MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 20527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021891	TTG	2	6	82396	82401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321638
1502	NC_021891	TTC	2	6	82404	82409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321638
1503	NC_021891	T	6	6	82438	82443	0 %	100 %	0 %	0 %	527321638
1504	NC_021891	GAA	2	6	82477	82482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321638
1505	NC_021891	GAA	2	6	82506	82511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321638
1506	NC_021891	GA	3	6	82568	82573	50 %	0 %	50 %	0 %	527321638
1507	NC_021891	GTTC	2	8	82578	82585	0 %	50 %	25 %	25 %	527321638
1508	NC_021891	GCT	2	6	82713	82718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321638
1509	NC_021891	GTGC	2	8	82725	82732	0 %	25 %	50 %	25 %	527321638
1510	NC_021891	TAA	2	6	82775	82780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321638
1511	NC_021891	CAT	2	6	82791	82796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321638
1512	NC_021891	GAA	2	6	82803	82808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321638
1513	NC_021891	GA	3	6	82888	82893	50 %	0 %	50 %	0 %	527321638
1514	NC_021891	TAC	2	6	82939	82944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321639
1515	NC_021891	T	6	6	82963	82968	0 %	100 %	0 %	0 %	527321639
1516	NC_021891	T	7	7	82975	82981	0 %	100 %	0 %	0 %	527321639
1517	NC_021891	T	6	6	82988	82993	0 %	100 %	0 %	0 %	527321639
1518	NC_021891	GTA	2	6	83074	83079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321639
1519	NC_021891	T	6	6	83085	83090	0 %	100 %	0 %	0 %	527321639
1520	NC_021891	TATG	2	8	83109	83116	25 %	50 %	25 %	0 %	527321639
1521	NC_021891	TAT	2	6	83138	83143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321639
1522	NC_021891	GTCTGT	2	12	83152	83163	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527321639
1523	NC_021891	TCA	2	6	83172	83177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321639
1524	NC_021891	TCAT	2	8	83180	83187	25 %	50 %	0 %	25 %	527321639
1525	NC_021891	CAA	2	6	83222	83227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321639
1526	NC_021891	ACTG	2	8	83232	83239	25 %	25 %	25 %	25 %	527321639
1527	NC_021891	CATT	2	8	83247	83254	25 %	50 %	0 %	25 %	527321639
1528	NC_021891	AGA	2	6	83280	83285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321639
1529	NC_021891	AGCA	2	8	83286	83293	50 %	0 %	25 %	25 %	527321639
1530	NC_021891	TC	3	6	83308	83313	0 %	50 %	0 %	50 %	527321639
1531	NC_021891	TTA	2	6	83329	83334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321639
1532	NC_021891	TAAC	2	8	83441	83448	50 %	25 %	0 %	25 %	527321639
1533	NC_021891	TTTG	2	8	83479	83486	0 %	75 %	25 %	0 %	527321639
1534	NC_021891	TTG	2	6	83576	83581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321639
1535	NC_021891	GAT	2	6	83673	83678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321639
1536	NC_021891	TCTA	2	8	83763	83770	25 %	50 %	0 %	25 %	527321639
1537	NC_021891	CTA	2	6	83791	83796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321639
1538	NC_021891	TAT	2	6	83844	83849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321639
1539	NC_021891	TAAG	2	8	83868	83875	50 %	25 %	25 %	0 %	527321639
1540	NC_021891	AGT	2	6	83957	83962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321640
1541	NC_021891	TAT	2	6	83984	83989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321640
1542	NC_021891	TGC	2	6	83999	84004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321640
1543	NC_021891	AAG	2	6	84019	84024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321640
1544	NC_021891	TC	3	6	84031	84036	0 %	50 %	0 %	50 %	527321640
1545	NC_021891	AG	3	6	84042	84047	50 %	0 %	50 %	0 %	527321640
1546	NC_021891	GAA	2	6	84075	84080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321640
1547	NC_021891	CAG	2	6	84214	84219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321640
1548	NC_021891	TAA	2	6	84260	84265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321640
1549	NC_021891	AG	3	6	84309	84314	50 %	0 %	50 %	0 %	527321640
1550	NC_021891	TTC	2	6	84328	84333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321640
1551	NC_021891	GAAG	2	8	84372	84379	50 %	0 %	50 %	0 %	527321640
1552	NC_021891	A	6	6	84396	84401	100 %	0 %	0 %	0 %	527321640
1553	NC_021891	AGA	2	6	84446	84451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321640
1554	NC_021891	TTC	2	6	84524	84529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321640
1555	NC_021891	TAAA	2	8	84538	84545	75 %	25 %	0 %	0 %	527321640
1556	NC_021891	ATCC	2	8	84609	84616	25 %	25 %	0 %	50 %	527321640
