MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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2124	NC_021892	TC	4	8	113627	113634	0 %	50 %	0 %	50 %	527322602
2125	NC_021892	GCA	2	6	113669	113674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
2126	NC_021892	GCA	2	6	113678	113683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
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2129	NC_021892	GCA	2	6	113894	113899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
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2140	NC_021892	T	6	6	114538	114543	0 %	100 %	0 %	0 %	527322603
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2145	NC_021892	AGAA	2	8	114739	114746	75 %	0 %	25 %	0 %	527322603
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2229	NC_021892	GTT	2	6	119249	119254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322607
2230	NC_021892	TAT	2	6	119284	119289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322607
2231	NC_021892	GAT	2	6	119300	119305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322607
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2234	NC_021892	AG	3	6	119525	119530	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2235	NC_021892	GCTA	2	8	119547	119554	25 %	25 %	25 %	25 %	527322608
2236	NC_021892	GA	3	6	119558	119563	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2237	NC_021892	AAG	2	6	119566	119571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322608
2238	NC_021892	GCT	3	9	119572	119580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322608
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2241	NC_021892	TC	3	6	119646	119651	0 %	50 %	0 %	50 %	527322608
2242	NC_021892	GCTA	2	8	119679	119686	25 %	25 %	25 %	25 %	527322608
2243	NC_021892	CGGC	2	8	119728	119735	0 %	0 %	50 %	50 %	527322608
2244	NC_021892	AGC	2	6	119769	119774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322608
2245	NC_021892	TGC	2	6	119778	119783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322608
2246	NC_021892	TCC	2	6	119790	119795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322608
2247	NC_021892	AG	3	6	119836	119841	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2248	NC_021892	GA	4	8	119879	119886	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2249	NC_021892	GGC	2	6	119919	119924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322608
2250	NC_021892	T	6	6	120018	120023	0 %	100 %	0 %	0 %	527322608
2251	NC_021892	TCT	2	6	120103	120108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322608
2252	NC_021892	GA	3	6	120212	120217	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2253	NC_021892	ATC	2	6	120306	120311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322608
2254	NC_021892	TTGGTA	2	12	120607	120618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527322609
2255	NC_021892	TG	3	6	120646	120651	0 %	50 %	50 %	0 %	527322609
2256	NC_021892	TCA	2	6	120654	120659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322609
2257	NC_021892	GAA	2	6	120678	120683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2258	NC_021892	CGC	2	6	120707	120712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527322609
2259	NC_021892	TGC	2	6	120725	120730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322609
2260	NC_021892	CTG	2	6	120733	120738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322609
2261	NC_021892	AGC	2	6	120756	120761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322609
2262	NC_021892	CTTC	2	8	120954	120961	0 %	50 %	0 %	50 %	527322609
2263	NC_021892	GTA	2	6	120963	120968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322609
2264	NC_021892	AGGATC	2	12	120986	120997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527322609
2265	NC_021892	CTT	2	6	121138	121143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322609
2266	NC_021892	CAG	2	6	121180	121185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322609
2267	NC_021892	AGG	2	6	121211	121216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322609
2268	NC_021892	CT	3	6	121271	121276	0 %	50 %	0 %	50 %	527322609
2269	NC_021892	GAA	2	6	121325	121330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2270	NC_021892	TCC	2	6	121416	121421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322609
2271	NC_021892	ATG	2	6	121525	121530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322609
2272	NC_021892	TGC	2	6	121542	121547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322609
2273	NC_021892	CTT	2	6	121567	121572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322609
