MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021896	TTTCT	2	10	211522	211531	0 %	80 %	0 %	20 %	527325709
4002	NC_021896	TAA	2	6	211551	211556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325710
4003	NC_021896	CTG	2	6	211589	211594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325710
4004	NC_021896	CTT	2	6	211719	211724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325710
4005	NC_021896	ACG	2	6	211857	211862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325710
4006	NC_021896	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325711
4007	NC_021896	AATA	2	8	212150	212157	75 %	25 %	0 %	0 %	527325711
4008	NC_021896	CTT	2	6	212200	212205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325711
4009	NC_021896	CAG	2	6	212210	212215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325711
4010	NC_021896	TTG	2	6	212333	212338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325711
4011	NC_021896	TCC	2	6	212343	212348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325711
4012	NC_021896	AAG	2	6	212383	212388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325711
4013	NC_021896	CTT	2	6	212389	212394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325711
4014	NC_021896	CTT	2	6	212416	212421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325711
4015	NC_021896	CTG	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325711
4016	NC_021896	CCA	2	6	212538	212543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325711
4017	NC_021896	CAAA	2	8	212558	212565	75 %	0 %	0 %	25 %	527325711
4018	NC_021896	CCA	2	6	212577	212582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325711
4019	NC_021896	GCA	2	6	212589	212594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325711
4020	NC_021896	CAA	2	6	212602	212607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325711
4021	NC_021896	TAC	2	6	212653	212658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325711
4022	NC_021896	CTT	2	6	212716	212721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325711
4023	NC_021896	TA	3	6	212842	212847	50 %	50 %	0 %	0 %	527325712
4024	NC_021896	ATG	2	6	212895	212900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325712
4025	NC_021896	TGT	2	6	212903	212908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325712
4026	NC_021896	GC	3	6	212968	212973	0 %	0 %	50 %	50 %	527325712
4027	NC_021896	AGA	2	6	213030	213035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325712
4028	NC_021896	ATT	2	6	213045	213050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325712
4029	NC_021896	CTG	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325712
4030	NC_021896	CAC	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325712
4031	NC_021896	TCT	2	6	213295	213300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325712
4032	NC_021896	C	6	6	213339	213344	0 %	0 %	0 %	100 %	527325712
4033	NC_021896	ATGA	2	8	213345	213352	50 %	25 %	25 %	0 %	527325712
4034	NC_021896	T	6	6	213379	213384	0 %	100 %	0 %	0 %	527325712
4035	NC_021896	GCA	2	6	213467	213472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325712
4036	NC_021896	GAA	2	6	213485	213490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325712
4037	NC_021896	GAAA	2	8	213538	213545	75 %	0 %	25 %	0 %	527325712
4038	NC_021896	TCA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325712
4039	NC_021896	ATG	2	6	213601	213606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325712
4040	NC_021896	TCC	2	6	213612	213617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325712
4041	NC_021896	T	6	6	213618	213623	0 %	100 %	0 %	0 %	527325712
4042	NC_021896	TAA	2	6	213698	213703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325712
4043	NC_021896	AGC	2	6	213744	213749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325712
4044	NC_021896	GAT	2	6	213779	213784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325712
4045	NC_021896	T	7	7	213921	213927	0 %	100 %	0 %	0 %	527325712
4046	NC_021896	AGA	2	6	214211	214216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325713
4047	NC_021896	AGT	2	6	214236	214241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325713
4048	NC_021896	CTC	2	6	214295	214300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325713
4049	NC_021896	AAC	2	6	214309	214314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325713
4050	NC_021896	ACA	2	6	214335	214340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325713
4051	NC_021896	TC	3	6	214412	214417	0 %	50 %	0 %	50 %	527325713
4052	NC_021896	TTC	2	6	214418	214423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4053	NC_021896	AAAG	2	8	214429	214436	75 %	0 %	25 %	0 %	527325713
4054	NC_021896	TAC	2	6	214451	214456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325713
4055	NC_021896	TGC	2	6	214469	214474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325713
4056	NC_021896	GAA	2	6	214518	214523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325713
4057	NC_021896	T	6	6	214553	214558	0 %	100 %	0 %	0 %	527325713
4058	NC_021896	TAA	2	6	214604	214609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325713
4059	NC_021896	TCT	2	6	214669	214674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4060	NC_021896	GTC	2	6	214675	214680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325713
4061	NC_021896	TCT	2	6	214714	214719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4062	NC_021896	TTC	2	6	214767	214772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4063	NC_021896	CTT	2	6	214823	214828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4064	NC_021896	AAT	2	6	214902	214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325713
