MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6124	NC_021892	TCC	2	6	320316	320321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322788
6125	NC_021892	CGC	2	6	320371	320376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527322788
6126	NC_021892	TGTGT	2	10	320383	320392	0 %	60 %	40 %	0 %	527322788
6127	NC_021892	TGA	2	6	320397	320402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322788
6128	NC_021892	CAT	3	9	320505	320513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322788
6129	NC_021892	GTG	2	6	320552	320557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322788
6130	NC_021892	TGC	2	6	320616	320621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322788
6131	NC_021892	AAG	2	6	320626	320631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322788
6132	NC_021892	AAG	2	6	320693	320698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322788
6133	NC_021892	TAA	2	6	320727	320732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322788
6134	NC_021892	GGA	2	6	320865	320870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322788
6135	NC_021892	AAG	2	6	320909	320914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322788
6136	NC_021892	CG	4	8	320926	320933	0 %	0 %	50 %	50 %	527322788
6137	NC_021892	AGA	2	6	320940	320945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322788
6138	NC_021892	GTT	2	6	320950	320955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322788
6139	NC_021892	AGA	3	9	320964	320972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322788
6140	NC_021892	TGA	2	6	321024	321029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322788
6141	NC_021892	CTC	3	9	321049	321057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322789
6142	NC_021892	TAAAG	2	10	321270	321279	60 %	20 %	20 %	0 %	527322789
6143	NC_021892	GAT	2	6	321280	321285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322789
6144	NC_021892	ATT	2	6	321311	321316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322789
6145	NC_021892	TCC	2	6	321356	321361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322789
6146	NC_021892	TAA	2	6	321393	321398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322789
6147	NC_021892	TGT	2	6	321426	321431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322789
6148	NC_021892	AAT	2	6	321443	321448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322789
6149	NC_021892	T	7	7	321530	321536	0 %	100 %	0 %	0 %	527322789
6150	NC_021892	CTT	2	6	321556	321561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322789
6151	NC_021892	CTC	2	6	321706	321711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322789
6152	NC_021892	AAT	2	6	321715	321720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322789
6153	NC_021892	A	6	6	321732	321737	100 %	0 %	0 %	0 %	527322789
6154	NC_021892	CTT	2	6	321758	321763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322789
6155	NC_021892	TAA	2	6	321767	321772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322789
6156	NC_021892	ATGGA	2	10	321895	321904	40 %	20 %	40 %	0 %	527322789
6157	NC_021892	CAA	2	6	322000	322005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322789
6158	NC_021892	CTT	2	6	322022	322027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322789
6159	NC_021892	CAA	2	6	322039	322044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322789
6160	NC_021892	CTC	2	6	322057	322062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322789
6161	NC_021892	CAA	2	6	322072	322077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322789
6162	NC_021892	TCA	2	6	322145	322150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322790
6163	NC_021892	A	7	7	322158	322164	100 %	0 %	0 %	0 %	527322790
6164	NC_021892	A	7	7	322172	322178	100 %	0 %	0 %	0 %	527322790
6165	NC_021892	GCC	2	6	322191	322196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527322790
6166	NC_021892	TCAAT	2	10	322227	322236	40 %	40 %	0 %	20 %	527322790
6167	NC_021892	A	7	7	322242	322248	100 %	0 %	0 %	0 %	527322790
6168	NC_021892	TCA	2	6	322343	322348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322791
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6172	NC_021892	AAAACA	2	12	322610	322621	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527322791
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6175	NC_021892	AAG	2	6	322780	322785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322791
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6177	NC_021892	GAG	2	6	322888	322893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322791
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6181	NC_021892	TA	3	6	323044	323049	50 %	50 %	0 %	0 %	527322791
6182	NC_021892	GCT	2	6	323094	323099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322791
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6185	NC_021892	GCCT	2	8	323122	323129	0 %	25 %	25 %	50 %	527322791
