MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 2568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527320615
2	NC_021890	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527320616
3	NC_021890	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527320616
4	NC_021890	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	527320617
5	NC_021890	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527320617
6	NC_021890	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527320617
7	NC_021890	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527320618
8	NC_021890	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527320618
9	NC_021890	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527320618
10	NC_021890	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527320618
11	NC_021890	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527320619
12	NC_021890	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527320619
13	NC_021890	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527320619
14	NC_021890	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527320620
15	NC_021890	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527320620
16	NC_021890	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527320621
17	NC_021890	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527320621
18	NC_021890	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527320622
19	NC_021890	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527320623
20	NC_021890	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527320623
21	NC_021890	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527320623
22	NC_021890	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527320623
23	NC_021890	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527320624
24	NC_021890	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527320624
25	NC_021890	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527320624
26	NC_021890	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527320625
27	NC_021890	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527320625
28	NC_021890	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527320625
29	NC_021890	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527320625
30	NC_021890	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527320626
31	NC_021890	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527320627
32	NC_021890	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527320627
33	NC_021890	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527320628
34	NC_021890	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527320628
35	NC_021890	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527320628
36	NC_021890	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527320629
37	NC_021890	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527320629
38	NC_021890	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527320630
39	NC_021890	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527320630
40	NC_021890	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527320630
41	NC_021890	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527320630
42	NC_021890	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
43	NC_021890	TTTG	2	8	19539	19546	0 %	75 %	25 %	0 %	527320632
44	NC_021890	TGTA	2	8	20231	20238	25 %	50 %	25 %	0 %	527320633
45	NC_021890	TGGG	2	8	21649	21656	0 %	25 %	75 %	0 %	527320634
46	NC_021890	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527320634
47	NC_021890	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527320634
48	NC_021890	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527320634
49	NC_021890	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527320634
50	NC_021890	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527320634
51	NC_021890	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527320634
52	NC_021890	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527320634
53	NC_021890	TTGA	2	8	25058	25065	25 %	50 %	25 %	0 %	527320635
54	NC_021890	TTCG	2	8	25203	25210	0 %	50 %	25 %	25 %	527320635
55	NC_021890	TAGG	2	8	25282	25289	25 %	25 %	50 %	0 %	527320635
56	NC_021890	TTCC	2	8	25406	25413	0 %	50 %	0 %	50 %	527320635
57	NC_021890	TAGG	2	8	25520	25527	25 %	25 %	50 %	0 %	527320635
58	NC_021890	TTTC	2	8	25955	25962	0 %	75 %	0 %	25 %	527320635
59	NC_021890	GCTT	2	8	26292	26299	0 %	50 %	25 %	25 %	527320635
60	NC_021890	GGAA	2	8	26875	26882	50 %	0 %	50 %	0 %	527320636
61	NC_021890	TTAA	2	8	26948	26955	50 %	50 %	0 %	0 %	527320636
62	NC_021890	AAAG	2	8	26998	27005	75 %	0 %	25 %	0 %	527320636
63	NC_021890	GGGC	2	8	27278	27285	0 %	0 %	75 %	25 %	527320636
64	NC_021890	GTTT	2	8	27561	27568	0 %	75 %	25 %	0 %	527320637
65	NC_021890	CAGA	2	8	27583	27590	50 %	0 %	25 %	25 %	527320637
66	NC_021890	CTTT	2	8	29555	29562	0 %	75 %	0 %	25 %	527320639
