MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022106	AAG	2	6	992835	992840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350314
19502	NC_022106	CCG	2	6	992859	992864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350314
19503	NC_022106	CCT	2	6	992865	992870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350314
19504	NC_022106	CTT	2	6	993218	993223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19505	NC_022106	CTT	2	6	993284	993289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19506	NC_022106	GGA	2	6	993296	993301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350315
19507	NC_022106	TCA	2	6	993448	993453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350315
19508	NC_022106	TCC	2	6	993504	993509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350315
19509	NC_022106	GAT	2	6	993761	993766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350315
19510	NC_022106	GAT	2	6	993792	993797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350315
19511	NC_022106	GGA	2	6	993906	993911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350315
19512	NC_022106	GAA	2	6	993977	993982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350315
19513	NC_022106	AGG	2	6	994071	994076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350315
19514	NC_022106	GAA	2	6	994077	994082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350315
19515	NC_022106	TAGA	2	8	994089	994096	50 %	25 %	25 %	0 %	532350315
19516	NC_022106	AGCG	2	8	994097	994104	25 %	0 %	50 %	25 %	532350315
19517	NC_022106	CTCCAT	2	12	994106	994117	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532350315
19518	NC_022106	TC	3	6	994181	994186	0 %	50 %	0 %	50 %	532350315
19519	NC_022106	GT	3	6	994209	994214	0 %	50 %	50 %	0 %	532350315
19520	NC_022106	GAA	2	6	994220	994225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350315
19521	NC_022106	TGG	2	6	994259	994264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350315
19522	NC_022106	CAA	2	6	994350	994355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350315
19523	NC_022106	TCT	2	6	994372	994377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19524	NC_022106	CTT	2	6	994433	994438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19525	NC_022106	TAA	2	6	994475	994480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350315
19526	NC_022106	TCT	2	6	994504	994509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19527	NC_022106	TTTG	2	8	994538	994545	0 %	75 %	25 %	0 %	532350315
19528	NC_022106	TA	3	6	994590	994595	50 %	50 %	0 %	0 %	532350315
19529	NC_022106	TCC	2	6	994749	994754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350315
19530	NC_022106	CGT	2	6	994862	994867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350315
19531	NC_022106	ACG	2	6	994919	994924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350315
19532	NC_022106	TC	4	8	994963	994970	0 %	50 %	0 %	50 %	532350315
19533	NC_022106	TCC	2	6	994998	995003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350315
19534	NC_022106	TTC	2	6	995009	995014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350315
19535	NC_022106	GGA	2	6	995019	995024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350315
19536	NC_022106	AGG	2	6	995078	995083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350315
19537	NC_022106	GAA	2	6	995095	995100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350315
19538	NC_022106	A	6	6	995099	995104	100 %	0 %	0 %	0 %	532350315
19539	NC_022106	CTGGC	2	10	995140	995149	0 %	20 %	40 %	40 %	532350315
19540	NC_022106	TCAGTA	2	12	995294	995305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532350316
19541	NC_022106	TCT	2	6	995329	995334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350316
19542	NC_022106	CTA	2	6	995340	995345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350316
19543	NC_022106	TCAG	2	8	995420	995427	25 %	25 %	25 %	25 %	532350316
19544	NC_022106	T	6	6	995479	995484	0 %	100 %	0 %	0 %	532350316
19545	NC_022106	TCT	2	6	995492	995497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350316
19546	NC_022106	ATTT	2	8	995762	995769	25 %	75 %	0 %	0 %	532350317
19547	NC_022106	GAA	2	6	995775	995780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350317
19548	NC_022106	GTTG	2	8	995827	995834	0 %	50 %	50 %	0 %	532350317
19549	NC_022106	ATC	2	6	995836	995841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350317
19550	NC_022106	ATC	2	6	995857	995862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350317
19551	NC_022106	ATA	2	6	995873	995878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350317
19552	NC_022106	GCA	3	9	995932	995940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350317
19553	NC_022106	TG	3	6	996005	996010	0 %	50 %	50 %	0 %	532350317
19554	NC_022106	G	6	6	996050	996055	0 %	0 %	100 %	0 %	532350317
19555	NC_022106	GGAG	2	8	996079	996086	25 %	0 %	75 %	0 %	532350317
19556	NC_022106	T	7	7	996098	996104	0 %	100 %	0 %	0 %	532350317
19557	NC_022106	GTT	2	6	996134	996139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350317
19558	NC_022106	T	8	8	996181	996188	0 %	100 %	0 %	0 %	532350317
19559	NC_022106	AGAGA	2	10	996189	996198	60 %	0 %	40 %	0 %	532350317
