MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022106	AG	3	6	153341	153346	50 %	0 %	50 %	0 %	532349634
3002	NC_022106	CTTT	2	8	153370	153377	0 %	75 %	0 %	25 %	532349634
3003	NC_022106	AT	3	6	153495	153500	50 %	50 %	0 %	0 %	532349635
3004	NC_022106	T	7	7	153510	153516	0 %	100 %	0 %	0 %	532349635
3005	NC_022106	T	6	6	153581	153586	0 %	100 %	0 %	0 %	532349635
3006	NC_022106	ATC	2	6	153611	153616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349635
3007	NC_022106	T	6	6	153621	153626	0 %	100 %	0 %	0 %	532349635
3008	NC_022106	TGTGCG	2	12	153635	153646	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532349635
3009	NC_022106	TCT	2	6	153760	153765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349635
3010	NC_022106	CAG	2	6	153799	153804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349635
3011	NC_022106	GATC	2	8	153871	153878	25 %	25 %	25 %	25 %	532349635
3012	NC_022106	ATT	2	6	153886	153891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349635
3013	NC_022106	ATG	2	6	153913	153918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349635
3014	NC_022106	ACG	2	6	153919	153924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349635
3015	NC_022106	TTC	2	6	153936	153941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349635
3016	NC_022106	AGC	2	6	153978	153983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349635
3017	NC_022106	AATC	2	8	153991	153998	50 %	25 %	0 %	25 %	532349635
3018	NC_022106	GAA	2	6	154003	154008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349635
3019	NC_022106	TA	3	6	154036	154041	50 %	50 %	0 %	0 %	532349635
3020	NC_022106	GAT	2	6	154057	154062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349635
3021	NC_022106	TA	3	6	154094	154099	50 %	50 %	0 %	0 %	532349635
3022	NC_022106	CTT	2	6	154112	154117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349635
3023	NC_022106	GGA	2	6	154144	154149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349635
3024	NC_022106	TGT	2	6	154161	154166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349635
3025	NC_022106	ATG	2	6	154168	154173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349635
3026	NC_022106	GCA	2	6	154245	154250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349636
3027	NC_022106	GAG	2	6	154255	154260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349636
3028	NC_022106	ATT	2	6	154350	154355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349636
3029	NC_022106	AGA	2	6	154410	154415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349636
3030	NC_022106	TTC	2	6	154475	154480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349636
3031	NC_022106	ATA	2	6	154508	154513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349636
3032	NC_022106	ATC	2	6	154556	154561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349636
3033	NC_022106	GCA	2	6	154569	154574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349636
3034	NC_022106	CTG	2	6	154643	154648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349636
3035	NC_022106	GAA	2	6	154672	154677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349636
3036	NC_022106	GAG	2	6	154738	154743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349636
3037	NC_022106	A	6	6	154841	154846	100 %	0 %	0 %	0 %	532349636
3038	NC_022106	TGT	2	6	154857	154862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349636
3039	NC_022106	CCTCAT	2	12	154933	154944	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532349636
3040	NC_022106	AGGC	2	8	154963	154970	25 %	0 %	50 %	25 %	532349636
3041	NC_022106	GAGT	2	8	155051	155058	25 %	25 %	50 %	0 %	532349636
3042	NC_022106	CAC	2	6	155203	155208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349637
3043	NC_022106	TTCTT	2	10	155231	155240	0 %	80 %	0 %	20 %	532349637
3044	NC_022106	GACT	2	8	155259	155266	25 %	25 %	25 %	25 %	532349637
3045	NC_022106	GTA	2	6	155313	155318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349637
3046	NC_022106	TGT	2	6	155382	155387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349637
3047	NC_022106	TA	3	6	155411	155416	50 %	50 %	0 %	0 %	532349637
3048	NC_022106	TGG	3	9	155446	155454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349637
3049	NC_022106	TTG	2	6	155504	155509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349637
3050	NC_022106	GAT	2	6	155561	155566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349637
3051	NC_022106	CG	3	6	155630	155635	0 %	0 %	50 %	50 %	532349637
3052	NC_022106	TTA	2	6	155657	155662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349637
3053	NC_022106	T	7	7	155816	155822	0 %	100 %	0 %	0 %	532349637
3054	NC_022106	GAA	2	6	155831	155836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349637
3055	NC_022106	AC	3	6	155881	155886	50 %	0 %	0 %	50 %	532349637
3056	NC_022106	AGG	2	6	155895	155900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349637
3057	NC_022106	AAAG	2	8	155977	155984	75 %	0 %	25 %	0 %	532349637
3058	NC_022106	ATT	2	6	156319	156324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349638
3059	NC_022106	AT	3	6	156328	156333	50 %	50 %	0 %	0 %	532349638
3060	NC_022106	CTT	2	6	156366	156371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349638
3061	NC_022106	TGGAGA	2	12	156391	156402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532349638
3062	NC_022106	GCTT	2	8	156434	156441	0 %	50 %	25 %	25 %	532349638
3063	NC_022106	GCA	2	6	156464	156469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349638
3064	NC_022106	TAGA	2	8	156486	156493	50 %	25 %	25 %	0 %	532349638
3065	NC_022106	AG	3	6	156561	156566	50 %	0 %	50 %	0 %	532349638
3066	NC_022106	CCCA	2	8	156614	156621	25 %	0 %	0 %	75 %	532349638
3067	NC_022106	CTT	2	6	156635	156640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349638
3068	NC_022106	ATG	2	6	156671	156676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349638
