MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021896	AAC	2	6	262086	262091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325758
5002	NC_021896	TTG	2	6	262109	262114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325758
5003	NC_021896	CTA	2	6	262250	262255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325759
5004	NC_021896	ACA	2	6	262256	262261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325759
5005	NC_021896	AGA	2	6	262320	262325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325759
5006	NC_021896	GCT	2	6	262327	262332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325759
5007	NC_021896	ATA	2	6	262405	262410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325759
5008	NC_021896	TGA	2	6	262423	262428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325759
5009	NC_021896	GCA	2	6	262486	262491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325759
5010	NC_021896	TCG	2	6	262500	262505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325759
5011	NC_021896	CTT	2	6	262523	262528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325759
5012	NC_021896	TGA	2	6	262552	262557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325759
5013	NC_021896	CCT	2	6	262594	262599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325759
5014	NC_021896	CAA	2	6	262685	262690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325759
5015	NC_021896	AC	3	6	262718	262723	50 %	0 %	0 %	50 %	527325759
5016	NC_021896	CA	3	6	262782	262787	50 %	0 %	0 %	50 %	527325759
5017	NC_021896	GCA	2	6	262909	262914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325759
5018	NC_021896	ATACA	2	10	262952	262961	60 %	20 %	0 %	20 %	527325759
5019	NC_021896	GCC	2	6	263008	263013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325759
5020	NC_021896	CTC	2	6	263037	263042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325759
5021	NC_021896	T	6	6	263111	263116	0 %	100 %	0 %	0 %	527325759
5022	NC_021896	TCATT	2	10	263352	263361	20 %	60 %	0 %	20 %	527325760
5023	NC_021896	A	6	6	263365	263370	100 %	0 %	0 %	0 %	527325760
5024	NC_021896	CAG	2	6	263394	263399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325760
5025	NC_021896	A	6	6	263400	263405	100 %	0 %	0 %	0 %	527325760
5026	NC_021896	ATT	2	6	263416	263421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325760
5027	NC_021896	TC	3	6	263517	263522	0 %	50 %	0 %	50 %	527325760
5028	NC_021896	TTC	3	9	263560	263568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325760
5029	NC_021896	ACTT	2	8	263652	263659	25 %	50 %	0 %	25 %	527325760
5030	NC_021896	AGC	2	6	263709	263714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325760
5031	NC_021896	TC	3	6	263857	263862	0 %	50 %	0 %	50 %	527325760
5032	NC_021896	TTG	2	6	263871	263876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325760
5033	NC_021896	GAA	2	6	263907	263912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325760
5034	NC_021896	TAA	2	6	264292	264297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325761
5035	NC_021896	A	7	7	264312	264318	100 %	0 %	0 %	0 %	527325761
5036	NC_021896	TTCT	2	8	264365	264372	0 %	75 %	0 %	25 %	527325761
5037	NC_021896	GA	3	6	264427	264432	50 %	0 %	50 %	0 %	527325761
5038	NC_021896	TAAAA	2	10	264458	264467	80 %	20 %	0 %	0 %	527325761
5039	NC_021896	GTT	2	6	264482	264487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325761
5040	NC_021896	TGA	2	6	264503	264508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325761
5041	NC_021896	TC	3	6	264583	264588	0 %	50 %	0 %	50 %	527325761
5042	NC_021896	AG	3	6	264615	264620	50 %	0 %	50 %	0 %	527325761
5043	NC_021896	ATT	2	6	264707	264712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325761
5044	NC_021896	TAC	2	6	264759	264764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325761
5045	NC_021896	TCATAA	2	12	264785	264796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527325761
5046	NC_021896	AAG	2	6	264835	264840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325761
5047	NC_021896	A	7	7	264857	264863	100 %	0 %	0 %	0 %	527325761
5048	NC_021896	CAA	2	6	264937	264942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325761
5049	NC_021896	ATC	2	6	264970	264975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325761
5050	NC_021896	TTGG	2	8	265188	265195	0 %	50 %	50 %	0 %	527325761
5051	NC_021896	GAGT	2	8	265342	265349	25 %	25 %	50 %	0 %	527325761
5052	NC_021896	TTAA	2	8	265374	265381	50 %	50 %	0 %	0 %	527325761
5053	NC_021896	ATG	2	6	265408	265413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325761
5054	NC_021896	AGA	2	6	265469	265474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325761
