MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 20527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021891	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527321590
502	NC_021891	TTC	2	6	28618	28623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321590
503	NC_021891	CAG	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321590
504	NC_021891	GAA	2	6	28644	28649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321590
505	NC_021891	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321590
506	NC_021891	TTC	2	6	28691	28696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321590
507	NC_021891	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527321590
508	NC_021891	AAG	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321590
509	NC_021891	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527321590
510	NC_021891	GAA	2	6	29073	29078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321590
511	NC_021891	TGT	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321591
512	NC_021891	TCT	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321591
513	NC_021891	ACA	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321591
514	NC_021891	ATG	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321591
515	NC_021891	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527321591
516	NC_021891	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
517	NC_021891	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
518	NC_021891	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527321591
519	NC_021891	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	527321591
520	NC_021891	ATC	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321591
521	NC_021891	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527321591
522	NC_021891	T	8	8	29872	29879	0 %	100 %	0 %	0 %	527321591
523	NC_021891	ATG	2	6	29897	29902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321591
524	NC_021891	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527321591
525	NC_021891	AGG	2	6	30010	30015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321592
526	NC_021891	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	527321592
527	NC_021891	GTT	2	6	30114	30119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321592
528	NC_021891	GAA	2	6	30123	30128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321592
529	NC_021891	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527321592
530	NC_021891	TCT	2	6	30189	30194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321592
531	NC_021891	CTG	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321592
532	NC_021891	ACT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321592
533	NC_021891	TTC	2	6	30307	30312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321592
534	NC_021891	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527321592
535	NC_021891	CCT	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321592
536	NC_021891	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527321592
537	NC_021891	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	527321592
538	NC_021891	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527321592
539	NC_021891	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527321592
540	NC_021891	GAT	2	6	30528	30533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321592
541	NC_021891	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527321592
542	NC_021891	TAG	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321592
543	NC_021891	GTT	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321592
544	NC_021891	TAA	2	6	30734	30739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321592
545	NC_021891	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	527321592
546	NC_021891	GAA	2	6	30873	30878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321592
547	NC_021891	AGA	2	6	30893	30898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321592
548	NC_021891	TCG	2	6	30956	30961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321592
549	NC_021891	ATG	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321592
550	NC_021891	TGG	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321592
551	NC_021891	GAA	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321592
552	NC_021891	ATT	2	6	31071	31076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321592
553	NC_021891	ATG	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321592
554	NC_021891	AAG	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321592
555	NC_021891	T	6	6	31212	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	527321592
556	NC_021891	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	527321592
557	NC_021891	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	527321592
558	NC_021891	ACA	2	6	31300	31305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321593
559	NC_021891	TGT	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321593
560	NC_021891	AT	3	6	31372	31377	50 %	50 %	0 %	0 %	527321593
561	NC_021891	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	527321593
562	NC_021891	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527321593
563	NC_021891	A	6	6	31535	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	527321593
564	NC_021891	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	527321593
565	NC_021891	TGC	2	6	31594	31599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321593
566	NC_021891	AGC	2	6	31612	31617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321593
567	NC_021891	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527321594
568	NC_021891	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	527321594
569	NC_021891	AAG	2	6	31861	31866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321594
570	NC_021891	AAG	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321594
571	NC_021891	CTT	2	6	31907	31912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321594
572	NC_021891	CGT	2	6	31938	31943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321594
573	NC_021891	TGA	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321594
574	NC_021891	GAG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321594
575	NC_021891	GCG	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527321594
576	NC_021891	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	527321594
577	NC_021891	AGA	2	6	32235	32240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321594
578	NC_021891	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	527321594
579	NC_021891	AAG	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321594
580	NC_021891	ATT	2	6	32473	32478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321594
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582	NC_021891	GGA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321594
583	NC_021891	AGG	2	6	32828	32833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321595
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593	NC_021891	T	6	6	33518	33523	0 %	100 %	0 %	0 %	527321596
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597	NC_021891	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	527321596
598	NC_021891	CTG	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321597
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600	NC_021891	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	527321597
601	NC_021891	GTC	2	6	33949	33954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321597
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609	NC_021891	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527321597
610	NC_021891	TGC	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321597
611	NC_021891	TGT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321597
612	NC_021891	ATG	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321597
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615	NC_021891	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527321598
616	NC_021891	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527321598
617	NC_021891	GAT	2	6	34602	34607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321598
618	NC_021891	GA	4	8	34609	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	527321598
619	NC_021891	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	527321598
620	NC_021891	AGA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321598
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624	NC_021891	ATC	2	6	35013	35018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321599
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629	NC_021891	AGA	2	6	35305	35310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321599
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751	NC_021891	A	7	7	42085	42091	100 %	0 %	0 %	0 %	527321603
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