4065	NC_021896	ATT	2	6	214989	214994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325713
4066	NC_021896	CTT	2	6	215012	215017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4067	NC_021896	GTT	2	6	215023	215028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325713
4068	NC_021896	A	6	6	215043	215048	100 %	0 %	0 %	0 %	527325713
4069	NC_021896	TTCC	2	8	215077	215084	0 %	50 %	0 %	50 %	527325713
4070	NC_021896	TTC	2	6	215141	215146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4071	NC_021896	ATC	2	6	215166	215171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325713
4072	NC_021896	TAA	3	9	215276	215284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325713
4073	NC_021896	TA	3	6	215381	215386	50 %	50 %	0 %	0 %	527325713
4074	NC_021896	CTG	2	6	215423	215428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325713
4075	NC_021896	CTT	2	6	215444	215449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325713
4076	NC_021896	TCA	2	6	215467	215472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325713
4077	NC_021896	ATG	2	6	215979	215984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325714
4078	NC_021896	GAT	2	6	216037	216042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325714
4079	NC_021896	AGA	2	6	216056	216061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325714
4080	NC_021896	AAC	2	6	216081	216086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325714
4081	NC_021896	C	6	6	216127	216132	0 %	0 %	0 %	100 %	527325714
4082	NC_021896	T	7	7	216149	216155	0 %	100 %	0 %	0 %	527325714
4083	NC_021896	A	6	6	216159	216164	100 %	0 %	0 %	0 %	527325714
4084	NC_021896	CTC	2	6	216174	216179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325714
4085	NC_021896	CGAA	2	8	216181	216188	50 %	0 %	25 %	25 %	527325714
4086	NC_021896	ATT	2	6	216196	216201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325714
4087	NC_021896	GCT	2	6	216281	216286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325714
4088	NC_021896	CAA	2	6	216313	216318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325714
4089	NC_021896	AACA	2	8	216348	216355	75 %	0 %	0 %	25 %	527325714
4090	NC_021896	TGTC	2	8	216375	216382	0 %	50 %	25 %	25 %	527325714
4091	NC_021896	ACG	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325714
4092	NC_021896	GGA	2	6	216524	216529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325714
4093	NC_021896	TCTA	2	8	216562	216569	25 %	50 %	0 %	25 %	527325714
4094	NC_021896	CTT	2	6	216624	216629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325714
4095	NC_021896	CA	3	6	216633	216638	50 %	0 %	0 %	50 %	527325714
4096	NC_021896	GA	3	6	216660	216665	50 %	0 %	50 %	0 %	527325714
4097	NC_021896	TCT	2	6	216678	216683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325714
4098	NC_021896	TAGC	2	8	216726	216733	25 %	25 %	25 %	25 %	527325714
4099	NC_021896	C	6	6	216733	216738	0 %	0 %	0 %	100 %	527325714
4100	NC_021896	AAATA	2	10	216742	216751	80 %	20 %	0 %	0 %	527325714
4101	NC_021896	GAA	2	6	216756	216761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325714
4102	NC_021896	ACA	2	6	216823	216828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325714
4103	NC_021896	ACA	2	6	216842	216847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325714
4104	NC_021896	ACA	2	6	216857	216862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325714
4105	NC_021896	TAA	2	6	216867	216872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325714
4106	NC_021896	AAG	3	9	216894	216902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325714
4107	NC_021896	AGG	2	6	217000	217005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325714
4108	NC_021896	CAA	2	6	217259	217264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325715
4109	NC_021896	CT	3	6	217281	217286	0 %	50 %	0 %	50 %	527325715
4110	NC_021896	GCT	2	6	217324	217329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325715
4111	NC_021896	T	7	7	217335	217341	0 %	100 %	0 %	0 %	527325715
4112	NC_021896	ATC	2	6	217343	217348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325715
4113	NC_021896	CTT	2	6	217366	217371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325715
4114	NC_021896	ATT	2	6	217389	217394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325715
4115	NC_021896	GCA	2	6	217441	217446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325715
4116	NC_021896	CTTT	2	8	217452	217459	0 %	75 %	0 %	25 %	527325715
4117	NC_021896	CT	3	6	217517	217522	0 %	50 %	0 %	50 %	527325715
4118	NC_021896	CTT	2	6	217754	217759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325716
4119	NC_021896	GGA	2	6	217762	217767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325716
4120	NC_021896	CTG	2	6	217816	217821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325716
4121	NC_021896	GCA	2	6	217825	217830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325716
4122	NC_021896	AATT	2	8	217865	217872	50 %	50 %	0 %	0 %	527325716
4123	NC_021896	CTAT	2	8	217906	217913	25 %	50 %	0 %	25 %	527325716
4124	NC_021896	GAT	2	6	218119	218124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325716
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4240	NC_021896	GAG	2	6	223090	223095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325721
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4242	NC_021896	TCGA	2	8	223185	223192	25 %	25 %	25 %	25 %	527325721
4243	NC_021896	TCC	2	6	223202	223207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325721
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