MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021895	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527324646
1002	NC_021895	TGG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527324646
1003	NC_021895	GGTTCA	2	12	55110	55121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527324646
1004	NC_021895	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527324646
1005	NC_021895	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527324646
1006	NC_021895	CTG	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324646
1007	NC_021895	GAG	2	6	55312	55317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324646
1008	NC_021895	AT	3	6	55556	55561	50 %	50 %	0 %	0 %	527324646
1009	NC_021895	TTA	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324646
1010	NC_021895	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527324647
1011	NC_021895	ATT	2	6	55864	55869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324647
1012	NC_021895	GAT	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324647
1013	NC_021895	TCT	2	6	55895	55900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324647
1014	NC_021895	TCC	2	6	55909	55914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324647
1015	NC_021895	TCC	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324647
1016	NC_021895	TTA	2	6	55940	55945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324647
1017	NC_021895	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527324647
1018	NC_021895	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527324647
1019	NC_021895	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	527324647
1020	NC_021895	GTA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324647
1021	NC_021895	GTT	2	6	56177	56182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324647
1022	NC_021895	GAT	2	6	56195	56200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324647
1023	NC_021895	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527324647
1024	NC_021895	T	6	6	56331	56336	0 %	100 %	0 %	0 %	527324647
1025	NC_021895	GAT	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324648
1026	NC_021895	TCC	2	6	57645	57650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324648
1027	NC_021895	GAG	2	6	57664	57669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324648
1028	NC_021895	AGTTGT	2	12	57706	57717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527324648
1029	NC_021895	AGA	2	6	57777	57782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324648
1030	NC_021895	CTA	2	6	57793	57798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324648
1031	NC_021895	CTG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324648
1032	NC_021895	TGT	2	6	58032	58037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324648
1033	NC_021895	TTG	2	6	58070	58075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324648
1034	NC_021895	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527324648
1035	NC_021895	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527324648
1036	NC_021895	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324648
1037	NC_021895	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527324648
1038	NC_021895	AGA	2	6	59103	59108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324649
1039	NC_021895	TCT	2	6	59119	59124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324649
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1041	NC_021895	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527324649
1042	NC_021895	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527324649
1043	NC_021895	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527324649
1044	NC_021895	TCCTAA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324649
1045	NC_021895	AGT	2	6	59459	59464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324649
1046	NC_021895	T	6	6	59491	59496	0 %	100 %	0 %	0 %	527324649
1047	NC_021895	AGC	2	6	59539	59544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324649
1048	NC_021895	GCT	2	6	59551	59556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324649
1049	NC_021895	GTC	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324649
1050	NC_021895	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527324649
1051	NC_021895	AGG	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324649
1052	NC_021895	GA	3	6	59676	59681	50 %	0 %	50 %	0 %	527324649
1053	NC_021895	CAA	2	6	59699	59704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324649
1054	NC_021895	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527324649
1055	NC_021895	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527324649
1056	NC_021895	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527324649
1057	NC_021895	TAG	2	6	59826	59831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324649
1058	NC_021895	AAG	2	6	60011	60016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324649
1059	NC_021895	CTC	2	6	60023	60028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324649
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1061	NC_021895	T	7	7	60075	60081	0 %	100 %	0 %	0 %	527324649
1062	NC_021895	CTT	2	6	60125	60130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324649
1063	NC_021895	AAT	2	6	60155	60160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324649
1064	NC_021895	TTC	2	6	60166	60171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324649
1065	NC_021895	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527324649
1066	NC_021895	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527324649
1067	NC_021895	ATG	2	6	60236	60241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324650
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1069	NC_021895	AGT	2	6	60297	60302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324650
1070	NC_021895	TCT	2	6	60320	60325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324650
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1072	NC_021895	TTC	2	6	60453	60458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324650
1073	NC_021895	CTTT	2	8	60488	60495	0 %	75 %	0 %	25 %	527324650
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1083	NC_021895	A	6	6	61181	61186	100 %	0 %	0 %	0 %	527324652
1084	NC_021895	CA	3	6	61188	61193	50 %	0 %	0 %	50 %	527324652
1085	NC_021895	TGA	2	6	61200	61205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324652
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1093	NC_021895	GA	3	6	61461	61466	50 %	0 %	50 %	0 %	527324652
1094	NC_021895	TTC	2	6	61488	61493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324652
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1096	NC_021895	A	6	6	61561	61566	100 %	0 %	0 %	0 %	527324652
1097	NC_021895	GA	3	6	61587	61592	50 %	0 %	50 %	0 %	527324652
1098	NC_021895	ATG	2	6	61829	61834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324652
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1102	NC_021895	ATG	2	6	62129	62134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324652
1103	NC_021895	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527324652
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1106	NC_021895	ATT	2	6	62344	62349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324652
1107	NC_021895	TTC	2	6	62386	62391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324652
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1109	NC_021895	CTT	2	6	62519	62524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324652
1110	NC_021895	AAG	2	6	62553	62558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324652
1111	NC_021895	TTA	2	6	62630	62635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324652
1112	NC_021895	GA	3	6	62661	62666	50 %	0 %	50 %	0 %	527324652
1113	NC_021895	TTA	2	6	62711	62716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324652
1114	NC_021895	AAG	2	6	62718	62723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324652
1115	NC_021895	TC	3	6	62817	62822	0 %	50 %	0 %	50 %	527324652
1116	NC_021895	CAA	2	6	62918	62923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324652
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1118	NC_021895	TTC	2	6	63004	63009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324652
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1121	NC_021895	AG	3	6	63198	63203	50 %	0 %	50 %	0 %	527324652
1122	NC_021895	CT	4	8	63206	63213	0 %	50 %	0 %	50 %	527324652
1123	NC_021895	T	6	6	63225	63230	0 %	100 %	0 %	0 %	527324652
1124	NC_021895	GTTCTT	2	12	63344	63355	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527324652
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1126	NC_021895	AG	3	6	63433	63438	50 %	0 %	50 %	0 %	527324652
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1128	NC_021895	TATG	2	8	63503	63510	25 %	50 %	25 %	0 %	527324652
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