MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021898	CAA	2	6	54790	54795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327419
1003	NC_021898	G	6	6	54827	54832	0 %	0 %	100 %	0 %	527327419
1004	NC_021898	AAT	2	6	54924	54929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327419
1005	NC_021898	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527327419
1006	NC_021898	TGG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327419
1007	NC_021898	GGTTCA	2	12	55110	55121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527327419
1008	NC_021898	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527327419
1009	NC_021898	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527327419
1010	NC_021898	CTG	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327419
1011	NC_021898	GAG	2	6	55312	55317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327419
1012	NC_021898	AT	3	6	55556	55561	50 %	50 %	0 %	0 %	527327419
1013	NC_021898	TTA	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327419
1014	NC_021898	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527327420
1015	NC_021898	ATT	2	6	55864	55869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327420
1016	NC_021898	GAT	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327420
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1018	NC_021898	TCC	2	6	55909	55914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327420
1019	NC_021898	TCC	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327420
1020	NC_021898	TTA	2	6	55940	55945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327420
1021	NC_021898	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527327420
1022	NC_021898	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527327420
1023	NC_021898	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	527327420
1024	NC_021898	GTA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327420
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1026	NC_021898	GAT	2	6	56195	56200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327420
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1029	NC_021898	GAT	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327421
1030	NC_021898	TCC	2	6	57645	57650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327421
1031	NC_021898	GAG	2	6	57664	57669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327421
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1034	NC_021898	CTA	2	6	57793	57798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327421
1035	NC_021898	CTG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327421
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1039	NC_021898	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527327421
1040	NC_021898	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327421
1041	NC_021898	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527327421
1042	NC_021898	AGA	2	6	59103	59108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327422
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1045	NC_021898	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527327422
1046	NC_021898	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527327422
1047	NC_021898	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527327422
1048	NC_021898	TCCTAA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327422
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1053	NC_021898	GTC	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327422
1054	NC_021898	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527327422
1055	NC_021898	AGG	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327422
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1058	NC_021898	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527327422
1059	NC_021898	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527327422
1060	NC_021898	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527327422
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1063	NC_021898	CTC	2	6	60023	60028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327422
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1065	NC_021898	T	7	7	60075	60081	0 %	100 %	0 %	0 %	527327422
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1067	NC_021898	AAT	2	6	60155	60160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327422
1068	NC_021898	TTC	2	6	60166	60171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327422
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1070	NC_021898	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527327422
1071	NC_021898	ATG	2	6	60236	60241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327423
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1098	NC_021898	TTC	2	6	61488	61493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327425
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1100	NC_021898	A	6	6	61561	61566	100 %	0 %	0 %	0 %	527327425
1101	NC_021898	GA	3	6	61587	61592	50 %	0 %	50 %	0 %	527327425
1102	NC_021898	ATG	2	6	61829	61834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327425
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1107	NC_021898	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527327425
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1109	NC_021898	A	6	6	62327	62332	100 %	0 %	0 %	0 %	527327425
1110	NC_021898	ATT	2	6	62344	62349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327425
1111	NC_021898	TTC	2	6	62386	62391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327425
1112	NC_021898	GA	3	6	62402	62407	50 %	0 %	50 %	0 %	527327425
1113	NC_021898	CTT	2	6	62519	62524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327425
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1117	NC_021898	TTA	2	6	62711	62716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327425
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1121	NC_021898	AT	3	6	62998	63003	50 %	50 %	0 %	0 %	527327425
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1125	NC_021898	AG	3	6	63198	63203	50 %	0 %	50 %	0 %	527327425
1126	NC_021898	CT	4	8	63206	63213	0 %	50 %	0 %	50 %	527327425
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1251	NC_021898	GCA	2	6	69997	70002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327431
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1383	NC_021898	GCA	2	6	76237	76242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327435
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