MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021898	AACAT	2	10	310883	310892	60 %	20 %	0 %	20 %	527327654
6002	NC_021898	AGA	2	6	310905	310910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327654
6003	NC_021898	GAC	2	6	311012	311017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327654
6004	NC_021898	T	8	8	311055	311062	0 %	100 %	0 %	0 %	527327654
6005	NC_021898	GA	3	6	311102	311107	50 %	0 %	50 %	0 %	527327654
6006	NC_021898	AT	3	6	311129	311134	50 %	50 %	0 %	0 %	527327654
6007	NC_021898	CTT	2	6	311174	311179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327654
6008	NC_021898	GAA	2	6	311182	311187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327654
6009	NC_021898	CTC	2	6	311224	311229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327654
6010	NC_021898	TA	3	6	311260	311265	50 %	50 %	0 %	0 %	527327654
6011	NC_021898	A	6	6	311380	311385	100 %	0 %	0 %	0 %	527327654
6012	NC_021898	AAG	2	6	311394	311399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327654
6013	NC_021898	TTTG	2	8	311463	311470	0 %	75 %	25 %	0 %	527327654
6014	NC_021898	AAAC	2	8	311512	311519	75 %	0 %	0 %	25 %	527327654
6015	NC_021898	CTT	2	6	311544	311549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327654
6016	NC_021898	A	6	6	311562	311567	100 %	0 %	0 %	0 %	527327654
6017	NC_021898	AAT	2	6	311809	311814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327655
6018	NC_021898	TCA	2	6	311844	311849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6019	NC_021898	TAC	2	6	311888	311893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6020	NC_021898	CTT	2	6	311911	311916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6021	NC_021898	AATC	2	8	311920	311927	50 %	25 %	0 %	25 %	527327655
6022	NC_021898	CTT	2	6	311960	311965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6023	NC_021898	ATC	2	6	311999	312004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6024	NC_021898	TAAT	2	8	312141	312148	50 %	50 %	0 %	0 %	527327655
6025	NC_021898	AGCA	2	8	312238	312245	50 %	0 %	25 %	25 %	527327655
6026	NC_021898	AT	3	6	312260	312265	50 %	50 %	0 %	0 %	527327655
6027	NC_021898	A	6	6	312281	312286	100 %	0 %	0 %	0 %	527327655
6028	NC_021898	TTC	2	6	312338	312343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6029	NC_021898	GTT	2	6	312353	312358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327655
6030	NC_021898	TCCGG	2	10	312366	312375	0 %	20 %	40 %	40 %	527327655
6031	NC_021898	GATT	2	8	312472	312479	25 %	50 %	25 %	0 %	527327655
6032	NC_021898	ATC	2	6	312497	312502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6033	NC_021898	T	6	6	312506	312511	0 %	100 %	0 %	0 %	527327655
6034	NC_021898	TTC	2	6	312590	312595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6035	NC_021898	CTC	2	6	312643	312648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327655
6036	NC_021898	CAA	2	6	312751	312756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327655
6037	NC_021898	CGG	2	6	312809	312814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527327655
6038	NC_021898	TTC	2	6	312873	312878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6039	NC_021898	ATC	2	6	312887	312892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6040	NC_021898	CTT	2	6	312937	312942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327655
6041	NC_021898	GCT	2	6	312949	312954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327655
6042	NC_021898	GAA	2	6	312964	312969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327655
6043	NC_021898	TC	3	6	312982	312987	0 %	50 %	0 %	50 %	527327655
6044	NC_021898	ACT	2	6	313028	313033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327655
6045	NC_021898	T	6	6	313094	313099	0 %	100 %	0 %	0 %	527327655
6046	NC_021898	ACA	2	6	313146	313151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327655
6047	NC_021898	TACAAA	2	12	313157	313168	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527327655
6048	NC_021898	A	6	6	313179	313184	100 %	0 %	0 %	0 %	527327655
6049	NC_021898	TTA	2	6	313198	313203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327656
6050	NC_021898	CCT	2	6	313209	313214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327656
6051	NC_021898	CTT	2	6	313257	313262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327656
6052	NC_021898	A	6	6	313298	313303	100 %	0 %	0 %	0 %	527327656
6053	NC_021898	CTC	2	6	313440	313445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327656
6054	NC_021898	CGT	2	6	313470	313475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327656
6055	NC_021898	CA	3	6	313492	313497	50 %	0 %	0 %	50 %	527327656
6056	NC_021898	AGA	2	6	313504	313509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327656
6057	NC_021898	TCCAA	2	10	313553	313562	40 %	20 %	0 %	40 %	527327656
6058	NC_021898	ATTG	2	8	313570	313577	25 %	50 %	25 %	0 %	527327656
6059	NC_021898	TAT	2	6	313677	313682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327656
6060	NC_021898	ACC	3	9	313693	313701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327656
