MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022106	ATG	2	6	603893	603898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350017
12002	NC_022106	CGA	2	6	603973	603978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350017
12003	NC_022106	CTG	2	6	604084	604089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350017
12004	NC_022106	GCTC	2	8	604095	604102	0 %	25 %	25 %	50 %	532350017
12005	NC_022106	AAT	2	6	604130	604135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350017
12006	NC_022106	TCA	2	6	604137	604142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350017
12007	NC_022106	GCA	2	6	604158	604163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350017
12008	NC_022106	T	6	6	604182	604187	0 %	100 %	0 %	0 %	532350017
12009	NC_022106	GTT	2	6	604200	604205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350017
12010	NC_022106	AAAC	2	8	604215	604222	75 %	0 %	0 %	25 %	532350017
12011	NC_022106	A	6	6	604268	604273	100 %	0 %	0 %	0 %	532350018
12012	NC_022106	TACT	2	8	604303	604310	25 %	50 %	0 %	25 %	532350018
12013	NC_022106	AGCG	2	8	604329	604336	25 %	0 %	50 %	25 %	532350018
12014	NC_022106	CA	3	6	604343	604348	50 %	0 %	0 %	50 %	532350018
12015	NC_022106	TCT	2	6	604410	604415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350018
12016	NC_022106	ATA	2	6	604627	604632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350018
12017	NC_022106	AAC	2	6	604634	604639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350018
12018	NC_022106	TAG	2	6	604669	604674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350018
12019	NC_022106	GAGT	2	8	604698	604705	25 %	25 %	50 %	0 %	532350018
12020	NC_022106	TCC	2	6	604790	604795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350019
12021	NC_022106	CTT	2	6	604860	604865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350019
12022	NC_022106	GTAA	2	8	604881	604888	50 %	25 %	25 %	0 %	532350019
12023	NC_022106	AG	3	6	604908	604913	50 %	0 %	50 %	0 %	532350019
12024	NC_022106	AAC	2	6	604928	604933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350019
12025	NC_022106	ATAG	2	8	604954	604961	50 %	25 %	25 %	0 %	532350019
12026	NC_022106	ATC	2	6	605014	605019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350019
12027	NC_022106	A	6	6	605027	605032	100 %	0 %	0 %	0 %	532350019
12028	NC_022106	CT	3	6	605059	605064	0 %	50 %	0 %	50 %	532350019
12029	NC_022106	AAG	2	6	605076	605081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350019
12030	NC_022106	AGA	2	6	605197	605202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350019
12031	NC_022106	TC	3	6	605219	605224	0 %	50 %	0 %	50 %	532350019
12032	NC_022106	TCT	2	6	605229	605234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350019
12033	NC_022106	TCT	2	6	605261	605266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350019
12034	NC_022106	AAC	2	6	605299	605304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350019
12035	NC_022106	TAAA	2	8	605329	605336	75 %	25 %	0 %	0 %	532350019
12036	NC_022106	TTTG	2	8	605394	605401	0 %	75 %	25 %	0 %	532350019
12037	NC_022106	T	7	7	606208	606214	0 %	100 %	0 %	0 %	532350020
12038	NC_022106	GCA	2	6	606266	606271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350020
12039	NC_022106	TTC	2	6	606310	606315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350020
12040	NC_022106	CAAAGA	2	12	606406	606417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532350020
12041	NC_022106	CT	3	6	606455	606460	0 %	50 %	0 %	50 %	532350020
12042	NC_022106	AAT	2	6	606505	606510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350021
12043	NC_022106	CATA	2	8	606536	606543	50 %	25 %	0 %	25 %	532350021
12044	NC_022106	CT	4	8	606690	606697	0 %	50 %	0 %	50 %	532350021
12045	NC_022106	ATA	2	6	606702	606707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350021
12046	NC_022106	A	6	6	606731	606736	100 %	0 %	0 %	0 %	532350021
12047	NC_022106	CTT	2	6	606764	606769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350021
12048	NC_022106	CCA	2	6	606779	606784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350021
12049	NC_022106	AAAG	2	8	606790	606797	75 %	0 %	25 %	0 %	532350021
12050	NC_022106	AAT	2	6	606806	606811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350021
12051	NC_022106	CT	3	6	606821	606826	0 %	50 %	0 %	50 %	532350021
