MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 20294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021899	ACC	2	6	211238	211243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328484
4002	NC_021899	CTTG	2	8	211266	211273	0 %	50 %	25 %	25 %	527328484
4003	NC_021899	GAAATA	2	12	211322	211333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527328484
4004	NC_021899	AAC	2	6	211354	211359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328484
4005	NC_021899	CCA	2	6	211404	211409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328484
4006	NC_021899	CGT	2	6	211515	211520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328484
4007	NC_021899	TTTCT	2	10	211522	211531	0 %	80 %	0 %	20 %	527328484
4008	NC_021899	TAA	2	6	211551	211556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328485
4009	NC_021899	CTG	2	6	211589	211594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328485
4010	NC_021899	CTT	2	6	211719	211724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328485
4011	NC_021899	ACG	2	6	211857	211862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328485
4012	NC_021899	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328486
4013	NC_021899	AATA	2	8	212150	212157	75 %	25 %	0 %	0 %	527328486
4014	NC_021899	CTT	2	6	212200	212205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328486
4015	NC_021899	CAG	2	6	212210	212215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328486
4016	NC_021899	TTG	2	6	212333	212338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328486
4017	NC_021899	TCC	2	6	212343	212348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328486
4018	NC_021899	AAG	2	6	212383	212388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328486
4019	NC_021899	CTT	2	6	212389	212394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328486
4020	NC_021899	CTT	2	6	212416	212421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328486
4021	NC_021899	CTG	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328486
4022	NC_021899	CCA	2	6	212538	212543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328486
4023	NC_021899	CAAA	2	8	212558	212565	75 %	0 %	0 %	25 %	527328486
4024	NC_021899	CCA	2	6	212577	212582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328486
4025	NC_021899	GCA	2	6	212589	212594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328486
4026	NC_021899	CAA	2	6	212602	212607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328486
4027	NC_021899	TAC	2	6	212653	212658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328486
4028	NC_021899	CTT	2	6	212716	212721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328486
4029	NC_021899	TA	3	6	212842	212847	50 %	50 %	0 %	0 %	527328487
4030	NC_021899	ATG	2	6	212895	212900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328487
4031	NC_021899	TGT	2	6	212903	212908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328487
4032	NC_021899	GC	3	6	212968	212973	0 %	0 %	50 %	50 %	527328487
4033	NC_021899	AGA	2	6	213030	213035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328487
4034	NC_021899	ATT	2	6	213045	213050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328487
4035	NC_021899	CTG	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328487
4036	NC_021899	CAC	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328487
4037	NC_021899	TCT	2	6	213295	213300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328487
4038	NC_021899	C	6	6	213339	213344	0 %	0 %	0 %	100 %	527328487
4039	NC_021899	ATGA	2	8	213345	213352	50 %	25 %	25 %	0 %	527328487
4040	NC_021899	T	6	6	213379	213384	0 %	100 %	0 %	0 %	527328487
4041	NC_021899	GCA	2	6	213467	213472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328487
4042	NC_021899	GAA	2	6	213485	213490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328487
4043	NC_021899	GAAA	2	8	213538	213545	75 %	0 %	25 %	0 %	527328487
4044	NC_021899	TCA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328487
4045	NC_021899	ATG	2	6	213601	213606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328487
4046	NC_021899	TCC	2	6	213612	213617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328487
4047	NC_021899	T	6	6	213618	213623	0 %	100 %	0 %	0 %	527328487
4048	NC_021899	TAA	2	6	213698	213703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328487
4049	NC_021899	AGC	2	6	213744	213749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328487
4050	NC_021899	GAT	2	6	213779	213784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328487
4051	NC_021899	T	7	7	213921	213927	0 %	100 %	0 %	0 %	527328487
4052	NC_021899	AGA	2	6	214211	214216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328488
4053	NC_021899	AGT	2	6	214236	214241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328488
4054	NC_021899	CTC	2	6	214295	214300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328488
4055	NC_021899	AAC	2	6	214309	214314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328488
4056	NC_021899	ACA	2	6	214335	214340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328488
4057	NC_021899	TC	3	6	214412	214417	0 %	50 %	0 %	50 %	527328488
4058	NC_021899	TTC	2	6	214418	214423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4059	NC_021899	AAAG	2	8	214429	214436	75 %	0 %	25 %	0 %	527328488
4060	NC_021899	TAC	2	6	214451	214456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328488
