MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021898	GAA	2	6	261640	261645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327608
5002	NC_021898	ACA	2	6	261756	261761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327608
5003	NC_021898	AGC	2	6	261812	261817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327608
5004	NC_021898	TCA	2	6	261820	261825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327608
5005	NC_021898	CT	3	6	261832	261837	0 %	50 %	0 %	50 %	527327608
5006	NC_021898	TCT	2	6	261858	261863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327608
5007	NC_021898	GT	3	6	261944	261949	0 %	50 %	50 %	0 %	527327608
5008	NC_021898	CTT	2	6	262021	262026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327608
5009	NC_021898	ATA	2	6	262041	262046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327608
5010	NC_021898	TCA	2	6	262071	262076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327608
5011	NC_021898	AAC	2	6	262086	262091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327608
5012	NC_021898	TTG	2	6	262109	262114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327608
5013	NC_021898	CTA	2	6	262250	262255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327609
5014	NC_021898	ACA	2	6	262256	262261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327609
5015	NC_021898	AGA	2	6	262320	262325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327609
5016	NC_021898	GCT	2	6	262327	262332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327609
5017	NC_021898	ATA	2	6	262405	262410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327609
5018	NC_021898	TGA	2	6	262423	262428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327609
5019	NC_021898	GCA	2	6	262486	262491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327609
5020	NC_021898	TCG	2	6	262500	262505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327609
5021	NC_021898	CTT	2	6	262523	262528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327609
5022	NC_021898	TGA	2	6	262552	262557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327609
5023	NC_021898	CCT	2	6	262594	262599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327609
5024	NC_021898	CAA	2	6	262685	262690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327609
5025	NC_021898	AC	3	6	262718	262723	50 %	0 %	0 %	50 %	527327609
5026	NC_021898	CA	3	6	262782	262787	50 %	0 %	0 %	50 %	527327609
5027	NC_021898	GCA	2	6	262909	262914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327609
5028	NC_021898	ATACA	2	10	262952	262961	60 %	20 %	0 %	20 %	527327609
5029	NC_021898	GCC	2	6	263008	263013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527327609
5030	NC_021898	CTC	2	6	263037	263042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327609
5031	NC_021898	T	6	6	263111	263116	0 %	100 %	0 %	0 %	527327609
5032	NC_021898	TCATT	2	10	263352	263361	20 %	60 %	0 %	20 %	527327610
5033	NC_021898	A	6	6	263365	263370	100 %	0 %	0 %	0 %	527327610
5034	NC_021898	CAG	2	6	263394	263399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327610
5035	NC_021898	A	6	6	263400	263405	100 %	0 %	0 %	0 %	527327610
5036	NC_021898	ATT	2	6	263416	263421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327610
5037	NC_021898	TC	3	6	263517	263522	0 %	50 %	0 %	50 %	527327610
5038	NC_021898	TTC	3	9	263560	263568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327610
5039	NC_021898	ACTT	2	8	263652	263659	25 %	50 %	0 %	25 %	527327610
5040	NC_021898	AGC	2	6	263709	263714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327610
5041	NC_021898	TC	3	6	263857	263862	0 %	50 %	0 %	50 %	527327610
5042	NC_021898	TTG	2	6	263871	263876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327610
5043	NC_021898	GAA	2	6	263907	263912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327610
5044	NC_021898	TAA	2	6	264292	264297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327611
5045	NC_021898	A	7	7	264312	264318	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5046	NC_021898	TTCT	2	8	264365	264372	0 %	75 %	0 %	25 %	527327611
5047	NC_021898	GA	3	6	264427	264432	50 %	0 %	50 %	0 %	527327611
5048	NC_021898	TAAAA	2	10	264458	264467	80 %	20 %	0 %	0 %	527327611
5049	NC_021898	GTT	2	6	264482	264487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327611
5050	NC_021898	TGA	2	6	264503	264508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327611
5051	NC_021898	TC	3	6	264583	264588	0 %	50 %	0 %	50 %	527327611
5052	NC_021898	AG	3	6	264615	264620	50 %	0 %	50 %	0 %	527327611
5053	NC_021898	ATT	2	6	264707	264712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327611
5054	NC_021898	TAC	2	6	264759	264764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327611
5055	NC_021898	TCATAA	2	12	264785	264796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527327611
5056	NC_021898	AAG	2	6	264835	264840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327611
5057	NC_021898	A	7	7	264857	264863	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5058	NC_021898	CAA	2	6	264937	264942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327611
5059	NC_021898	ATC	2	6	264970	264975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327611
5060	NC_021898	TTGG	2	8	265188	265195	0 %	50 %	50 %	0 %	527327611
5061	NC_021898	GAGT	2	8	265342	265349	25 %	25 %	50 %	0 %	527327611