19560	NC_022106	GAAG	2	8	996211	996218	50 %	0 %	50 %	0 %	532350317
19561	NC_022106	TA	3	6	996243	996248	50 %	50 %	0 %	0 %	532350317
19562	NC_022106	GAC	2	6	996280	996285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350318
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19564	NC_022106	GAG	2	6	996344	996349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350318
19565	NC_022106	CTT	2	6	996354	996359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350318
19566	NC_022106	GAA	2	6	996368	996373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350318
19567	NC_022106	GA	3	6	996393	996398	50 %	0 %	50 %	0 %	532350318
19568	NC_022106	T	8	8	996418	996425	0 %	100 %	0 %	0 %	532350318
19569	NC_022106	AGA	2	6	996433	996438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350318
19570	NC_022106	TCT	2	6	996455	996460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350318
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19572	NC_022106	GGA	2	6	996593	996598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350319
19573	NC_022106	T	6	6	996656	996661	0 %	100 %	0 %	0 %	532350319
19574	NC_022106	GAA	2	6	996717	996722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350319
19575	NC_022106	AAT	2	6	996828	996833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350319
19576	NC_022106	CTG	2	6	996935	996940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350319
19577	NC_022106	TGA	2	6	996979	996984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350319
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19579	NC_022106	A	7	7	997032	997038	100 %	0 %	0 %	0 %	532350319
19580	NC_022106	GGAGC	2	10	997063	997072	20 %	0 %	60 %	20 %	532350319
19581	NC_022106	AAG	2	6	997073	997078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350319
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19584	NC_022106	GA	3	6	997346	997351	50 %	0 %	50 %	0 %	532350320
19585	NC_022106	GAA	2	6	997375	997380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350320
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19587	NC_022106	TCG	2	6	997536	997541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350320
19588	NC_022106	T	8	8	997551	997558	0 %	100 %	0 %	0 %	532350320
19589	NC_022106	TGT	2	6	997614	997619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350320
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19591	NC_022106	TAGAG	2	10	997754	997763	40 %	20 %	40 %	0 %	532350320
19592	NC_022106	T	7	7	997779	997785	0 %	100 %	0 %	0 %	532350320
19593	NC_022106	GAT	2	6	997799	997804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350320
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19596	NC_022106	ATT	3	9	997913	997921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350321
19597	NC_022106	T	6	6	998064	998069	0 %	100 %	0 %	0 %	532350321
19598	NC_022106	CTT	2	6	998095	998100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350321
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19601	NC_022106	GTA	2	6	998195	998200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350321
19602	NC_022106	TCA	2	6	998250	998255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350321
19603	NC_022106	GTT	2	6	998271	998276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350321
19604	NC_022106	GCAT	2	8	998313	998320	25 %	25 %	25 %	25 %	532350321
19605	NC_022106	TTTA	2	8	998378	998385	25 %	75 %	0 %	0 %	532350322
19606	NC_022106	TGA	2	6	998422	998427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350322
19607	NC_022106	AGG	2	6	998428	998433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350322
19608	NC_022106	TGC	2	6	998451	998456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350322
19609	NC_022106	TAATGT	2	12	998458	998469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532350322
19610	NC_022106	GA	3	6	998482	998487	50 %	0 %	50 %	0 %	532350322
19611	NC_022106	TCT	2	6	998589	998594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350322
19612	NC_022106	ATTTG	2	10	998620	998629	20 %	60 %	20 %	0 %	532350322
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19617	NC_022106	TG	3	6	998811	998816	0 %	50 %	50 %	0 %	532350322
19618	NC_022106	A	6	6	998851	998856	100 %	0 %	0 %	0 %	532350322
19619	NC_022106	GCGA	2	8	999183	999190	25 %	0 %	50 %	25 %	532350323
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19621	NC_022106	TGA	2	6	999208	999213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350323
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19857	NC_022106	AGA	2	6	1012180	1012185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350332
19858	NC_022106	GATT	2	8	1012200	1012207	25 %	50 %	25 %	0 %	532350332
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19860	NC_022106	CAT	2	6	1012282	1012287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350332
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19885	NC_022106	GAA	2	6	1013127	1013132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350333
19886	NC_022106	A	6	6	1013153	1013158	100 %	0 %	0 %	0 %	532350333
19887	NC_022106	TGA	2	6	1013165	1013170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350333
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