4061	NC_021899	TGC	2	6	214469	214474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328488
4062	NC_021899	GAA	2	6	214518	214523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328488
4063	NC_021899	T	6	6	214553	214558	0 %	100 %	0 %	0 %	527328488
4064	NC_021899	TAA	2	6	214604	214609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328488
4065	NC_021899	TCT	2	6	214669	214674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4066	NC_021899	GTC	2	6	214675	214680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328488
4067	NC_021899	TCT	2	6	214714	214719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4068	NC_021899	TTC	2	6	214767	214772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4069	NC_021899	CTT	2	6	214823	214828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4070	NC_021899	AAT	2	6	214902	214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328488
4071	NC_021899	ATT	2	6	214989	214994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328488
4072	NC_021899	CTT	2	6	215012	215017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328488
4073	NC_021899	GTT	2	6	215023	215028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328488
4074	NC_021899	A	6	6	215043	215048	100 %	0 %	0 %	0 %	527328488
4075	NC_021899	TTCC	2	8	215077	215084	0 %	50 %	0 %	50 %	527328488
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4079	NC_021899	TA	3	6	215381	215386	50 %	50 %	0 %	0 %	527328488
4080	NC_021899	CTG	2	6	215423	215428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328488
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4087	NC_021899	C	6	6	216127	216132	0 %	0 %	0 %	100 %	527328489
4088	NC_021899	T	7	7	216149	216155	0 %	100 %	0 %	0 %	527328489
4089	NC_021899	A	6	6	216159	216164	100 %	0 %	0 %	0 %	527328489
4090	NC_021899	CTC	2	6	216174	216179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328489
4091	NC_021899	CGAA	2	8	216181	216188	50 %	0 %	25 %	25 %	527328489
4092	NC_021899	ATT	2	6	216196	216201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328489
4093	NC_021899	GCT	2	6	216281	216286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328489
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4095	NC_021899	AACA	2	8	216348	216355	75 %	0 %	0 %	25 %	527328489
4096	NC_021899	TGTC	2	8	216375	216382	0 %	50 %	25 %	25 %	527328489
4097	NC_021899	ACG	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328489
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4100	NC_021899	CTT	2	6	216624	216629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328489
4101	NC_021899	CA	3	6	216633	216638	50 %	0 %	0 %	50 %	527328489
4102	NC_021899	GA	3	6	216660	216665	50 %	0 %	50 %	0 %	527328489
4103	NC_021899	TCT	2	6	216678	216683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328489
4104	NC_021899	TAGC	2	8	216726	216733	25 %	25 %	25 %	25 %	527328489
4105	NC_021899	C	6	6	216733	216738	0 %	0 %	0 %	100 %	527328489
4106	NC_021899	AAATA	2	10	216742	216751	80 %	20 %	0 %	0 %	527328489
4107	NC_021899	GAA	2	6	216756	216761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328489
4108	NC_021899	ACA	2	6	216823	216828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328489
4109	NC_021899	ACA	2	6	216842	216847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328489
4110	NC_021899	ACA	2	6	216857	216862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328489
4111	NC_021899	TAA	2	6	216867	216872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328489
4112	NC_021899	AAG	3	9	216894	216902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328489
4113	NC_021899	AGG	2	6	217000	217005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328489
4114	NC_021899	CAA	2	6	217259	217264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328490
4115	NC_021899	CT	3	6	217281	217286	0 %	50 %	0 %	50 %	527328490
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4117	NC_021899	T	7	7	217335	217341	0 %	100 %	0 %	0 %	527328490
4118	NC_021899	ATC	2	6	217343	217348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328490
4119	NC_021899	CTT	2	6	217366	217371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328490
4120	NC_021899	ATT	2	6	217389	217394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328490
4121	NC_021899	GCA	2	6	217441	217446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328490
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4123	NC_021899	CT	3	6	217517	217522	0 %	50 %	0 %	50 %	527328490
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4491	NC_021899	AGAT	2	8	236664	236671	50 %	25 %	25 %	0 %	527328506
4492	NC_021899	CTT	2	6	236726	236731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328506
4493	NC_021899	CTG	2	6	236732	236737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328506
4494	NC_021899	T	6	6	236751	236756	0 %	100 %	0 %	0 %	527328506
4495	NC_021899	AAT	2	6	236817	236822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328506
4496	NC_021899	ATTA	2	8	236859	236866	50 %	50 %	0 %	0 %	527328506
4497	NC_021899	T	7	7	236917	236923	0 %	100 %	0 %	0 %	527328507
4498	NC_021899	AAT	2	6	236989	236994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328507
4499	NC_021899	TC	3	6	237113	237118	0 %	50 %	0 %	50 %	527328507
4500	NC_021899	AGA	2	6	237160	237165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328507

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