5062	NC_021898	TTAA	2	8	265374	265381	50 %	50 %	0 %	0 %	527327611
5063	NC_021898	ATG	2	6	265408	265413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327611
5064	NC_021898	AGA	2	6	265469	265474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327611
5065	NC_021898	AAGTGT	2	12	265511	265522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327611
5066	NC_021898	GTTC	2	8	265530	265537	0 %	50 %	25 %	25 %	527327611
5067	NC_021898	ATTT	2	8	265648	265655	25 %	75 %	0 %	0 %	527327611
5068	NC_021898	GGA	2	6	265656	265661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327611
5069	NC_021898	ATTT	2	8	265687	265694	25 %	75 %	0 %	0 %	527327611
5070	NC_021898	A	6	6	265713	265718	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5071	NC_021898	GGT	2	6	265737	265742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327611
5072	NC_021898	CTT	2	6	265817	265822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327611
5073	NC_021898	TAA	2	6	265865	265870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327611
5074	NC_021898	ACT	2	6	265885	265890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327611
5075	NC_021898	ACC	2	6	265920	265925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327611
5076	NC_021898	A	7	7	265995	266001	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5077	NC_021898	TAA	2	6	266039	266044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327611
5078	NC_021898	CTA	2	6	266107	266112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327611
5079	NC_021898	ACTAA	2	10	266172	266181	60 %	20 %	0 %	20 %	527327611
5080	NC_021898	TCTA	2	8	266193	266200	25 %	50 %	0 %	25 %	527327611
5081	NC_021898	TTA	2	6	266205	266210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327611
5082	NC_021898	A	6	6	266214	266219	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5083	NC_021898	AAC	3	9	266267	266275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327611
5084	NC_021898	TTC	2	6	266304	266309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327611
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5086	NC_021898	TAT	2	6	266348	266353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327611
5087	NC_021898	AGG	2	6	266384	266389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327611
5088	NC_021898	CTA	2	6	266400	266405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327611
5089	NC_021898	AGA	2	6	266411	266416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327611
5090	NC_021898	AGA	2	6	266489	266494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327611
5091	NC_021898	ATG	2	6	266553	266558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327611
5092	NC_021898	AAT	2	6	266559	266564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327611
5093	NC_021898	AAT	2	6	266616	266621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327611
5094	NC_021898	A	6	6	266623	266628	100 %	0 %	0 %	0 %	527327611
5095	NC_021898	TTC	2	6	266646	266651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327611
5096	NC_021898	GAG	2	6	266662	266667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327611
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5098	NC_021898	CTAC	2	8	266784	266791	25 %	25 %	0 %	50 %	527327612
5099	NC_021898	AGA	2	6	266846	266851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327612
5100	NC_021898	A	6	6	266865	266870	100 %	0 %	0 %	0 %	527327612
5101	NC_021898	CTG	2	6	266875	266880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327612
5102	NC_021898	GGA	2	6	266927	266932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327612
5103	NC_021898	TCT	2	6	266940	266945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327612
5104	NC_021898	GAC	2	6	266964	266969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327612
5105	NC_021898	A	7	7	267014	267020	100 %	0 %	0 %	0 %	527327612
5106	NC_021898	ATCT	2	8	267028	267035	25 %	50 %	0 %	25 %	527327612
5107	NC_021898	ACA	2	6	267043	267048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327612
5108	NC_021898	GAA	2	6	267114	267119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327612
5109	NC_021898	A	6	6	267123	267128	100 %	0 %	0 %	0 %	527327612
5110	NC_021898	AAG	2	6	267151	267156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327612
5111	NC_021898	CTT	2	6	267168	267173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327612
5112	NC_021898	TATC	2	8	267190	267197	25 %	50 %	0 %	25 %	527327612
5113	NC_021898	TTA	2	6	267226	267231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327612
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5117	NC_021898	CTT	2	6	267366	267371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327613
5118	NC_021898	CA	3	6	267406	267411	50 %	0 %	0 %	50 %	527327613
5119	NC_021898	ATC	2	6	267452	267457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327613
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5121	NC_021898	ATT	2	6	267572	267577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327613
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5123	NC_021898	ATT	2	6	267642	267647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327613
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5493	NC_021898	TGT	2	6	285499	285504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327627
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