5055	NC_021896	AAGTGT	2	12	265511	265522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325761
5056	NC_021896	GTTC	2	8	265530	265537	0 %	50 %	25 %	25 %	527325761
5057	NC_021896	ATTT	2	8	265648	265655	25 %	75 %	0 %	0 %	527325761
5058	NC_021896	GGA	2	6	265656	265661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325761
5059	NC_021896	ATTT	2	8	265687	265694	25 %	75 %	0 %	0 %	527325761
5060	NC_021896	A	6	6	265713	265718	100 %	0 %	0 %	0 %	527325761
5061	NC_021896	GGT	2	6	265737	265742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325761
5062	NC_021896	CTT	2	6	265817	265822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325761
5063	NC_021896	TAA	2	6	265865	265870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325761
5064	NC_021896	ACT	2	6	265885	265890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325761
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5066	NC_021896	A	7	7	265995	266001	100 %	0 %	0 %	0 %	527325761
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5069	NC_021896	ACTAA	2	10	266172	266181	60 %	20 %	0 %	20 %	527325761
5070	NC_021896	TCTA	2	8	266193	266200	25 %	50 %	0 %	25 %	527325761
5071	NC_021896	TTA	2	6	266205	266210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325761
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5073	NC_021896	AAC	3	9	266267	266275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325761
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5081	NC_021896	ATG	2	6	266553	266558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325761
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5088	NC_021896	CTAC	2	8	266784	266791	25 %	25 %	0 %	50 %	527325762
5089	NC_021896	AGA	2	6	266846	266851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325762
5090	NC_021896	A	6	6	266865	266870	100 %	0 %	0 %	0 %	527325762
5091	NC_021896	CTG	2	6	266875	266880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325762
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5096	NC_021896	ATCT	2	8	267028	267035	25 %	50 %	0 %	25 %	527325762
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5106	NC_021896	T	6	6	267329	267334	0 %	100 %	0 %	0 %	527325763
5107	NC_021896	CTT	2	6	267366	267371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325763
5108	NC_021896	CA	3	6	267406	267411	50 %	0 %	0 %	50 %	527325763
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5119	NC_021896	GAC	2	6	267927	267932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325763
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5121	NC_021896	TTGCA	2	10	268145	268154	20 %	40 %	20 %	20 %	527325763
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5123	NC_021896	GAA	2	6	268290	268295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325763
5124	NC_021896	GCA	2	6	268302	268307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325763
5125	NC_021896	CT	3	6	268336	268341	0 %	50 %	0 %	50 %	527325763
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5136	NC_021896	GCT	2	6	268647	268652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325764
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5141	NC_021896	TTTC	2	8	268879	268886	0 %	75 %	0 %	25 %	527325764
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5154	NC_021896	TTG	2	6	269933	269938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325765
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5368	NC_021896	TAC	2	6	279736	279741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325771
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5384	NC_021896	AAGC	2	8	280803	280810	50 %	0 %	25 %	25 %	527325772
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5491	NC_021896	CTC	2	6	285828	285833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325777
5492	NC_021896	CTG	2	6	285947	285952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325778
5493	NC_021896	TGC	2	6	285983	285988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325778
5494	NC_021896	TCT	3	9	285999	286007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325778
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5496	NC_021896	CTT	2	6	286252	286257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325778
5497	NC_021896	GCT	2	6	286312	286317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325778
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5499	NC_021896	CGAA	2	8	286379	286386	50 %	0 %	25 %	25 %	527325778
5500	NC_021896	CCT	2	6	286389	286394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325778

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