MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_021896	CCA	2	6	237540	237545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325732
4503	NC_021896	GAA	2	6	237596	237601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325732
4504	NC_021896	GTT	2	6	237615	237620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325732
4505	NC_021896	AAT	2	6	237729	237734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325733
4506	NC_021896	TTAA	2	8	237750	237757	50 %	50 %	0 %	0 %	527325733
4507	NC_021896	CT	3	6	237772	237777	0 %	50 %	0 %	50 %	527325733
4508	NC_021896	TAG	2	6	237811	237816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325733
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4510	NC_021896	TAA	2	6	237866	237871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325733
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4512	NC_021896	T	8	8	237899	237906	0 %	100 %	0 %	0 %	527325733
4513	NC_021896	TGA	2	6	237908	237913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325733
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4516	NC_021896	TAA	2	6	238033	238038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325733
4517	NC_021896	AGA	2	6	238076	238081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325733
4518	NC_021896	CAAT	2	8	238090	238097	50 %	25 %	0 %	25 %	527325733
4519	NC_021896	CAA	2	6	238136	238141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325733
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4521	NC_021896	ACAA	2	8	238243	238250	75 %	0 %	0 %	25 %	527325733
4522	NC_021896	CTT	2	6	238255	238260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325733
4523	NC_021896	TCT	2	6	238287	238292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325733
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4527	NC_021896	AAG	2	6	238508	238513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325733
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4539	NC_021896	GA	3	6	238955	238960	50 %	0 %	50 %	0 %	527325733
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4545	NC_021896	CGAT	2	8	239134	239141	25 %	25 %	25 %	25 %	527325733
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4554	NC_021896	GAGAG	2	10	239345	239354	40 %	0 %	60 %	0 %	527325733
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4557	NC_021896	A	7	7	239734	239740	100 %	0 %	0 %	0 %	527325734
4558	NC_021896	CTTC	2	8	239753	239760	0 %	50 %	0 %	50 %	527325734
4559	NC_021896	CAGA	2	8	239793	239800	50 %	0 %	25 %	25 %	527325734
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4572	NC_021896	CTTGG	2	10	240239	240248	0 %	40 %	40 %	20 %	527325734
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4593	NC_021896	ATA	2	6	241003	241008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325735
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4603	NC_021896	TCTTT	2	10	241535	241544	0 %	80 %	0 %	20 %	527325735
4604	NC_021896	ATC	2	6	241575	241580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325735
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4607	NC_021896	TTTG	2	8	241846	241853	0 %	75 %	25 %	0 %	527325735
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4618	NC_021896	AACT	2	8	242413	242420	50 %	25 %	0 %	25 %	527325736
4619	NC_021896	TC	3	6	242480	242485	0 %	50 %	0 %	50 %	527325736
4620	NC_021896	TCCCC	2	10	242524	242533	0 %	20 %	0 %	80 %	527325736
4621	NC_021896	CTT	2	6	242586	242591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325736
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4994	NC_021896	TCA	2	6	261820	261825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325758
4995	NC_021896	CT	3	6	261832	261837	0 %	50 %	0 %	50 %	527325758
4996	NC_021896	TCT	2	6	261858	261863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325758
4997	NC_021896	GT	3	6	261944	261949	0 %	50 %	50 %	0 %	527325758
4998	NC_021896	CTT	2	6	262021	262026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325758
4999	NC_021896	ATA	2	6	262041	262046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325758
5000	NC_021896	TCA	2	6	262071	262076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325758

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