MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 20527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021891	CTG	2	6	220514	220519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321751
4002	NC_021891	CAC	2	6	220542	220547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527321751
4003	NC_021891	TCT	2	6	220612	220617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321751
4004	NC_021891	C	6	6	220656	220661	0 %	0 %	0 %	100 %	527321751
4005	NC_021891	ATGA	2	8	220662	220669	50 %	25 %	25 %	0 %	527321751
4006	NC_021891	T	6	6	220696	220701	0 %	100 %	0 %	0 %	527321751
4007	NC_021891	GCA	2	6	220784	220789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321751
4008	NC_021891	GAA	2	6	220802	220807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321751
4009	NC_021891	GAAA	2	8	220855	220862	75 %	0 %	25 %	0 %	527321751
4010	NC_021891	TCA	2	6	220903	220908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321751
4011	NC_021891	ATG	2	6	220918	220923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321751
4012	NC_021891	TCC	2	6	220929	220934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321751
4013	NC_021891	T	6	6	220935	220940	0 %	100 %	0 %	0 %	527321751
4014	NC_021891	TAA	2	6	221015	221020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321751
4015	NC_021891	AGC	2	6	221061	221066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321751
4016	NC_021891	GAT	2	6	221096	221101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321751
4017	NC_021891	T	7	7	221238	221244	0 %	100 %	0 %	0 %	527321751
4018	NC_021891	AGA	2	6	221528	221533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321752
4019	NC_021891	AGT	2	6	221553	221558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321752
4020	NC_021891	CTC	2	6	221612	221617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321752
4021	NC_021891	AAC	2	6	221626	221631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321752
4022	NC_021891	ACA	2	6	221652	221657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321752
4023	NC_021891	TC	3	6	221729	221734	0 %	50 %	0 %	50 %	527321752
4024	NC_021891	TTC	2	6	221735	221740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4025	NC_021891	AAAG	2	8	221746	221753	75 %	0 %	25 %	0 %	527321752
4026	NC_021891	TAC	2	6	221768	221773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321752
4027	NC_021891	TGC	2	6	221786	221791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321752
4028	NC_021891	GAA	2	6	221835	221840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321752
4029	NC_021891	T	6	6	221870	221875	0 %	100 %	0 %	0 %	527321752
4030	NC_021891	TAA	2	6	221921	221926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321752
4031	NC_021891	TCT	2	6	221986	221991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4032	NC_021891	GTC	2	6	221992	221997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321752
4033	NC_021891	TCT	2	6	222031	222036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4034	NC_021891	TTC	2	6	222084	222089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4035	NC_021891	CTT	2	6	222140	222145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4036	NC_021891	AAT	2	6	222219	222224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321752
4037	NC_021891	ATT	2	6	222306	222311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321752
4038	NC_021891	CTT	2	6	222329	222334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4039	NC_021891	GTT	2	6	222340	222345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321752
4040	NC_021891	A	6	6	222360	222365	100 %	0 %	0 %	0 %	527321752
4041	NC_021891	TTCC	2	8	222394	222401	0 %	50 %	0 %	50 %	527321752
4042	NC_021891	TTC	2	6	222458	222463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4043	NC_021891	ATC	2	6	222483	222488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321752
4044	NC_021891	TAA	3	9	222593	222601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321752
4045	NC_021891	TA	3	6	222698	222703	50 %	50 %	0 %	0 %	527321752
4046	NC_021891	CTG	2	6	222740	222745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321752
4047	NC_021891	CTT	2	6	222761	222766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321752
4048	NC_021891	TCA	2	6	222784	222789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321752
4049	NC_021891	ATG	2	6	223296	223301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321753
4050	NC_021891	GAT	2	6	223354	223359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321753
4051	NC_021891	AGA	2	6	223373	223378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321753
4052	NC_021891	AAC	2	6	223398	223403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321753
4053	NC_021891	C	6	6	223444	223449	0 %	0 %	0 %	100 %	527321753
4054	NC_021891	T	7	7	223466	223472	0 %	100 %	0 %	0 %	527321753
4055	NC_021891	A	6	6	223476	223481	100 %	0 %	0 %	0 %	527321753
4056	NC_021891	CTC	2	6	223491	223496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321753
4057	NC_021891	CGAA	2	8	223498	223505	50 %	0 %	25 %	25 %	527321753
