MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021892	ATA	2	6	639813	639818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323093
12503	NC_021892	CAT	2	6	639839	639844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323093
12504	NC_021892	GAA	2	6	639935	639940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323094
12505	NC_021892	AATC	2	8	639954	639961	50 %	25 %	0 %	25 %	527323094
12506	NC_021892	ACC	2	6	640069	640074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527323094
12507	NC_021892	TTC	2	6	640089	640094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323094
12508	NC_021892	TCC	2	6	640164	640169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323094
12509	NC_021892	AAC	2	6	640173	640178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323094
12510	NC_021892	CTT	2	6	640190	640195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323094
12511	NC_021892	CCT	2	6	640267	640272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323094
12512	NC_021892	CAG	2	6	640280	640285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323094
12513	NC_021892	TCT	2	6	640346	640351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323094
12514	NC_021892	T	6	6	640386	640391	0 %	100 %	0 %	0 %	527323094
12515	NC_021892	TCC	2	6	640425	640430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323094
12516	NC_021892	TTTC	2	8	640520	640527	0 %	75 %	0 %	25 %	527323094
12517	NC_021892	AGAA	2	8	640549	640556	75 %	0 %	25 %	0 %	527323094
12518	NC_021892	CAC	2	6	640557	640562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527323094
12519	NC_021892	TGC	2	6	640605	640610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323094
12520	NC_021892	TAA	2	6	640652	640657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323094
12521	NC_021892	CT	3	6	640690	640695	0 %	50 %	0 %	50 %	527323094
12522	NC_021892	AAG	2	6	640793	640798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323094
12523	NC_021892	CAGC	2	8	640808	640815	25 %	0 %	25 %	50 %	527323094
12524	NC_021892	TAA	3	9	640878	640886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323094
12525	NC_021892	TC	4	8	640938	640945	0 %	50 %	0 %	50 %	527323094
12526	NC_021892	AGC	2	6	640980	640985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323094
12527	NC_021892	AAG	2	6	640986	640991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323094
12528	NC_021892	CT	3	6	640992	640997	0 %	50 %	0 %	50 %	527323094
12529	NC_021892	CGT	2	6	641032	641037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323094
12530	NC_021892	T	6	6	641037	641042	0 %	100 %	0 %	0 %	527323094
12531	NC_021892	CGGAA	2	10	641302	641311	40 %	0 %	40 %	20 %	527323095
12532	NC_021892	TAA	2	6	641372	641377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323095
12533	NC_021892	CA	3	6	641399	641404	50 %	0 %	0 %	50 %	527323095
12534	NC_021892	TTG	2	6	641464	641469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323095
12535	NC_021892	ATA	2	6	641473	641478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323095
12536	NC_021892	CAT	2	6	641527	641532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323095
12537	NC_021892	GGA	2	6	641730	641735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323095
12538	NC_021892	TCT	2	6	641736	641741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323095
12539	NC_021892	TA	3	6	641788	641793	50 %	50 %	0 %	0 %	527323095
12540	NC_021892	GTC	2	6	641799	641804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323095
12541	NC_021892	AGG	2	6	641869	641874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323095
12542	NC_021892	AGG	2	6	641885	641890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323095
12543	NC_021892	ACC	2	6	641946	641951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527323095
12544	NC_021892	ATGA	2	8	641960	641967	50 %	25 %	25 %	0 %	527323095
12545	NC_021892	TCC	2	6	642002	642007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323095
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12547	NC_021892	GCTC	2	8	642198	642205	0 %	25 %	25 %	50 %	527323095
12548	NC_021892	AAG	2	6	642272	642277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323095
12549	NC_021892	TA	3	6	642361	642366	50 %	50 %	0 %	0 %	527323095
12550	NC_021892	AAT	2	6	642383	642388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323095
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12552	NC_021892	T	7	7	642466	642472	0 %	100 %	0 %	0 %	527323095
12553	NC_021892	GCA	2	6	642517	642522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323095
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12555	NC_021892	A	6	6	642537	642542	100 %	0 %	0 %	0 %	527323095
12556	NC_021892	CAT	2	6	642593	642598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323095
12557	NC_021892	GGA	2	6	642621	642626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323096
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12559	NC_021892	TTTC	2	8	642652	642659	0 %	75 %	0 %	25 %	527323096
12560	NC_021892	AGC	2	6	642672	642677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323096
12561	NC_021892	CTG	2	6	642678	642683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323096
12562	NC_021892	CTA	2	6	642689	642694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323096
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12564	NC_021892	AGC	2	6	642729	642734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323096
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12569	NC_021892	AAT	2	6	642927	642932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323096
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12577	NC_021892	T	7	7	643457	643463	0 %	100 %	0 %	0 %	527323096
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12585	NC_021892	AGCG	2	8	643870	643877	25 %	0 %	50 %	25 %	527323096
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12602	NC_021892	TCC	2	6	644871	644876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323097
12603	NC_021892	CAA	2	6	644969	644974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323097
12604	NC_021892	TCT	2	6	645082	645087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323097
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12607	NC_021892	CTG	2	6	645173	645178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323097
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12616	NC_021892	GCT	2	6	645563	645568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323097
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12618	NC_021892	CCT	2	6	645679	645684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323097
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12983	NC_021892	AT	3	6	664743	664748	50 %	50 %	0 %	0 %	527323113
12984	NC_021892	CT	3	6	664752	664757	0 %	50 %	0 %	50 %	527323113
12985	NC_021892	GAA	2	6	664789	664794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323113
12986	NC_021892	CTT	2	6	664811	664816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323113
12987	NC_021892	CGA	2	6	664822	664827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323113
12988	NC_021892	TTG	2	6	664851	664856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323113
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12990	NC_021892	ATG	2	6	664933	664938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323113
12991	NC_021892	TCG	2	6	664944	664949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323113
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12999	NC_021892	TGAG	2	8	665339	665346	25 %	25 %	50 %	0 %	527323113
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