6186	NC_021892	A	6	6	323254	323259	100 %	0 %	0 %	0 %	527322791
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6189	NC_021892	AT	3	6	323428	323433	50 %	50 %	0 %	0 %	527322791
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6193	NC_021892	TAA	2	6	323519	323524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322791
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6196	NC_021892	ACG	2	6	323630	323635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322791
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6199	NC_021892	CTC	2	6	323772	323777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322791
6200	NC_021892	AGA	2	6	323780	323785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322791
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6203	NC_021892	CT	3	6	323970	323975	0 %	50 %	0 %	50 %	527322791
6204	NC_021892	ACA	2	6	323981	323986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322791
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6208	NC_021892	TACA	2	8	324220	324227	50 %	25 %	0 %	25 %	527322792
6209	NC_021892	AAG	2	6	324262	324267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322792
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6211	NC_021892	TGA	2	6	324306	324311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322792
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6214	NC_021892	TCA	2	6	324429	324434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322792
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6217	NC_021892	TCT	2	6	324678	324683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322792
6218	NC_021892	AGC	3	9	324701	324709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322792
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6220	NC_021892	TTC	2	6	324734	324739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322792
6221	NC_021892	CTTT	2	8	324782	324789	0 %	75 %	0 %	25 %	527322792
6222	NC_021892	ATC	2	6	324791	324796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322792
6223	NC_021892	TTCT	2	8	324827	324834	0 %	75 %	0 %	25 %	527322792
6224	NC_021892	GTT	2	6	324843	324848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322792
6225	NC_021892	T	6	6	324854	324859	0 %	100 %	0 %	0 %	527322792
6226	NC_021892	ACT	2	6	324873	324878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322792
6227	NC_021892	T	6	6	324908	324913	0 %	100 %	0 %	0 %	527322792
6228	NC_021892	GCT	2	6	324925	324930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322792
6229	NC_021892	AAGAA	2	10	324964	324973	80 %	0 %	20 %	0 %	527322792
6230	NC_021892	AAG	2	6	324988	324993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322792
6231	NC_021892	T	7	7	325024	325030	0 %	100 %	0 %	0 %	527322792
6232	NC_021892	TAG	2	6	325105	325110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322792
6233	NC_021892	CAT	2	6	325205	325210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322792
6234	NC_021892	AAGA	2	8	325373	325380	75 %	0 %	25 %	0 %	527322793
6235	NC_021892	AAG	2	6	325458	325463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322793
6236	NC_021892	AAT	2	6	325532	325537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322793
6237	NC_021892	AAG	2	6	325557	325562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322793
6238	NC_021892	TTA	2	6	325665	325670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322793
6239	NC_021892	TA	3	6	325673	325678	50 %	50 %	0 %	0 %	527322793
6240	NC_021892	AGC	2	6	325682	325687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322793
6241	NC_021892	CCTT	2	8	325701	325708	0 %	50 %	0 %	50 %	527322793
6242	NC_021892	T	6	6	325725	325730	0 %	100 %	0 %	0 %	527322793
6243	NC_021892	CCCCT	2	10	325735	325744	0 %	20 %	0 %	80 %	527322793
6244	NC_021892	CTT	2	6	325855	325860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322793
6245	NC_021892	TCC	2	6	325904	325909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322793
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6491	NC_021892	TCCAA	2	10	338433	338442	40 %	20 %	0 %	40 %	527322804
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6493	NC_021892	TCCAT	2	10	338516	338525	20 %	40 %	0 %	40 %	527322804
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6495	NC_021892	TCA	2	6	338781	338786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322804
6496	NC_021892	CTT	2	6	338939	338944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322804
6497	NC_021892	TCA	2	6	338961	338966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322804
6498	NC_021892	CCAA	2	8	338969	338976	50 %	0 %	0 %	50 %	527322804
6499	NC_021892	GAA	2	6	339000	339005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322804
6500	NC_021892	TAT	2	6	339112	339117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322804

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