4058	NC_021891	ATT	2	6	223513	223518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321753
4059	NC_021891	GCT	2	6	223598	223603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321753
4060	NC_021891	CAA	2	6	223630	223635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321753
4061	NC_021891	AACA	2	8	223665	223672	75 %	0 %	0 %	25 %	527321753
4062	NC_021891	TGTC	2	8	223692	223699	0 %	50 %	25 %	25 %	527321753
4063	NC_021891	ACG	2	6	223811	223816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321753
4064	NC_021891	GGA	2	6	223841	223846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321753
4065	NC_021891	TCTA	2	8	223879	223886	25 %	50 %	0 %	25 %	527321753
4066	NC_021891	CTT	2	6	223941	223946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321753
4067	NC_021891	CA	3	6	223950	223955	50 %	0 %	0 %	50 %	527321753
4068	NC_021891	GA	3	6	223977	223982	50 %	0 %	50 %	0 %	527321753
4069	NC_021891	TCT	2	6	223995	224000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321753
4070	NC_021891	TAGC	2	8	224043	224050	25 %	25 %	25 %	25 %	527321753
4071	NC_021891	C	6	6	224050	224055	0 %	0 %	0 %	100 %	527321753
4072	NC_021891	AAATA	2	10	224059	224068	80 %	20 %	0 %	0 %	527321753
4073	NC_021891	GAA	2	6	224073	224078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321753
4074	NC_021891	ACA	2	6	224140	224145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321753
4075	NC_021891	ACA	2	6	224159	224164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321753
4076	NC_021891	ACA	2	6	224174	224179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321753
4077	NC_021891	TAA	2	6	224184	224189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321753
4078	NC_021891	AAG	3	9	224211	224219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321753
4079	NC_021891	AGG	2	6	224317	224322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321753
4080	NC_021891	CAA	2	6	224576	224581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321754
4081	NC_021891	CT	3	6	224598	224603	0 %	50 %	0 %	50 %	527321754
4082	NC_021891	GCT	2	6	224641	224646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321754
4083	NC_021891	T	7	7	224652	224658	0 %	100 %	0 %	0 %	527321754
4084	NC_021891	ATC	2	6	224660	224665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321754
4085	NC_021891	CTT	2	6	224683	224688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321754
4086	NC_021891	ATT	2	6	224706	224711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321754
4087	NC_021891	GCA	2	6	224758	224763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321754
4088	NC_021891	CTTT	2	8	224769	224776	0 %	75 %	0 %	25 %	527321754
4089	NC_021891	CT	3	6	224834	224839	0 %	50 %	0 %	50 %	527321754
4090	NC_021891	CTT	2	6	225071	225076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321755
4091	NC_021891	GGA	2	6	225079	225084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321755
4092	NC_021891	CTG	2	6	225133	225138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321755
4093	NC_021891	GCA	2	6	225142	225147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321755
4094	NC_021891	AATT	2	8	225182	225189	50 %	50 %	0 %	0 %	527321755
4095	NC_021891	CTAT	2	8	225223	225230	25 %	50 %	0 %	25 %	527321755
4096	NC_021891	GAT	2	6	225436	225441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321755
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4098	NC_021891	AGA	2	6	225510	225515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321755
4099	NC_021891	GATGCA	2	12	225532	225543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527321755
4100	NC_021891	CAA	2	6	225627	225632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321755
4101	NC_021891	GAAAC	2	10	225675	225684	60 %	0 %	20 %	20 %	527321755
4102	NC_021891	GCA	2	6	225688	225693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321755
4103	NC_021891	TTG	2	6	225773	225778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321755
4104	NC_021891	ACA	2	6	225794	225799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321755
4105	NC_021891	CT	3	6	225831	225836	0 %	50 %	0 %	50 %	527321755
4106	NC_021891	CTT	2	6	225851	225856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321755
4107	NC_021891	GA	4	8	225899	225906	50 %	0 %	50 %	0 %	527321755
4108	NC_021891	CA	3	6	225921	225926	50 %	0 %	0 %	50 %	527321755
4109	NC_021891	AGG	2	6	225935	225940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321755
4110	NC_021891	TGCT	2	8	225972	225979	0 %	50 %	25 %	25 %	527321755
4111	NC_021891	TCC	2	6	226011	226016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321756
4112	NC_021891	CA	3	6	226047	226052	50 %	0 %	0 %	50 %	527321756
4113	NC_021891	GAT	2	6	226071	226076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321756
4114	NC_021891	CTT	2	6	226107	226112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321756
4115	NC_021891	TCA	2	6	226130	226135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321756
4116	NC_021891	TCT	2	6	226201	226206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321756
