MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii DC

Total Repeats: 3076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021894	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
2	NC_021894	TGA	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324387
3	NC_021894	ATT	2	6	55	60	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
4	NC_021894	AAT	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
5	NC_021894	TAG	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324387
6	NC_021894	CAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324387
7	NC_021894	TAA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
8	NC_021894	TAA	3	9	378	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
9	NC_021894	ATT	2	6	388	393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
10	NC_021894	TAA	2	6	396	401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
11	NC_021894	ATT	2	6	490	495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
12	NC_021894	TAA	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
13	NC_021894	TTA	2	6	532	537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
14	NC_021894	AAC	3	9	735	743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324387
15	NC_021894	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324387
16	NC_021894	TAT	2	6	894	899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
17	NC_021894	AAG	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324387
18	NC_021894	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
19	NC_021894	AAG	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324387
20	NC_021894	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
21	NC_021894	ATA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
22	NC_021894	ATT	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
23	NC_021894	TAA	3	9	1134	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
24	NC_021894	ATT	3	9	1164	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324387
25	NC_021894	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324387
26	NC_021894	TAA	2	6	1235	1240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
27	NC_021894	TAA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
28	NC_021894	AAT	2	6	1328	1333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324387
29	NC_021894	TCT	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324388
30	NC_021894	TAA	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
31	NC_021894	AGG	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324388
32	NC_021894	AGG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324388
33	NC_021894	AAT	2	6	1523	1528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
34	NC_021894	TCT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324388
35	NC_021894	ATT	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
36	NC_021894	TTG	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324388
37	NC_021894	TTA	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
38	NC_021894	ATT	2	6	1674	1679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
39	NC_021894	TAT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
40	NC_021894	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
41	NC_021894	TAA	2	6	1949	1954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
42	NC_021894	TAA	3	9	2009	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
43	NC_021894	TTA	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
44	NC_021894	AGA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324388
45	NC_021894	TCA	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324388
46	NC_021894	TAG	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324388
47	NC_021894	TAA	2	6	2272	2277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
48	NC_021894	TAT	2	6	2306	2311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
49	NC_021894	ATA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
50	NC_021894	ATT	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
51	NC_021894	ATA	2	6	2389	2394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
52	NC_021894	ACA	2	6	2421	2426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324388
53	NC_021894	GAA	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324388
54	NC_021894	GCT	3	9	2439	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324388
55	NC_021894	TTG	2	6	2455	2460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324388
56	NC_021894	TAA	2	6	2747	2752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
57	NC_021894	TAA	2	6	2788	2793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324388
58	NC_021894	TAT	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324388
59	NC_021894	AAT	2	6	2854	2859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324389
60	NC_021894	TAT	3	9	2888	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
61	NC_021894	TTA	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
62	NC_021894	ATT	2	6	2951	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
63	NC_021894	TAA	2	6	2982	2987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324389
64	NC_021894	TTA	2	6	3037	3042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
65	NC_021894	AAT	2	6	3150	3155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324389
66	NC_021894	TAA	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324389
67	NC_021894	ATT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
68	NC_021894	ATA	2	6	3346	3351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324389
69	NC_021894	ATT	2	6	3419	3424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
70	NC_021894	TTA	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
71	NC_021894	ATT	2	6	3483	3488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324389
72	NC_021894	AGC	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324390
73	NC_021894	TAT	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324390
74	NC_021894	ATT	2	6	3589	3594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324390
75	NC_021894	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324390
76	NC_021894	TAA	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324390
77	NC_021894	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324390
78	NC_021894	ATA	2	6	3766	3771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
79	NC_021894	TAA	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
80	NC_021894	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
81	NC_021894	TTA	2	6	3893	3898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324391
82	NC_021894	AAT	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
83	NC_021894	TAT	2	6	3978	3983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324391
84	NC_021894	TAT	2	6	4016	4021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324391
85	NC_021894	ATT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324391
86	NC_021894	ATA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
87	NC_021894	TAA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324391
88	NC_021894	TAA	2	6	4218	4223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324392
89	NC_021894	TAT	2	6	4265	4270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324392
90	NC_021894	ATA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324392
91	NC_021894	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324392
92	NC_021894	TAT	2	6	4382	4387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
93	NC_021894	TTG	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324393
94	NC_021894	AAT	2	6	4464	4469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
95	NC_021894	AAT	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
96	NC_021894	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324393
97	NC_021894	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
98	NC_021894	GAA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324393
99	NC_021894	ATA	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
100	NC_021894	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
101	NC_021894	ATT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
102	NC_021894	TAA	2	6	4792	4797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
103	NC_021894	ACA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324393
104	NC_021894	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
105	NC_021894	TCT	2	6	4902	4907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324393
106	NC_021894	TAA	2	6	4909	4914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
107	NC_021894	AGT	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324393
108	NC_021894	CAG	3	9	4975	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324393
109	NC_021894	CTG	3	9	4987	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324393
110	NC_021894	ATT	2	6	5067	5072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
111	NC_021894	ATG	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324393
112	NC_021894	AAG	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324393
113	NC_021894	CCT	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324393
114	NC_021894	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324393
115	NC_021894	TAA	2	6	5240	5245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
116	NC_021894	AAT	2	6	5247	5252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
117	NC_021894	AAT	2	6	5273	5278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
118	NC_021894	CTT	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324393
119	NC_021894	CAA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324393
120	NC_021894	AGG	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324393
121	NC_021894	GCA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324393
122	NC_021894	TTC	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324393
123	NC_021894	TTA	2	6	5574	5579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
124	NC_021894	ATT	2	6	5602	5607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
125	NC_021894	TAA	3	9	5620	5628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
126	NC_021894	ATA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
127	NC_021894	ATA	2	6	5734	5739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
128	NC_021894	TAA	2	6	5753	5758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324393
129	NC_021894	TTA	2	6	5769	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
130	NC_021894	ATT	2	6	5781	5786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324393
131	NC_021894	TAA	2	6	5857	5862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324394
132	NC_021894	AAT	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324394
133	NC_021894	ATG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324394
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