MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022106	CTC	2	6	103477	103482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349592
2002	NC_022106	TTC	2	6	103527	103532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349593
2003	NC_022106	CTT	2	6	103563	103568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349593
2004	NC_022106	AGG	2	6	103654	103659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349593
2005	NC_022106	TCC	2	6	103663	103668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349593
2006	NC_022106	AGG	2	6	103669	103674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349593
2007	NC_022106	GTTT	2	8	103757	103764	0 %	75 %	25 %	0 %	532349593
2008	NC_022106	ATC	2	6	103778	103783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349593
2009	NC_022106	GA	3	6	103833	103838	50 %	0 %	50 %	0 %	532349593
2010	NC_022106	AGTA	2	8	103882	103889	50 %	25 %	25 %	0 %	532349593
2011	NC_022106	GGAA	2	8	104043	104050	50 %	0 %	50 %	0 %	532349593
2012	NC_022106	GAA	2	6	104116	104121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349593
2013	NC_022106	GAA	2	6	104133	104138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349593
2014	NC_022106	GCA	2	6	104228	104233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349593
2015	NC_022106	GTAA	2	8	104239	104246	50 %	25 %	25 %	0 %	532349593
2016	NC_022106	TCT	2	6	104276	104281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349593
2017	NC_022106	TGG	2	6	104305	104310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349593
2018	NC_022106	CAG	2	6	104341	104346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349593
2019	NC_022106	AAGG	2	8	104369	104376	50 %	0 %	50 %	0 %	532349593
2020	NC_022106	GTAC	2	8	104384	104391	25 %	25 %	25 %	25 %	532349593
2021	NC_022106	AG	3	6	104427	104432	50 %	0 %	50 %	0 %	532349593
2022	NC_022106	ATCAT	2	10	104450	104459	40 %	40 %	0 %	20 %	532349593
2023	NC_022106	GTT	2	6	104487	104492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349593
2024	NC_022106	ATC	2	6	104551	104556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349593
2025	NC_022106	GTA	3	9	104600	104608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349593
2026	NC_022106	T	6	6	104623	104628	0 %	100 %	0 %	0 %	532349593
2027	NC_022106	GAA	2	6	104719	104724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349593
2028	NC_022106	AG	3	6	104867	104872	50 %	0 %	50 %	0 %	532349593
2029	NC_022106	TCC	2	6	104971	104976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349593
2030	NC_022106	CTTT	2	8	105065	105072	0 %	75 %	0 %	25 %	532349593
2031	NC_022106	ATCA	2	8	105109	105116	50 %	25 %	0 %	25 %	532349593
2032	NC_022106	GGCAT	2	10	105158	105167	20 %	20 %	40 %	20 %	532349593
2033	NC_022106	AGC	2	6	105181	105186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349593
2034	NC_022106	ATG	2	6	105233	105238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349593
2035	NC_022106	TGA	2	6	105240	105245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349593
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2037	NC_022106	TCC	2	6	105277	105282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349593
2038	NC_022106	ACG	2	6	105284	105289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349593
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2041	NC_022106	CAG	2	6	105448	105453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349593
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2043	NC_022106	ATC	2	6	105521	105526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349593
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2046	NC_022106	CGT	2	6	106006	106011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349594
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2048	NC_022106	AGG	2	6	106203	106208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349594
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2050	NC_022106	AGC	2	6	106269	106274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349594
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2052	NC_022106	CAA	2	6	106422	106427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349594
2053	NC_022106	AG	3	6	106459	106464	50 %	0 %	50 %	0 %	532349594
2054	NC_022106	TCAGAA	2	12	106469	106480	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532349594
2055	NC_022106	T	6	6	106489	106494	0 %	100 %	0 %	0 %	532349594
2056	NC_022106	ATA	2	6	106497	106502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349594
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2058	NC_022106	T	6	6	106666	106671	0 %	100 %	0 %	0 %	532349594
2059	NC_022106	T	6	6	106709	106714	0 %	100 %	0 %	0 %	532349594
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2061	NC_022106	T	8	8	106858	106865	0 %	100 %	0 %	0 %	532350354
2062	NC_022106	TAG	2	6	107006	107011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349595
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2095	NC_022106	CTC	2	6	108777	108782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349596
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2098	NC_022106	GCTG	2	8	108833	108840	0 %	25 %	50 %	25 %	532349596
2099	NC_022106	A	6	6	108877	108882	100 %	0 %	0 %	0 %	532349596
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2101	NC_022106	A	6	6	108919	108924	100 %	0 %	0 %	0 %	532349596
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2107	NC_022106	CTTT	2	8	109290	109297	0 %	75 %	0 %	25 %	532350355
2108	NC_022106	AGG	2	6	109309	109314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350355
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2111	NC_022106	CAA	2	6	109392	109397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350355
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2119	NC_022106	AGA	2	6	109752	109757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349597
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2122	NC_022106	TC	3	6	109947	109952	0 %	50 %	0 %	50 %	532349597
