MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri str. Sulcia-ALF

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021916	ATTAA	2	10	649	658	60 %	40 %	0 %	0 %	529057755
2	NC_021916	AAAAT	2	10	700	709	80 %	20 %	0 %	0 %	529057756
3	NC_021916	TTGAT	2	10	2287	2296	20 %	60 %	20 %	0 %	529057756
4	NC_021916	TTATT	2	10	2940	2949	20 %	80 %	0 %	0 %	529057756
5	NC_021916	CGAAA	2	10	3032	3041	60 %	0 %	20 %	20 %	529057756
6	NC_021916	AGGAG	2	10	3634	3643	40 %	0 %	60 %	0 %	529057757
7	NC_021916	TTATT	2	10	4168	4177	20 %	80 %	0 %	0 %	529057757
8	NC_021916	ATATT	2	10	4352	4361	40 %	60 %	0 %	0 %	529057757
9	NC_021916	ATAAA	2	10	5390	5399	80 %	20 %	0 %	0 %	529057758
10	NC_021916	AATTA	2	10	7506	7515	60 %	40 %	0 %	0 %	529057760
11	NC_021916	AAATG	2	10	8325	8334	60 %	20 %	20 %	0 %	529057760
12	NC_021916	TCTTT	2	10	9320	9329	0 %	80 %	0 %	20 %	529057764
13	NC_021916	CGTAC	2	10	10645	10654	20 %	20 %	20 %	40 %	529057764
14	NC_021916	AAAAG	2	10	11391	11400	80 %	0 %	20 %	0 %	529057765
15	NC_021916	AATGT	2	10	12045	12054	40 %	40 %	20 %	0 %	529057766
16	NC_021916	ATTTT	2	10	12057	12066	20 %	80 %	0 %	0 %	529057766
17	NC_021916	TAATT	2	10	13722	13731	40 %	60 %	0 %	0 %	529057767
18	NC_021916	TAAAT	2	10	13972	13981	60 %	40 %	0 %	0 %	529057767
19	NC_021916	ATCTA	2	10	14607	14616	40 %	40 %	0 %	20 %	529057767
20	NC_021916	TATAT	2	10	15099	15108	40 %	60 %	0 %	0 %	529057767
21	NC_021916	ATTTT	2	10	15726	15735	20 %	80 %	0 %	0 %	529057769
22	NC_021916	ATATA	2	10	15802	15811	60 %	40 %	0 %	0 %	529057769
23	NC_021916	TATTT	2	10	16480	16489	20 %	80 %	0 %	0 %	529057770
24	NC_021916	AGAAA	2	10	16760	16769	80 %	0 %	20 %	0 %	529057770
25	NC_021916	ATCTA	2	10	16801	16810	40 %	40 %	0 %	20 %	529057770
26	NC_021916	AATTA	3	15	17281	17295	60 %	40 %	0 %	0 %	529057770
27	NC_021916	TTTTC	2	10	18005	18014	0 %	80 %	0 %	20 %	529057772
28	NC_021916	TTTTA	2	10	18902	18911	20 %	80 %	0 %	0 %	529057773
29	NC_021916	TACTA	2	10	19691	19700	40 %	40 %	0 %	20 %	529057773
30	NC_021916	TAAAA	2	10	20466	20475	80 %	20 %	0 %	0 %	529057774
31	NC_021916	ATTAT	2	10	20476	20485	40 %	60 %	0 %	0 %	529057774
32	NC_021916	TCTTT	2	10	20663	20672	0 %	80 %	0 %	20 %	529057774
33	NC_021916	ATTTG	2	10	21372	21381	20 %	60 %	20 %	0 %	529057776
34	NC_021916	AATTT	2	10	22449	22458	40 %	60 %	0 %	0 %	529057777
35	NC_021916	TGTAA	2	10	22722	22731	40 %	40 %	20 %	0 %	529057778
36	NC_021916	TTTTA	2	10	22870	22879	20 %	80 %	0 %	0 %	529057778
37	NC_021916	TGATA	2	10	22885	22894	40 %	40 %	20 %	0 %	529057778
38	NC_021916	AATGA	2	10	24251	24260	60 %	20 %	20 %	0 %	529057779
39	NC_021916	TAAAA	2	10	24319	24328	80 %	20 %	0 %	0 %	529057779
40	NC_021916	AAATA	2	10	25749	25758	80 %	20 %	0 %	0 %	529057781
41	NC_021916	TAAAT	2	10	25783	25792	60 %	40 %	0 %	0 %	529057781
42	NC_021916	TAAAA	2	10	25989	25998	80 %	20 %	0 %	0 %	529057781
43	NC_021916	AATTT	2	10	27022	27031	40 %	60 %	0 %	0 %	529057782
44	NC_021916	TAATA	2	10	27722	27731	60 %	40 %	0 %	0 %	529057783
45	NC_021916	ATTTT	2	10	28147	28156	20 %	80 %	0 %	0 %	529057783
46	NC_021916	ATATG	2	10	28383	28392	40 %	40 %	20 %	0 %	529057783
