MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022106	TCC	2	6	79174	79179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349571
1502	NC_022106	GCT	2	6	79206	79211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349571
1503	NC_022106	TCT	2	6	79217	79222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349571
1504	NC_022106	T	7	7	79913	79919	0 %	100 %	0 %	0 %	532349572
1505	NC_022106	TGA	2	6	80018	80023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349572
1506	NC_022106	TGTCT	2	10	80033	80042	0 %	60 %	20 %	20 %	532349572
1507	NC_022106	TGAT	2	8	80107	80114	25 %	50 %	25 %	0 %	532349572
1508	NC_022106	TCAT	2	8	80129	80136	25 %	50 %	0 %	25 %	532349572
1509	NC_022106	T	6	6	80185	80190	0 %	100 %	0 %	0 %	532349572
1510	NC_022106	GGTTTA	2	12	80196	80207	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532349572
1511	NC_022106	TCT	2	6	80297	80302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349572
1512	NC_022106	GAA	2	6	80307	80312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349572
1513	NC_022106	TGC	2	6	80357	80362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349572
1514	NC_022106	CAA	2	6	80391	80396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349572
1515	NC_022106	GAA	2	6	80409	80414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349572
1516	NC_022106	GGA	2	6	80453	80458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349572
1517	NC_022106	TC	4	8	80481	80488	0 %	50 %	0 %	50 %	532349572
1518	NC_022106	A	7	7	80500	80506	100 %	0 %	0 %	0 %	532349572
1519	NC_022106	TTACT	2	10	80540	80549	20 %	60 %	0 %	20 %	532349572
1520	NC_022106	TATC	2	8	80556	80563	25 %	50 %	0 %	25 %	532349572
1521	NC_022106	GA	3	6	80574	80579	50 %	0 %	50 %	0 %	532349572
1522	NC_022106	TAT	2	6	80654	80659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349572
1523	NC_022106	AGA	2	6	80858	80863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349572
1524	NC_022106	GGGA	2	8	80867	80874	25 %	0 %	75 %	0 %	532349572
1525	NC_022106	CTGC	2	8	80971	80978	0 %	25 %	25 %	50 %	532349573
1526	NC_022106	GCT	2	6	80989	80994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349573
1527	NC_022106	ATT	2	6	80995	81000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349573
1528	NC_022106	CTT	2	6	81038	81043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349573
1529	NC_022106	CTT	2	6	81059	81064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349573
1530	NC_022106	CAT	2	6	81106	81111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349573
1531	NC_022106	TGA	2	6	81228	81233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349573
1532	NC_022106	AGG	2	6	81239	81244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349573
1533	NC_022106	GGTT	2	8	81264	81271	0 %	50 %	50 %	0 %	532349573
1534	NC_022106	GTC	2	6	81287	81292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349573
1535	NC_022106	CT	3	6	81304	81309	0 %	50 %	0 %	50 %	532349573
1536	NC_022106	GGA	2	6	81310	81315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349573
1537	NC_022106	CAA	2	6	81316	81321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349573
1538	NC_022106	AG	3	6	81323	81328	50 %	0 %	50 %	0 %	532349573
1539	NC_022106	T	6	6	81330	81335	0 %	100 %	0 %	0 %	532349573
1540	NC_022106	CGAT	2	8	81392	81399	25 %	25 %	25 %	25 %	532349573
1541	NC_022106	TCAT	2	8	81467	81474	25 %	50 %	0 %	25 %	532349573
1542	NC_022106	TTA	2	6	81517	81522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349573
1543	NC_022106	TG	3	6	81534	81539	0 %	50 %	50 %	0 %	532349573
1544	NC_022106	AGA	2	6	81552	81557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349573
1545	NC_022106	AAG	2	6	81569	81574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349573
1546	NC_022106	AC	3	6	81617	81622	50 %	0 %	0 %	50 %	532349573
1547	NC_022106	T	6	6	81702	81707	0 %	100 %	0 %	0 %	532349574
1548	NC_022106	GAC	2	6	81729	81734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349574
1549	NC_022106	GA	3	6	81763	81768	50 %	0 %	50 %	0 %	532349574
1550	NC_022106	TTA	2	6	81775	81780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349574
1551	NC_022106	CTT	2	6	81829	81834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349574
1552	NC_022106	TTA	2	6	81872	81877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349574
1553	NC_022106	T	6	6	81880	81885	0 %	100 %	0 %	0 %	532349574
1554	NC_022106	AGAAA	2	10	81930	81939	80 %	0 %	20 %	0 %	532349574
1555	NC_022106	T	6	6	81985	81990	0 %	100 %	0 %	0 %	532349574
1556	NC_022106	GTTA	2	8	82009	82016	25 %	50 %	25 %	0 %	532349574
1557	NC_022106	ACA	2	6	82043	82048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349574
1558	NC_022106	GCG	2	6	82075	82080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349574
1559	NC_022106	T	6	6	82118	82123	0 %	100 %	0 %	0 %	532349574
1560	NC_022106	TGG	3	9	82144	82152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349574
1561	NC_022106	CAG	2	6	82220	82225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349574
1562	NC_022106	GTT	2	6	82231	82236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349574
1563	NC_022106	TATT	2	8	82241	82248	25 %	75 %	0 %	0 %	532349574
1564	NC_022106	GTG	2	6	82265	82270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349574
1565	NC_022106	CCT	2	6	82315	82320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349574
1566	NC_022106	GGAAG	2	10	82443	82452	40 %	0 %	60 %	0 %	532349574
1567	NC_022106	ATT	2	6	82462	82467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349574
1568	NC_022106	TTG	2	6	82484	82489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349574
1569	NC_022106	TTC	2	6	82492	82497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349574
