MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12503	NC_021896	TTC	2	6	635814	635819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326111
12504	NC_021896	TCC	2	6	635889	635894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326111
12505	NC_021896	AAC	2	6	635898	635903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326111
12506	NC_021896	CTT	2	6	635915	635920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326111
12507	NC_021896	CCT	2	6	635992	635997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326111
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12509	NC_021896	TCT	2	6	636071	636076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326111
12510	NC_021896	T	6	6	636111	636116	0 %	100 %	0 %	0 %	527326111
12511	NC_021896	TCC	2	6	636150	636155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326111
12512	NC_021896	TTTC	2	8	636245	636252	0 %	75 %	0 %	25 %	527326111
12513	NC_021896	AGAA	2	8	636274	636281	75 %	0 %	25 %	0 %	527326111
12514	NC_021896	CAC	2	6	636282	636287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326111
12515	NC_021896	TGC	2	6	636330	636335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326111
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12517	NC_021896	CT	3	6	636415	636420	0 %	50 %	0 %	50 %	527326111
12518	NC_021896	AAG	2	6	636518	636523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326111
12519	NC_021896	CAGC	2	8	636533	636540	25 %	0 %	25 %	50 %	527326111
12520	NC_021896	TAA	3	9	636603	636611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326111
12521	NC_021896	TC	4	8	636663	636670	0 %	50 %	0 %	50 %	527326111
12522	NC_021896	AGC	2	6	636705	636710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326111
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12525	NC_021896	CGT	2	6	636757	636762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326111
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12527	NC_021896	CGGAA	2	10	637027	637036	40 %	0 %	40 %	20 %	527326112
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12530	NC_021896	TTG	2	6	637189	637194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326112
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12535	NC_021896	TA	3	6	637513	637518	50 %	50 %	0 %	0 %	527326112
12536	NC_021896	GTC	2	6	637524	637529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326112
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12543	NC_021896	GCTC	2	8	637923	637930	0 %	25 %	25 %	50 %	527326112
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12545	NC_021896	TA	3	6	638086	638091	50 %	50 %	0 %	0 %	527326112
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12551	NC_021896	A	6	6	638262	638267	100 %	0 %	0 %	0 %	527326112
12552	NC_021896	CAT	2	6	638318	638323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326112
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12555	NC_021896	TTTC	2	8	638377	638384	0 %	75 %	0 %	25 %	527326113
12556	NC_021896	AGC	2	6	638397	638402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326113
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12593	NC_021896	GTT	2	6	640307	640312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326113
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12604	NC_021896	CTG	2	6	640898	640903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
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12607	NC_021896	CTG	2	6	641004	641009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
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12984	NC_021896	ATC	2	6	660690	660695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326129
12985	NC_021896	A	7	7	660753	660759	100 %	0 %	0 %	0 %	527326129
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