MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021892	TAA	2	6	82831	82836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322575
1503	NC_021892	CAT	2	6	82847	82852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322575
1504	NC_021892	GAA	2	6	82859	82864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322575
1505	NC_021892	GA	3	6	82944	82949	50 %	0 %	50 %	0 %	527322575
1506	NC_021892	TAC	2	6	82995	83000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322576
1507	NC_021892	T	6	6	83019	83024	0 %	100 %	0 %	0 %	527322576
1508	NC_021892	T	7	7	83031	83037	0 %	100 %	0 %	0 %	527322576
1509	NC_021892	T	6	6	83044	83049	0 %	100 %	0 %	0 %	527322576
1510	NC_021892	GTA	2	6	83130	83135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322576
1511	NC_021892	T	6	6	83141	83146	0 %	100 %	0 %	0 %	527322576
1512	NC_021892	TATG	2	8	83165	83172	25 %	50 %	25 %	0 %	527322576
1513	NC_021892	TAT	2	6	83194	83199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322576
1514	NC_021892	GTCTGT	2	12	83208	83219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527322576
1515	NC_021892	TCA	2	6	83228	83233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322576
1516	NC_021892	TCAT	2	8	83236	83243	25 %	50 %	0 %	25 %	527322576
1517	NC_021892	CAA	2	6	83278	83283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322576
1518	NC_021892	ACTG	2	8	83288	83295	25 %	25 %	25 %	25 %	527322576
1519	NC_021892	CATT	2	8	83303	83310	25 %	50 %	0 %	25 %	527322576
1520	NC_021892	AGA	2	6	83336	83341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322576
1521	NC_021892	AGCA	2	8	83342	83349	50 %	0 %	25 %	25 %	527322576
1522	NC_021892	TC	3	6	83364	83369	0 %	50 %	0 %	50 %	527322576
1523	NC_021892	TTA	2	6	83385	83390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322576
1524	NC_021892	ATTA	2	8	83495	83502	50 %	50 %	0 %	0 %	527322576
1525	NC_021892	TTTG	2	8	83535	83542	0 %	75 %	25 %	0 %	527322576
1526	NC_021892	TTG	2	6	83632	83637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322576
1527	NC_021892	GAT	2	6	83729	83734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322576
1528	NC_021892	TCTA	2	8	83819	83826	25 %	50 %	0 %	25 %	527322576
1529	NC_021892	CTA	2	6	83847	83852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322576
1530	NC_021892	TAT	2	6	83900	83905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322576
1531	NC_021892	TAAG	2	8	83924	83931	50 %	25 %	25 %	0 %	527322576
1532	NC_021892	AGT	2	6	84013	84018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322577
1533	NC_021892	TAT	2	6	84040	84045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322577
1534	NC_021892	TGC	2	6	84055	84060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322577
1535	NC_021892	AAG	2	6	84075	84080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322577
1536	NC_021892	TC	3	6	84087	84092	0 %	50 %	0 %	50 %	527322577
1537	NC_021892	AG	3	6	84098	84103	50 %	0 %	50 %	0 %	527322577
1538	NC_021892	GAA	2	6	84131	84136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322577
1539	NC_021892	CAG	2	6	84270	84275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322577
1540	NC_021892	TAA	2	6	84316	84321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322577
1541	NC_021892	AG	3	6	84365	84370	50 %	0 %	50 %	0 %	527322577
1542	NC_021892	TTC	2	6	84384	84389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322577
1543	NC_021892	GAAG	2	8	84428	84435	50 %	0 %	50 %	0 %	527322577
1544	NC_021892	A	6	6	84452	84457	100 %	0 %	0 %	0 %	527322577
1545	NC_021892	AGA	2	6	84502	84507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322577
1546	NC_021892	TTC	2	6	84580	84585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322577
1547	NC_021892	TAAA	2	8	84594	84601	75 %	25 %	0 %	0 %	527322577
1548	NC_021892	ATCC	2	8	84665	84672	25 %	25 %	0 %	50 %	527322577
1549	NC_021892	TGG	2	6	84693	84698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322577
1550	NC_021892	TGA	2	6	84726	84731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322577
1551	NC_021892	TCC	2	6	84733	84738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322577
1552	NC_021892	ACA	2	6	84757	84762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322577
1553	NC_021892	TTTC	2	8	84812	84819	0 %	75 %	0 %	25 %	527322577
1554	NC_021892	AGAT	2	8	84853	84860	50 %	25 %	25 %	0 %	527322577
1555	NC_021892	CTT	2	6	84890	84895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322577
1556	NC_021892	T	6	6	84916	84921	0 %	100 %	0 %	0 %	527322577
1557	NC_021892	GAA	2	6	85043	85048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322577
1558	NC_021892	AAT	2	6	85297	85302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322578
1559	NC_021892	AT	3	6	85301	85306	50 %	50 %	0 %	0 %	527322578
1560	NC_021892	AGC	2	6	85369	85374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322578
1561	NC_021892	AG	3	6	85396	85401	50 %	0 %	50 %	0 %	527322578
1562	NC_021892	GAAA	2	8	85434	85441	75 %	0 %	25 %	0 %	527322578
1563	NC_021892	T	6	6	85571	85576	0 %	100 %	0 %	0 %	527322578
1564	NC_021892	TGG	2	6	85672	85677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322578
1565	NC_021892	CTT	2	6	85728	85733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322578
1566	NC_021892	CAA	2	6	85739	85744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322578
1567	NC_021892	TCT	2	6	85817	85822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322578
1568	NC_021892	CTT	2	6	85823	85828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322578
1569	NC_021892	GAAA	2	8	85829	85836	75 %	0 %	25 %	0 %	527322578
1570	NC_021892	GCA	2	6	85852	85857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322578
1571	NC_021892	CTG	2	6	85949	85954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322578
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1573	NC_021892	TAG	2	6	85992	85997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322578
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1591	NC_021892	CT	3	6	87329	87334	0 %	50 %	0 %	50 %	527322579
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1593	NC_021892	TG	3	6	87371	87376	0 %	50 %	50 %	0 %	527322579
1594	NC_021892	ATG	2	6	87387	87392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322579
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1608	NC_021892	A	6	6	88062	88067	100 %	0 %	0 %	0 %	527322579
1609	NC_021892	TTC	2	6	88068	88073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322579
1610	NC_021892	GAG	2	6	88244	88249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322580
1611	NC_021892	TGT	2	6	88293	88298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322580
1612	NC_021892	TAG	2	6	88319	88324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322580
1613	NC_021892	AGA	2	6	88417	88422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322580
1614	NC_021892	GGAT	2	8	88423	88430	25 %	25 %	50 %	0 %	527322580
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1616	NC_021892	GAA	2	6	88469	88474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322580
1617	NC_021892	GTT	2	6	88613	88618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322580
1618	NC_021892	GTA	2	6	88620	88625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322580
1619	NC_021892	GA	3	6	88668	88673	50 %	0 %	50 %	0 %	527322580
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1622	NC_021892	AAG	2	6	88765	88770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322580
1623	NC_021892	CAAT	2	8	88790	88797	50 %	25 %	0 %	25 %	527322580
1624	NC_021892	TTCTGA	2	12	88822	88833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527322580
1625	NC_021892	AG	3	6	88874	88879	50 %	0 %	50 %	0 %	527322580
1626	NC_021892	A	6	6	88927	88932	100 %	0 %	0 %	0 %	527322580
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1633	NC_021892	A	6	6	89124	89129	100 %	0 %	0 %	0 %	527322580
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1644	NC_021892	TTC	2	6	89825	89830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322581
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