MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021892	AGAT	2	8	240983	240990	50 %	25 %	25 %	0 %	527322713
4502	NC_021892	CTT	2	6	241045	241050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322713
4503	NC_021892	CTG	2	6	241051	241056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322713
4504	NC_021892	T	6	6	241070	241075	0 %	100 %	0 %	0 %	527322713
4505	NC_021892	AAT	2	6	241136	241141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322713
4506	NC_021892	ATTA	2	8	241178	241185	50 %	50 %	0 %	0 %	527322713
4507	NC_021892	T	7	7	241236	241242	0 %	100 %	0 %	0 %	527322714
4508	NC_021892	AAT	2	6	241308	241313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322714
4509	NC_021892	TC	3	6	241432	241437	0 %	50 %	0 %	50 %	527322714
4510	NC_021892	AGA	2	6	241479	241484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322714
4511	NC_021892	CTA	2	6	241553	241558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322714
4512	NC_021892	GAA	3	9	241583	241591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322714
4513	NC_021892	T	6	6	241592	241597	0 %	100 %	0 %	0 %	527322714
4514	NC_021892	CTC	2	6	241616	241621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322714
4515	NC_021892	TCCA	2	8	241659	241666	25 %	25 %	0 %	50 %	527322714
4516	NC_021892	CT	3	6	241812	241817	0 %	50 %	0 %	50 %	527322714
4517	NC_021892	CA	4	8	241842	241849	50 %	0 %	0 %	50 %	527322714
4518	NC_021892	CCA	2	6	241859	241864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322714
4519	NC_021892	GAA	2	6	241915	241920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322714
4520	NC_021892	GTT	2	6	241934	241939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322714
4521	NC_021892	AAT	2	6	242048	242053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322715
4522	NC_021892	TTAA	2	8	242069	242076	50 %	50 %	0 %	0 %	527322715
4523	NC_021892	CT	3	6	242091	242096	0 %	50 %	0 %	50 %	527322715
4524	NC_021892	TAG	2	6	242130	242135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322715
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4527	NC_021892	AG	3	6	242197	242202	50 %	0 %	50 %	0 %	527322715
4528	NC_021892	T	8	8	242218	242225	0 %	100 %	0 %	0 %	527322715
4529	NC_021892	TGA	2	6	242227	242232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322715
4530	NC_021892	TCT	2	6	242253	242258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322715
4531	NC_021892	AAG	2	6	242277	242282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322715
4532	NC_021892	TAA	2	6	242352	242357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322715
4533	NC_021892	GAA	2	6	242396	242401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322715
4534	NC_021892	CAAT	2	8	242409	242416	50 %	25 %	0 %	25 %	527322715
4535	NC_021892	CAA	2	6	242455	242460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322715
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4537	NC_021892	ACAA	2	8	242562	242569	75 %	0 %	0 %	25 %	527322715
4538	NC_021892	CTT	2	6	242574	242579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322715
4539	NC_021892	TCT	2	6	242606	242611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322715
4540	NC_021892	ACT	2	6	242662	242667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322715
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4542	NC_021892	GAAAA	2	10	242807	242816	80 %	0 %	20 %	0 %	527322715
4543	NC_021892	AAG	2	6	242827	242832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322715
4544	NC_021892	AGCT	2	8	242845	242852	25 %	25 %	25 %	25 %	527322715
4545	NC_021892	TCT	2	6	242904	242909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322715
4546	NC_021892	CA	3	6	242961	242966	50 %	0 %	0 %	50 %	527322715
4547	NC_021892	GAG	2	6	242997	243002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322715
4548	NC_021892	TCT	2	6	243012	243017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322715
4549	NC_021892	A	7	7	243071	243077	100 %	0 %	0 %	0 %	527322715
4550	NC_021892	ATT	2	6	243169	243174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322715
4551	NC_021892	TGC	2	6	243188	243193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322715
4552	NC_021892	T	6	6	243199	243204	0 %	100 %	0 %	0 %	527322715
4553	NC_021892	GAA	2	6	243228	243233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322715
4554	NC_021892	T	7	7	243249	243255	0 %	100 %	0 %	0 %	527322715
4555	NC_021892	ATC	2	6	243280	243285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322715
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4557	NC_021892	ACT	2	6	243376	243381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322715
4558	NC_021892	CAA	2	6	243402	243407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322715
4559	NC_021892	TA	4	8	243421	243428	50 %	50 %	0 %	0 %	527322715
4560	NC_021892	CGAT	2	8	243453	243460	25 %	25 %	25 %	25 %	527322715
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4563	NC_021892	TAA	2	6	243538	243543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322715