1570	NC_022106	T	6	6	82526	82531	0 %	100 %	0 %	0 %	532349574
1571	NC_022106	GAA	2	6	82565	82570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349574
1572	NC_022106	GAA	2	6	82594	82599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349574
1573	NC_022106	GA	3	6	82656	82661	50 %	0 %	50 %	0 %	532349574
1574	NC_022106	GTTC	2	8	82666	82673	0 %	50 %	25 %	25 %	532349574
1575	NC_022106	GCT	2	6	82801	82806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349574
1576	NC_022106	GTGC	2	8	82813	82820	0 %	25 %	50 %	25 %	532349574
1577	NC_022106	TAA	2	6	82863	82868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349574
1578	NC_022106	CAT	2	6	82879	82884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349574
1579	NC_022106	GAA	2	6	82891	82896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349574
1580	NC_022106	GA	3	6	82976	82981	50 %	0 %	50 %	0 %	532349574
1581	NC_022106	TAC	2	6	83027	83032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349575
1582	NC_022106	T	6	6	83051	83056	0 %	100 %	0 %	0 %	532349575
1583	NC_022106	T	7	7	83063	83069	0 %	100 %	0 %	0 %	532349575
1584	NC_022106	T	6	6	83076	83081	0 %	100 %	0 %	0 %	532349575
1585	NC_022106	GTA	2	6	83162	83167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349575
1586	NC_022106	T	6	6	83173	83178	0 %	100 %	0 %	0 %	532349575
1587	NC_022106	TATG	2	8	83197	83204	25 %	50 %	25 %	0 %	532349575
1588	NC_022106	TAT	2	6	83226	83231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349575
1589	NC_022106	GTCTGT	2	12	83240	83251	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532349575
1590	NC_022106	TCA	2	6	83260	83265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349575
1591	NC_022106	TCAT	2	8	83268	83275	25 %	50 %	0 %	25 %	532349575
1592	NC_022106	CAA	2	6	83310	83315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349575
1593	NC_022106	ACTG	2	8	83320	83327	25 %	25 %	25 %	25 %	532349575
1594	NC_022106	CATT	2	8	83335	83342	25 %	50 %	0 %	25 %	532349575
1595	NC_022106	AGA	2	6	83368	83373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349575
1596	NC_022106	AGCA	2	8	83374	83381	50 %	0 %	25 %	25 %	532349575
1597	NC_022106	TC	3	6	83396	83401	0 %	50 %	0 %	50 %	532349575
1598	NC_022106	ATTA	2	8	83527	83534	50 %	50 %	0 %	0 %	532349575
1599	NC_022106	TTTG	2	8	83567	83574	0 %	75 %	25 %	0 %	532349575
1600	NC_022106	TTG	2	6	83664	83669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349575
1601	NC_022106	GAT	2	6	83761	83766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349575
1602	NC_022106	TCTA	2	8	83851	83858	25 %	50 %	0 %	25 %	532349575
1603	NC_022106	CTA	2	6	83879	83884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349575
1604	NC_022106	TAT	2	6	83932	83937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349575
1605	NC_022106	TAAG	2	8	83956	83963	50 %	25 %	25 %	0 %	532349575
1606	NC_022106	AGT	2	6	84045	84050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349576
1607	NC_022106	TAT	2	6	84072	84077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349576
1608	NC_022106	TGC	2	6	84087	84092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349576
1609	NC_022106	AAG	2	6	84107	84112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349576
1610	NC_022106	TC	3	6	84119	84124	0 %	50 %	0 %	50 %	532349576
1611	NC_022106	AG	3	6	84130	84135	50 %	0 %	50 %	0 %	532349576
1612	NC_022106	GAA	2	6	84163	84168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349576
1613	NC_022106	CAG	2	6	84302	84307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349576
1614	NC_022106	TAA	2	6	84348	84353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349576
1615	NC_022106	AG	3	6	84397	84402	50 %	0 %	50 %	0 %	532349576
1616	NC_022106	TTC	2	6	84416	84421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349576
1617	NC_022106	GAAG	2	8	84460	84467	50 %	0 %	50 %	0 %	532349576
1618	NC_022106	A	6	6	84484	84489	100 %	0 %	0 %	0 %	532349576
1619	NC_022106	AGA	2	6	84534	84539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349576
1620	NC_022106	TTC	2	6	84612	84617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349576
1621	NC_022106	TAAA	2	8	84626	84633	75 %	25 %	0 %	0 %	532349576
1622	NC_022106	ATCC	2	8	84697	84704	25 %	25 %	0 %	50 %	532349576
1623	NC_022106	TGG	2	6	84725	84730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349576
1624	NC_022106	TGA	2	6	84758	84763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349576
1625	NC_022106	TCC	2	6	84765	84770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349576
1626	NC_022106	ACA	2	6	84789	84794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349576
1627	NC_022106	TTTC	2	8	84844	84851	0 %	75 %	0 %	25 %	532349576
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1629	NC_022106	AGCGA	2	10	84909	84918	40 %	0 %	40 %	20 %	532349576
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1992	NC_022106	CGAA	2	8	103138	103145	50 %	0 %	25 %	25 %	532349592
1993	NC_022106	TCT	2	6	103164	103169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349592
1994	NC_022106	TCT	2	6	103188	103193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349592
1995	NC_022106	TTTCT	2	10	103244	103253	0 %	80 %	0 %	20 %	532349592
1996	NC_022106	CGA	2	6	103275	103280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349592
1997	NC_022106	TC	3	6	103300	103305	0 %	50 %	0 %	50 %	532349592
1998	NC_022106	T	9	9	103307	103315	0 %	100 %	0 %	0 %	532349592
1999	NC_022106	GCA	2	6	103422	103427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349592
2000	NC_022106	TGC	2	6	103459	103464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349592

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