MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021896	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325543
502	NC_021896	TTC	2	6	28691	28696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325543
503	NC_021896	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527325543
504	NC_021896	AAG	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325543
505	NC_021896	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527325543
506	NC_021896	GAA	2	6	29073	29078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325543
507	NC_021896	TGT	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325544
508	NC_021896	TCT	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325544
509	NC_021896	ACA	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325544
510	NC_021896	ATG	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325544
511	NC_021896	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527325544
512	NC_021896	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527325544
513	NC_021896	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527325544
514	NC_021896	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527325544
515	NC_021896	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	527325544
516	NC_021896	ATC	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325544
517	NC_021896	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527325544
518	NC_021896	T	8	8	29872	29879	0 %	100 %	0 %	0 %	527325544
519	NC_021896	ATG	2	6	29897	29902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325544
520	NC_021896	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527325544
521	NC_021896	AGG	2	6	30010	30015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325545
522	NC_021896	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	527325545
523	NC_021896	GTT	2	6	30114	30119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325545
524	NC_021896	GAA	2	6	30123	30128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325545
525	NC_021896	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527325545
526	NC_021896	TCT	2	6	30189	30194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325545
527	NC_021896	CTG	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325545
528	NC_021896	ACT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325545
529	NC_021896	TTC	2	6	30307	30312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325545
530	NC_021896	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527325545
531	NC_021896	CCT	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325545
532	NC_021896	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527325545
533	NC_021896	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	527325545
534	NC_021896	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527325545
535	NC_021896	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527325545
536	NC_021896	GAT	2	6	30528	30533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325545
537	NC_021896	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527325545
538	NC_021896	TAG	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325545
539	NC_021896	GTT	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325545
540	NC_021896	TAA	2	6	30734	30739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325545
541	NC_021896	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	527325545
542	NC_021896	GAA	2	6	30873	30878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325545
543	NC_021896	AGA	2	6	30893	30898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325545
544	NC_021896	TCG	2	6	30956	30961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325545
545	NC_021896	ATG	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325545
546	NC_021896	TGG	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325545
547	NC_021896	GAA	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325545
548	NC_021896	ATT	2	6	31071	31076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325545
549	NC_021896	ATG	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325545
550	NC_021896	AAG	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325545
551	NC_021896	T	6	6	31212	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	527325545
552	NC_021896	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	527325545
553	NC_021896	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	527325545
554	NC_021896	ACA	2	6	31300	31305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325546
555	NC_021896	TGT	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325546
556	NC_021896	AT	3	6	31372	31377	50 %	50 %	0 %	0 %	527325546
557	NC_021896	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	527325546
558	NC_021896	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527325546
559	NC_021896	A	6	6	31535	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	527325546
560	NC_021896	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	527325546
561	NC_021896	TGC	2	6	31594	31599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325546
562	NC_021896	AGC	2	6	31612	31617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325546
563	NC_021896	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527325547
564	NC_021896	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	527325547
565	NC_021896	AAG	2	6	31861	31866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325547
566	NC_021896	AAG	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325547
567	NC_021896	CTT	2	6	31907	31912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325547
568	NC_021896	CGT	2	6	31938	31943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325547
569	NC_021896	TGA	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325547
570	NC_021896	GAG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325547
571	NC_021896	GCG	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527325547
572	NC_021896	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	527325547
573	NC_021896	AGA	2	6	32235	32240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325547
574	NC_021896	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	527325547
575	NC_021896	AAG	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325547
576	NC_021896	ATT	2	6	32473	32478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325547
577	NC_021896	T	6	6	32578	32583	0 %	100 %	0 %	0 %	527325547
578	NC_021896	GGA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325547
579	NC_021896	AGG	2	6	32828	32833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325548
580	NC_021896	GGT	2	6	32883	32888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325548
581	NC_021896	GCT	2	6	33045	33050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325548
582	NC_021896	GCT	2	6	33078	33083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325548
583	NC_021896	GAA	2	6	33189	33194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325549
584	NC_021896	A	6	6	33193	33198	100 %	0 %	0 %	0 %	527325549
585	NC_021896	TGT	2	6	33284	33289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325549
586	NC_021896	TGA	2	6	33335	33340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325549
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588	NC_021896	CTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325549
589	NC_021896	T	6	6	33518	33523	0 %	100 %	0 %	0 %	527325549
590	NC_021896	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325549
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592	NC_021896	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	527325549
593	NC_021896	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	527325549
594	NC_021896	CTG	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325550
595	NC_021896	ACA	2	6	33893	33898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325550
596	NC_021896	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	527325550
597	NC_021896	GTC	2	6	33949	33954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325550
598	NC_021896	ATT	2	6	33996	34001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325550
599	NC_021896	T	6	6	34048	34053	0 %	100 %	0 %	0 %	527325550
600	NC_021896	TTA	2	6	34078	34083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325550
601	NC_021896	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527325550
602	NC_021896	GAA	2	6	34171	34176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325550
603	NC_021896	AAG	2	6	34218	34223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325550
604	NC_021896	AGA	2	6	34269	34274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325550
605	NC_021896	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527325550
606	NC_021896	TGC	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325550
607	NC_021896	TGT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325550
608	NC_021896	ATG	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325550
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610	NC_021896	GAA	2	6	34391	34396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325550
611	NC_021896	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527325551
612	NC_021896	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527325551
613	NC_021896	GAT	2	6	34602	34607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325551
614	NC_021896	GA	4	8	34609	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	527325551
615	NC_021896	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	527325551
616	NC_021896	AGA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325551
617	NC_021896	TTA	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325552
618	NC_021896	TGA	2	6	34864	34869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325552
619	NC_021896	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527325552
620	NC_021896	ATC	2	6	35013	35018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325552
621	NC_021896	GAA	2	6	35102	35107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325552
622	NC_021896	TGT	2	6	35131	35136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325552
623	NC_021896	GAG	2	6	35172	35177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325552
624	NC_021896	CAG	2	6	35186	35191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325552
625	NC_021896	AGA	2	6	35305	35310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325552
626	NC_021896	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527325552
627	NC_021896	TG	3	6	35458	35463	0 %	50 %	50 %	0 %	527325552
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629	NC_021896	GAA	2	6	35536	35541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325552
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755	NC_021896	T	6	6	42842	42847	0 %	100 %	0 %	0 %	527325557
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