3069	NC_022106	TAA	2	6	156719	156724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349638
3070	NC_022106	T	7	7	156728	156734	0 %	100 %	0 %	0 %	532349638
3071	NC_022106	AGA	2	6	156784	156789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349638
3072	NC_022106	A	6	6	156820	156825	100 %	0 %	0 %	0 %	532349638
3073	NC_022106	GAA	3	9	156887	156895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349638
3074	NC_022106	GT	3	6	156950	156955	0 %	50 %	50 %	0 %	532349638
3075	NC_022106	AGC	2	6	156961	156966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349638
3076	NC_022106	TCT	2	6	156974	156979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349638
3077	NC_022106	AG	3	6	156989	156994	50 %	0 %	50 %	0 %	532349638
3078	NC_022106	AGG	2	6	157062	157067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349638
3079	NC_022106	AG	3	6	157090	157095	50 %	0 %	50 %	0 %	532349638
3080	NC_022106	AG	3	6	157107	157112	50 %	0 %	50 %	0 %	532349638
3081	NC_022106	AG	3	6	157172	157177	50 %	0 %	50 %	0 %	532349638
3082	NC_022106	ATC	2	6	157183	157188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349638
3083	NC_022106	GGA	2	6	157217	157222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349638
3084	NC_022106	ATA	2	6	157253	157258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349638
3085	NC_022106	A	6	6	157261	157266	100 %	0 %	0 %	0 %	532349638
3086	NC_022106	ACAT	2	8	157277	157284	50 %	25 %	0 %	25 %	532349638
3087	NC_022106	ATT	2	6	157474	157479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349639
3088	NC_022106	T	7	7	157516	157522	0 %	100 %	0 %	0 %	532349639
3089	NC_022106	CTTG	2	8	157659	157666	0 %	50 %	25 %	25 %	532349639
3090	NC_022106	GA	3	6	157675	157680	50 %	0 %	50 %	0 %	532349639
3091	NC_022106	GCA	2	6	157728	157733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349639
3092	NC_022106	CTTT	2	8	157736	157743	0 %	75 %	0 %	25 %	532349639
3093	NC_022106	CTCCAT	2	12	157760	157771	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532349639
3094	NC_022106	ATT	2	6	157838	157843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349639
3095	NC_022106	GAT	2	6	157864	157869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349639
3096	NC_022106	A	6	6	157907	157912	100 %	0 %	0 %	0 %	532349639
3097	NC_022106	T	6	6	157986	157991	0 %	100 %	0 %	0 %	532349639
3098	NC_022106	ATG	2	6	158036	158041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349639
3099	NC_022106	TG	3	6	158087	158092	0 %	50 %	50 %	0 %	532349639
3100	NC_022106	T	6	6	158106	158111	0 %	100 %	0 %	0 %	532349639
3101	NC_022106	AGA	2	6	158128	158133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349639
3102	NC_022106	TCCTTG	2	12	158356	158367	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532349640
3103	NC_022106	GAA	2	6	158377	158382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349640
3104	NC_022106	GTT	2	6	158394	158399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349640
3105	NC_022106	TTA	2	6	158565	158570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349640
3106	NC_022106	CG	3	6	158597	158602	0 %	0 %	50 %	50 %	532349640
3107	NC_022106	AGA	2	6	158623	158628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349640
3108	NC_022106	CAT	2	6	158632	158637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349640
3109	NC_022106	TTC	2	6	158727	158732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349640
3110	NC_022106	AGA	3	9	158737	158745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349640
3111	NC_022106	ATT	2	6	159193	159198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349641
3112	NC_022106	CAT	2	6	159345	159350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349641
3113	NC_022106	TCAA	2	8	159406	159413	50 %	25 %	0 %	25 %	532349641
3114	NC_022106	TGA	2	6	159603	159608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349641
3115	NC_022106	GAA	2	6	159631	159636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349641
3116	NC_022106	TC	3	6	159666	159671	0 %	50 %	0 %	50 %	532349641
3117	NC_022106	GT	3	6	159704	159709	0 %	50 %	50 %	0 %	532349641
3118	NC_022106	AAT	2	6	159748	159753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349641
3119	NC_022106	GGA	2	6	159760	159765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349641
3120	NC_022106	AGGAA	2	10	159789	159798	60 %	0 %	40 %	0 %	532349641
3121	NC_022106	TAG	2	6	159819	159824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349641
3122	NC_022106	AGG	2	6	159825	159830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349641
3123	NC_022106	CTG	2	6	159845	159850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349641
3124	NC_022106	AG	3	6	159876	159881	50 %	0 %	50 %	0 %	532349641
3125	NC_022106	TCT	2	6	159904	159909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349641
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3245	NC_022106	AG	3	6	166403	166408	50 %	0 %	50 %	0 %	532349646
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3492	NC_022106	AGT	2	6	178858	178863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350362
3493	NC_022106	GAT	2	6	178893	178898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350362
3494	NC_022106	CTC	2	6	178913	178918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350362
3495	NC_022106	AAG	2	6	178942	178947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350362
3496	NC_022106	AAG	2	6	178960	178965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350362
3497	NC_022106	TGC	2	6	179028	179033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350362
3498	NC_022106	AGC	2	6	179068	179073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350362
3499	NC_022106	GA	3	6	179169	179174	50 %	0 %	50 %	0 %	532350362
3500	NC_022106	ACT	2	6	179203	179208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350362

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