MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021892	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	527322526
502	NC_021892	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322526
503	NC_021892	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	527322526
504	NC_021892	GAA	2	6	29068	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322526
505	NC_021892	TGT	2	6	29100	29105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322527
506	NC_021892	TCT	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322527
507	NC_021892	ACA	2	6	29396	29401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322527
508	NC_021892	ATG	2	6	29406	29411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322527
509	NC_021892	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	527322527
510	NC_021892	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
511	NC_021892	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
512	NC_021892	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	527322527
513	NC_021892	T	6	6	29633	29638	0 %	100 %	0 %	0 %	527322527
514	NC_021892	ATC	2	6	29712	29717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322527
515	NC_021892	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	527322527
516	NC_021892	T	8	8	29867	29874	0 %	100 %	0 %	0 %	527322527
517	NC_021892	ATG	2	6	29892	29897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322527
518	NC_021892	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	527322527
519	NC_021892	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
520	NC_021892	GTT	2	6	30109	30114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322528
521	NC_021892	GAA	2	6	30118	30123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
522	NC_021892	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	527322528
523	NC_021892	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322528
524	NC_021892	ACT	2	6	30274	30279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322528
525	NC_021892	TTC	2	6	30302	30307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322528
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527	NC_021892	CCT	2	6	30338	30343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322528
528	NC_021892	AAAC	2	8	30391	30398	75 %	0 %	0 %	25 %	527322528
529	NC_021892	T	6	6	30408	30413	0 %	100 %	0 %	0 %	527322528
530	NC_021892	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	527322528
531	NC_021892	GGC	2	6	30444	30449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322528
532	NC_021892	GAT	2	6	30523	30528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322528
533	NC_021892	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	527322528
534	NC_021892	TAG	2	6	30545	30550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322528
535	NC_021892	GTT	2	6	30619	30624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322528
536	NC_021892	TAA	2	6	30729	30734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322528
537	NC_021892	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
538	NC_021892	GAA	2	6	30868	30873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
539	NC_021892	AGA	2	6	30888	30893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
540	NC_021892	TCG	2	6	30951	30956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322528
541	NC_021892	ATG	2	6	30985	30990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322528
542	NC_021892	TGG	2	6	30999	31004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322528
543	NC_021892	GAA	2	6	31030	31035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
544	NC_021892	ATT	2	6	31066	31071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322528
545	NC_021892	ATG	2	6	31189	31194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322528
546	NC_021892	AAG	2	6	31201	31206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
547	NC_021892	T	6	6	31207	31212	0 %	100 %	0 %	0 %	527322528
548	NC_021892	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
549	NC_021892	A	7	7	31249	31255	100 %	0 %	0 %	0 %	527322528
550	NC_021892	ACA	2	6	31295	31300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322529
551	NC_021892	TGT	2	6	31316	31321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322529
552	NC_021892	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	527322529
553	NC_021892	T	6	6	31435	31440	0 %	100 %	0 %	0 %	527322529
554	NC_021892	GAGCT	2	10	31456	31465	20 %	20 %	40 %	20 %	527322529
555	NC_021892	A	6	6	31530	31535	100 %	0 %	0 %	0 %	527322529
556	NC_021892	A	6	6	31561	31566	100 %	0 %	0 %	0 %	527322529
557	NC_021892	TGC	2	6	31589	31594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322529
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560	NC_021892	TC	3	6	31652	31657	0 %	50 %	0 %	50 %	527322530
561	NC_021892	AAG	2	6	31856	31861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322530
562	NC_021892	AAG	2	6	31863	31868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322530
563	NC_021892	CTT	2	6	31902	31907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322530
564	NC_021892	CGT	2	6	31933	31938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322530
565	NC_021892	TGA	2	6	31979	31984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322530
566	NC_021892	GAG	2	6	32010	32015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322530
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569	NC_021892	CT	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	527322530
570	NC_021892	AGA	2	6	32230	32235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322530
571	NC_021892	AG	3	6	32264	32269	50 %	0 %	50 %	0 %	527322530
572	NC_021892	AAG	2	6	32418	32423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322530
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581	NC_021892	TGT	2	6	33279	33284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322532
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589	NC_021892	AG	3	6	33774	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	527322532
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593	NC_021892	GTC	2	6	33944	33949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322533
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600	NC_021892	AGA	2	6	34264	34269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322533
601	NC_021892	AAGA	3	12	34266	34277	75 %	0 %	25 %	0 %	527322533
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607	NC_021892	AAGC	2	8	34486	34493	50 %	0 %	25 %	25 %	527322534
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611	NC_021892	GA	4	8	34628	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	527322534
612	NC_021892	AGA	2	6	34663	34668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322534
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614	NC_021892	TGA	2	6	34859	34864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322535
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619	NC_021892	TCGA	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	527322535
620	NC_021892	GAG	2	6	35167	35172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322535
621	NC_021892	CAG	2	6	35181	35186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322535
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623	NC_021892	TGCT	2	8	35308	35315	0 %	50 %	25 %	25 %	527322535
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625	NC_021892	GCA	2	6	35502	35507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322535
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630	NC_021892	TCT	2	6	35925	35930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322535
631	NC_021892	GGATTT	2	12	35948	35959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527322535
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633	NC_021892	ATG	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322535
634	NC_021892	CTATT	2	10	36130	36139	20 %	60 %	0 %	20 %	527322535
635	NC_021892	TCCTA	2	10	36177	36186	20 %	40 %	0 %	40 %	527322535
636	NC_021892	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	527322535
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649	NC_021892	TTA	2	6	36988	36993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322536
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741	NC_021892	GGAT	2	8	42020	42027	25 %	25 %	50 %	0 %	527322539
742	NC_021892	A	7	7	42081	42087	100 %	0 %	0 %	0 %	527322539
743	NC_021892	AGCAA	2	10	42108	42117	60 %	0 %	20 %	20 %	527322539
744	NC_021892	CGG	2	6	42138	42143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322539
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750	NC_021892	CT	3	6	42312	42317	0 %	50 %	0 %	50 %	527322540
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755	NC_021892	T	8	8	42479	42486	0 %	100 %	0 %	0 %	527322540
756	NC_021892	ACC	2	6	42531	42536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322540
757	NC_021892	A	6	6	42578	42583	100 %	0 %	0 %	0 %	527322540
758	NC_021892	GA	5	10	42588	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	527322540
759	NC_021892	A	7	7	42627	42633	100 %	0 %	0 %	0 %	527322540
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