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2124	NC_022106	TTC	2	6	110065	110070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349597
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2242	NC_022106	CAA	2	6	115676	115681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349599
2243	NC_022106	TTC	3	9	115725	115733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349599
2244	NC_022106	TCT	2	6	115786	115791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349599
2245	NC_022106	AAGC	2	8	115795	115802	50 %	0 %	25 %	25 %	532349599
2246	NC_022106	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	532349599
2247	NC_022106	T	6	6	115819	115824	0 %	100 %	0 %	0 %	532349599
2248	NC_022106	GGTT	2	8	116127	116134	0 %	50 %	50 %	0 %	532349600
2249	NC_022106	T	7	7	116143	116149	0 %	100 %	0 %	0 %	532349600
2250	NC_022106	GCT	2	6	116269	116274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349600
2251	NC_022106	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	532349600
2252	NC_022106	ACA	2	6	116356	116361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349600
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2254	NC_022106	TATC	2	8	116576	116583	25 %	50 %	0 %	25 %	532349600
2255	NC_022106	TTTG	2	8	116673	116680	0 %	75 %	25 %	0 %	532349600
2256	NC_022106	AGG	3	9	116685	116693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349600
2257	NC_022106	AGA	2	6	116706	116711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349600
2258	NC_022106	GA	3	6	116760	116765	50 %	0 %	50 %	0 %	532349600
2259	NC_022106	A	6	6	116813	116818	100 %	0 %	0 %	0 %	532349600
2260	NC_022106	GTTC	2	8	116869	116876	0 %	50 %	25 %	25 %	532349600
2261	NC_022106	TAA	2	6	116889	116894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349600
2262	NC_022106	ACC	2	6	116905	116910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349600
2263	NC_022106	GCT	2	6	116923	116928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349600
2264	NC_022106	AGG	2	6	116973	116978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349600
2265	NC_022106	ATT	2	6	117007	117012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349600
2266	NC_022106	TTC	2	6	117024	117029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349600
2267	NC_022106	TGC	2	6	117054	117059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349600
2268	NC_022106	CTG	2	6	117101	117106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349600
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2270	NC_022106	TGC	2	6	117317	117322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349601
2271	NC_022106	AAG	2	6	117325	117330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349601
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2273	NC_022106	GTT	2	6	117420	117425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349601
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2280	NC_022106	CAA	2	6	117657	117662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350357
2281	NC_022106	AGA	2	6	117663	117668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350357
2282	NC_022106	AAG	2	6	117709	117714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350358
2283	NC_022106	TAA	2	6	117722	117727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350358
2284	NC_022106	T	6	6	117743	117748	0 %	100 %	0 %	0 %	532350358
2285	NC_022106	CA	3	6	117930	117935	50 %	0 %	0 %	50 %	532350358
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2288	NC_022106	T	6	6	118146	118151	0 %	100 %	0 %	0 %	532349602
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2292	NC_022106	G	6	6	118282	118287	0 %	0 %	100 %	0 %	532349602
2293	NC_022106	T	6	6	118305	118310	0 %	100 %	0 %	0 %	532349602
2294	NC_022106	GTT	2	6	118423	118428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349602
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2304	NC_022106	TTC	2	6	118819	118824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349603
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2306	NC_022106	TTTA	2	8	118850	118857	25 %	75 %	0 %	0 %	532349603
2307	NC_022106	CTG	2	6	119048	119053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349603
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2314	NC_022106	GTT	2	6	119282	119287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349603
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2319	NC_022106	AG	3	6	119558	119563	50 %	0 %	50 %	0 %	532349604
2320	NC_022106	GCTA	2	8	119580	119587	25 %	25 %	25 %	25 %	532349604
2321	NC_022106	GA	3	6	119591	119596	50 %	0 %	50 %	0 %	532349604
2322	NC_022106	AAG	2	6	119599	119604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349604
2323	NC_022106	GCT	3	9	119605	119613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349604
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2327	NC_022106	GCTA	2	8	119712	119719	25 %	25 %	25 %	25 %	532349604
2328	NC_022106	CGGC	2	8	119761	119768	0 %	0 %	50 %	50 %	532349604
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2332	NC_022106	AG	3	6	119869	119874	50 %	0 %	50 %	0 %	532349604
2333	NC_022106	GA	4	8	119912	119919	50 %	0 %	50 %	0 %	532349604
2334	NC_022106	GGC	2	6	119952	119957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349604
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2337	NC_022106	GA	3	6	120245	120250	50 %	0 %	50 %	0 %	532349604
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2339	NC_022106	TTGGTA	2	12	120640	120651	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532349605
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2341	NC_022106	TCA	2	6	120687	120692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349605
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2344	NC_022106	TGC	2	6	120758	120763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349605
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2347	NC_022106	CTTC	2	8	120987	120994	0 %	50 %	0 %	50 %	532349605
2348	NC_022106	GTA	2	6	120996	121001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349605