67	NC_021890	TTTG	2	8	29570	29577	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
68	NC_021890	TTGT	2	8	29605	29612	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
69	NC_021890	TGGC	2	8	29768	29775	0 %	25 %	50 %	25 %	527320639
70	NC_021890	AAAG	2	8	30328	30335	75 %	0 %	25 %	0 %	527320640
71	NC_021890	AAAC	2	8	30398	30405	75 %	0 %	0 %	25 %	527320640
72	NC_021890	GATG	2	8	30541	30548	25 %	25 %	50 %	0 %	527320640
73	NC_021890	TGAT	2	8	34144	34151	25 %	50 %	25 %	0 %	527320645
74	NC_021890	AAGA	3	12	34272	34283	75 %	0 %	25 %	0 %	527320645
75	NC_021890	AAGC	2	8	34492	34499	50 %	0 %	25 %	25 %	527320646
76	NC_021890	GTTC	2	8	34525	34532	0 %	50 %	25 %	25 %	527320646
77	NC_021890	GGCA	2	8	34904	34911	25 %	0 %	50 %	25 %	527320647
78	NC_021890	TCGA	2	8	35161	35168	25 %	25 %	25 %	25 %	527320647
79	NC_021890	TGCT	2	8	35314	35321	0 %	50 %	25 %	25 %	527320647
80	NC_021890	TTGG	2	8	35546	35553	0 %	50 %	50 %	0 %	527320647
81	NC_021890	AGAT	2	8	36266	36273	50 %	25 %	25 %	0 %	527320647
82	NC_021890	CTTT	2	8	36639	36646	0 %	75 %	0 %	25 %	527320648
83	NC_021890	ATGA	2	8	37129	37136	50 %	25 %	25 %	0 %	527320648
84	NC_021890	TAGG	2	8	37288	37295	25 %	25 %	50 %	0 %	527320648
85	NC_021890	CAAT	2	8	37472	37479	50 %	25 %	0 %	25 %	527320648
86	NC_021890	AATG	2	8	38259	38266	50 %	25 %	25 %	0 %	527320648
87	NC_021890	AGAA	2	8	39096	39103	75 %	0 %	25 %	0 %	527320649
88	NC_021890	AAGA	2	8	39148	39155	75 %	0 %	25 %	0 %	527320649
89	NC_021890	ATCC	2	8	39156	39163	25 %	25 %	0 %	50 %	527320649
90	NC_021890	TAAT	2	8	39367	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	527320649
91	NC_021890	GTGC	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	527320651
92	NC_021890	AGAA	2	8	41875	41882	75 %	0 %	25 %	0 %	527320651
93	NC_021890	GGAT	2	8	42027	42034	25 %	25 %	50 %	0 %	527320651
94	NC_021890	AAAC	2	8	43235	43242	75 %	0 %	0 %	25 %	527320654
95	NC_021890	CAAT	2	8	43439	43446	50 %	25 %	0 %	25 %	527320654
96	NC_021890	ATTT	2	8	44196	44203	25 %	75 %	0 %	0 %	527320656
97	NC_021890	GCTC	2	8	44504	44511	0 %	25 %	25 %	50 %	527320656
98	NC_021890	TTCT	2	8	44646	44653	0 %	75 %	0 %	25 %	527320656
99	NC_021890	TTGA	2	8	45246	45253	25 %	50 %	25 %	0 %	527320657
100	NC_021890	TGTT	2	8	45418	45425	0 %	75 %	25 %	0 %	527320657
101	NC_021890	CTAT	2	8	45448	45455	25 %	50 %	0 %	25 %	527320657
102	NC_021890	TGTT	2	8	45477	45484	0 %	75 %	25 %	0 %	527320657
103	NC_021890	CTAT	2	8	45773	45780	25 %	50 %	0 %	25 %	527320657
104	NC_021890	AAGA	2	8	46269	46276	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
105	NC_021890	AAGA	2	8	46326	46333	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
106	NC_021890	AAAG	2	8	46366	46373	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
107	NC_021890	AAGA	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
108	NC_021890	ACTT	2	8	46742	46749	25 %	50 %	0 %	25 %	527320658
109	NC_021890	ATGG	2	8	47368	47375	25 %	25 %	50 %	0 %	527320658
110	NC_021890	AGGA	2	8	47399	47406	50 %	0 %	50 %	0 %	527320658
111	NC_021890	GAAC	2	8	47946	47953	50 %	0 %	25 %	25 %	527320658
112	NC_021890	AACA	2	8	48190	48197	75 %	0 %	0 %	25 %	527320659
113	NC_021890	CTTT	2	8	48386	48393	0 %	75 %	0 %	25 %	527320659
114	NC_021890	CTTT	2	8	49271	49278	0 %	75 %	0 %	25 %	527320660
115	NC_021890	GTAG	2	8	49289	49296	25 %	25 %	50 %	0 %	527320660
116	NC_021890	GAAG	2	8	50717	50724	50 %	0 %	50 %	0 %	527320661
117	NC_021890	TTCA	2	8	51139	51146	25 %	50 %	0 %	25 %	527320661
118	NC_021890	TCTA	2	8	51356	51363	25 %	50 %	0 %	25 %	527320661
119	NC_021890	GGAA	2	8	52522	52529	50 %	0 %	50 %	0 %	527320663
120	NC_021890	TTAA	2	8	53263	53270	50 %	50 %	0 %	0 %	527320663
121	NC_021890	CCTT	2	8	53470	53477	0 %	50 %	0 %	50 %	527320664
122	NC_021890	TTTA	2	8	53637	53644	25 %	75 %	0 %	0 %	527320664
123	NC_021890	AAAG	2	8	53861	53868	75 %	0 %	25 %	0 %	527320664
124	NC_021890	GATT	2	8	53998	54005	25 %	50 %	25 %	0 %	527320664
125	NC_021890	AATC	2	8	54053	54060	50 %	25 %	0 %	25 %	527320664
126	NC_021890	TATT	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	527320664
127	NC_021890	TCGA	2	8	54502	54509	25 %	25 %	25 %	25 %	527320665
128	NC_021890	CTTC	2	8	54596	54603	0 %	50 %	0 %	50 %	527320665
129	NC_021890	GAAT	2	8	54631	54638	50 %	25 %	25 %	0 %	527320665
130	NC_021890	TGAT	2	8	54702	54709	25 %	50 %	25 %	0 %	527320665
131	NC_021890	GGAA	2	8	55057	55064	50 %	0 %	50 %	0 %	527320665
132	NC_021890	GAGT	2	8	55626	55633	25 %	25 %	50 %	0 %	527320665
133	NC_021890	CTGG	3	12	55968	55979	0 %	25 %	50 %	25 %	527320666
134	NC_021890	TTGC	2	8	56105	56112	0 %	50 %	25 %	25 %	527320666
135	NC_021890	CGAG	2	8	56147	56154	25 %	0 %	50 %	25 %	527320666
136	NC_021890	GAAA	2	8	58172	58179	75 %	0 %	25 %	0 %	527320667
137	NC_021890	AGGT	2	8	58211	58218	25 %	25 %	50 %	0 %	527320667
138	NC_021890	CGTT	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	527320668
139	NC_021890	GGAG	2	8	59378	59385	25 %	0 %	75 %	0 %	527320668
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