MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 20485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022106	GAG	2	6	28363	28368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349530
502	NC_022106	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	532349530
503	NC_022106	GCA	2	6	28419	28424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349530
504	NC_022106	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	532349530
505	NC_022106	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532349530
506	NC_022106	TTC	2	6	28618	28623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349530
507	NC_022106	CAG	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349530
508	NC_022106	GAA	2	6	28644	28649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
509	NC_022106	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349530
510	NC_022106	TTC	2	6	28691	28696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349530
511	NC_022106	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	532349530
512	NC_022106	AAG	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
513	NC_022106	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	532349530
514	NC_022106	GAA	2	6	29073	29078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
515	NC_022106	TGT	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349531
516	NC_022106	TCT	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349531
517	NC_022106	ACA	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349531
518	NC_022106	ATG	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349531
519	NC_022106	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532349531
520	NC_022106	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
521	NC_022106	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
522	NC_022106	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532349531
523	NC_022106	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	532349531
524	NC_022106	ATC	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349531
525	NC_022106	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	532349531
526	NC_022106	T	8	8	29872	29879	0 %	100 %	0 %	0 %	532349531
527	NC_022106	ATG	2	6	29897	29902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349531
528	NC_022106	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	532349531
529	NC_022106	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
530	NC_022106	GTT	2	6	30114	30119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349532
531	NC_022106	GAA	2	6	30123	30128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
532	NC_022106	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	532349532
533	NC_022106	TCT	2	6	30189	30194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349532
534	NC_022106	ACT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349532
535	NC_022106	TTC	2	6	30307	30312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349532
536	NC_022106	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	532349532
537	NC_022106	CCT	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349532
538	NC_022106	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532349532
539	NC_022106	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	532349532
540	NC_022106	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532349532
541	NC_022106	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349532
542	NC_022106	GAT	2	6	30528	30533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
543	NC_022106	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532349532
544	NC_022106	TAG	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
545	NC_022106	GTT	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349532
546	NC_022106	TAA	2	6	30734	30739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349532
547	NC_022106	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
548	NC_022106	AGA	2	6	30893	30898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
549	NC_022106	TCG	2	6	30956	30961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349532
550	NC_022106	ATG	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
551	NC_022106	TGG	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349532
552	NC_022106	GAA	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
553	NC_022106	ATT	2	6	31071	31076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349532
554	NC_022106	ATG	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
555	NC_022106	AAG	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
556	NC_022106	T	6	6	31212	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	532349532
557	NC_022106	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
558	NC_022106	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	532349532
559	NC_022106	ACA	2	6	31300	31305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349533
560	NC_022106	TGT	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349533
561	NC_022106	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	532349533
562	NC_022106	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532349533
563	NC_022106	A	6	6	31535	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	532349533
564	NC_022106	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	532349533
565	NC_022106	TGC	2	6	31594	31599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349533
566	NC_022106	AGC	2	6	31612	31617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349533
567	NC_022106	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	532349534
568	NC_022106	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	532349534
569	NC_022106	AAG	2	6	31861	31866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349534
570	NC_022106	AAG	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349534
571	NC_022106	CTT	2	6	31907	31912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349534
572	NC_022106	CGT	2	6	31938	31943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349534
573	NC_022106	TGA	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349534
574	NC_022106	GAG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349534
575	NC_022106	GCG	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349534
576	NC_022106	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	532349534
577	NC_022106	AGA	2	6	32235	32240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349534
578	NC_022106	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	532349534
579	NC_022106	AAG	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349534
580	NC_022106	ATT	2	6	32473	32478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349534
581	NC_022106	T	6	6	32578	32583	0 %	100 %	0 %	0 %	532349534
582	NC_022106	GGA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349534
583	NC_022106	AGG	2	6	32828	32833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349535
584	NC_022106	GGT	2	6	32883	32888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349535
585	NC_022106	GCT	2	6	33045	33050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349535
586	NC_022106	GCT	2	6	33078	33083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349535
587	NC_022106	GAA	2	6	33189	33194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349536
588	NC_022106	A	6	6	33193	33198	100 %	0 %	0 %	0 %	532349536
589	NC_022106	TGT	2	6	33284	33289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349536
590	NC_022106	TGA	2	6	33335	33340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349536
591	NC_022106	GTT	2	6	33423	33428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349536
592	NC_022106	AGG	2	6	33472	33477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349536
593	NC_022106	CTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349536
594	NC_022106	T	6	6	33518	33523	0 %	100 %	0 %	0 %	532349536
595	NC_022106	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349536
596	NC_022106	TGA	2	6	33643	33648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349536
597	NC_022106	CAG	2	6	33706	33711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349536
598	NC_022106	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	532349536
599	NC_022106	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	532349536
600	NC_022106	CTG	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349537
601	NC_022106	ACA	2	6	33893	33898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349537
602	NC_022106	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	532349537
603	NC_022106	GTC	2	6	33949	33954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349537
604	NC_022106	ATT	2	6	33996	34001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349537
605	NC_022106	T	6	6	34048	34053	0 %	100 %	0 %	0 %	532349537
606	NC_022106	TTA	2	6	34078	34083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349537
607	NC_022106	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532349537
608	NC_022106	GAA	2	6	34171	34176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349537
609	NC_022106	AAG	2	6	34218	34223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349537
610	NC_022106	AGA	2	6	34269	34274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349537
611	NC_022106	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532349537
612	NC_022106	TGC	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349537
613	NC_022106	TGT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349537
614	NC_022106	ATG	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349537
615	NC_022106	AAG	2	6	34372	34377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349537
616	NC_022106	GAA	2	6	34391	34396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349537
617	NC_022106	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532349538
618	NC_022106	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532349538
619	NC_022106	GAT	2	6	34602	34607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349538
620	NC_022106	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	532349538
621	NC_022106	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532349538
622	NC_022106	AGA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349538
623	NC_022106	TTA	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349539
624	NC_022106	TGA	2	6	34864	34869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349539
625	NC_022106	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	532349539
626	NC_022106	GAA	2	6	34963	34968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349539
627	NC_022106	ATC	2	6	35013	35018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349539
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629	NC_022106	TGT	2	6	35131	35136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349539
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753	NC_022106	GGAT	2	8	42026	42033	25 %	25 %	50 %	0 %	532349543
754	NC_022106	A	7	7	42087	42093	100 %	0 %	0 %	0 %	532349543
755	NC_022106	AGCAA	2	10	42114	42123	60 %	0 %	20 %	20 %	532349543
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