12052	NC_022106	CA	3	6	606891	606896	50 %	0 %	0 %	50 %	532350021
12053	NC_022106	GAA	2	6	606941	606946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350021
12054	NC_022106	A	6	6	606957	606962	100 %	0 %	0 %	0 %	532350021
12055	NC_022106	TCG	2	6	606994	606999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350022
12056	NC_022106	ACTTC	2	10	607013	607022	20 %	40 %	0 %	40 %	532350022
12057	NC_022106	AG	3	6	607033	607038	50 %	0 %	50 %	0 %	532350022
12058	NC_022106	ATGT	2	8	607080	607087	25 %	50 %	25 %	0 %	532350022
12059	NC_022106	CTT	2	6	607106	607111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350022
12060	NC_022106	TTC	2	6	607180	607185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350022
12061	NC_022106	GAA	2	6	607189	607194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350022
12062	NC_022106	AGAA	2	8	607254	607261	75 %	0 %	25 %	0 %	532350022
12063	NC_022106	TTA	2	6	607300	607305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350022
12064	NC_022106	CAA	2	6	607493	607498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350022
12065	NC_022106	TCT	2	6	607591	607596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350022
12066	NC_022106	AT	3	6	607691	607696	50 %	50 %	0 %	0 %	532350022
12067	NC_022106	CAT	2	6	607886	607891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350023
12068	NC_022106	CAT	2	6	607961	607966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350023
12069	NC_022106	GGA	2	6	608001	608006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350023
12070	NC_022106	A	6	6	608030	608035	100 %	0 %	0 %	0 %	532350023
12071	NC_022106	TAA	2	6	608072	608077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350023
12072	NC_022106	ATTTT	2	10	608085	608094	20 %	80 %	0 %	0 %	532350023
12073	NC_022106	GAAC	2	8	608169	608176	50 %	0 %	25 %	25 %	532350023
12074	NC_022106	GAT	2	6	608233	608238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350023
12075	NC_022106	GCT	2	6	608388	608393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350023
12076	NC_022106	T	6	6	608501	608506	0 %	100 %	0 %	0 %	532350023
12077	NC_022106	CAA	2	6	608673	608678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350023
12078	NC_022106	CTT	2	6	608737	608742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350023
12079	NC_022106	CCA	2	6	608841	608846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350023
12080	NC_022106	CGCA	2	8	608891	608898	25 %	0 %	25 %	50 %	532350023
12081	NC_022106	TCA	2	6	608904	608909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350023
12082	NC_022106	AAC	2	6	608970	608975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350023
12083	NC_022106	GATA	2	8	609010	609017	50 %	25 %	25 %	0 %	532350023
12084	NC_022106	AGT	2	6	609031	609036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350023
12085	NC_022106	TTC	2	6	609203	609208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350023
12086	NC_022106	TCA	2	6	609225	609230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350023
12087	NC_022106	ACA	2	6	609262	609267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350023
12088	NC_022106	GAA	2	6	609276	609281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350023
12089	NC_022106	CA	3	6	609356	609361	50 %	0 %	0 %	50 %	532350023
12090	NC_022106	TGA	2	6	609396	609401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350023
12091	NC_022106	AC	3	6	609425	609430	50 %	0 %	0 %	50 %	532350023
12092	NC_022106	CACC	2	8	609500	609507	25 %	0 %	0 %	75 %	532350023
12093	NC_022106	AACC	2	8	609579	609586	50 %	0 %	0 %	50 %	532350023
12094	NC_022106	TTG	2	6	609600	609605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350024
12095	NC_022106	ACAA	2	8	609684	609691	75 %	0 %	0 %	25 %	532350024
12096	NC_022106	TTG	2	6	609699	609704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350024
12097	NC_022106	GCA	2	6	609709	609714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350024
12098	NC_022106	CTT	2	6	609735	609740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350024
12099	NC_022106	CTGC	2	8	609812	609819	0 %	25 %	25 %	50 %	532350024
12100	NC_022106	CCAAAA	2	12	609913	609924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350024
12101	NC_022106	TCA	2	6	609961	609966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350024