2349	NC_022106	AGGATC	2	12	121019	121030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532349605
2350	NC_022106	CTT	2	6	121171	121176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349605
2351	NC_022106	CAG	2	6	121213	121218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349605
2352	NC_022106	AGG	2	6	121244	121249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349605
2353	NC_022106	CT	3	6	121304	121309	0 %	50 %	0 %	50 %	532349605
2354	NC_022106	GAA	2	6	121358	121363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2355	NC_022106	TCC	2	6	121449	121454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349605
2356	NC_022106	ATG	2	6	121558	121563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349605
2357	NC_022106	TGC	2	6	121575	121580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349605
2358	NC_022106	CTT	2	6	121600	121605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349605
2359	NC_022106	AGA	2	6	121697	121702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2360	NC_022106	GAA	2	6	121713	121718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2361	NC_022106	TTTC	2	8	121795	121802	0 %	75 %	0 %	25 %	532349605
2362	NC_022106	AAC	2	6	121846	121851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349605
2363	NC_022106	AAG	2	6	121867	121872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2364	NC_022106	TGA	2	6	121894	121899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349605
2365	NC_022106	AT	3	6	122006	122011	50 %	50 %	0 %	0 %	532349605
2366	NC_022106	GTT	2	6	122046	122051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349605
2367	NC_022106	CAA	2	6	122063	122068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349605
2368	NC_022106	AAG	2	6	122071	122076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2369	NC_022106	AGA	2	6	122138	122143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349605
2370	NC_022106	TGA	2	6	122150	122155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349605
2371	NC_022106	CTT	2	6	122193	122198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349605
2372	NC_022106	TC	3	6	122216	122221	0 %	50 %	0 %	50 %	532349605
2373	NC_022106	ATC	2	6	122399	122404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349605
2374	NC_022106	AAAG	2	8	122526	122533	75 %	0 %	25 %	0 %	532349605
2375	NC_022106	GA	3	6	122546	122551	50 %	0 %	50 %	0 %	532349605
2376	NC_022106	GCTTC	2	10	122554	122563	0 %	40 %	20 %	40 %	532349605
2377	NC_022106	TCTA	2	8	122595	122602	25 %	50 %	0 %	25 %	532349605
2378	NC_022106	ACT	2	6	122756	122761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349606
2379	NC_022106	AAGGGT	2	12	122826	122837	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532349606
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2381	NC_022106	T	6	6	122868	122873	0 %	100 %	0 %	0 %	532349606
2382	NC_022106	AGCT	2	8	122901	122908	25 %	25 %	25 %	25 %	532349606
2383	NC_022106	CAA	2	6	122970	122975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349606
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2386	NC_022106	ATA	2	6	123126	123131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349606
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2390	NC_022106	GAT	2	6	123436	123441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349606
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2392	NC_022106	AGA	2	6	123580	123585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349606
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2394	NC_022106	GA	3	6	123766	123771	50 %	0 %	50 %	0 %	532349607
2395	NC_022106	GGGTTT	2	12	123789	123800	0 %	50 %	50 %	0 %	532349607
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2399	NC_022106	TGGA	2	8	123857	123864	25 %	25 %	50 %	0 %	532349607
2400	NC_022106	GCAA	2	8	123892	123899	50 %	0 %	25 %	25 %	532349607
2401	NC_022106	TTA	2	6	123937	123942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349607
2402	NC_022106	TTA	2	6	123978	123983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349607
2403	NC_022106	GGA	2	6	123995	124000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349607
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2407	NC_022106	CTG	2	6	124098	124103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349607
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2411	NC_022106	AG	3	6	124178	124183	50 %	0 %	50 %	0 %	532349607
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2449	NC_022106	T	7	7	126321	126327	0 %	100 %	0 %	0 %	532349609
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2456	NC_022106	TTG	2	6	126744	126749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349610
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2480	NC_022106	AG	3	6	127551	127556	50 %	0 %	50 %	0 %	532349610
2481	NC_022106	ATTC	2	8	127572	127579	25 %	50 %	0 %	25 %	532349610
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2490	NC_022106	CTT	2	6	127925	127930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349610
2491	NC_022106	CTT	2	6	127976	127981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349610
2492	NC_022106	ACA	2	6	128038	128043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349610
2493	NC_022106	GTC	2	6	128045	128050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349610
2494	NC_022106	CTT	2	6	128120	128125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349610
2495	NC_022106	TGC	2	6	128319	128324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349611
2496	NC_022106	ATC	2	6	128330	128335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349611
2497	NC_022106	T	6	6	128336	128341	0 %	100 %	0 %	0 %	532349611
2498	NC_022106	GAA	2	6	128398	128403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349611
2499	NC_022106	CTT	3	9	128428	128436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349611
2500	NC_022106	AGCT	2	8	128680	128687	25 %	25 %	25 %	25 %	532349612

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