47	NC_021916	TAATA	2	10	29830	29839	60 %	40 %	0 %	0 %	529057784
48	NC_021916	AAAAG	2	10	30623	30632	80 %	0 %	20 %	0 %	529057785
49	NC_021916	AAAAT	2	10	31462	31471	80 %	20 %	0 %	0 %	529057785
50	NC_021916	ATTTA	2	10	31783	31792	40 %	60 %	0 %	0 %	529057785
51	NC_021916	TTAGA	2	10	32062	32071	40 %	40 %	20 %	0 %	529057785
52	NC_021916	TAAAA	2	10	32642	32651	80 %	20 %	0 %	0 %	529057785
53	NC_021916	AGTAA	2	10	32887	32896	60 %	20 %	20 %	0 %	529057786
54	NC_021916	TTTCT	2	10	33758	33767	0 %	80 %	0 %	20 %	529057787
55	NC_021916	TAATT	2	10	33888	33897	40 %	60 %	0 %	0 %	529057787
56	NC_021916	AAAAT	2	10	34007	34016	80 %	20 %	0 %	0 %	529057787
57	NC_021916	AAATT	2	10	34823	34832	60 %	40 %	0 %	0 %	529057787
58	NC_021916	ATGTC	2	10	35172	35181	20 %	40 %	20 %	20 %	529057788
59	NC_021916	AAATA	2	10	35349	35358	80 %	20 %	0 %	0 %	529057789
60	NC_021916	TCTAT	2	10	36061	36070	20 %	60 %	0 %	20 %	529057791
61	NC_021916	TAAAT	2	10	36695	36704	60 %	40 %	0 %	0 %	529057792
62	NC_021916	ATATT	2	10	36999	37008	40 %	60 %	0 %	0 %	529057792
63	NC_021916	TTAAT	3	15	37201	37215	40 %	60 %	0 %	0 %	529057792
64	NC_021916	ATTTC	2	10	37227	37236	20 %	60 %	0 %	20 %	529057793
65	NC_021916	TAAAT	2	10	39325	39334	60 %	40 %	0 %	0 %	529057793
66	NC_021916	TTTTA	2	10	39373	39382	20 %	80 %	0 %	0 %	529057793
67	NC_021916	TATTT	2	10	40900	40909	20 %	80 %	0 %	0 %	529057793
68	NC_021916	TATAA	2	10	42538	42547	60 %	40 %	0 %	0 %	529057794
69	NC_021916	AAATA	2	10	43186	43195	80 %	20 %	0 %	0 %	529057794
70	NC_021916	ATGTT	2	10	43500	43509	20 %	60 %	20 %	0 %	529057794
71	NC_021916	TAAAT	2	10	44567	44576	60 %	40 %	0 %	0 %	529057794
72	NC_021916	AAGTA	2	10	44606	44615	60 %	20 %	20 %	0 %	529057794
73	NC_021916	ATATT	2	10	45431	45440	40 %	60 %	0 %	0 %	529057795
74	NC_021916	ATTTT	2	10	46824	46833	20 %	80 %	0 %	0 %	529057797
75	NC_021916	AAGAA	2	10	46955	46964	80 %	0 %	20 %	0 %	529057797
76	NC_021916	ATTTT	2	10	47131	47140	20 %	80 %	0 %	0 %	529057797
77	NC_021916	AAATA	2	10	55044	55053	80 %	20 %	0 %	0 %	529057801
78	NC_021916	ATTAA	2	10	55517	55526	60 %	40 %	0 %	0 %	529057801
79	NC_021916	ATTAA	2	10	55877	55886	60 %	40 %	0 %	0 %	529057801
80	NC_021916	AATGG	2	10	56582	56591	40 %	20 %	40 %	0 %	529057802
81	NC_021916	TGAAT	2	10	58180	58189	40 %	40 %	20 %	0 %	529057802
82	NC_021916	AGGTA	2	10	58551	58560	40 %	20 %	40 %	0 %	529057803
83	NC_021916	ACATT	2	10	59220	59229	40 %	40 %	0 %	20 %	529057803
84	NC_021916	AGCTA	2	10	59375	59384	40 %	20 %	20 %	20 %	529057804
85	NC_021916	GATTT	2	10	61481	61490	20 %	60 %	20 %	0 %	529057806
86	NC_021916	AAAGA	2	10	61697	61706	80 %	0 %	20 %	0 %	529057806
87	NC_021916	TAAAA	2	10	62332	62341	80 %	20 %	0 %	0 %	529057807
88	NC_021916	TTAAA	2	10	62545	62554	60 %	40 %	0 %	0 %	529057807
89	NC_021916	ATTAA	2	10	62992	63001	60 %	40 %	0 %	0 %	529057809
90	NC_021916	ATTAT	2	10	63299	63308	40 %	60 %	0 %	0 %	529057810
91	NC_021916	ATTAT	2	10	63919	63928	40 %	60 %	0 %	0 %	529057811
92	NC_021916	AAAAG	2	10	64826	64835	80 %	0 %	20 %	0 %	529057812
93	NC_021916	TTATA	2	10	66740	66749	40 %	60 %	0 %	0 %	529057814