4117	NC_021891	A	7	7	226218	226224	100 %	0 %	0 %	0 %	527321756
4118	NC_021891	A	6	6	226242	226247	100 %	0 %	0 %	0 %	527321756
4119	NC_021891	TTA	2	6	226270	226275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321756
4120	NC_021891	GTTC	2	8	226290	226297	0 %	50 %	25 %	25 %	527321756
4121	NC_021891	ATG	2	6	226303	226308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321756
4122	NC_021891	TATT	2	8	226331	226338	25 %	75 %	0 %	0 %	527321756
4123	NC_021891	T	6	6	226380	226385	0 %	100 %	0 %	0 %	527321756
4124	NC_021891	GAT	2	6	226392	226397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321756
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4132	NC_021891	TAC	2	6	226587	226592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321756
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4153	NC_021891	A	7	7	227326	227332	100 %	0 %	0 %	0 %	527321756
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4237	NC_021891	TGA	2	6	231703	231708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321761
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4243	NC_021891	GATA	2	8	231967	231974	50 %	25 %	25 %	0 %	527321761
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4245	NC_021891	GAA	2	6	232016	232021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321761
4246	NC_021891	TCT	2	6	232047	232052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321761
4247	NC_021891	AGA	2	6	232081	232086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321761
4248	NC_021891	CTT	2	6	232173	232178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
4249	NC_021891	TAC	2	6	232275	232280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321762
4250	NC_021891	TAT	2	6	232284	232289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321762
4251	NC_021891	TCT	2	6	232344	232349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
4252	NC_021891	GCTTG	2	10	232408	232417	0 %	40 %	40 %	20 %	527321762
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4254	NC_021891	CTT	2	6	232482	232487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
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4262	NC_021891	CAA	2	6	233027	233032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321762
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4264	NC_021891	ACT	2	6	233107	233112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321762
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4267	NC_021891	TTAT	2	8	233258	233265	25 %	75 %	0 %	0 %	527321762
4268	NC_021891	CTAT	2	8	233277	233284	25 %	50 %	0 %	25 %	527321762
4269	NC_021891	TCTT	2	8	233324	233331	0 %	75 %	0 %	25 %	527321762
4270	NC_021891	TGC	2	6	233367	233372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321762
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4274	NC_021891	TGG	2	6	233476	233481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321762
4275	NC_021891	TTGG	2	8	233520	233527	0 %	50 %	50 %	0 %	527321762
4276	NC_021891	TGG	3	9	233539	233547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321762
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4283	NC_021891	TGG	2	6	233845	233850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321763
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4287	NC_021891	ATT	2	6	234104	234109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321763
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4343	NC_021891	TTCT	2	8	236803	236810	0 %	75 %	0 %	25 %	527321765
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4347	NC_021891	GAA	2	6	237090	237095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321765
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4353	NC_021891	ATG	2	6	237495	237500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321765
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4355	NC_021891	AGA	2	6	237611	237616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321765
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4360	NC_021891	T	7	7	238092	238098	0 %	100 %	0 %	0 %	527321766
4361	NC_021891	GAA	2	6	238105	238110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321766
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4363	NC_021891	AATA	2	8	238198	238205	75 %	25 %	0 %	0 %	527321766
4364	NC_021891	TAA	2	6	238247	238252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321766
4365	NC_021891	CCT	2	6	238260	238265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321766
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4492	NC_021891	ACA	2	6	245534	245539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321772
4493	NC_021891	ACAA	2	8	245560	245567	75 %	0 %	0 %	25 %	527321772
4494	NC_021891	CTT	2	6	245572	245577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321772
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4496	NC_021891	ACT	2	6	245660	245665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321772
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4500	NC_021891	AGCT	2	8	245843	245850	25 %	25 %	25 %	25 %	527321772

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