MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021892	GGAA	2	8	54969	54976	50 %	0 %	50 %	0 %	527322553
1002	NC_021892	GATCTG	2	12	54992	55003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527322553
1003	NC_021892	GTGTAA	2	12	55040	55051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322553
1004	NC_021892	GCA	2	6	55054	55059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322553
1005	NC_021892	TGG	2	6	55106	55111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322553
1006	NC_021892	GGTTCA	2	12	55129	55140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527322553
1007	NC_021892	TTATC	2	10	55230	55239	20 %	60 %	0 %	20 %	527322553
1008	NC_021892	TGAGT	2	10	55251	55260	20 %	40 %	40 %	0 %	527322553
1009	NC_021892	TCA	3	9	55264	55272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322553
1010	NC_021892	GTT	2	6	55279	55284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322553
1011	NC_021892	CTG	2	6	55325	55330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322553
1012	NC_021892	GAG	2	6	55331	55336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322553
1013	NC_021892	TGC	2	6	55365	55370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322553
1014	NC_021892	AT	3	6	55575	55580	50 %	50 %	0 %	0 %	527322553
1015	NC_021892	TTA	2	6	55590	55595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322553
1016	NC_021892	CTGG	3	12	55868	55879	0 %	25 %	50 %	25 %	527322554
1017	NC_021892	ATT	2	6	55883	55888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322554
1018	NC_021892	GAT	2	6	55896	55901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322554
1019	NC_021892	TCT	2	6	55914	55919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322554
1020	NC_021892	TCC	2	6	55949	55954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322554
1021	NC_021892	TTA	2	6	55962	55967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322554
1022	NC_021892	TTGC	2	8	56005	56012	0 %	50 %	25 %	25 %	527322554
1023	NC_021892	AGCG	2	8	56045	56052	25 %	0 %	50 %	25 %	527322554
1024	NC_021892	T	6	6	56057	56062	0 %	100 %	0 %	0 %	527322554
1025	NC_021892	GTA	2	6	56088	56093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322554
1026	NC_021892	GTT	2	6	56199	56204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322554
1027	NC_021892	TGG	2	6	56219	56224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322554
1028	NC_021892	GTTGT	2	10	56298	56307	0 %	60 %	40 %	0 %	527322554
1029	NC_021892	T	6	6	56353	56358	0 %	100 %	0 %	0 %	527322554
1030	NC_021892	TGA	2	6	57996	58001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322555
1031	NC_021892	TGAAAA	2	12	59129	59140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527322556
1032	NC_021892	AGA	2	6	59141	59146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322556
1033	NC_021892	TCT	2	6	59157	59162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322556
1034	NC_021892	T	6	6	59189	59194	0 %	100 %	0 %	0 %	527322556
1035	NC_021892	CGTT	2	8	59340	59347	0 %	50 %	25 %	25 %	527322556
1036	NC_021892	GGAG	2	8	59349	59356	25 %	0 %	75 %	0 %	527322556
1037	NC_021892	GTAA	2	8	59401	59408	50 %	25 %	25 %	0 %	527322556
1038	NC_021892	TCCTAA	2	12	59468	59479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322556
1039	NC_021892	AGT	2	6	59497	59502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322556
1040	NC_021892	T	6	6	59529	59534	0 %	100 %	0 %	0 %	527322556
1041	NC_021892	TAG	2	6	59576	59581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322556
1042	NC_021892	GCT	2	6	59589	59594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322556
1043	NC_021892	GTC	2	6	59615	59620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322556
1044	NC_021892	ATGG	2	8	59628	59635	25 %	25 %	50 %	0 %	527322556
1045	NC_021892	AGG	2	6	59662	59667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322556
1046	NC_021892	GA	3	6	59714	59719	50 %	0 %	50 %	0 %	527322556
1047	NC_021892	CAA	2	6	59737	59742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322556
1048	NC_021892	ATAA	2	8	59774	59781	75 %	25 %	0 %	0 %	527322556
1049	NC_021892	GAGCA	2	10	59814	59823	40 %	0 %	40 %	20 %	527322556
1050	NC_021892	GT	3	6	59852	59857	0 %	50 %	50 %	0 %	527322556
1051	NC_021892	AAG	2	6	60049	60054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322556
1052	NC_021892	CTC	2	6	60061	60066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322556
1053	NC_021892	AAC	2	6	60094	60099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322556
1054	NC_021892	T	7	7	60113	60119	0 %	100 %	0 %	0 %	527322556
1055	NC_021892	CTT	2	6	60163	60168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322556
1056	NC_021892	AAT	2	6	60193	60198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322556
1057	NC_021892	TTC	2	6	60204	60209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322556
1058	NC_021892	ATGT	2	8	60224	60231	25 %	50 %	25 %	0 %	527322556
1059	NC_021892	CATT	2	8	60253	60260	25 %	50 %	0 %	25 %	527322556
1060	NC_021892	ATG	2	6	60274	60279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322557