1557	NC_021891	TGG	2	6	84637	84642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321640
1558	NC_021891	TGA	2	6	84670	84675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321640
1559	NC_021891	TCC	2	6	84677	84682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321640
1560	NC_021891	ACA	2	6	84701	84706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321640
1561	NC_021891	TTTC	2	8	84756	84763	0 %	75 %	0 %	25 %	527321640
1562	NC_021891	AGAT	2	8	84797	84804	50 %	25 %	25 %	0 %	527321640
1563	NC_021891	CTT	2	6	84834	84839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321640
1564	NC_021891	T	6	6	84860	84865	0 %	100 %	0 %	0 %	527321640
1565	NC_021891	GAA	2	6	84987	84992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321640
1566	NC_021891	AAT	2	6	85241	85246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321641
1567	NC_021891	AT	3	6	85245	85250	50 %	50 %	0 %	0 %	527321641
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1569	NC_021891	AG	3	6	85340	85345	50 %	0 %	50 %	0 %	527321641
1570	NC_021891	GAAA	2	8	85378	85385	75 %	0 %	25 %	0 %	527321641
1571	NC_021891	T	6	6	85515	85520	0 %	100 %	0 %	0 %	527321641
1572	NC_021891	TGG	2	6	85616	85621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321641
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1574	NC_021891	CAA	2	6	85683	85688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321641
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1576	NC_021891	CTT	2	6	85767	85772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321641
1577	NC_021891	GAAA	2	8	85773	85780	75 %	0 %	25 %	0 %	527321641
1578	NC_021891	GCA	2	6	85796	85801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321641
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1580	NC_021891	GATCC	2	10	85906	85915	20 %	20 %	20 %	40 %	527321641
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1585	NC_021891	AT	3	6	86198	86203	50 %	50 %	0 %	0 %	527321641
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1591	NC_021891	AG	3	6	86624	86629	50 %	0 %	50 %	0 %	527321641
1592	NC_021891	TTA	2	6	86633	86638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321641
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1594	NC_021891	TA	3	6	86946	86951	50 %	50 %	0 %	0 %	527321641
1595	NC_021891	T	6	6	87045	87050	0 %	100 %	0 %	0 %	527321641
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1598	NC_021891	AGAGC	2	10	87241	87250	40 %	0 %	40 %	20 %	527321642
1599	NC_021891	ATG	2	6	87307	87312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321642
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1601	NC_021891	ATG	2	6	87331	87336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321642
1602	NC_021891	CAT	2	6	87386	87391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321642
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1608	NC_021891	T	6	6	87621	87626	0 %	100 %	0 %	0 %	527321642
1609	NC_021891	CTT	2	6	87629	87634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321642
1610	NC_021891	CTC	2	6	87674	87679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321642
1611	NC_021891	CAT	2	6	87809	87814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321642
1612	NC_021891	ACA	2	6	87886	87891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321642
1613	NC_021891	TTC	2	6	87900	87905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321642
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1615	NC_021891	A	6	6	88006	88011	100 %	0 %	0 %	0 %	527321642
1616	NC_021891	TTC	2	6	88012	88017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321642
1617	NC_021891	GAG	2	6	88188	88193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321643
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1619	NC_021891	TAG	2	6	88263	88268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321643
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1621	NC_021891	CTT	2	6	88383	88388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321643
1622	NC_021891	GAA	2	6	88413	88418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321643
1623	NC_021891	GTT	2	6	88557	88562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321643
1624	NC_021891	GTA	2	6	88564	88569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321643
1625	NC_021891	GA	3	6	88612	88617	50 %	0 %	50 %	0 %	527321643
1626	NC_021891	TAT	2	6	88653	88658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321643
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1628	NC_021891	AAG	2	6	88709	88714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321643
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