6061	NC_021898	GAC	2	6	313707	313712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327656
6062	NC_021898	TC	3	6	313756	313761	0 %	50 %	0 %	50 %	527327656
6063	NC_021898	TAA	2	6	313767	313772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327656
6064	NC_021898	GAA	2	6	313818	313823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327656
6065	NC_021898	ATT	2	6	313919	313924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327656
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6068	NC_021898	GAA	2	6	314464	314469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327657
6069	NC_021898	GCT	2	6	314470	314475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327657
6070	NC_021898	TCAA	2	8	314525	314532	50 %	25 %	0 %	25 %	527327657
6071	NC_021898	ATTTA	2	10	314619	314628	40 %	60 %	0 %	0 %	527327657
6072	NC_021898	C	7	7	314634	314640	0 %	0 %	0 %	100 %	527327657
6073	NC_021898	TCC	2	6	314644	314649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327657
6074	NC_021898	CTT	3	9	314675	314683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327657
6075	NC_021898	TCT	3	9	314689	314697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327657
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6077	NC_021898	TTAATT	2	12	314836	314847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327657
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6081	NC_021898	A	6	6	314968	314973	100 %	0 %	0 %	0 %	527327657
6082	NC_021898	GAA	2	6	315034	315039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327657
6083	NC_021898	GATG	2	8	315054	315061	25 %	25 %	50 %	0 %	527327657
6084	NC_021898	TTAT	2	8	315088	315095	25 %	75 %	0 %	0 %	527327657
6085	NC_021898	TGA	2	6	315096	315101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327657
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6088	NC_021898	GAG	2	6	315179	315184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327657
6089	NC_021898	A	6	6	315266	315271	100 %	0 %	0 %	0 %	527327657
6090	NC_021898	GTT	2	6	315274	315279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327657
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6093	NC_021898	TCA	2	6	315356	315361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327657
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6096	NC_021898	CT	3	6	315391	315396	0 %	50 %	0 %	50 %	527327657
6097	NC_021898	TTC	2	6	315419	315424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327657
6098	NC_021898	A	6	6	315524	315529	100 %	0 %	0 %	0 %	527327657
6099	NC_021898	GCT	2	6	315577	315582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327657
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6104	NC_021898	TGA	2	6	315675	315680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327657
6105	NC_021898	AGT	2	6	315696	315701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327657
6106	NC_021898	AAAG	2	8	315783	315790	75 %	0 %	25 %	0 %	527327657
6107	NC_021898	CGT	2	6	315835	315840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327657
6108	NC_021898	TCCT	2	8	315880	315887	0 %	50 %	0 %	50 %	527327657
6109	NC_021898	GCA	2	6	315927	315932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327657
6110	NC_021898	GGA	2	6	315952	315957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327657
6111	NC_021898	GAT	2	6	316017	316022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327657
6112	NC_021898	TCC	2	6	316029	316034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327657
6113	NC_021898	CGC	2	6	316084	316089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527327657
6114	NC_021898	TGTGT	2	10	316096	316105	0 %	60 %	40 %	0 %	527327657
6115	NC_021898	TGA	2	6	316110	316115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327657
6116	NC_021898	CAT	3	9	316218	316226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327657
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6118	NC_021898	TGC	2	6	316329	316334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327657
6119	NC_021898	AAG	2	6	316339	316344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327657
6120	NC_021898	AAG	2	6	316406	316411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327657
6121	NC_021898	TAA	2	6	316440	316445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327657
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6123	NC_021898	AAG	2	6	316622	316627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327657
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6495	NC_021898	TC	3	6	335174	335179	0 %	50 %	0 %	50 %	527327672
6496	NC_021898	ATC	2	6	335235	335240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327672
6497	NC_021898	AAT	2	6	335307	335312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327672
6498	NC_021898	GTA	2	6	335478	335483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327672
6499	NC_021898	TC	4	8	335494	335501	0 %	50 %	0 %	50 %	527327672
6500	NC_021898	TCA	2	6	335515	335520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327672

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