MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 20294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021899	GCT	2	6	286305	286310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328553
5503	NC_021899	TAA	2	6	286315	286320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328553
5504	NC_021899	CGAA	2	8	286372	286379	50 %	0 %	25 %	25 %	527328553
5505	NC_021899	CCT	2	6	286382	286387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328553
5506	NC_021899	TGT	2	6	286388	286393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328553
5507	NC_021899	CCT	2	6	286394	286399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328553
5508	NC_021899	ATT	2	6	286406	286411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328553
5509	NC_021899	AAG	2	6	286438	286443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328553
5510	NC_021899	CTT	2	6	286521	286526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328553
5511	NC_021899	AGT	2	6	286559	286564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328553
5512	NC_021899	CTT	2	6	286668	286673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328553
5513	NC_021899	AAC	2	6	286690	286695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328553
5514	NC_021899	AAGT	2	8	286718	286725	50 %	25 %	25 %	0 %	527328553
5515	NC_021899	TGCT	2	8	286738	286745	0 %	50 %	25 %	25 %	527328553
5516	NC_021899	CTG	2	6	286761	286766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328553
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5518	NC_021899	T	6	6	286918	286923	0 %	100 %	0 %	0 %	527328553
5519	NC_021899	TTTC	2	8	286927	286934	0 %	75 %	0 %	25 %	527328553
5520	NC_021899	TA	3	6	287045	287050	50 %	50 %	0 %	0 %	527328553
5521	NC_021899	CTT	2	6	287141	287146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328554
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5524	NC_021899	A	6	6	287219	287224	100 %	0 %	0 %	0 %	527328554
5525	NC_021899	TCT	2	6	287233	287238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328554
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5527	NC_021899	GAC	2	6	287279	287284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328554
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5529	NC_021899	AGT	2	6	287487	287492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328554
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5539	NC_021899	CT	3	6	288250	288255	0 %	50 %	0 %	50 %	527328555
5540	NC_021899	CAG	2	6	288318	288323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328555
5541	NC_021899	CGACAT	2	12	288368	288379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527328555
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5543	NC_021899	TAC	2	6	288466	288471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328555
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5545	NC_021899	AGCA	2	8	288568	288575	50 %	0 %	25 %	25 %	527328555
5546	NC_021899	T	6	6	288636	288641	0 %	100 %	0 %	0 %	527328556
5547	NC_021899	AGAT	2	8	288666	288673	50 %	25 %	25 %	0 %	527328556
5548	NC_021899	AGCT	2	8	288690	288697	25 %	25 %	25 %	25 %	527328556
5549	NC_021899	CGAG	2	8	288714	288721	25 %	0 %	50 %	25 %	527328556
5550	NC_021899	CTG	2	6	288759	288764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328556
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5552	NC_021899	A	7	7	288979	288985	100 %	0 %	0 %	0 %	527328556
5553	NC_021899	GAA	2	6	289043	289048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328556
5554	NC_021899	CTA	2	6	289142	289147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328556
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5557	NC_021899	TCTT	2	8	289358	289365	0 %	75 %	0 %	25 %	527328557
5558	NC_021899	TCTT	2	8	289372	289379	0 %	75 %	0 %	25 %	527328557
5559	NC_021899	TCT	2	6	289432	289437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328557
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5561	NC_021899	TTAA	2	8	289471	289478	50 %	50 %	0 %	0 %	527328557
5562	NC_021899	ATG	2	6	289517	289522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328557
5563	NC_021899	ACT	2	6	289537	289542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328557
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5588	NC_021899	TAG	2	6	290523	290528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328558
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5593	NC_021899	CT	3	6	290612	290617	0 %	50 %	0 %	50 %	527328558
5594	NC_021899	AT	3	6	290645	290650	50 %	50 %	0 %	0 %	527328558
5595	NC_021899	CAT	2	6	290690	290695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328559
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5603	NC_021899	CTT	3	9	291120	291128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328559
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5605	NC_021899	CA	3	6	291196	291201	50 %	0 %	0 %	50 %	527328559
5606	NC_021899	GA	3	6	291273	291278	50 %	0 %	50 %	0 %	527328559
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5621	NC_021899	CTTT	2	8	291894	291901	0 %	75 %	0 %	25 %	527328559
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5993	NC_021899	TCT	2	6	310512	310517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328578
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5996	NC_021899	ATAC	2	8	310670	310677	50 %	25 %	0 %	25 %	527328578
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5999	NC_021899	AAGG	2	8	310821	310828	50 %	0 %	50 %	0 %	527328578
6000	NC_021899	CTT	2	6	310838	310843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328578

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