12102	NC_022106	CGCC	2	8	609970	609977	0 %	0 %	25 %	75 %	532350024
12103	NC_022106	TAA	2	6	610039	610044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350024
12104	NC_022106	GATT	2	8	610067	610074	25 %	50 %	25 %	0 %	532350024
12105	NC_022106	ATC	2	6	610137	610142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350024
12106	NC_022106	TCT	2	6	610186	610191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350024
12107	NC_022106	TCTT	2	8	610233	610240	0 %	75 %	0 %	25 %	532350024
12108	NC_022106	GAA	2	6	610275	610280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350024
12109	NC_022106	A	6	6	610327	610332	100 %	0 %	0 %	0 %	532350024
12110	NC_022106	AG	4	8	610387	610394	50 %	0 %	50 %	0 %	532350024
12111	NC_022106	TGA	2	6	610447	610452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350024
12112	NC_022106	TTG	2	6	610473	610478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350024
12113	NC_022106	ATA	2	6	610506	610511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350024
12114	NC_022106	TTA	2	6	610516	610521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350024
12115	NC_022106	CAG	2	6	610535	610540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350024
12116	NC_022106	CAA	2	6	610548	610553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350024
12117	NC_022106	AAC	2	6	610560	610565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350024
12118	NC_022106	TGC	2	6	610566	610571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350024
12119	NC_022106	T	7	7	610604	610610	0 %	100 %	0 %	0 %	532350024
12120	NC_022106	AAG	2	6	610615	610620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350024
12121	NC_022106	T	6	6	610633	610638	0 %	100 %	0 %	0 %	532350024
12122	NC_022106	A	6	6	610666	610671	100 %	0 %	0 %	0 %	532350024
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12135	NC_022106	GGTT	2	8	611673	611680	0 %	50 %	50 %	0 %	532350025
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12231	NC_022106	ACT	2	6	615787	615792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350026
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12233	NC_022106	A	6	6	615814	615819	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
12234	NC_022106	GAA	2	6	615907	615912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
12235	NC_022106	TTAT	2	8	615920	615927	25 %	75 %	0 %	0 %	532350026
12236	NC_022106	CGA	2	6	616026	616031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350026
12237	NC_022106	A	6	6	616075	616080	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
12238	NC_022106	A	7	7	616110	616116	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
12239	NC_022106	AG	3	6	616126	616131	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
12240	NC_022106	TC	3	6	616133	616138	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
12241	NC_022106	TAAA	2	8	616160	616167	75 %	25 %	0 %	0 %	532350026
12242	NC_022106	TTAT	2	8	616183	616190	25 %	75 %	0 %	0 %	532350026
12243	NC_022106	CT	4	8	616231	616238	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
12244	NC_022106	TC	3	6	616274	616279	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
12245	NC_022106	T	6	6	616290	616295	0 %	100 %	0 %	0 %	532350026
12246	NC_022106	GAT	2	6	616303	616308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350026
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12250	NC_022106	TGAAT	2	10	616851	616860	40 %	40 %	20 %	0 %	532350027
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12254	NC_022106	TCC	2	6	617022	617027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350027
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12274	NC_022106	CT	3	6	618240	618245	0 %	50 %	0 %	50 %	532350028
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12365	NC_022106	CT	3	6	622116	622121	0 %	50 %	0 %	50 %	532350034
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12489	NC_022106	TGC	2	6	627941	627946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350036
12490	NC_022106	TGG	2	6	627999	628004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350036
12491	NC_022106	A	7	7	628054	628060	100 %	0 %	0 %	0 %	532350036
12492	NC_022106	ACT	2	6	628114	628119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350036
12493	NC_022106	A	7	7	628128	628134	100 %	0 %	0 %	0 %	532350036
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