MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 20286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021893	CAA	2	6	54790	54795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323511
1003	NC_021893	G	6	6	54827	54832	0 %	0 %	100 %	0 %	527323511
1004	NC_021893	AAT	2	6	54924	54929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323511
1005	NC_021893	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527323511
1006	NC_021893	TGG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527323511
1007	NC_021893	GGTTCA	2	12	55110	55121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527323511
1008	NC_021893	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527323511
1009	NC_021893	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527323511
1010	NC_021893	CTG	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323511
1011	NC_021893	GAG	2	6	55312	55317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323511
1012	NC_021893	AT	3	6	55556	55561	50 %	50 %	0 %	0 %	527323511
1013	NC_021893	TTA	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323511
1014	NC_021893	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527323512
1015	NC_021893	ATT	2	6	55864	55869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323512
1016	NC_021893	GAT	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323512
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1018	NC_021893	TCC	2	6	55909	55914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323512
1019	NC_021893	TCC	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323512
1020	NC_021893	TTA	2	6	55940	55945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323512
1021	NC_021893	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527323512
1022	NC_021893	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527323512
1023	NC_021893	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	527323512
1024	NC_021893	GTA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323512
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1026	NC_021893	GAT	2	6	56195	56200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323512
1027	NC_021893	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527323512
1028	NC_021893	T	6	6	56331	56336	0 %	100 %	0 %	0 %	527323512
1029	NC_021893	GAT	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323513
1030	NC_021893	TCC	2	6	57645	57650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323513
1031	NC_021893	GAG	2	6	57664	57669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323513
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1033	NC_021893	AGA	2	6	57777	57782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323513
1034	NC_021893	CTA	2	6	57793	57798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323513
1035	NC_021893	CTG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323513
1036	NC_021893	TGT	2	6	58032	58037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323513
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1038	NC_021893	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527323513
1039	NC_021893	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527323513
1040	NC_021893	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323513
1041	NC_021893	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527323513
1042	NC_021893	AGA	2	6	59103	59108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323514
1043	NC_021893	TCT	2	6	59119	59124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323514
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1045	NC_021893	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527323514
1046	NC_021893	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527323514
1047	NC_021893	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527323514
1048	NC_021893	TCCTAA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323514
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1053	NC_021893	GTC	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323514
1054	NC_021893	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527323514
1055	NC_021893	AGG	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323514
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1058	NC_021893	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527323514
1059	NC_021893	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527323514
1060	NC_021893	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527323514
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1063	NC_021893	CTC	2	6	60023	60028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323514
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1065	NC_021893	T	7	7	60075	60081	0 %	100 %	0 %	0 %	527323514
1066	NC_021893	CTT	2	6	60125	60130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323514
1067	NC_021893	AAT	2	6	60155	60160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323514
1068	NC_021893	TTC	2	6	60166	60171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323514
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1070	NC_021893	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527323514
1071	NC_021893	ATG	2	6	60236	60241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323515
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1101	NC_021893	GA	3	6	61587	61592	50 %	0 %	50 %	0 %	527323517
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1107	NC_021893	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527323517
1108	NC_021893	TGT	2	6	62246	62251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323517
1109	NC_021893	A	6	6	62327	62332	100 %	0 %	0 %	0 %	527323517
1110	NC_021893	ATT	2	6	62344	62349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323517
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1121	NC_021893	AT	3	6	62998	63003	50 %	50 %	0 %	0 %	527323517
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1125	NC_021893	AG	3	6	63198	63203	50 %	0 %	50 %	0 %	527323517
1126	NC_021893	CT	4	8	63206	63213	0 %	50 %	0 %	50 %	527323517
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1251	NC_021893	GCA	2	6	69997	70002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323523
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1383	NC_021893	GCA	2	6	76237	76242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323527
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1494	NC_021893	GTTA	2	8	81923	81930	25 %	50 %	25 %	0 %	527323533
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1500	NC_021893	CAG	2	6	82134	82139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323533

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