1061	NC_021892	CCT	2	6	60280	60285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322557
1062	NC_021892	TCT	2	6	60358	60363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322557
1063	NC_021892	TCA	2	6	60370	60375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322557
1064	NC_021892	TTC	2	6	60491	60496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322557
1065	NC_021892	CTTT	2	8	60526	60533	0 %	75 %	0 %	25 %	527322557
1066	NC_021892	TTCT	2	8	60549	60556	0 %	75 %	0 %	25 %	527322557
1067	NC_021892	TTC	2	6	60588	60593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322557
1068	NC_021892	TC	3	6	60600	60605	0 %	50 %	0 %	50 %	527322557
1069	NC_021892	T	6	6	60612	60617	0 %	100 %	0 %	0 %	527322557
1070	NC_021892	T	7	7	60672	60678	0 %	100 %	0 %	0 %	527322557
1071	NC_021892	CAGA	2	8	60786	60793	50 %	0 %	25 %	25 %	527322558
1072	NC_021892	GA	3	6	60828	60833	50 %	0 %	50 %	0 %	527322558
1073	NC_021892	TAA	2	6	60841	60846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322558
1074	NC_021892	TCA	2	6	61057	61062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322559
1075	NC_021892	TTC	2	6	61119	61124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322559
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1078	NC_021892	CA	3	6	61226	61231	50 %	0 %	0 %	50 %	527322559
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1080	NC_021892	TTA	2	6	61251	61256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322559
1081	NC_021892	TCA	2	6	61291	61296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322559
1082	NC_021892	GAA	2	6	61297	61302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
1083	NC_021892	TCT	2	6	61303	61308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322559
1084	NC_021892	AAG	2	6	61343	61348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
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1086	NC_021892	ATT	2	6	61365	61370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322559
1087	NC_021892	AT	3	6	61476	61481	50 %	50 %	0 %	0 %	527322559
1088	NC_021892	GA	3	6	61499	61504	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
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1091	NC_021892	GA	3	6	61625	61630	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
1092	NC_021892	ATG	2	6	61867	61872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322559
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1095	NC_021892	AAT	2	6	62095	62100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322559
1096	NC_021892	ATG	2	6	62167	62172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322559
1097	NC_021892	TGTGA	2	10	62263	62272	20 %	40 %	40 %	0 %	527322559
1098	NC_021892	TGT	2	6	62284	62289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322559
1099	NC_021892	A	6	6	62365	62370	100 %	0 %	0 %	0 %	527322559
1100	NC_021892	ATT	2	6	62382	62387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322559
1101	NC_021892	CGA	2	6	62430	62435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322559
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1103	NC_021892	A	6	6	62521	62526	100 %	0 %	0 %	0 %	527322559
1104	NC_021892	CTT	2	6	62563	62568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322559
1105	NC_021892	AAG	2	6	62597	62602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
1106	NC_021892	TTA	2	6	62674	62679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322559
1107	NC_021892	GA	3	6	62705	62710	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
1108	NC_021892	CTT	2	6	62750	62755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322559
1109	NC_021892	AAG	2	6	62762	62767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
1110	NC_021892	TC	3	6	62861	62866	0 %	50 %	0 %	50 %	527322559
1111	NC_021892	CAA	2	6	62962	62967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322559
1112	NC_021892	AT	3	6	63042	63047	50 %	50 %	0 %	0 %	527322559
1113	NC_021892	TTC	2	6	63048	63053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322559
1114	NC_021892	GTT	2	6	63187	63192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322559
1115	NC_021892	CTTC	2	8	63193	63200	0 %	50 %	0 %	50 %	527322559
1116	NC_021892	AG	3	6	63242	63247	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
1117	NC_021892	CT	4	8	63250	63257	0 %	50 %	0 %	50 %	527322559
1118	NC_021892	T	6	6	63269	63274	0 %	100 %	0 %	0 %	527322559
1119	NC_021892	GTTCTT	2	12	63388	63399	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527322559
1120	NC_021892	TTA	2	6	63414	63419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322559
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1122	NC_021892	AGA	2	6	63501	63506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
1123	NC_021892	TATG	2	8	63547	63554	25 %	50 %	25 %	0 %	527322559
1124	NC_021892	AAG	2	6	63560	63565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322559
1125	NC_021892	AGT	2	6	63655	63660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322559
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1127	NC_021892	AG	3	6	63864	63869	50 %	0 %	50 %	0 %	527322560
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