2274	NC_021892	AGA	2	6	121664	121669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2275	NC_021892	GAA	2	6	121680	121685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2276	NC_021892	TTTC	2	8	121762	121769	0 %	75 %	0 %	25 %	527322609
2277	NC_021892	AAC	2	6	121813	121818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322609
2278	NC_021892	AAG	2	6	121834	121839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2279	NC_021892	TGA	2	6	121861	121866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322609
2280	NC_021892	AT	3	6	121973	121978	50 %	50 %	0 %	0 %	527322609
2281	NC_021892	GTT	2	6	122013	122018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322609
2282	NC_021892	CAA	2	6	122030	122035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322609
2283	NC_021892	AAG	2	6	122038	122043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2284	NC_021892	AGA	2	6	122105	122110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322609
2285	NC_021892	TGA	2	6	122117	122122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322609
2286	NC_021892	CTT	2	6	122160	122165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322609
2287	NC_021892	TC	3	6	122183	122188	0 %	50 %	0 %	50 %	527322609
2288	NC_021892	ATC	2	6	122366	122371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322609
2289	NC_021892	AAAG	2	8	122493	122500	75 %	0 %	25 %	0 %	527322609
2290	NC_021892	GA	3	6	122513	122518	50 %	0 %	50 %	0 %	527322609
2291	NC_021892	GCTTC	2	10	122521	122530	0 %	40 %	20 %	40 %	527322609
2292	NC_021892	TCTA	2	8	122562	122569	25 %	50 %	0 %	25 %	527322609
2293	NC_021892	ACT	2	6	122723	122728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322610
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2295	NC_021892	AG	3	6	122819	122824	50 %	0 %	50 %	0 %	527322610
2296	NC_021892	T	6	6	122835	122840	0 %	100 %	0 %	0 %	527322610
2297	NC_021892	AGCT	2	8	122868	122875	25 %	25 %	25 %	25 %	527322610
2298	NC_021892	CAA	2	6	122937	122942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322610
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2301	NC_021892	ATA	2	6	123093	123098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322610
2302	NC_021892	TAA	2	6	123222	123227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322610
2303	NC_021892	TGA	2	6	123311	123316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322610
2304	NC_021892	TCC	2	6	123371	123376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322610
2305	NC_021892	GAT	2	6	123403	123408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322610
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2307	NC_021892	AGA	2	6	123547	123552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322610
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2309	NC_021892	GA	3	6	123733	123738	50 %	0 %	50 %	0 %	527322611
2310	NC_021892	GGGTTT	2	12	123756	123767	0 %	50 %	50 %	0 %	527322611
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2314	NC_021892	TGGA	2	8	123824	123831	25 %	25 %	50 %	0 %	527322611
2315	NC_021892	GCAA	2	8	123859	123866	50 %	0 %	25 %	25 %	527322611
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2318	NC_021892	GGA	2	6	123962	123967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322611
2319	NC_021892	CTT	2	6	123989	123994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322611
2320	NC_021892	TTGCAT	2	12	124038	124049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527322611
2321	NC_021892	A	7	7	124056	124062	100 %	0 %	0 %	0 %	527322611
2322	NC_021892	CTG	2	6	124065	124070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322611
2323	NC_021892	TGA	2	6	124092	124097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
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2326	NC_021892	AG	3	6	124145	124150	50 %	0 %	50 %	0 %	527322611
2327	NC_021892	TGT	2	6	124360	124365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322611
2328	NC_021892	TGA	2	6	124392	124397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
2329	NC_021892	AAGAGA	2	12	124407	124418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322611
2330	NC_021892	TAC	2	6	124445	124450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322611
2331	NC_021892	AGA	2	6	124462	124467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322611
2332	NC_021892	TTG	2	6	124468	124473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322611
2333	NC_021892	GA	3	6	124515	124520	50 %	0 %	50 %	0 %	527322611
2334	NC_021892	TAG	2	6	124534	124539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
2335	NC_021892	CTTC	2	8	124541	124548	0 %	50 %	0 %	50 %	527322611
2336	NC_021892	TCA	2	6	124661	124666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322611
