50 %	0 %	0 %	532349554
124	NC_022106	CCTT	2	8	53469	53476	0 %	50 %	0 %	50 %	532349555
125	NC_022106	TTTA	2	8	53636	53643	25 %	75 %	0 %	0 %	532349555
126	NC_022106	AAAG	2	8	53860	53867	75 %	0 %	25 %	0 %	532349555
127	NC_022106	GATT	2	8	53997	54004	25 %	50 %	25 %	0 %	532349555
128	NC_022106	AATC	2	8	54052	54059	50 %	25 %	0 %	25 %	532349555
129	NC_022106	GGAT	2	8	54345	54352	25 %	25 %	50 %	0 %	532349556
130	NC_022106	TCGA	2	8	54507	54514	25 %	25 %	25 %	25 %	532349556
131	NC_022106	CTTC	2	8	54601	54608	0 %	50 %	0 %	50 %	532349556
132	NC_022106	GAAT	2	8	54636	54643	50 %	25 %	25 %	0 %	532349556
133	NC_022106	TTGA	2	8	54706	54713	25 %	50 %	25 %	0 %	532349556
134	NC_022106	GGAA	2	8	55062	55069	50 %	0 %	50 %	0 %	532349556
135	NC_022106	CTGG	3	12	55973	55984	0 %	25 %	50 %	25 %	532350348
136	NC_022106	TTGC	2	8	56110	56117	0 %	50 %	25 %	25 %	532350348
137	NC_022106	AGCT	2	8	56609	56616	25 %	25 %	25 %	25 %	532350348
138	NC_022106	GGTT	2	8	57312	57319	0 %	50 %	50 %	0 %	532350348
139	NC_022106	AGAA	2	8	58173	58180	75 %	0 %	25 %	0 %	532350349
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141	NC_022106	TAGA	2	8	58892	58899	50 %	25 %	25 %	0 %	532350349
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