MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/3

Total Repeats: 12771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021897	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326448
2	NC_021897	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326448
3	NC_021897	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326448
4	NC_021897	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326448
5	NC_021897	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326448
6	NC_021897	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326448
7	NC_021897	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326448
8	NC_021897	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326448
9	NC_021897	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326448
10	NC_021897	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326448
11	NC_021897	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326449
12	NC_021897	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326449
13	NC_021897	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326449
14	NC_021897	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326449
15	NC_021897	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326449
16	NC_021897	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326449
17	NC_021897	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326449
18	NC_021897	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326450
19	NC_021897	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326450
20	NC_021897	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326450
21	NC_021897	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326450
22	NC_021897	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326450
23	NC_021897	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326450
24	NC_021897	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326450
25	NC_021897	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326450
26	NC_021897	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326450
27	NC_021897	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326450
28	NC_021897	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326450
29	NC_021897	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326450
30	NC_021897	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326450
31	NC_021897	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326450
32	NC_021897	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326450
33	NC_021897	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326450
34	NC_021897	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326450
35	NC_021897	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326450
36	NC_021897	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326450
37	NC_021897	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326450
38	NC_021897	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326450
39	NC_021897	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326450
40	NC_021897	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326451
41	NC_021897	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326451
42	NC_021897	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326451
43	NC_021897	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326451
44	NC_021897	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326451
45	NC_021897	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326451
46	NC_021897	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326451
47	NC_021897	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326451
48	NC_021897	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326451
49	NC_021897	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326451
50	NC_021897	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326451
51	NC_021897	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326451
52	NC_021897	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326451
53	NC_021897	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326451
54	NC_021897	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326451
55	NC_021897	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326451
56	NC_021897	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326452
57	NC_021897	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326452
58	NC_021897	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326452
59	NC_021897	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326452
60	NC_021897	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326452
61	NC_021897	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326452
62	NC_021897	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326452
63	NC_021897	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326452
64	NC_021897	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326452
65	NC_021897	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326452
66	NC_021897	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326452
67	NC_021897	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326452
68	NC_021897	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326452
69	NC_021897	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326452
70	NC_021897	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326452
71	NC_021897	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326452
72	NC_021897	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326452
73	NC_021897	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326453
74	NC_021897	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326453
75	NC_021897	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326453
76	NC_021897	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326453
77	NC_021897	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326453
78	NC_021897	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326454
79	NC_021897	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326454
80	NC_021897	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326454
81	NC_021897	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326454
82	NC_021897	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326454
83	NC_021897	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326455
84	NC_021897	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326455
85	NC_021897	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326455
86	NC_021897	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326455
87	NC_021897	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326455
88	NC_021897	AGG	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326455
89	NC_021897	GAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326455
90	NC_021897	CAG	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326455
91	NC_021897	TGT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326455
92	NC_021897	GAG	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326455
93	NC_021897	TAC	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326455
94	NC_021897	GTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326455
95	NC_021897	AAG	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326455
96	NC_021897	GAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326455
97	NC_021897	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326456
98	NC_021897	AGA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326456
99	NC_021897	TGC	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326456
100	NC_021897	GAA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326456
101	NC_021897	TCG	2	6	9752	9757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326456
102	NC_021897	TGG	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326456
103	NC_021897	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326457
104	NC_021897	AGC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326457
105	NC_021897	CTT	2	6	10000	10005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326457
106	NC_021897	ATG	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326457
107	NC_021897	CGT	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326457
108	NC_021897	GAC	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326457
109	NC_021897	GGT	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326457
110	NC_021897	GAA	2	6	10491	10496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326457
111	NC_021897	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326457
112	NC_021897	GGA	2	6	10575	10580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326457
113	NC_021897	CGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326457
114	NC_021897	CTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326457
115	NC_021897	TTG	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326457
116	NC_021897	CTT	2	6	10792	10797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326457
117	NC_021897	ATC	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326457
118	NC_021897	TGT	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326457
119	NC_021897	AGA	2	6	11014	11019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326457
120	NC_021897	AGG	2	6	11053	11058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326457
121	NC_021897	GAT	2	6	11113	11118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326457
122	NC_021897	CGA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326457
123	NC_021897	AAT	2	6	11332	11337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326458
124	NC_021897	AGG	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326458
125	NC_021897	ATA	3	9	11585	11593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326458
126	NC_021897	TAT	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326458
127	NC_021897	ACA	2	6	11615	11620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326458
128	NC_021897	TAG	2	6	11714	11719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326458
129	NC_021897	TAC	2	6	11908	11913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326458
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