94	NC_021916	ATTTT	2	10	67338	67347	20 %	80 %	0 %	0 %	529057815
95	NC_021916	AATTT	2	10	67640	67649	40 %	60 %	0 %	0 %	529057815
96	NC_021916	CTAAA	2	10	72047	72056	60 %	20 %	0 %	20 %	529057820
97	NC_021916	TTTAC	2	10	72543	72552	20 %	60 %	0 %	20 %	529057821
98	NC_021916	ATATG	2	10	73820	73829	40 %	40 %	20 %	0 %	529057822
99	NC_021916	ATTTT	2	10	74447	74456	20 %	80 %	0 %	0 %	529057822
100	NC_021916	ATTCT	2	10	76261	76270	20 %	60 %	0 %	20 %	529057822
101	NC_021916	TAAAA	2	10	77144	77153	80 %	20 %	0 %	0 %	529057822
102	NC_021916	GATTT	2	10	78104	78113	20 %	60 %	20 %	0 %	529057823
103	NC_021916	ATACT	2	10	78491	78500	40 %	40 %	0 %	20 %	529057823
104	NC_021916	ATTTA	2	10	80307	80316	40 %	60 %	0 %	0 %	529057825
105	NC_021916	GAATT	2	10	82379	82388	40 %	40 %	20 %	0 %	529057827
106	NC_021916	TAATA	2	10	82896	82905	60 %	40 %	0 %	0 %	529057827
107	NC_021916	AATGT	2	10	82910	82919	40 %	40 %	20 %	0 %	529057827
108	NC_021916	GTGTT	2	10	83826	83835	0 %	60 %	40 %	0 %	529057827
109	NC_021916	ATTAT	2	10	84989	84998	40 %	60 %	0 %	0 %	529057827
110	NC_021916	GATAT	3	15	86214	86228	40 %	40 %	20 %	0 %	529057828
111	NC_021916	AACAT	2	10	88512	88521	60 %	20 %	0 %	20 %	529057831
112	NC_021916	ATGTT	2	10	88753	88762	20 %	60 %	20 %	0 %	529057831
113	NC_021916	TTCAA	2	10	89024	89033	40 %	40 %	0 %	20 %	529057832
114	NC_021916	ATCAT	2	10	89244	89253	40 %	40 %	0 %	20 %	529057832
115	NC_021916	TTAAC	2	10	90870	90879	40 %	40 %	0 %	20 %	529057834
116	NC_021916	ATTTT	2	10	92920	92929	20 %	80 %	0 %	0 %	529057835
117	NC_021916	ATTTA	2	10	93799	93808	40 %	60 %	0 %	0 %	529057836
118	NC_021916	TGATC	2	10	94460	94469	20 %	40 %	20 %	20 %	529057837
119	NC_021916	TACTT	2	10	94574	94583	20 %	60 %	0 %	20 %	529057838
120	NC_021916	AAAAT	2	10	95217	95226	80 %	20 %	0 %	0 %	529057838
121	NC_021916	ATTAA	2	10	95824	95833	60 %	40 %	0 %	0 %	529057838
122	NC_021916	ACAAT	2	10	97310	97319	60 %	20 %	0 %	20 %	529057840
123	NC_021916	TTAAA	2	10	97999	98008	60 %	40 %	0 %	0 %	529057840
124	NC_021916	GATAT	2	10	98032	98041	40 %	40 %	20 %	0 %	529057840
125	NC_021916	AATTT	2	10	99640	99649	40 %	60 %	0 %	0 %	529057840
126	NC_021916	GATAG	2	10	100891	100900	40 %	20 %	40 %	0 %	529057841
127	NC_021916	AAAGA	2	10	101168	101177	80 %	0 %	20 %	0 %	529057842
128	NC_021916	AAAAT	2	10	102269	102278	80 %	20 %	0 %	0 %	529057843
129	NC_021916	AAATA	2	10	102621	102630	80 %	20 %	0 %	0 %	529057843
130	NC_021916	AGATA	2	10	102891	102900	60 %	20 %	20 %	0 %	529057843
131	NC_021916	ATCTT	2	10	103017	103026	20 %	60 %	0 %	20 %	529057843
132	NC_021916	TACAT	2	10	103884	103893	40 %	40 %	0 %	20 %	529057844
133	NC_021916	TTTTA	2	10	105235	105244	20 %	80 %	0 %	0 %	529057845
134	NC_021916	AATTA	2	10	105367	105376	60 %	40 %	0 %	0 %	529057845
135	NC_021916	TATTT	2	10	105416	105425	20 %	80 %	0 %	0 %	529057845
136	NC_021916	ATTTT	2	10	105482	105491	20 %	80 %	0 %	0 %	529057845
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138	NC_021916	TATTT	2	10	107863	107872	20 %	80 %	0 %	0 %	529057845
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.