MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 2565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527321567
2	NC_021891	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527321568
3	NC_021891	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527321568
4	NC_021891	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527321569
5	NC_021891	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527321569
6	NC_021891	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527321570
7	NC_021891	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527321570
8	NC_021891	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527321570
9	NC_021891	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527321570
10	NC_021891	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527321571
11	NC_021891	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527321571
12	NC_021891	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527321571
13	NC_021891	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527321572
14	NC_021891	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527321572
15	NC_021891	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527321573
16	NC_021891	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527321573
17	NC_021891	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527321574
18	NC_021891	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527321575
19	NC_021891	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527321575
20	NC_021891	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527321575
21	NC_021891	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527321575
22	NC_021891	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527321576
23	NC_021891	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527321576
24	NC_021891	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527321576
25	NC_021891	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527321577
26	NC_021891	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527321577
27	NC_021891	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527321577
28	NC_021891	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527321577
29	NC_021891	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527321578
30	NC_021891	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527321579
31	NC_021891	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527321579
32	NC_021891	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527321580
33	NC_021891	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527321580
34	NC_021891	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527321580
35	NC_021891	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527321581
36	NC_021891	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527321581
37	NC_021891	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527321582
38	NC_021891	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527321582
39	NC_021891	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527321582
40	NC_021891	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527321582
41	NC_021891	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527321582
42	NC_021891	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527321584
43	NC_021891	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527321586
44	NC_021891	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527321586
45	NC_021891	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527321586
46	NC_021891	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527321586
47	NC_021891	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527321586
48	NC_021891	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527321586
49	NC_021891	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527321586
50	NC_021891	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527321586
51	NC_021891	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527321587
52	NC_021891	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527321587
53	NC_021891	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527321587
54	NC_021891	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527321587
55	NC_021891	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527321587
56	NC_021891	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527321588
57	NC_021891	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527321588
58	NC_021891	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527321588
59	NC_021891	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527321588
60	NC_021891	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527321589
61	NC_021891	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527321589
62	NC_021891	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527321591
63	NC_021891	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
64	NC_021891	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
65	NC_021891	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527321591
66	NC_021891	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527321592
67	NC_021891	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527321592
68	NC_021891	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527321592
69	NC_021891	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527321594
70	NC_021891	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527321597
71	NC_021891	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527321597
72	NC_021891	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527321598
73	NC_021891	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527321598
74	NC_021891	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527321599
75	NC_021891	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527321599
76	NC_021891	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527321599
77	NC_021891	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527321599
78	NC_021891	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527321600
79	NC_021891	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527321600
80	NC_021891	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527321600
81	NC_021891	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527321600
82	NC_021891	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527321600
83	NC_021891	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527321601
84	NC_021891	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527321601
85	NC_021891	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527321601
86	NC_021891	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527321601
87	NC_021891	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	527321603
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89	NC_021891	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527321603
90	NC_021891	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527321605
91	NC_021891	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527321605
92	NC_021891	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527321607
93	NC_021891	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527321607
94	NC_021891	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527321607
95	NC_021891	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527321608
96	NC_021891	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527321608
97	NC_021891	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527321608
98	NC_021891	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527321608
99	NC_021891	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527321608
100	NC_021891	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
101	NC_021891	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
102	NC_021891	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
103	NC_021891	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
104	NC_021891	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527321609
105	NC_021891	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527321609
106	NC_021891	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527321609
107	NC_021891	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527321609
108	NC_021891	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527321610
109	NC_021891	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527321610
110	NC_021891	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527321611
111	NC_021891	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527321611
112	NC_021891	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527321613
113	NC_021891	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527321613
114	NC_021891	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527321613
115	NC_021891	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527321615
116	NC_021891	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527321615
117	NC_021891	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527321616
118	NC_021891	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527321616
119	NC_021891	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527321616
120	NC_021891	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527321616
121	NC_021891	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527321616
122	NC_021891	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527321616
123	NC_021891	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527321617
124	NC_021891	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527321617
125	NC_021891	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527321617
126	NC_021891	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527321617
127	NC_021891	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527321617
128	NC_021891	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527321617
129	NC_021891	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527321618
130	NC_021891	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527321618
131	NC_021891	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527321618
132	NC_021891	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527321619
133	NC_021891	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527321619
134	NC_021891	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527321620
135	NC_021891	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527321620
136	NC_021891	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527321620
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138	NC_021891	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527321620
139	NC_021891	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527321620
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