MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 20286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021893	TCT	2	6	261858	261863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323699
5002	NC_021893	GT	3	6	261944	261949	0 %	50 %	50 %	0 %	527323699
5003	NC_021893	CTT	2	6	262021	262026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323699
5004	NC_021893	ATA	2	6	262041	262046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323699
5005	NC_021893	TCA	2	6	262071	262076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323699
5006	NC_021893	AAC	2	6	262086	262091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323699
5007	NC_021893	TTG	2	6	262109	262114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323699
5008	NC_021893	CTA	2	6	262250	262255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323700
5009	NC_021893	ACA	2	6	262256	262261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323700
5010	NC_021893	AGA	2	6	262320	262325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323700
5011	NC_021893	GCT	2	6	262327	262332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323700
5012	NC_021893	ATA	2	6	262405	262410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323700
5013	NC_021893	TGA	2	6	262423	262428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323700
5014	NC_021893	GCA	2	6	262486	262491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323700
5015	NC_021893	TCG	2	6	262500	262505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323700
5016	NC_021893	CTT	2	6	262523	262528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323700
5017	NC_021893	TGA	2	6	262552	262557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323700
5018	NC_021893	CCT	2	6	262594	262599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323700
5019	NC_021893	CAA	2	6	262685	262690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323700
5020	NC_021893	AC	3	6	262718	262723	50 %	0 %	0 %	50 %	527323700
5021	NC_021893	CA	3	6	262782	262787	50 %	0 %	0 %	50 %	527323700
5022	NC_021893	GCA	2	6	262909	262914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323700
5023	NC_021893	ATACA	2	10	262952	262961	60 %	20 %	0 %	20 %	527323700
5024	NC_021893	GCC	2	6	263008	263013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527323700
5025	NC_021893	CTC	2	6	263037	263042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323700
5026	NC_021893	T	6	6	263111	263116	0 %	100 %	0 %	0 %	527323700
5027	NC_021893	TCATT	2	10	263352	263361	20 %	60 %	0 %	20 %	527323701
5028	NC_021893	A	6	6	263365	263370	100 %	0 %	0 %	0 %	527323701
5029	NC_021893	CAG	2	6	263394	263399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323701
5030	NC_021893	A	6	6	263400	263405	100 %	0 %	0 %	0 %	527323701
5031	NC_021893	ATT	2	6	263416	263421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323701
5032	NC_021893	TC	3	6	263517	263522	0 %	50 %	0 %	50 %	527323701
5033	NC_021893	TTC	3	9	263560	263568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323701
5034	NC_021893	ACTT	2	8	263652	263659	25 %	50 %	0 %	25 %	527323701
5035	NC_021893	AGC	2	6	263709	263714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323701
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5037	NC_021893	TTG	2	6	263871	263876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323701
5038	NC_021893	GAA	2	6	263907	263912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323701
5039	NC_021893	TAA	2	6	264292	264297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323702
5040	NC_021893	A	7	7	264312	264318	100 %	0 %	0 %	0 %	527323702
5041	NC_021893	TTCT	2	8	264365	264372	0 %	75 %	0 %	25 %	527323702
5042	NC_021893	GA	3	6	264427	264432	50 %	0 %	50 %	0 %	527323702
5043	NC_021893	TAAAA	2	10	264458	264467	80 %	20 %	0 %	0 %	527323702
5044	NC_021893	GTT	2	6	264482	264487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323702
5045	NC_021893	TGA	2	6	264503	264508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323702
5046	NC_021893	TC	3	6	264583	264588	0 %	50 %	0 %	50 %	527323702
5047	NC_021893	AG	3	6	264615	264620	50 %	0 %	50 %	0 %	527323702
5048	NC_021893	ATT	2	6	264707	264712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323702
5049	NC_021893	TAC	2	6	264759	264764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323702
5050	NC_021893	TCATAA	2	12	264785	264796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527323702
5051	NC_021893	AAG	2	6	264835	264840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323702
5052	NC_021893	A	7	7	264857	264863	100 %	0 %	0 %	0 %	527323702
5053	NC_021893	CAA	2	6	264937	264942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323702
5054	NC_021893	ATC	2	6	264970	264975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323702
5055	NC_021893	TTGG	2	8	265188	265195	0 %	50 %	50 %	0 %	527323702
5056	NC_021893	GAGT	2	8	265342	265349	25 %	25 %	50 %	0 %	527323702
5057	NC_021893	TTAA	2	8	265374	265381	50 %	50 %	0 %	0 %	527323702
5058	NC_021893	ATG	2	6	265408	265413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323702
5059	NC_021893	AGA	2	6	265469	265474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323702
5060	NC_021893	AAGTGT	2	12	265511	265522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323702
5061	NC_021893	GTTC	2	8	265530	265537	0 %	50 %	25 %	25 %	527323702
5062	NC_021893	ATTT	2	8	265648	265655	25 %	75 %	0 %	0 %	527323702
5063	NC_021893	GGA	2	6	265656	265661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323702
5064	NC_021893	ATTT	2	8	265687	265694	25 %	75 %	0 %	0 %	527323702
5065	NC_021893	A	6	6	265713	265718	100 %	0 %	0 %	0 %	527323702
5066	NC_021893	GGT	2	6	265737	265742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527323702
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5071	NC_021893	A	7	7	265995	266001	100 %	0 %	0 %	0 %	527323702
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5075	NC_021893	TCTA	2	8	266193	266200	25 %	50 %	0 %	25 %	527323702
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5094	NC_021893	AGA	2	6	266846	266851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323703
5095	NC_021893	A	6	6	266865	266870	100 %	0 %	0 %	0 %	527323703
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5101	NC_021893	ATCT	2	8	267028	267035	25 %	50 %	0 %	25 %	527323703
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5113	NC_021893	CA	3	6	267406	267411	50 %	0 %	0 %	50 %	527323704
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5123	NC_021893	ATT	2	6	267918	267923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323704
5124	NC_021893	GAC	2	6	267927	267932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323704
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