4564	NC_021892	TGC	2	6	243544	243549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322715
4565	NC_021892	GCT	2	6	243551	243556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322715
4566	NC_021892	CAG	2	6	243558	243563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322715
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4571	NC_021892	TCT	2	6	244005	244010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322716
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4573	NC_021892	A	7	7	244053	244059	100 %	0 %	0 %	0 %	527322716
4574	NC_021892	CTTC	2	8	244072	244079	0 %	50 %	0 %	50 %	527322716
4575	NC_021892	CAGA	2	8	244112	244119	50 %	0 %	25 %	25 %	527322716
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4578	NC_021892	GCTG	2	8	244294	244301	0 %	25 %	50 %	25 %	527322716
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4581	NC_021892	TAAAC	2	10	244377	244386	60 %	20 %	0 %	20 %	527322716
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4588	NC_021892	CTTGG	2	10	244558	244567	0 %	40 %	40 %	20 %	527322716
4589	NC_021892	TGT	2	6	244605	244610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322716
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4594	NC_021892	TGA	2	6	244749	244754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322716
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4599	NC_021892	TGG	2	6	244917	244922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322716
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4601	NC_021892	CAT	2	6	245051	245056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322717
4602	NC_021892	TCT	2	6	245063	245068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322717
4603	NC_021892	AGT	2	6	245110	245115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322717
4604	NC_021892	CCTT	2	8	245131	245138	0 %	50 %	0 %	50 %	527322717
4605	NC_021892	GCA	2	6	245219	245224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322717
4606	NC_021892	TTCA	2	8	245233	245240	25 %	50 %	0 %	25 %	527322717
4607	NC_021892	ATA	2	6	245322	245327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322717
4608	NC_021892	AAT	2	6	245399	245404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322717
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4610	NC_021892	TGC	2	6	245548	245553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322717
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4617	NC_021892	TCTTT	2	10	245854	245863	0 %	80 %	0 %	20 %	527322717
4618	NC_021892	ATC	2	6	245894	245899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322717
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4621	NC_021892	GC	3	6	246138	246143	0 %	0 %	50 %	50 %	527322717
4622	NC_021892	TTTG	2	8	246165	246172	0 %	75 %	25 %	0 %	527322717
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4624	NC_021892	TG	3	6	246252	246257	0 %	50 %	50 %	0 %	527322717
4625	NC_021892	TTCT	2	8	246276	246283	0 %	75 %	0 %	25 %	527322717
4626	NC_021892	TCC	2	6	246309	246314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322717
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4731	NC_021892	ATA	2	6	251392	251397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322724
4732	NC_021892	CAAT	2	8	251479	251486	50 %	25 %	0 %	25 %	527322724
4733	NC_021892	CTTT	3	12	251531	251542	0 %	75 %	0 %	25 %	527322724
4734	NC_021892	CGA	2	6	251573	251578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322724
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4740	NC_021892	AGT	2	6	251989	251994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322725
4741	NC_021892	GCAG	2	8	252036	252043	25 %	0 %	50 %	25 %	527322725
4742	NC_021892	TCTT	2	8	252053	252060	0 %	75 %	0 %	25 %	527322725
4743	NC_021892	AGA	2	6	252081	252086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322725
4744	NC_021892	CTT	2	6	252097	252102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322725
4745	NC_021892	ACA	2	6	252113	252118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322725
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4992	NC_021892	ACT	2	6	264809	264814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322739
4993	NC_021892	TTC	2	6	264901	264906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322739
4994	NC_021892	CTT	2	6	265038	265043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322739
4995	NC_021892	AAT	2	6	265066	265071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322739
4996	NC_021892	GCT	2	6	265082	265087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322739
4997	NC_021892	TAA	2	6	265140	265145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322739
4998	NC_021892	CTG	2	6	265182	265187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322739
4999	NC_021892	TA	3	6	265199	265204	50 %	50 %	0 %	0 %	527322739
5000	NC_021892	TTC	3	9	265237	265245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322739

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