2337	NC_021892	T	6	6	124690	124695	0 %	100 %	0 %	0 %	527322611
2338	NC_021892	ATAA	2	8	124744	124751	75 %	25 %	0 %	0 %	527322611
2339	NC_021892	TGAA	2	8	124829	124836	50 %	25 %	25 %	0 %	527322612
2340	NC_021892	TAA	2	6	125124	125129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322612
2341	NC_021892	AAC	2	6	125159	125164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322612
2342	NC_021892	CTT	2	6	125189	125194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322612
2343	NC_021892	GGA	2	6	125290	125295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322612
2344	NC_021892	TCT	2	6	125308	125313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322612
2345	NC_021892	CAG	2	6	125365	125370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322612
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2347	NC_021892	TGA	2	6	125397	125402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322612
2348	NC_021892	T	6	6	125439	125444	0 %	100 %	0 %	0 %	527322612
2349	NC_021892	TTAA	2	8	125553	125560	50 %	50 %	0 %	0 %	527322612
2350	NC_021892	T	7	7	125638	125644	0 %	100 %	0 %	0 %	527322613
2351	NC_021892	AGA	2	6	125665	125670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322613
2352	NC_021892	CT	3	6	125741	125746	0 %	50 %	0 %	50 %	527322613
2353	NC_021892	GA	3	6	125827	125832	50 %	0 %	50 %	0 %	527322613
2354	NC_021892	GTA	2	6	125843	125848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322613
2355	NC_021892	GTT	2	6	125863	125868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322613
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2357	NC_021892	TGAT	2	8	125981	125988	25 %	50 %	25 %	0 %	527322613
2358	NC_021892	AGA	2	6	126022	126027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322613
2359	NC_021892	GAA	2	6	126167	126172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322613
2360	NC_021892	CAA	2	6	126276	126281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322613
2361	NC_021892	CTTT	2	8	126284	126291	0 %	75 %	0 %	25 %	527322613
2362	NC_021892	T	7	7	126289	126295	0 %	100 %	0 %	0 %	527322613
2363	NC_021892	TACAA	2	10	126310	126319	60 %	20 %	0 %	20 %	527322613
2364	NC_021892	GCA	2	6	126522	126527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322614
2365	NC_021892	TCT	2	6	126534	126539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322614
2366	NC_021892	TGT	2	6	126563	126568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322614
2367	NC_021892	CAT	2	6	126676	126681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322614
2368	NC_021892	TTCG	2	8	126686	126693	0 %	50 %	25 %	25 %	527322614
2369	NC_021892	TTG	2	6	126710	126715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322614
2370	NC_021892	GAT	2	6	126719	126724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322614
2371	NC_021892	CTT	2	6	126730	126735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322614
2372	NC_021892	GCA	2	6	126747	126752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322614
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2477	NC_021892	AT	3	6	131725	131730	50 %	50 %	0 %	0 %	527322617
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2480	NC_021892	TTCT	2	8	131886	131893	0 %	75 %	0 %	25 %	527322617
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2486	NC_021892	GAA	2	6	132152	132157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322617
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2488	NC_021892	CTT	2	6	132282	132287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322617
2489	NC_021892	GGA	2	6	132289	132294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322617
2490	NC_021892	TGA	2	6	132358	132363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322617
2491	NC_021892	GTT	2	6	132380	132385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322617
2492	NC_021892	A	6	6	132411	132416	100 %	0 %	0 %	0 %	527322617
2493	NC_021892	GGAG	2	8	132421	132428	25 %	0 %	75 %	0 %	527322617
2494	NC_021892	GGA	2	6	132451	132456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322617
2495	NC_021892	AGA	2	6	132463	132468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322617
2496	NC_021892	CAGT	2	8	132501	132508	25 %	25 %	25 %	25 %	527322617
2497	NC_021892	GATTC	2	10	132509	132518	20 %	40 %	20 %	20 %	527322617
2498	NC_021892	GCT	2	6	132521	132526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322617
2499	NC_021892	TAA	2	6	132634	132639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322617
2500	NC_021892	GAA	2	6	132641	132646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322617

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